Protein–RNA interactions for Protein: Q13112

CHAF1B, Chromatin assembly factor 1 subunit B, humanhuman

Predictions only

Length 559 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHAF1BQ13112 OR56A7P-201ENST00000524865 941 ntBASIC5.61□□□□□ -1.51
CHAF1BQ13112 CERS3-203ENST00000538112 1856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.61□□□□□ -1.51
CHAF1BQ13112 AC022075.3-201ENST00000539009 649 ntTSL 3 BASIC5.61□□□□□ -1.51
CHAF1BQ13112 AP002373.2-201ENST00000541631 1060 ntBASIC5.61□□□□□ -1.51
CHAF1BQ13112 CKS1BP1-201ENST00000555221 240 ntBASIC5.61□□□□□ -1.51
CHAF1BQ13112 AL163195.3-202ENST00000555283 578 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC5.61□□□□□ -1.51
CHAF1BQ13112 AC084757.2-201ENST00000559165 540 ntTSL 2 BASIC5.61□□□□□ -1.51
CHAF1BQ13112 PYGO1-202ENST00000563719 2653 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.61□□□□□ -1.51
CHAF1BQ13112 MIR4443-201ENST00000585052 53 ntBASIC5.61□□□□□ -1.51
CHAF1BQ13112 MAPRE2-211ENST00000589699 4080 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC5.61□□□□□ -1.51
CHAF1BQ13112 AP005131.3-201ENST00000590042 665 ntTSL 3 BASIC5.61□□□□□ -1.51
CHAF1BQ13112 AC012254.3-201ENST00000591183 2117 ntBASIC5.61□□□□□ -1.51
CHAF1BQ13112 AC020916.2-201ENST00000591242 360 ntBASIC5.61□□□□□ -1.51
CHAF1BQ13112 AL445465.1-206ENST00000609544 528 ntTSL 5 BASIC5.61□□□□□ -1.51
CHAF1BQ13112 AC239809.3-208ENST00000611452 531 ntTSL 5 BASIC5.61□□□□□ -1.51
CHAF1BQ13112 AC006840.1-201ENST00000623069 542 ntBASIC5.61□□□□□ -1.51
CHAF1BQ13112 AC116667.2-201ENST00000641075 823 ntBASIC5.61□□□□□ -1.51
CHAF1BQ13112 WDPCP-203ENST00000409120 5408 ntTSL 1 (best) BASIC5.61□□□□□ -1.51
CHAF1BQ13112 AC127164.1-201ENST00000548738 4196 ntTSL 2 BASIC5.61□□□□□ -1.51
CHAF1BQ13112 GNG2-212ENST00000556752 3424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.61□□□□□ -1.51
CHAF1BQ13112 DCDC1-203ENST00000406071 4758 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC5.6□□□□□ -1.51
CHAF1BQ13112 LINC01505-205ENST00000636028 2298 ntTSL 5 BASIC5.6□□□□□ -1.51
CHAF1BQ13112 ERBIN-208ENST00000506030 4386 ntTSL 1 (best) BASIC5.6□□□□□ -1.51
CHAF1BQ13112 N4BP2L2-IT2-201ENST00000629393 4890 ntBASIC5.6□□□□□ -1.51
CHAF1BQ13112 AQP9-201ENST00000219919 3034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.6□□□□□ -1.51
CHAF1BQ13112 PDE10A-203ENST00000539869 4401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.6□□□□□ -1.51
CHAF1BQ13112 PCGF5-205ENST00000614189 7037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.6□□□□□ -1.51
CHAF1BQ13112 MOSPD2-201ENST00000380492 4163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.6□□□□□ -1.51
CHAF1BQ13112 CCDC190-202ENST00000367911 1395 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC5.6□□□□□ -1.51
