Protein–RNA interactions for Protein: Q14714

SSPN, Sarcospan, humanhuman

Predictions only

Length 243 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SSPNQ14714 GLYATL1-219ENST00000612196 909 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.31□□□□□ -1.4
SSPNQ14714 AC004223.4-201ENST00000612426 332 ntBASIC6.31□□□□□ -1.4
SSPNQ14714 MIR7109-201ENST00000613748 65 ntBASIC6.31□□□□□ -1.4
SSPNQ14714 AC026368.1-201ENST00000614934 690 ntBASIC6.31□□□□□ -1.4
SSPNQ14714 C8orf59-212ENST00000615697 483 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.31□□□□□ -1.4
SSPNQ14714 AL353651.2-201ENST00000635706 559 ntTSL 5 BASIC6.31□□□□□ -1.4
SSPNQ14714 OGT-202ENST00000373719 5461 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.31□□□□□ -1.4
SSPNQ14714 HOXD8-202ENST00000429017 1608 ntTSL 2 BASIC6.31□□□□□ -1.4
SSPNQ14714 ZBTB21-205ENST00000398511 5608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.31□□□□□ -1.4
SSPNQ14714 ZNF652-201ENST00000362063 5988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.31□□□□□ -1.4
SSPNQ14714 C16orf62-202ENST00000417362 3115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.31□□□□□ -1.4
SSPNQ14714 UTY-216ENST00000624098 3636 ntTSL 1 (best) BASIC6.31□□□□□ -1.4
SSPNQ14714 C1QTNF7-201ENST00000295297 4516 ntTSL 1 (best) BASIC6.31□□□□□ -1.4
SSPNQ14714 AC034111.1-201ENST00000562143 3770 ntBASIC6.31□□□□□ -1.4
SSPNQ14714 AC123769.2-201ENST00000624332 5984 ntBASIC6.31□□□□□ -1.4
SSPNQ14714 LINC01722-201ENST00000456265 3033 ntTSL 1 (best) BASIC6.31□□□□□ -1.4
SSPNQ14714 PSD3-218ENST00000523619 8145 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.31□□□□□ -1.4
SSPNQ14714 AC005614.1-201ENST00000598952 3653 ntBASIC6.3□□□□□ -1.4
SSPNQ14714 SF3B1-201ENST00000335508 6526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.3□□□□□ -1.4
SSPNQ14714 ZC3H14-206ENST00000406216 1341 ntTSL 3 BASIC6.3□□□□□ -1.4
SSPNQ14714 NEK2P4-201ENST00000425793 1329 ntBASIC6.3□□□□□ -1.4
SSPNQ14714 DOCK9-216ENST00000627024 4096 ntTSL 2 BASIC6.3□□□□□ -1.4
SSPNQ14714 NAALAD2-201ENST00000321955 3035 ntTSL 2 BASIC6.3□□□□□ -1.4
SSPNQ14714 CTNND1-216ENST00000527467 5071 ntTSL 1 (best) BASIC6.3□□□□□ -1.4
SSPNQ14714 CTNND1-229ENST00000531014 5053 ntTSL 1 (best) BASIC6.3□□□□□ -1.4
SSPNQ14714 CSNK1G3-205ENST00000510842 1979 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC6.3□□□□□ -1.4
SSPNQ14714 PAICS-208ENST00000514888 3340 ntTSL 1 (best) BASIC6.3□□□□□ -1.4
SSPNQ14714 IFNK-201ENST00000276943 1140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.3□□□□□ -1.4
SSPNQ14714 TIA1-201ENST00000282574 3823 ntTSL 5 BASIC6.3□□□□□ -1.4
SSPNQ14714 OR1Q1-201ENST00000297913 945 ntAPPRIS P1 BASIC6.3□□□□□ -1.4
