Protein–RNA interactions for Protein: Q15059

BRD3, Bromodomain-containing protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 726 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BRD3Q15059 AC106900.1-201ENST00000418620 456 ntTSL 5 BASIC6.32□□□□□ -1.4
BRD3Q15059 MTCO3P4-201ENST00000419236 787 ntBASIC6.32□□□□□ -1.4
BRD3Q15059 LINC01058-201ENST00000420694 448 ntTSL 5 BASIC6.32□□□□□ -1.4
BRD3Q15059 PNRC2P1-201ENST00000423940 420 ntBASIC6.32□□□□□ -1.4
BRD3Q15059 MTCO2P1-201ENST00000424648 477 ntBASIC6.32□□□□□ -1.4
BRD3Q15059 LINC01473-202ENST00000427108 695 ntTSL 5 BASIC6.32□□□□□ -1.4
BRD3Q15059 FO393419.3-201ENST00000428741 282 ntBASIC6.32□□□□□ -1.4
BRD3Q15059 GAPDHP19-201ENST00000431768 1005 ntBASIC6.32□□□□□ -1.4
BRD3Q15059 AKR1D1-203ENST00000432161 1236 ntTSL 2 BASIC6.32□□□□□ -1.4
BRD3Q15059 AC242426.1-201ENST00000435270 960 ntBASIC6.32□□□□□ -1.4
BRD3Q15059 AL513348.1-201ENST00000435554 440 ntTSL 3 BASIC6.32□□□□□ -1.4
BRD3Q15059 AC099063.1-201ENST00000437128 324 ntTSL 5 BASIC6.32□□□□□ -1.4
BRD3Q15059 MIR205HG-206ENST00000440276 539 ntTSL 5 BASIC6.32□□□□□ -1.4
BRD3Q15059 RPS18P1-201ENST00000447840 458 ntBASIC6.32□□□□□ -1.4
BRD3Q15059 AL158835.1-204ENST00000449693 371 ntTSL 3 BASIC6.32□□□□□ -1.4
BRD3Q15059 KF459542.1-201ENST00000450908 553 ntBASIC6.32□□□□□ -1.4
BRD3Q15059 AC099670.1-201ENST00000455141 783 ntBASIC6.32□□□□□ -1.4
BRD3Q15059 CEACAMP11-201ENST00000455211 583 ntBASIC6.32□□□□□ -1.4
BRD3Q15059 AC004890.1-201ENST00000461005 181 ntBASIC6.32□□□□□ -1.4
BRD3Q15059 RPL7P48-201ENST00000461513 746 ntBASIC6.32□□□□□ -1.4
BRD3Q15059 RN7SL393P-201ENST00000463588 296 ntBASIC6.32□□□□□ -1.4
BRD3Q15059 SSBP1-205ENST00000465582 731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.32□□□□□ -1.4
BRD3Q15059 AC044810.1-201ENST00000480271 711 ntBASIC6.32□□□□□ -1.4
BRD3Q15059 RPL7AP10-201ENST00000481016 791 ntBASIC6.32□□□□□ -1.4
BRD3Q15059 SH3GLB1-202ENST00000482504 1199 ntTSL 1 (best) BASIC6.32□□□□□ -1.4
BRD3Q15059 RN7SL612P-201ENST00000497704 295 ntBASIC6.32□□□□□ -1.4
BRD3Q15059 AC133963.2-201ENST00000513686 578 ntBASIC6.32□□□□□ -1.4
BRD3Q15059 RNA5SP418-201ENST00000515951 117 ntBASIC6.32□□□□□ -1.4
BRD3Q15059 RN7SKP288-201ENST00000516227 268 ntBASIC6.32□□□□□ -1.4
BRD3Q15059 AL133399.1-201ENST00000527476 298 ntBASIC6.32□□□□□ -1.4
BRD3Q15059 NAV2-IT1-201ENST00000528204 506 ntTSL 1 (best) BASIC6.32□□□□□ -1.4
BRD3Q15059 AP003049.2-202ENST00000532929 803 ntTSL 3 BASIC6.32□□□□□ -1.4
BRD3Q15059 RPL3P13-201ENST00000550415 216 ntBASIC6.32□□□□□ -1.4
BRD3Q15059 AC023968.1-201ENST00000560719 475 ntBASIC6.32□□□□□ -1.4
BRD3Q15059 AC007346.2-201ENST00000564816 892 ntBASIC6.32□□□□□ -1.4
