Protein–RNA interactions for Protein: Q13342

SP140, Nuclear body protein SP140, humanhuman

Predictions only

Length 867 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SP140Q13342 PCBP1-AS1-232ENST00000442040 1111 ntTSL 3 BASIC6.07□□□□□ -1.44
SP140Q13342 LINC00867-203ENST00000445161 580 ntTSL 2 BASIC6.07□□□□□ -1.44
SP140Q13342 HIGD1AP16-201ENST00000450986 258 ntBASIC6.07□□□□□ -1.44
SP140Q13342 AC095033.1-201ENST00000451611 1096 ntTSL 1 (best) BASIC6.07□□□□□ -1.44
SP140Q13342 AL133351.3-201ENST00000454998 193 ntBASIC6.07□□□□□ -1.44
SP140Q13342 SEPT7P3-201ENST00000455017 621 ntBASIC6.07□□□□□ -1.44
SP140Q13342 H3F3AP5-201ENST00000475267 429 ntBASIC6.07□□□□□ -1.44
SP140Q13342 PLSCR5-202ENST00000482567 1018 ntTSL 1 (best) BASIC6.07□□□□□ -1.44
SP140Q13342 CCDC169-211ENST00000503173 837 ntTSL 1 (best) BASIC6.07□□□□□ -1.44
SP140Q13342 LINC02114-201ENST00000503757 801 ntTSL 1 (best) BASIC6.07□□□□□ -1.44
SP140Q13342 AC104619.2-201ENST00000514293 646 ntTSL 3 BASIC6.07□□□□□ -1.44
SP140Q13342 IGHV7-34-1-201ENST00000519200 350 ntBASIC6.07□□□□□ -1.44
SP140Q13342 AC018442.2-201ENST00000523658 648 ntTSL 3 BASIC6.07□□□□□ -1.44
SP140Q13342 ZFPM2-AS1-207ENST00000524045 987 ntTSL 3 BASIC6.07□□□□□ -1.44
SP140Q13342 AP003100.1-201ENST00000524772 832 ntTSL 3 BASIC6.07□□□□□ -1.44
SP140Q13342 RGS5-208ENST00000530507 851 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC6.07□□□□□ -1.44
SP140Q13342 AC007834.2-201ENST00000536310 343 ntBASIC6.07□□□□□ -1.44
SP140Q13342 AC090607.1-201ENST00000560057 449 ntTSL 3 BASIC6.07□□□□□ -1.44
SP140Q13342 AP003774.2-201ENST00000569737 558 ntTSL 1 (best) BASIC6.07□□□□□ -1.44
SP140Q13342 AC010320.2-202ENST00000599125 595 ntTSL 4 BASIC6.07□□□□□ -1.44
SP140Q13342 MTCO2P22-201ENST00000603246 681 ntBASIC6.07□□□□□ -1.44
SP140Q13342 AC012368.3-201ENST00000604190 219 ntBASIC6.07□□□□□ -1.44
SP140Q13342 SUMO2P14-201ENST00000604488 293 ntBASIC6.07□□□□□ -1.44
SP140Q13342 AL591167.1-201ENST00000607321 456 ntBASIC6.07□□□□□ -1.44
SP140Q13342 AL161457.2-204ENST00000609241 869 ntTSL 5 BASIC6.07□□□□□ -1.44
SP140Q13342 AL133342.1-201ENST00000618168 366 ntTSL 3 BASIC6.07□□□□□ -1.44
SP140Q13342 Metazoa_SRP.81-201ENST00000618466 316 ntBASIC6.07□□□□□ -1.44
SP140Q13342 AL162377.2-201ENST00000624532 337 ntBASIC6.07□□□□□ -1.44
SP140Q13342 AC022021.1-201ENST00000634334 843 ntTSL 5 BASIC6.07□□□□□ -1.44
SP140Q13342 AC068137.4-201ENST00000638485 296 ntBASIC6.07□□□□□ -1.44
SP140Q13342 AC010325.3-201ENST00000641084 394 ntBASIC6.07□□□□□ -1.44
SP140Q13342 OR8G3P-202ENST00000641572 1255 ntBASIC6.07□□□□□ -1.44
SP140Q13342 CD84-208ENST00000534968 7885 ntTSL 1 (best) BASIC6.07□□□□□ -1.44
