Protein–RNA interactions for Protein: Q13634

CDH18, Cadherin-18, humanhuman

Predictions only

Length 790 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDH18Q13634 RNU1-77P-201ENST00000390868 162 ntBASIC5.65□□□□□ -1.5
CDH18Q13634 AP000534.2-201ENST00000412729 568 ntBASIC5.65□□□□□ -1.5
CDH18Q13634 GABARAPL3-201ENST00000412799 354 ntBASIC5.65□□□□□ -1.5
CDH18Q13634 AC007161.1-204ENST00000423039 460 ntBASIC5.65□□□□□ -1.5
CDH18Q13634 LINC02096-201ENST00000445035 953 ntTSL 5 BASIC5.65□□□□□ -1.5
CDH18Q13634 IGBP1P3-201ENST00000447449 1000 ntBASIC5.65□□□□□ -1.5
CDH18Q13634 AC034195.1-203ENST00000455703 728 ntTSL 2 BASIC5.65□□□□□ -1.5
CDH18Q13634 RPL7P45-201ENST00000455851 743 ntBASIC5.65□□□□□ -1.5
CDH18Q13634 AC110749.1-201ENST00000462007 357 ntBASIC5.65□□□□□ -1.5
CDH18Q13634 RPL7P39-201ENST00000481157 744 ntBASIC5.65□□□□□ -1.5
CDH18Q13634 OR2A3P-201ENST00000493774 953 ntBASIC5.65□□□□□ -1.5
CDH18Q13634 RN7SL447P-201ENST00000494711 245 ntBASIC5.65□□□□□ -1.5
CDH18Q13634 AC126768.1-201ENST00000511698 490 ntTSL 3 BASIC5.65□□□□□ -1.5
CDH18Q13634 GAPDHP62-201ENST00000515313 990 ntBASIC5.65□□□□□ -1.5
CDH18Q13634 AC010226.1-203ENST00000515570 765 ntTSL 2 BASIC5.65□□□□□ -1.5
CDH18Q13634 AC097173.2-201ENST00000518701 474 ntTSL 3 BASIC5.65□□□□□ -1.5
CDH18Q13634 AC122688.1-201ENST00000541494 223 ntBASIC5.65□□□□□ -1.5
CDH18Q13634 AC025580.2-202ENST00000558536 715 ntTSL 3 BASIC5.65□□□□□ -1.5
CDH18Q13634 AC025271.2-201ENST00000566990 800 ntTSL 3 BASIC5.65□□□□□ -1.5
CDH18Q13634 AC000068.2-201ENST00000608816 460 ntBASIC5.65□□□□□ -1.5
CDH18Q13634 RALGAPB-202ENST00000397040 8435 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.65□□□□□ -1.51
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CDH18Q13634 LINC00343-202ENST00000415294 1320 ntTSL 5 BASIC5.65□□□□□ -1.51
CDH18Q13634 AC090220.1-201ENST00000593078 1699 ntBASIC5.65□□□□□ -1.51
CDH18Q13634 PTPRZ1-201ENST00000393386 8175 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.65□□□□□ -1.51
CDH18Q13634 ERP27-201ENST00000266397 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.65□□□□□ -1.51
CDH18Q13634 GVINP1-202ENST00000531871 7271 ntBASIC5.65□□□□□ -1.51
CDH18Q13634 ZRANB3-211ENST00000619650 2494 ntTSL 5 BASIC5.65□□□□□ -1.51
CDH18Q13634 OR6C4-203ENST00000641851 4989 ntAPPRIS P1 BASIC5.65□□□□□ -1.51
CDH18Q13634 LINC01020-202ENST00000508201 1800 ntTSL 1 (best) BASIC5.64□□□□□ -1.51
CDH18Q13634 CCR2-202ENST00000400888 2232 ntTSL 1 (best) BASIC5.64□□□□□ -1.51
CDH18Q13634 BPIFC-201ENST00000300399 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.64□□□□□ -1.51
CDH18Q13634 MUC12-206ENST00000536621 16321 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC5.64□□□□□ -1.51
CDH18Q13634 LYVE1-201ENST00000256178 3273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.64□□□□□ -1.51