SSPNQ14714 OR2G3-201ENST00000320002 930 ntAPPRIS P1 BASIC6.3□□□□□ -1.4
SSPNQ14714 MIR621-201ENST00000384919 96 ntBASIC6.3□□□□□ -1.4
SSPNQ14714 PDE11A-203ENST00000409504 2102 ntTSL 1 (best) BASIC6.3□□□□□ -1.4
SSPNQ14714 LYST-AS1-201ENST00000412098 521 ntTSL 3 BASIC6.3□□□□□ -1.4
SSPNQ14714 NUP35P2-201ENST00000416748 943 ntBASIC6.3□□□□□ -1.4
SSPNQ14714 RPL7P30-201ENST00000420888 709 ntBASIC6.3□□□□□ -1.4
SSPNQ14714 LINC00352-201ENST00000425800 552 ntTSL 3 BASIC6.3□□□□□ -1.4
SSPNQ14714 AC239367.3-201ENST00000428996 814 ntBASIC6.3□□□□□ -1.4
SSPNQ14714 AL158832.1-201ENST00000429661 406 ntTSL 3 BASIC6.3□□□□□ -1.4
SSPNQ14714 MTND1P2-201ENST00000430604 821 ntBASIC6.3□□□□□ -1.4
SSPNQ14714 USP9YP35-201ENST00000435696 412 ntBASIC6.3□□□□□ -1.4
SSPNQ14714 LINC00328-2P-201ENST00000436585 219 ntBASIC6.3□□□□□ -1.4
SSPNQ14714 AL139237.2-201ENST00000438454 493 ntTSL 3 BASIC6.3□□□□□ -1.4
SSPNQ14714 COL11A2P1-205ENST00000441798 676 ntBASIC6.3□□□□□ -1.4
SSPNQ14714 AL138830.2-202ENST00000446358 786 ntTSL 2 BASIC6.3□□□□□ -1.4
SSPNQ14714 ZNF114P1-201ENST00000453500 292 ntBASIC6.3□□□□□ -1.4
SSPNQ14714 AC236972.4-201ENST00000458091 963 ntBASIC6.3□□□□□ -1.4
SSPNQ14714 AC104233.1-201ENST00000458107 339 ntTSL 5 BASIC6.3□□□□□ -1.4
SSPNQ14714 AC135999.1-201ENST00000478962 479 ntBASIC6.3□□□□□ -1.4
SSPNQ14714 AC026826.1-201ENST00000493002 361 ntBASIC6.3□□□□□ -1.4
SSPNQ14714 STARD4-AS1-201ENST00000500779 5525 ntTSL 1 (best) BASIC6.3□□□□□ -1.4
SSPNQ14714 AC020900.1-201ENST00000502568 565 ntTSL 4 BASIC6.3□□□□□ -1.4
SSPNQ14714 MYL12BP2-201ENST00000503948 512 ntBASIC6.3□□□□□ -1.4
SSPNQ14714 PRDX4P1-201ENST00000507189 574 ntBASIC6.3□□□□□ -1.4
SSPNQ14714 AC138409.2-202ENST00000507274 458 ntBASIC6.3□□□□□ -1.4
SSPNQ14714 SETP21-201ENST00000514799 892 ntBASIC6.3□□□□□ -1.4
SSPNQ14714 AL358937.1-201ENST00000524512 336 ntTSL 2 BASIC6.3□□□□□ -1.4
SSPNQ14714 AP003733.3-201ENST00000524942 788 ntTSL 2 BASIC6.3□□□□□ -1.4
SSPNQ14714 CTAGE1-202ENST00000525417 1267 ntAPPRIS ALT2 BASIC6.3□□□□□ -1.4
SSPNQ14714 ALG9-IT1-201ENST00000531305 684 ntTSL 3 BASIC6.3□□□□□ -1.4
SSPNQ14714 OR4A43P-201ENST00000532938 908 ntBASIC6.3□□□□□ -1.4
SSPNQ14714 HNRNPCP1-201ENST00000556181 766 ntBASIC6.3□□□□□ -1.4
SSPNQ14714 SRP54-AS1-203ENST00000556355 603 ntTSL 5 BASIC6.3□□□□□ -1.4
SSPNQ14714 ANP32BP3-201ENST00000559213 706 ntBASIC6.3□□□□□ -1.4
SSPNQ14714 NPM1P47-201ENST00000560843 856 ntBASIC6.3□□□□□ -1.4
SSPNQ14714 LINC00907-202ENST00000585639 915 ntTSL 1 (best) BASIC6.3□□□□□ -1.4
SSPNQ14714 TTN-AS1-245ENST00000592182 749 ntTSL 5 BASIC6.3□□□□□ -1.4
SSPNQ14714 AL008582.1-201ENST00000609612 442 ntBASIC6.3□□□□□ -1.4
SSPNQ14714 ANKRD36C-207ENST00000612359 650 ntTSL 1 (best) BASIC6.3□□□□□ -1.4