SP140Q13342 VNN3-207ENST00000425515 1761 ntTSL 1 (best) BASIC6.07□□□□□ -1.44
SP140Q13342 NAMPTP1-201ENST00000440465 2514 ntBASIC6.07□□□□□ -1.44
SP140Q13342 VCAN-203ENST00000343200 9455 ntTSL 1 (best) BASIC6.07□□□□□ -1.44
SP140Q13342 LINC02008-201ENST00000470263 1951 ntTSL 1 (best) BASIC6.07□□□□□ -1.44
SP140Q13342 WASHC4-214ENST00000620430 5807 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC6.07□□□□□ -1.44
SP140Q13342 TAX1BP1-203ENST00000409980 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.07□□□□□ -1.44
SP140Q13342 CYLD-201ENST00000311559 5371 ntTSL 5 BASIC6.07□□□□□ -1.44
SP140Q13342 ZNF192P1-201ENST00000440790 1628 ntTSL 5 BASIC6.07□□□□□ -1.44
SP140Q13342 ZNF610-208ENST00000613461 1643 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.07□□□□□ -1.44
SP140Q13342 CUBN-202ENST00000377833 11949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.06□□□□□ -1.44
SP140Q13342 RNMT-201ENST00000262173 6051 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.06□□□□□ -1.44
SP140Q13342 APBB2-230ENST00000543538 6992 ntTSL 5 BASIC6.06□□□□□ -1.44
SP140Q13342 FCGR1B-209ENST00000616817 1584 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.06□□□□□ -1.44
SP140Q13342 AC068769.1-201ENST00000474767 2426 ntBASIC6.06□□□□□ -1.44
SP140Q13342 AC018717.1-201ENST00000457712 1505 ntBASIC6.06□□□□□ -1.44
SP140Q13342 CFAP221-203ENST00000413369 2801 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.06□□□□□ -1.44
SP140Q13342 PTPN3-202ENST00000374541 6703 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.06□□□□□ -1.44
SP140Q13342 SCGB1D4-201ENST00000358585 439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.06□□□□□ -1.44
SP140Q13342 AL451046.1-201ENST00000406097 534 ntBASIC6.06□□□□□ -1.44
SP140Q13342 RN7SKP151-201ENST00000410230 316 ntBASIC6.06□□□□□ -1.44
SP140Q13342 RNA5SP198-201ENST00000410376 127 ntBASIC6.06□□□□□ -1.44
SP140Q13342 RN7SKP144-201ENST00000411108 279 ntBASIC6.06□□□□□ -1.44
SP140Q13342 RNU2-22P-201ENST00000411266 212 ntBASIC6.06□□□□□ -1.44
SP140Q13342 AC105275.1-201ENST00000417794 491 ntTSL 3 BASIC6.06□□□□□ -1.44
SP140Q13342 AC018878.1-201ENST00000419904 433 ntTSL 3 BASIC6.06□□□□□ -1.44
SP140Q13342 USP9YP21-201ENST00000420603 432 ntBASIC6.06□□□□□ -1.44
SP140Q13342 OR3D1P-201ENST00000438288 955 ntBASIC6.06□□□□□ -1.44
SP140Q13342 AC000041.1-201ENST00000439655 175 ntBASIC6.06□□□□□ -1.44
SP140Q13342 AL645936.1-201ENST00000441979 518 ntBASIC6.06□□□□□ -1.44
SP140Q13342 GAPDHP23-201ENST00000444823 993 ntBASIC6.06□□□□□ -1.44
SP140Q13342 AL096803.2-201ENST00000450032 677 ntBASIC6.06□□□□□ -1.44
SP140Q13342 ZNF886P-201ENST00000450781 723 ntBASIC6.06□□□□□ -1.44
SP140Q13342 CYCSP42-201ENST00000450823 238 ntBASIC6.06□□□□□ -1.44
