Protein–RNA interactions for Protein: Q15532

SS18, Protein SSXT, humanhuman

Predictions only

Length 418 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SS18Q15532 AC068870.1-201ENST00000563737 2455 ntBASIC3.79□□□□□ -1.8
SS18Q15532 AL359715.3-201ENST00000569267 2123 ntBASIC3.79□□□□□ -1.8
SS18Q15532 UBXN7-201ENST00000296328 10568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.79□□□□□ -1.8
SS18Q15532 MMP8-201ENST00000236826 3056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.79□□□□□ -1.8
SS18Q15532 GJA9-201ENST00000357771 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.79□□□□□ -1.8
SS18Q15532 SIAH1-202ENST00000380006 3352 ntAPPRIS P3 BASIC3.79□□□□□ -1.8
SS18Q15532 DCN-201ENST00000052754 7156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.79□□□□□ -1.8
SS18Q15532 FOXN2-203ENST00000616844 1414 ntTSL 5 BASIC3.78□□□□□ -1.8
SS18Q15532 ZNF701-202ENST00000391785 2634 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC3.78□□□□□ -1.8
SS18Q15532 SCRG1-201ENST00000296506 4420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.78□□□□□ -1.8
SS18Q15532 AC004982.1-201ENST00000608770 1655 ntTSL 4 BASIC3.78□□□□□ -1.8
SS18Q15532 DDX6-207ENST00000617381 2883 ntTSL 1 (best) BASIC3.78□□□□□ -1.8
SS18Q15532 ERMN-201ENST00000397283 3760 ntTSL 2 BASIC3.78□□□□□ -1.8
SS18Q15532 KBTBD3-201ENST00000526793 3751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.78□□□□□ -1.8
SS18Q15532 KCNJ6-201ENST00000609713 19645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.78□□□□□ -1.8
SS18Q15532 LINC02203-203ENST00000625989 1600 ntTSL 1 (best) BASIC3.78□□□□□ -1.8
SS18Q15532 MTRNR2L11-201ENST00000604646 1552 ntAPPRIS P1 BASIC3.78□□□□□ -1.8
SS18Q15532 CLC-201ENST00000221804 635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.78□□□□□ -1.8
SS18Q15532 CLEC7A-203ENST00000310002 425 ntTSL 1 (best) BASIC3.78□□□□□ -1.8
SS18Q15532 STX19-201ENST00000315099 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.78□□□□□ -1.8
SS18Q15532 SPRR2D-201ENST00000360379 682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.78□□□□□ -1.8
SS18Q15532 U3.7-201ENST00000363668 216 ntBASIC3.78□□□□□ -1.8
SS18Q15532 SPRR2G-201ENST00000368748 568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.78□□□□□ -1.8
SS18Q15532 PAGE2-202ENST00000374968 551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.78□□□□□ -1.8
SS18Q15532 TRAV35-201ENST00000390462 330 ntBASIC3.78□□□□□ -1.8
SS18Q15532 AL358178.1-201ENST00000407698 397 ntBASIC3.78□□□□□ -1.8
SS18Q15532 RNA5SP431-201ENST00000410312 120 ntBASIC3.78□□□□□ -1.8
SS18Q15532 SETP15-201ENST00000412724 337 ntBASIC3.78□□□□□ -1.8
SS18Q15532 AC106900.1-201ENST00000418620 456 ntTSL 5 BASIC3.78□□□□□ -1.8
SS18Q15532 AC004882.2-201ENST00000420180 244 ntTSL 5 BASIC3.78□□□□□ -1.8