SSPNQ14714 EDRF1-AS1-210ENST00000613304 569 ntTSL 5 BASIC6.3□□□□□ -1.4
SSPNQ14714 SOX2OT_exon1.1-201ENST00000614902 232 ntBASIC6.3□□□□□ -1.4
SSPNQ14714 Metazoa_SRP.129-201ENST00000619776 251 ntBASIC6.3□□□□□ -1.4
SSPNQ14714 RSU1P2-204ENST00000619977 1240 ntTSL 1 (best) BASIC6.3□□□□□ -1.4
SSPNQ14714 AC092794.2-201ENST00000620933 563 ntBASIC6.3□□□□□ -1.4
SSPNQ14714 AC183089.2-201ENST00000637931 916 ntBASIC6.3□□□□□ -1.4
SSPNQ14714 AC132825.8-201ENST00000640783 297 ntBASIC6.3□□□□□ -1.4
SSPNQ14714 CD86-203ENST00000393627 1405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.3□□□□□ -1.4
SSPNQ14714 BEST1-202ENST00000449131 4267 ntTSL 1 (best) BASIC6.3□□□□□ -1.4
SSPNQ14714 CD164-207ENST00000504373 1402 ntTSL 1 (best) BASIC6.3□□□□□ -1.4
SSPNQ14714 BTK-209ENST00000618050 2417 ntTSL 5 BASIC6.3□□□□□ -1.4
SSPNQ14714 SPINK5-203ENST00000398454 2915 ntTSL 1 (best) BASIC6.3□□□□□ -1.4
SSPNQ14714 CEACAM1-207ENST00000403444 3427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.3□□□□□ -1.4
SSPNQ14714 STS-201ENST00000217961 6521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.3□□□□□ -1.4
SSPNQ14714 SLAMF6-203ENST00000368059 2743 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.3□□□□□ -1.4
SSPNQ14714 AC020633.1-201ENST00000468439 2247 ntBASIC6.3□□□□□ -1.4
SSPNQ14714 CDH12-201ENST00000382254 4164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.3□□□□□ -1.4
SSPNQ14714 KMT2C-201ENST00000262189 16862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.3□□□□□ -1.4
SSPNQ14714 KMT2C-202ENST00000355193 16858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.3□□□□□ -1.4
SSPNQ14714 DLG2-203ENST00000376104 5139 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.3□□□□□ -1.4
SSPNQ14714 PCDH11Y-204ENST00000400457 9039 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC6.3□□□□□ -1.4
SSPNQ14714 ZNF214-201ENST00000278314 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.3□□□□□ -1.4
SSPNQ14714 LINC00891-201ENST00000627173 4113 ntTSL 2 BASIC6.3□□□□□ -1.4
SSPNQ14714 BRD8-204ENST00000411594 2967 ntTSL 5 BASIC6.3□□□□□ -1.4
SSPNQ14714 HELLS-205ENST00000394036 3131 ntTSL 1 (best) BASIC6.3□□□□□ -1.4
SSPNQ14714 LCP1-202ENST00000398576 3944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.3□□□□□ -1.4
SSPNQ14714 SRGAP1-206ENST00000543397 5652 ntTSL 1 (best) BASIC6.3□□□□□ -1.4
SSPNQ14714 TMBIM6-209ENST00000547798 2494 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC6.3□□□□□ -1.4
SSPNQ14714 LINC01505-203ENST00000435485 1686 ntTSL 5 BASIC6.3□□□□□ -1.4
SSPNQ14714 ALCAM-207ENST00000486979 1818 ntTSL 5 BASIC6.29□□□□□ -1.4
SSPNQ14714 LINC00907-205ENST00000589068 1812 ntTSL 2 BASIC6.29□□□□□ -1.4
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 76 ms