SP140Q13342 AC073476.1-201ENST00000452854 407 ntBASIC6.06□□□□□ -1.44
SP140Q13342 Z95152.1-201ENST00000453556 656 ntBASIC6.06□□□□□ -1.44
SP140Q13342 AL035446.1-201ENST00000455011 453 ntTSL 5 BASIC6.06□□□□□ -1.44
SP140Q13342 AC092957.1-201ENST00000473299 570 ntTSL 4 BASIC6.06□□□□□ -1.44
SP140Q13342 FSBP-201ENST00000481490 1158 ntTSL 1 (best) BASIC6.06□□□□□ -1.44
SP140Q13342 RPS27AP16-201ENST00000492222 470 ntBASIC6.06□□□□□ -1.44
SP140Q13342 RPL21P131-201ENST00000497298 483 ntBASIC6.06□□□□□ -1.44
SP140Q13342 MGC32805-204ENST00000509993 783 ntTSL 2 BASIC6.06□□□□□ -1.44
SP140Q13342 CYP4F27P-201ENST00000514557 494 ntBASIC6.06□□□□□ -1.44
SP140Q13342 RN7SKP248-201ENST00000516278 305 ntBASIC6.06□□□□□ -1.44
SP140Q13342 AP001804.1-201ENST00000526868 919 ntBASIC6.06□□□□□ -1.44
SP140Q13342 LRRC6P1-201ENST00000532188 885 ntBASIC6.06□□□□□ -1.44
SP140Q13342 RAB30-209ENST00000532548 644 ntTSL 3 BASIC6.06□□□□□ -1.44
SP140Q13342 AP003717.3-201ENST00000544832 1180 ntBASIC6.06□□□□□ -1.44
SP140Q13342 AC127522.1-201ENST00000560531 751 ntTSL 2 BASIC6.06□□□□□ -1.44
SP140Q13342 AC021351.1-201ENST00000560886 652 ntTSL 5 BASIC6.06□□□□□ -1.44
SP140Q13342 RPGRIP1L-208ENST00000566096 893 ntTSL 2 BASIC6.06□□□□□ -1.44
SP140Q13342 AC007673.1-201ENST00000590604 1100 ntTSL 5 BASIC6.06□□□□□ -1.44
SP140Q13342 AC097717.1-230ENST00000597051 738 ntTSL 3 BASIC6.06□□□□□ -1.44
SP140Q13342 AC005479.3-201ENST00000602790 431 ntBASIC6.06□□□□□ -1.44
SP140Q13342 BPIFA4P-204ENST00000605211 656 ntTSL 2 BASIC6.06□□□□□ -1.44
SP140Q13342 AL359513.1-201ENST00000614364 557 ntBASIC6.06□□□□□ -1.44
SP140Q13342 AC105105.5-201ENST00000622635 1294 ntBASIC6.06□□□□□ -1.44
SP140Q13342 AC004943.3-201ENST00000624116 600 ntBASIC6.06□□□□□ -1.44
SP140Q13342 AC244517.5-203ENST00000624778 517 ntTSL 2 BASIC6.06□□□□□ -1.44
SP140Q13342 TTC33-206ENST00000636863 1149 ntTSL 5 BASIC6.06□□□□□ -1.44
SP140Q13342 OR7A1P-202ENST00000641542 1158 ntBASIC6.06□□□□□ -1.44
SP140Q13342 BX649567.1-201ENST00000642071 1134 ntBASIC6.06□□□□□ -1.44
SP140Q13342 SATB1-209ENST00000454909 3755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.06□□□□□ -1.44
SP140Q13342 HSPD1P7-201ENST00000447985 1686 ntBASIC6.06□□□□□ -1.44
SP140Q13342 ZNF727-201ENST00000456806 1679 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC6.06□□□□□ -1.44
SP140Q13342 KCNJ16-205ENST00000586462 1897 ntTSL 5 BASIC6.06□□□□□ -1.44
SP140Q13342 RALGAPA2-201ENST00000202677 6152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.06□□□□□ -1.44
SP140Q13342 NSUN3-201ENST00000314622 3289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.06□□□□□ -1.44
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 77.3 ms