BRD3Q15059 LINC01906-201ENST00000582962 499 ntTSL 4 BASIC6.32□□□□□ -1.4
BRD3Q15059 RN7SL475P-201ENST00000583379 298 ntBASIC6.32□□□□□ -1.4
BRD3Q15059 AC025809.1-201ENST00000585336 560 ntTSL 4 BASIC6.32□□□□□ -1.4
BRD3Q15059 AC005180.2-201ENST00000585620 562 ntTSL 3 BASIC6.32□□□□□ -1.4
BRD3Q15059 AC005332.4-201ENST00000592752 579 ntBASIC6.32□□□□□ -1.4
BRD3Q15059 AC063977.7-201ENST00000594454 337 ntBASIC6.32□□□□□ -1.4
BRD3Q15059 AL589765.6-201ENST00000601909 549 ntBASIC6.32□□□□□ -1.4
BRD3Q15059 AC073046.2-201ENST00000604756 527 ntBASIC6.32□□□□□ -1.4
BRD3Q15059 Metazoa_SRP.66-201ENST00000615609 282 ntBASIC6.32□□□□□ -1.4
BRD3Q15059 HTR1DP1-201ENST00000616500 888 ntBASIC6.32□□□□□ -1.4
BRD3Q15059 AC243654.3-201ENST00000617427 735 ntTSL 5 BASIC6.32□□□□□ -1.4
BRD3Q15059 AL161616.2-201ENST00000622001 565 ntTSL 4 BASIC6.32□□□□□ -1.4
BRD3Q15059 MIR6823-201ENST00000622118 61 ntBASIC6.32□□□□□ -1.4
BRD3Q15059 AC089999.3-201ENST00000622440 577 ntBASIC6.32□□□□□ -1.4
BRD3Q15059 OR2AK2-202ENST00000641852 1008 ntAPPRIS P2 BASIC6.32□□□□□ -1.4
BRD3Q15059 DBT-202ENST00000370132 10799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.32□□□□□ -1.4
BRD3Q15059 HIF1AN-201ENST00000299163 13011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.32□□□□□ -1.4
BRD3Q15059 IGF1-202ENST00000337514 7359 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.32□□□□□ -1.4
BRD3Q15059 AC130304.1-201ENST00000622942 2385 ntBASIC6.32□□□□□ -1.4
BRD3Q15059 MAGEB16-203ENST00000399988 1682 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC6.32□□□□□ -1.4
BRD3Q15059 MTCO1P4-201ENST00000520516 1409 ntBASIC6.32□□□□□ -1.4
BRD3Q15059 PIGN-241ENST00000640050 3154 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.32□□□□□ -1.4
BRD3Q15059 GAS2L3-202ENST00000537247 2742 ntTSL 2 BASIC6.32□□□□□ -1.4
BRD3Q15059 AASDH-201ENST00000205214 3590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.32□□□□□ -1.4
BRD3Q15059 MID2-202ENST00000443968 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.32□□□□□ -1.4
BRD3Q15059 AC093311.1-201ENST00000506586 2021 ntBASIC6.32□□□□□ -1.4
BRD3Q15059 NBPF20-205ENST00000622803 3689 ntTSL 5 BASIC6.31□□□□□ -1.4
BRD3Q15059 PTPRR-204ENST00000440835 2818 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.31□□□□□ -1.4
BRD3Q15059 TEK-205ENST00000615002 4666 ntTSL 5 BASIC6.31□□□□□ -1.4
BRD3Q15059 KLHL28-201ENST00000355081 2177 ntTSL 1 (best) BASIC6.31□□□□□ -1.4
BRD3Q15059 YPEL5-204ENST00000402003 2197 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.31□□□□□ -1.4
BRD3Q15059 HHLA2-206ENST00000467761 2379 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC6.31□□□□□ -1.4
BRD3Q15059 IGF2BP2-AS1-202ENST00000456447 1531 ntTSL 1 (best) BASIC6.31□□□□□ -1.4