SS18Q15532 AL035660.1-201ENST00000422041 222 ntBASIC3.78□□□□□ -1.8
SS18Q15532 PRUNEP1-201ENST00000425846 705 ntBASIC3.78□□□□□ -1.8
SS18Q15532 AC073283.2-202ENST00000426892 591 ntTSL 4 BASIC3.78□□□□□ -1.8
SS18Q15532 AC108066.1-201ENST00000437261 596 ntTSL 4 BASIC3.78□□□□□ -1.8
SS18Q15532 AC092106.1-201ENST00000444291 373 ntBASIC3.78□□□□□ -1.8
SS18Q15532 LINC01456-201ENST00000453902 708 ntTSL 3 BASIC3.78□□□□□ -1.8
SS18Q15532 AC118758.1-202ENST00000454719 225 ntBASIC3.78□□□□□ -1.8
SS18Q15532 AC022133.1-201ENST00000490961 571 ntBASIC3.78□□□□□ -1.8
SS18Q15532 AC092916.1-201ENST00000497896 411 ntTSL 3 BASIC3.78□□□□□ -1.8
SS18Q15532 LSM3P4-201ENST00000502948 309 ntBASIC3.78□□□□□ -1.8
SS18Q15532 AC010181.1-202ENST00000509191 798 ntTSL 3 BASIC3.78□□□□□ -1.8
SS18Q15532 LDHAP1-201ENST00000509421 992 ntBASIC3.78□□□□□ -1.8
SS18Q15532 AC018797.1-201ENST00000510791 255 ntBASIC3.78□□□□□ -1.8
SS18Q15532 IGHVIII-76-1-201ENST00000523776 286 ntBASIC3.78□□□□□ -1.8
SS18Q15532 AC021393.1-201ENST00000531077 433 ntTSL 3 BASIC3.78□□□□□ -1.8
SS18Q15532 AL133481.2-201ENST00000538322 367 ntTSL 2 BASIC3.78□□□□□ -1.8
SS18Q15532 NPIPA8-202ENST00000541810 1131 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.78□□□□□ -1.8
SS18Q15532 NPIPA3-203ENST00000552140 1053 ntTSL 5 BASIC3.78□□□□□ -1.8
SS18Q15532 NPIPA2-203ENST00000553201 1053 ntTSL 1 (best) BASIC3.78□□□□□ -1.8
SS18Q15532 AL139354.1-201ENST00000554319 645 ntTSL 5 BASIC3.78□□□□□ -1.8
SS18Q15532 LYRM1-211ENST00000569023 769 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC3.78□□□□□ -1.8
SS18Q15532 ARGFXP2-201ENST00000579304 949 ntBASIC3.78□□□□□ -1.8
SS18Q15532 AC092944.2-201ENST00000605443 889 ntBASIC3.78□□□□□ -1.8
SS18Q15532 AC010632.3-201ENST00000611377 369 ntBASIC3.78□□□□□ -1.8
SS18Q15532 AC074140.1-201ENST00000621617 208 ntBASIC3.78□□□□□ -1.8
SS18Q15532 MAPKBP1-217ENST00000627631 210 ntTSL 5 BASIC3.78□□□□□ -1.8
SS18Q15532 AP002008.2-205ENST00000637111 1091 ntTSL 5 BASIC3.78□□□□□ -1.8
SS18Q15532 SYNE2-203ENST00000357395 21555 ntTSL 5 BASIC3.78□□□□□ -1.8
SS18Q15532 EDA2R-202ENST00000374719 3418 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC3.78□□□□□ -1.8
SS18Q15532 ELF1-204ENST00000625359 2032 ntTSL 2 BASIC3.78□□□□□ -1.8
SS18Q15532 ZNF573-208ENST00000536220 2257 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC3.78□□□□□ -1.8
SS18Q15532 EIF4EBP2-201ENST00000373218 7257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.78□□□□□ -1.8
SS18Q15532 GABPB1-AS1-202ENST00000499624 16182 ntTSL 1 (best) BASIC3.78□□□□□ -1.8
SS18Q15532 FOXP2-202ENST00000360232 1412 ntTSL 1 (best) BASIC3.78□□□□□ -1.8
SS18Q15532 AC015813.6-201ENST00000624409 5808 ntBASIC3.78□□□□□ -1.8
SS18Q15532 CD69-201ENST00000228434 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.78□□□□□ -1.81
SS18Q15532 MYO16-201ENST00000251041 3492 ntTSL 5 BASIC3.78□□□□□ -1.81
