Protein–RNA interactions for Protein: Q14028

CNGB1, Cyclic nucleotide-gated cation channel beta-1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,251 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CNGB1Q14028 AC009498.1-201ENST00000419860 541 ntTSL 4 BASIC7.64□□□□□ -1.19
CNGB1Q14028 TNPO1P1-201ENST00000423641 1138 ntBASIC7.64□□□□□ -1.19
CNGB1Q14028 NAP1L4P2-201ENST00000425958 899 ntBASIC7.64□□□□□ -1.19
CNGB1Q14028 LINC01953-201ENST00000426870 717 ntTSL 5 BASIC7.64□□□□□ -1.19
CNGB1Q14028 AC092168.2-201ENST00000430586 717 ntTSL 3 BASIC7.64□□□□□ -1.19
CNGB1Q14028 AC019185.1-201ENST00000442718 389 ntBASIC7.64□□□□□ -1.19
CNGB1Q14028 MTND2P3-201ENST00000452458 470 ntBASIC7.64□□□□□ -1.19
CNGB1Q14028 AL356309.2-201ENST00000454034 719 ntTSL 5 BASIC7.64□□□□□ -1.19
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CNGB1Q14028 LINC01473-203ENST00000456653 1079 ntTSL 3 BASIC7.64□□□□□ -1.19
CNGB1Q14028 RN7SL174P-201ENST00000475578 289 ntBASIC7.64□□□□□ -1.19
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CNGB1Q14028 AC114954.1-201ENST00000506656 820 ntTSL 3 BASIC7.64□□□□□ -1.19
CNGB1Q14028 AC074087.1-201ENST00000512059 724 ntBASIC7.64□□□□□ -1.19
CNGB1Q14028 AC011389.1-203ENST00000513790 573 ntTSL 4 BASIC7.64□□□□□ -1.19
CNGB1Q14028 H2AFV-208ENST00000521529 439 ntTSL 5 BASIC7.64□□□□□ -1.19
CNGB1Q14028 IGKV3D-34-201ENST00000522638 302 ntBASIC7.64□□□□□ -1.19
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CNGB1Q14028 AL035587.1-202ENST00000607218 984 ntTSL 3 BASIC7.64□□□□□ -1.19
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CNGB1Q14028 AC253576.2-201ENST00000618815 580 ntBASIC7.64□□□□□ -1.19
CNGB1Q14028 SREK1-203ENST00000380918 2433 ntTSL 1 (best) BASIC7.64□□□□□ -1.19
CNGB1Q14028 AC099329.2-203ENST00000471537 3605 ntTSL 1 (best) BASIC7.64□□□□□ -1.19
CNGB1Q14028 RFC1-202ENST00000381897 4886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.64□□□□□ -1.19
CNGB1Q14028 ZNF559-201ENST00000317221 2732 ntTSL 2 BASIC7.64□□□□□ -1.19
CNGB1Q14028 LRRC36-202ENST00000435835 1765 ntTSL 2 BASIC7.64□□□□□ -1.19
CNGB1Q14028 CARD6-201ENST00000254691 4221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.63□□□□□ -1.19
CNGB1Q14028 AC093671.1-201ENST00000624981 2929 ntBASIC7.63□□□□□ -1.19
CNGB1Q14028 CPED1-203ENST00000423795 2189 ntTSL 1 (best) BASIC7.63□□□□□ -1.19
CNGB1Q14028 ZNF845-201ENST00000458035 4311 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC7.63□□□□□ -1.19
CNGB1Q14028 AC067956.1-201ENST00000414512 2062 ntTSL 1 (best) BASIC7.63□□□□□ -1.19
CNGB1Q14028 EEF1A1P33-201ENST00000554413 1362 ntBASIC7.63□□□□□ -1.19
CNGB1Q14028 ZNF681-201ENST00000402377 6497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.63□□□□□ -1.19
CNGB1Q14028 OR5T3-201ENST00000303059 1023 ntBASIC7.63□□□□□ -1.19
CNGB1Q14028 AL121886.1-201ENST00000358609 435 ntBASIC7.63□□□□□ -1.19
CNGB1Q14028 RN7SKP28-201ENST00000364770 305 ntBASIC7.63□□□□□ -1.19
CNGB1Q14028 SNORA17A-201ENST00000391185 133 ntBASIC7.63□□□□□ -1.19
CNGB1Q14028 DNAJA1P3-201ENST00000399417 1194 ntBASIC7.63□□□□□ -1.19
CNGB1Q14028 LINC00446-201ENST00000414743 459 ntTSL 5 BASIC7.63□□□□□ -1.19
CNGB1Q14028 RPL34P3-201ENST00000421454 338 ntBASIC7.63□□□□□ -1.19
CNGB1Q14028 AL390243.1-201ENST00000422038 708 ntTSL 2 BASIC7.63□□□□□ -1.19
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CNGB1Q14028 AP006216.2-201ENST00000457746 333 ntTSL 5 BASIC7.63□□□□□ -1.19
CNGB1Q14028 AC109992.2-201ENST00000460977 765 ntTSL 3 BASIC7.63□□□□□ -1.19
CNGB1Q14028 RN7SL717P-201ENST00000478343 297 ntBASIC7.63□□□□□ -1.19
CNGB1Q14028 LINC00518-204ENST00000491317 1228 ntTSL 2 BASIC7.63□□□□□ -1.19
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CNGB1Q14028 RNA5SP362-201ENST00000516048 118 ntBASIC7.63□□□□□ -1.19