CHAF1BQ13112 PRSS37-201ENST00000350549 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.6□□□□□ -1.51
CHAF1BQ13112 SAMD13-206ENST00000394834 785 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.6□□□□□ -1.51
CHAF1BQ13112 AL353626.3-201ENST00000413399 657 ntBASIC5.6□□□□□ -1.51
CHAF1BQ13112 BX284656.2-201ENST00000414483 498 ntTSL 2 BASIC5.6□□□□□ -1.51
CHAF1BQ13112 AC114803.1-201ENST00000417355 311 ntTSL 3 BASIC5.6□□□□□ -1.51
CHAF1BQ13112 AC008164.1-201ENST00000423925 564 ntTSL 4 BASIC5.6□□□□□ -1.51
CHAF1BQ13112 AC066595.1-201ENST00000426697 399 ntTSL 3 BASIC5.6□□□□□ -1.51
CHAF1BQ13112 AL121902.1-201ENST00000426963 459 ntTSL 2 BASIC5.6□□□□□ -1.51
CHAF1BQ13112 AC117944.1-201ENST00000430748 641 ntTSL 3 BASIC5.6□□□□□ -1.51
CHAF1BQ13112 AC126120.1-201ENST00000431082 470 ntBASIC5.6□□□□□ -1.51
CHAF1BQ13112 ZNF965P-201ENST00000432501 817 ntBASIC5.6□□□□□ -1.51
CHAF1BQ13112 FAM53B-AS1-201ENST00000432699 558 ntTSL 2 BASIC5.6□□□□□ -1.51
CHAF1BQ13112 LINC00383-201ENST00000433664 817 ntTSL 3 BASIC5.6□□□□□ -1.51
CHAF1BQ13112 AL121759.1-201ENST00000434043 795 ntTSL 5 BASIC5.6□□□□□ -1.51
CHAF1BQ13112 AL139294.1-201ENST00000435739 512 ntTSL 2 BASIC5.6□□□□□ -1.51
CHAF1BQ13112 AL096678.1-201ENST00000438877 472 ntTSL 3 BASIC5.6□□□□□ -1.51
CHAF1BQ13112 LINC01851-201ENST00000443419 637 ntTSL 3 BASIC5.6□□□□□ -1.51
CHAF1BQ13112 AL354793.1-201ENST00000446028 713 ntTSL 3 BASIC5.6□□□□□ -1.51
CHAF1BQ13112 AL035409.1-201ENST00000454305 497 ntTSL 2 BASIC5.6□□□□□ -1.51
CHAF1BQ13112 AP006216.2-201ENST00000457746 333 ntTSL 5 BASIC5.6□□□□□ -1.51
CHAF1BQ13112 PSMC1P13-201ENST00000458195 985 ntBASIC5.6□□□□□ -1.51
CHAF1BQ13112 NFU1-207ENST00000462320 558 ntTSL 4 BASIC5.6□□□□□ -1.51
CHAF1BQ13112 AF250324.1-203ENST00000508156 517 ntTSL 3 BASIC5.6□□□□□ -1.51
CHAF1BQ13112 IMPA1P1-201ENST00000510718 842 ntBASIC5.6□□□□□ -1.51
CHAF1BQ13112 SETP12-201ENST00000514068 805 ntBASIC5.6□□□□□ -1.51
CHAF1BQ13112 AC064802.1-201ENST00000521523 866 ntTSL 2 BASIC5.6□□□□□ -1.51
CHAF1BQ13112 AP000648.1-201ENST00000529682 397 ntBASIC5.6□□□□□ -1.51
CHAF1BQ13112 NOP56P3-201ENST00000549457 385 ntBASIC5.6□□□□□ -1.51
CHAF1BQ13112 AC103996.3-201ENST00000553477 442 ntTSL 3 BASIC5.6□□□□□ -1.51
CHAF1BQ13112 AC022404.1-201ENST00000555320 273 ntBASIC5.6□□□□□ -1.51
CHAF1BQ13112 AC006530.1-201ENST00000555980 571 ntBASIC5.6□□□□□ -1.51
CHAF1BQ13112 AC020661.4-201ENST00000561388 500 ntTSL 3 BASIC5.6□□□□□ -1.51
CHAF1BQ13112 AC009121.2-202ENST00000572706 505 ntTSL 3 BASIC5.6□□□□□ -1.51
CHAF1BQ13112 AC008109.1-201ENST00000583163 826 ntTSL 2 BASIC5.6□□□□□ -1.51
CHAF1BQ13112 LINC01533-201ENST00000585739 616 ntTSL 5 BASIC5.6□□□□□ -1.51
CHAF1BQ13112 AC013244.1-201ENST00000604279 193 ntBASIC5.6□□□□□ -1.51
CHAF1BQ13112 AL031601.1-201ENST00000605702 394 ntBASIC5.6□□□□□ -1.51