CDH18Q13634 IGF1-202ENST00000337514 7359 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.64□□□□□ -1.51
CDH18Q13634 AGO3-203ENST00000373191 19687 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.64□□□□□ -1.51
CDH18Q13634 ACADSB-201ENST00000358776 5859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.64□□□□□ -1.51
CDH18Q13634 OR8H3-201ENST00000313472 939 ntAPPRIS P1 BASIC5.64□□□□□ -1.51
CDH18Q13634 SPRR2D-201ENST00000360379 682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.64□□□□□ -1.51
CDH18Q13634 GPR52-201ENST00000367685 1088 ntAPPRIS P1 BASIC5.64□□□□□ -1.51
CDH18Q13634 SH3BGR-203ENST00000380634 816 ntTSL 5 BASIC5.64□□□□□ -1.51
CDH18Q13634 TRAJ25-201ENST00000390512 60 ntAPPRIS P1 BASIC5.64□□□□□ -1.51
CDH18Q13634 MIR3681HG-202ENST00000412606 578 ntTSL 5 BASIC5.64□□□□□ -1.51
CDH18Q13634 RPSAP35-201ENST00000413753 818 ntBASIC5.64□□□□□ -1.51
CDH18Q13634 GNRH1-202ENST00000421054 470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.64□□□□□ -1.51
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CDH18Q13634 AC105399.1-202ENST00000447303 205 ntBASIC5.64□□□□□ -1.51
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CDH18Q13634 LINC02421-201ENST00000542219 3135 ntTSL 1 (best) BASIC5.64□□□□□ -1.51
CDH18Q13634 NCOA4P2-201ENST00000340589 1813 ntBASIC5.64□□□□□ -1.51
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CDH18Q13634 ALCAM-205ENST00000472644 4189 ntTSL 1 (best) BASIC5.63□□□□□ -1.51
CDH18Q13634 SYTL2-208ENST00000524452 2733 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC5.63□□□□□ -1.51
CDH18Q13634 AC018628.1-201ENST00000624147 3819 ntBASIC5.63□□□□□ -1.51
CDH18Q13634 MYBPC1-221ENST00000551300 3934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.63□□□□□ -1.51
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CDH18Q13634 LINC01153-201ENST00000429809 2864 ntTSL 1 (best) BASIC5.63□□□□□ -1.51
CDH18Q13634 OTUD4-202ENST00000454497 7069 ntTSL 2 BASIC5.63□□□□□ -1.51
CDH18Q13634 GRAMD1C-208ENST00000472026 1876 ntTSL 2 BASIC5.63□□□□□ -1.51
CDH18Q13634 ZC2HC1B-201ENST00000237275 1002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.63□□□□□ -1.51
CDH18Q13634 RNU11-201ENST00000387069 134 ntBASIC5.63□□□□□ -1.51
CDH18Q13634 TRAV9-1-201ENST00000390431 338 ntAPPRIS P1 BASIC5.63□□□□□ -1.51
CDH18Q13634 MTATP6P19-201ENST00000413797 659 ntBASIC5.63□□□□□ -1.51
CDH18Q13634 Z68694.1-201ENST00000413929 841 ntBASIC5.63□□□□□ -1.51
CDH18Q13634 AL133325.1-201ENST00000421090 382 ntBASIC5.63□□□□□ -1.51
CDH18Q13634 RIMKLBP2-201ENST00000424737 654 ntBASIC5.63□□□□□ -1.51
CDH18Q13634 RPL7P56-201ENST00000429441 717 ntBASIC5.63□□□□□ -1.51
CDH18Q13634 ATP13A4-AS1-202ENST00000431512 394 ntTSL 3 BASIC5.63□□□□□ -1.51
CDH18Q13634 LINC01456-201ENST00000453902 708 ntTSL 3 BASIC5.63□□□□□ -1.51
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