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CNGB1Q14028 AC025278.1-201ENST00000593558 515 ntTSL 2 BASIC7.63□□□□□ -1.19
CNGB1Q14028 AC006115.2-201ENST00000596823 202 ntBASIC7.63□□□□□ -1.19
CNGB1Q14028 AL356580.1-201ENST00000604129 159 ntTSL 5 BASIC7.63□□□□□ -1.19
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CNGB1Q14028 AC022893.1-201ENST00000517664 3549 ntTSL 2 BASIC7.63□□□□□ -1.19
CNGB1Q14028 RNF145-206ENST00000519865 3478 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.63□□□□□ -1.19
CNGB1Q14028 EPS8-207ENST00000540613 2204 ntTSL 2 BASIC7.63□□□□□ -1.19
CNGB1Q14028 IFI16-205ENST00000368132 2704 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.63□□□□□ -1.19
CNGB1Q14028 AMY1C-201ENST00000370079 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.63□□□□□ -1.19
CNGB1Q14028 DSPP-202ENST00000399271 4331 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.63□□□□□ -1.19
CNGB1Q14028 AC027279.4-201ENST00000624371 2072 ntBASIC7.63□□□□□ -1.19
CNGB1Q14028 RAB30-216ENST00000612684 9783 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC7.63□□□□□ -1.19
CNGB1Q14028 C3orf35-203ENST00000425564 1364 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.62□□□□□ -1.19
CNGB1Q14028 GRAMD2B-202ENST00000502348 1363 ntTSL 2 BASIC7.62□□□□□ -1.19
CNGB1Q14028 ANKS1B-216ENST00000549558 2268 ntTSL 1 (best) BASIC7.62□□□□□ -1.19
CNGB1Q14028 PNISR-202ENST00000438806 3142 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.62□□□□□ -1.19
CNGB1Q14028 AP005212.5-201ENST00000577614 3505 ntTSL 5 BASIC7.62□□□□□ -1.19
CNGB1Q14028 OR1L4-201ENST00000259466 936 ntAPPRIS P1 BASIC7.62□□□□□ -1.19
CNGB1Q14028 RNA5SP46-201ENST00000362370 120 ntBASIC7.62□□□□□ -1.19
CNGB1Q14028 DYDC1-202ENST00000372204 750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.62□□□□□ -1.19
CNGB1Q14028 SMARCA2-207ENST00000382186 955 ntTSL 3 BASIC7.62□□□□□ -1.19
CNGB1Q14028 AL009179.1-201ENST00000406085 265 ntBASIC7.62□□□□□ -1.19
CNGB1Q14028 AL606970.4-201ENST00000424343 455 ntTSL 2 BASIC7.62□□□□□ -1.19
CNGB1Q14028 MTCYBP32-201ENST00000427945 1084 ntBASIC7.62□□□□□ -1.19
CNGB1Q14028 SLC36A1-202ENST00000429484 977 ntTSL 1 (best) BASIC7.62□□□□□ -1.19
CNGB1Q14028 AC073072.2-201ENST00000447425 348 ntBASIC7.62□□□□□ -1.19
CNGB1Q14028 RPL5P16-201ENST00000471467 790 ntBASIC7.62□□□□□ -1.19
CNGB1Q14028 LINC02432-203ENST00000511213 719 ntTSL 2 BASIC7.62□□□□□ -1.19
CNGB1Q14028 AC074255.1-201ENST00000511259 501 ntBASIC7.62□□□□□ -1.19
CNGB1Q14028 RN7SKP253-201ENST00000516424 309 ntBASIC7.62□□□□□ -1.19
CNGB1Q14028 AC022404.1-201ENST00000555320 273 ntBASIC7.62□□□□□ -1.19
CNGB1Q14028 LINC00871-202ENST00000556071 554 ntTSL 3 BASIC7.62□□□□□ -1.19
CNGB1Q14028 HNRNPCP1-201ENST00000556181 766 ntBASIC7.62□□□□□ -1.19
CNGB1Q14028 ULK4P1-201ENST00000564495 875 ntTSL 1 (best) BASIC7.62□□□□□ -1.19
CNGB1Q14028 AC007906.1-201ENST00000568648 510 ntTSL 5 BASIC7.62□□□□□ -1.19
CNGB1Q14028 ULK4P2-204ENST00000569682 798 ntTSL 1 (best) BASIC7.62□□□□□ -1.19
CNGB1Q14028 AC010547.6-201ENST00000571789 193 ntBASIC7.62□□□□□ -1.19
CNGB1Q14028 AC104996.1-201ENST00000583250 591 ntTSL 5 BASIC7.62□□□□□ -1.19
CNGB1Q14028 AC010463.2-201ENST00000597592 661 ntTSL 5 BASIC7.62□□□□□ -1.19
CNGB1Q14028 LINC01125-220ENST00000599501 965 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.62□□□□□ -1.19
CNGB1Q14028 AP000769.2-201ENST00000602344 396 ntBASIC7.62□□□□□ -1.19
CNGB1Q14028 MIR6862-1-201ENST00000613016 70 ntBASIC7.62□□□□□ -1.19
CNGB1Q14028 MIR6862-2-201ENST00000614755 70 ntBASIC7.62□□□□□ -1.19
CNGB1Q14028 AL391425.1-202ENST00000617518 774 ntTSL 5 BASIC7.62□□□□□ -1.19
CNGB1Q14028 AC079298.3-201ENST00000624941 977 ntTSL 3 BASIC7.62□□□□□ -1.19
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