SS18Q15532 INPP4B-220ENST00000513000 8831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.78□□□□□ -1.81
SS18Q15532 PPEF1-201ENST00000349874 2687 ntTSL 5 BASIC3.77□□□□□ -1.81
SS18Q15532 IKZF3-213ENST00000439167 1879 ntTSL 1 (best) BASIC3.77□□□□□ -1.81
SS18Q15532 ERP27-201ENST00000266397 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.77□□□□□ -1.81
SS18Q15532 MAPK6PS2-201ENST00000379571 2060 ntBASIC3.77□□□□□ -1.81
SS18Q15532 LRRC8B-201ENST00000330947 7593 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.77□□□□□ -1.81
SS18Q15532 DLG1-213ENST00000443183 2516 ntTSL 2 BASIC3.77□□□□□ -1.81
SS18Q15532 LINC01847-202ENST00000523311 1762 ntTSL 5 BASIC3.77□□□□□ -1.81
SS18Q15532 CEP164P1-202ENST00000456938 2472 ntTSL 1 (best) BASIC3.77□□□□□ -1.81
SS18Q15532 BNIP2-202ENST00000415213 1509 ntTSL 2 BASIC3.77□□□□□ -1.81
SS18Q15532 LIMA1-212ENST00000552491 2652 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC3.77□□□□□ -1.81
SS18Q15532 OR4S2-201ENST00000312422 936 ntAPPRIS P1 BASIC3.77□□□□□ -1.81
SS18Q15532 GAPDHP24-201ENST00000328713 983 ntBASIC3.77□□□□□ -1.81
SS18Q15532 OR5P2-201ENST00000329434 1069 ntAPPRIS P1 BASIC3.77□□□□□ -1.81
SS18Q15532 BPY2-201ENST00000331070 1206 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC3.77□□□□□ -1.81
SS18Q15532 RPS24-201ENST00000360830 514 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC3.77□□□□□ -1.81
SS18Q15532 RNA5SP30-201ENST00000365552 115 ntBASIC3.77□□□□□ -1.81
SS18Q15532 SAR1A-201ENST00000373236 437 ntTSL 1 (best) BASIC3.77□□□□□ -1.81
SS18Q15532 BPY2C-201ENST00000382287 1206 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC3.77□□□□□ -1.81
SS18Q15532 BPY2B-201ENST00000382392 1206 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC3.77□□□□□ -1.81
SS18Q15532 SNORA48.4-201ENST00000391089 134 ntBASIC3.77□□□□□ -1.81
SS18Q15532 AL096711.1-201ENST00000404780 554 ntBASIC3.77□□□□□ -1.81
SS18Q15532 AC002511.2-201ENST00000413796 450 ntTSL 2 BASIC3.77□□□□□ -1.81
SS18Q15532 SETP10-201ENST00000424368 814 ntBASIC3.77□□□□□ -1.81
SS18Q15532 PQLC2L-202ENST00000426338 1197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.77□□□□□ -1.81
SS18Q15532 TXNDC12-AS1-201ENST00000428794 391 ntTSL 3 BASIC3.77□□□□□ -1.81
SS18Q15532 SPATA13-AS1-201ENST00000430733 433 ntTSL 3 BASIC3.77□□□□□ -1.81
SS18Q15532 AC090018.1-201ENST00000434369 367 ntBASIC3.77□□□□□ -1.81
SS18Q15532 GAPDHP48-201ENST00000436626 961 ntBASIC3.77□□□□□ -1.81
SS18Q15532 AMYP1-201ENST00000440059 1023 ntBASIC3.77□□□□□ -1.81
SS18Q15532 AL121917.1-201ENST00000441270 893 ntTSL 5 BASIC3.77□□□□□ -1.81
SS18Q15532 LINC01789-201ENST00000443123 860 ntTSL 5 BASIC3.77□□□□□ -1.81
SS18Q15532 BCAP29-207ENST00000445771 1157 ntTSL 5 BASIC3.77□□□□□ -1.81
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 81.3 ms