Protein–RNA interactions for Protein: Q14839

CHD4, Chromodomain-helicase-DNA-binding protein 4, humanhuman

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Length 1,912 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHD4Q14839 AC073365.1-203ENST00000641055 1992 ntBASIC6.85□□□□□ -1.31
CHD4Q14839 TEX41-207ENST00000445791 4635 ntTSL 1 (best) BASIC6.85□□□□□ -1.31
CHD4Q14839 CPED1-203ENST00000423795 2189 ntTSL 1 (best) BASIC6.85□□□□□ -1.31
CHD4Q14839 TYW3-201ENST00000370867 3430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.84□□□□□ -1.31
CHD4Q14839 AL021877.2-201ENST00000624442 10684 ntBASIC6.84□□□□□ -1.31
CHD4Q14839 CTNNA2-202ENST00000361291 3071 ntTSL 5 BASIC6.84□□□□□ -1.31
CHD4Q14839 TPK1-207ENST00000538212 2243 ntTSL 2 BASIC6.84□□□□□ -1.31
CHD4Q14839 OR5F1-201ENST00000278409 945 ntAPPRIS P1 BASIC6.84□□□□□ -1.31
CHD4Q14839 RNA5SP44-201ENST00000410446 133 ntBASIC6.84□□□□□ -1.31
CHD4Q14839 RNU2-50P-201ENST00000410494 143 ntBASIC6.84□□□□□ -1.31
CHD4Q14839 LINC01198-201ENST00000416521 500 ntTSL 3 BASIC6.84□□□□□ -1.31
CHD4Q14839 AC069213.2-201ENST00000420238 366 ntBASIC6.84□□□□□ -1.31
CHD4Q14839 AC007161.1-204ENST00000423039 460 ntBASIC6.84□□□□□ -1.31
CHD4Q14839 USP24P1-201ENST00000433802 779 ntBASIC6.84□□□□□ -1.31
CHD4Q14839 AL161457.1-201ENST00000434656 905 ntTSL 5 BASIC6.84□□□□□ -1.31
CHD4Q14839 NPSR1-AS1-206ENST00000439852 710 ntTSL 1 (best) BASIC6.84□□□□□ -1.31
CHD4Q14839 AC068707.1-201ENST00000451438 391 ntTSL 3 BASIC6.84□□□□□ -1.31
CHD4Q14839 AC092647.2-201ENST00000452998 253 ntBASIC6.84□□□□□ -1.31
CHD4Q14839 AKR1C2-203ENST00000455190 1098 ntTSL 2 BASIC6.84□□□□□ -1.31
CHD4Q14839 ATP5J-207ENST00000457143 589 ntTSL 2 BASIC6.84□□□□□ -1.31
CHD4Q14839 AL603882.1-201ENST00000463059 681 ntBASIC6.84□□□□□ -1.31
CHD4Q14839 STK26-205ENST00000496850 1186 ntTSL 1 (best) BASIC6.84□□□□□ -1.31
CHD4Q14839 AL391358.1-201ENST00000605342 190 ntBASIC6.84□□□□□ -1.31
CHD4Q14839 Metazoa_SRP.207-201ENST00000612254 285 ntBASIC6.84□□□□□ -1.31
CHD4Q14839 ENTPD1-AS1-202ENST00000416301 4241 ntTSL 2 BASIC6.84□□□□□ -1.31
CHD4Q14839 MIR4500HG-201ENST00000436290 1675 ntTSL 1 (best) BASIC6.84□□□□□ -1.31
CHD4Q14839 LINC02097-201ENST00000419257 2063 ntTSL 1 (best) BASIC6.84□□□□□ -1.31
CHD4Q14839 AMPD1-203ENST00000520113 2375 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.84□□□□□ -1.31
CHD4Q14839 ZBTB26-202ENST00000373656 4443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.84□□□□□ -1.31
CHD4Q14839 AC078842.2-201ENST00000447529 1835 ntTSL 2 BASIC6.84□□□□□ -1.31
CHD4Q14839 EYA3-204ENST00000436342 5943 ntTSL 2 BASIC6.84□□□□□ -1.31
CHD4Q14839 LDAH-211ENST00000541941 3807 ntTSL 2 BASIC6.84□□□□□ -1.31
CHD4Q14839 TCP11-207ENST00000418521 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.84□□□□□ -1.32
CHD4Q14839 ZNF490-201ENST00000311437 4237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.84□□□□□ -1.32
CHD4Q14839 LRRN3-201ENST00000308478 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.84□□□□□ -1.32
CHD4Q14839 FSTL5-202ENST00000379164 4757 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC6.84□□□□□ -1.32
CHD4Q14839 RNA5SP326-201ENST00000363209 110 ntBASIC6.84□□□□□ -1.32
CHD4Q14839 LINC01731-201ENST00000428035 420 ntTSL 3 BASIC6.84□□□□□ -1.32