CHAF1BQ13112 SATB1-AS1-243ENST00000627546 589 ntTSL 5 BASIC5.6□□□□□ -1.51
CHAF1BQ13112 MIR325HG-208ENST00000630388 1043 ntTSL 1 (best) BASIC5.6□□□□□ -1.51
CHAF1BQ13112 IGLV10-54-202ENST00000640991 351 ntTSL 5 BASIC5.6□□□□□ -1.51
CHAF1BQ13112 LINC01920-201ENST00000441356 2528 ntTSL 1 (best) BASIC5.6□□□□□ -1.51
CHAF1BQ13112 PARD3B-214ENST00000622699 7442 ntTSL 5 BASIC5.6□□□□□ -1.51
CHAF1BQ13112 AC068769.1-201ENST00000474767 2426 ntBASIC5.6□□□□□ -1.51
CHAF1BQ13112 CNTN1-202ENST00000348761 3328 ntTSL 1 (best) BASIC5.6□□□□□ -1.51
CHAF1BQ13112 TEX9-203ENST00000558083 4440 ntTSL 2 BASIC5.6□□□□□ -1.51
CHAF1BQ13112 MGAM2-201ENST00000477922 7867 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.6□□□□□ -1.51
CHAF1BQ13112 IL1R1-204ENST00000409929 1858 ntTSL 1 (best) BASIC5.6□□□□□ -1.51
CHAF1BQ13112 SEC24D-211ENST00000511481 2626 ntTSL 1 (best) BASIC5.6□□□□□ -1.51
CHAF1BQ13112 KIAA1328-201ENST00000280020 4853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.59□□□□□ -1.51
CHAF1BQ13112 GPN1-205ENST00000458167 1618 ntTSL 2 BASIC5.59□□□□□ -1.51
CHAF1BQ13112 AC124017.1-201ENST00000508112 1594 ntTSL 5 BASIC5.59□□□□□ -1.51
CHAF1BQ13112 DSC2-202ENST00000280904 12325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.59□□□□□ -1.51
CHAF1BQ13112 CLEC4E-201ENST00000299663 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.59□□□□□ -1.51
CHAF1BQ13112 HSPA8P17-201ENST00000427029 1382 ntBASIC5.59□□□□□ -1.51
CHAF1BQ13112 ABCC9-204ENST00000538350 2672 ntTSL 2 BASIC5.59□□□□□ -1.51
CHAF1BQ13112 AC005725.1-201ENST00000577346 2607 ntBASIC5.59□□□□□ -1.51
CHAF1BQ13112 FLJ12825-201ENST00000515617 3942 ntTSL 2 BASIC5.59□□□□□ -1.51
CHAF1BQ13112 CHRDL1-202ENST00000372045 3860 ntTSL 1 (best) BASIC5.59□□□□□ -1.51
CHAF1BQ13112 WFDC8-202ENST00000357199 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.59□□□□□ -1.51
CHAF1BQ13112 MRRF-203ENST00000373723 1176 ntTSL 3 BASIC5.59□□□□□ -1.51
CHAF1BQ13112 IGLV5-48-201ENST00000390293 369 ntAPPRIS P1 BASIC5.59□□□□□ -1.51
CHAF1BQ13112 FIGN-202ENST00000409634 746 ntTSL 5 BASIC5.59□□□□□ -1.51
CHAF1BQ13112 USP9YP19-201ENST00000412165 485 ntBASIC5.59□□□□□ -1.51
CHAF1BQ13112 BMS1P13-201ENST00000417301 885 ntBASIC5.59□□□□□ -1.51
CHAF1BQ13112 AC079760.2-203ENST00000418395 489 ntTSL 3 BASIC5.59□□□□□ -1.51
CHAF1BQ13112 LINC02246-202ENST00000418954 717 ntTSL 2 BASIC5.59□□□□□ -1.51
CHAF1BQ13112 OR6K4P-201ENST00000423179 955 ntBASIC5.59□□□□□ -1.51
CHAF1BQ13112 AC099060.1-201ENST00000427806 448 ntTSL 3 BASIC5.59□□□□□ -1.51
CHAF1BQ13112 AL121776.1-201ENST00000429337 372 ntBASIC5.59□□□□□ -1.51
CHAF1BQ13112 MTND4P15-201ENST00000437913 1033 ntBASIC5.59□□□□□ -1.51
CHAF1BQ13112 AP000936.3-201ENST00000438127 255 ntBASIC5.59□□□□□ -1.51
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 85 ms