BRD3Q15059 FANCD2-203ENST00000419585 5185 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.31□□□□□ -1.4
BRD3Q15059 CLUL1-205ENST00000579494 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.31□□□□□ -1.4
BRD3Q15059 PLCH1-202ENST00000340059 6168 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.31□□□□□ -1.4
BRD3Q15059 FAR2-201ENST00000182377 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.31□□□□□ -1.4
BRD3Q15059 CCR6-201ENST00000341935 4018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.31□□□□□ -1.4
BRD3Q15059 RPS29-201ENST00000245458 296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.31□□□□□ -1.4
BRD3Q15059 RPL39-201ENST00000361575 401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.31□□□□□ -1.4
BRD3Q15059 RN7SKP184-201ENST00000362348 333 ntBASIC6.31□□□□□ -1.4
BRD3Q15059 SNORA63.3-201ENST00000362682 132 ntBASIC6.31□□□□□ -1.4
BRD3Q15059 APOOL-201ENST00000373173 1279 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.31□□□□□ -1.4
BRD3Q15059 AC078960.1-201ENST00000422160 177 ntTSL 5 BASIC6.31□□□□□ -1.4
BRD3Q15059 QKI-206ENST00000424802 954 ntTSL 1 (best) BASIC6.31□□□□□ -1.4
BRD3Q15059 AL590666.1-201ENST00000428641 433 ntTSL 2 BASIC6.31□□□□□ -1.4
BRD3Q15059 AL592146.1-201ENST00000433869 1126 ntTSL 1 (best) BASIC6.31□□□□□ -1.4
BRD3Q15059 AL358972.1-201ENST00000434356 466 ntTSL 2 BASIC6.31□□□□□ -1.4
BRD3Q15059 LINC01378-202ENST00000437514 783 ntTSL 3 BASIC6.31□□□□□ -1.4
BRD3Q15059 YWHAZP2-201ENST00000440317 728 ntBASIC6.31□□□□□ -1.4
BRD3Q15059 LARS2-AS1-201ENST00000442534 575 ntTSL 4 BASIC6.31□□□□□ -1.4
BRD3Q15059 GAPDHP23-201ENST00000444823 993 ntBASIC6.31□□□□□ -1.4
BRD3Q15059 TMEM247-203ENST00000449601 741 ntTSL 1 (best) BASIC6.31□□□□□ -1.4
BRD3Q15059 AC095033.1-201ENST00000451611 1096 ntTSL 1 (best) BASIC6.31□□□□□ -1.4
BRD3Q15059 AC104831.1-201ENST00000470024 444 ntTSL 3 BASIC6.31□□□□□ -1.4
BRD3Q15059 H3F3AP5-201ENST00000475267 429 ntBASIC6.31□□□□□ -1.4
BRD3Q15059 AC092902.1-201ENST00000486999 259 ntBASIC6.31□□□□□ -1.4
BRD3Q15059 NUDT6-203ENST00000502270 678 ntTSL 5 BASIC6.31□□□□□ -1.4
BRD3Q15059 LINC01386-201ENST00000506196 440 ntTSL 3 BASIC6.31□□□□□ -1.4
BRD3Q15059 RNU6-334P-201ENST00000517072 102 ntBASIC6.31□□□□□ -1.4
BRD3Q15059 ZFAND1-204ENST00000517588 633 ntTSL 2 BASIC6.31□□□□□ -1.4
BRD3Q15059 IGHV7-34-1-201ENST00000519200 350 ntBASIC6.31□□□□□ -1.4
BRD3Q15059 AC104248.1-202ENST00000524134 486 ntTSL 5 BASIC6.31□□□□□ -1.4
BRD3Q15059 SOX5P1-201ENST00000524155 1127 ntBASIC6.31□□□□□ -1.4
BRD3Q15059 AC103855.3-201ENST00000528445 606 ntTSL 5 BASIC6.31□□□□□ -1.4
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 85.2 ms