CHD4Q14839 BMS1P19-201ENST00000433925 393 ntBASIC6.84□□□□□ -1.32
CHD4Q14839 AL365271.1-201ENST00000448909 603 ntTSL 3 BASIC6.84□□□□□ -1.32
CHD4Q14839 CPSF7-220ENST00000541963 549 ntTSL 4 BASIC6.84□□□□□ -1.32
CHD4Q14839 DPPA3P2-202ENST00000557188 1219 ntBASIC6.84□□□□□ -1.32
CHD4Q14839 AL590392.1-201ENST00000604960 446 ntBASIC6.84□□□□□ -1.32
CHD4Q14839 MIR325HG-202ENST00000626832 598 ntTSL 4 BASIC6.84□□□□□ -1.32
CHD4Q14839 RASGRP1-209ENST00000559830 1910 ntTSL 1 (best) BASIC6.83□□□□□ -1.32
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CHD4Q14839 LRRC49-223ENST00000560369 2586 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC6.83□□□□□ -1.32
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CHD4Q14839 LINC00824-203ENST00000520206 2055 ntTSL 1 (best) BASIC6.83□□□□□ -1.32
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CHD4Q14839 TNFSF4-201ENST00000281834 3470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.83□□□□□ -1.32
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CHD4Q14839 PARP15-206ENST00000493645 1311 ntTSL 1 (best) BASIC6.83□□□□□ -1.32
CHD4Q14839 PRUNE2-201ENST00000223609 2697 ntTSL 2 BASIC6.83□□□□□ -1.32
CHD4Q14839 LMNTD1-207ENST00000539744 1729 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.82□□□□□ -1.32
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CHD4Q14839 MGAM-208ENST00000549489 6525 ntTSL 1 (best) BASIC6.82□□□□□ -1.32
CHD4Q14839 CTNND1-233ENST00000532787 5751 ntTSL 1 (best) BASIC6.82□□□□□ -1.32
CHD4Q14839 XIAP-205ENST00000434753 8415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.82□□□□□ -1.32
CHD4Q14839 TMPRSS15-201ENST00000284885 3947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.82□□□□□ -1.32
CHD4Q14839 OR5AN1-201ENST00000313940 1037 ntAPPRIS P1 BASIC6.82□□□□□ -1.32
CHD4Q14839 ELSPBP1-201ENST00000339841 1052 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.82□□□□□ -1.32
CHD4Q14839 C1orf105-203ENST00000367727 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.82□□□□□ -1.32
CHD4Q14839 OR5L2-201ENST00000378397 936 ntAPPRIS P1 BASIC6.82□□□□□ -1.32
CHD4Q14839 RPL23AP17-201ENST00000401064 499 ntBASIC6.82□□□□□ -1.32
CHD4Q14839 RN7SKP151-201ENST00000410230 316 ntBASIC6.82□□□□□ -1.32
CHD4Q14839 AC118345.1-201ENST00000411785 366 ntTSL 3 BASIC6.82□□□□□ -1.32
CHD4Q14839 AC092570.3-201ENST00000420113 693 ntBASIC6.82□□□□□ -1.32
CHD4Q14839 MACROD2-IT1-201ENST00000448536 665 ntTSL 5 BASIC6.82□□□□□ -1.32
CHD4Q14839 LINC01456-201ENST00000453902 708 ntTSL 3 BASIC6.82□□□□□ -1.32
CHD4Q14839 MOCS2-205ENST00000508922 1210 ntTSL 5 BASIC6.82□□□□□ -1.32
CHD4Q14839 TATDN1-202ENST00000517678 815 ntTSL 3 BASIC6.82□□□□□ -1.32
CHD4Q14839 TATDN1-206ENST00000519548 889 ntTSL 1 (best) BASIC6.82□□□□□ -1.32
CHD4Q14839 AC024681.2-201ENST00000523525 204 ntTSL 5 BASIC6.82□□□□□ -1.32
CHD4Q14839 AF233439.1-201ENST00000526235 401 ntTSL 3 BASIC6.82□□□□□ -1.32
CHD4Q14839 AC087783.1-201ENST00000527135 564 ntTSL 4 BASIC6.82□□□□□ -1.32
CHD4Q14839 MOCS2-209ENST00000582677 741 ntTSL 5 BASIC6.82□□□□□ -1.32
CHD4Q14839 AL034374.2-201ENST00000605281 548 ntBASIC6.82□□□□□ -1.32
CHD4Q14839 AJ009632.2-207ENST00000634659 527 ntTSL 5 BASIC6.82□□□□□ -1.32
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