Protein–RNA interactions for Protein: Q13002

GRIK2, Glutamate receptor ionotropic, kainate 2, humanhuman

Predictions only

Length 908 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GRIK2Q13002 OTUD4-202ENST00000454497 7069 ntTSL 2 BASIC5.77□□□□□ -1.49
GRIK2Q13002 SLAMF6-202ENST00000368057 2712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.77□□□□□ -1.49
GRIK2Q13002 NDUFA5-207ENST00000471770 5608 ntTSL 1 (best) BASIC5.77□□□□□ -1.49
GRIK2Q13002 AC087516.1-201ENST00000561236 2428 ntBASIC5.77□□□□□ -1.49
GRIK2Q13002 C17orf105-201ENST00000449302 3753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.77□□□□□ -1.49
GRIK2Q13002 CD200R1L-204ENST00000488794 1597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.77□□□□□ -1.49
GRIK2Q13002 CDC16-202ENST00000252458 1991 ntTSL 1 (best) BASIC5.77□□□□□ -1.49
GRIK2Q13002 GTDC1-201ENST00000241391 2356 ntTSL 2 BASIC5.77□□□□□ -1.49
GRIK2Q13002 KLHL5-202ENST00000261426 3300 ntTSL 1 (best) BASIC5.77□□□□□ -1.49
GRIK2Q13002 WFDC11-201ENST00000324384 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.77□□□□□ -1.49
GRIK2Q13002 RN7SKP186-201ENST00000365371 303 ntBASIC5.77□□□□□ -1.49
GRIK2Q13002 MIR1286-201ENST00000408112 78 ntBASIC5.77□□□□□ -1.49
GRIK2Q13002 AC012499.1-201ENST00000412133 741 ntTSL 5 BASIC5.77□□□□□ -1.49
GRIK2Q13002 AL158827.1-201ENST00000416300 391 ntBASIC5.77□□□□□ -1.49
GRIK2Q13002 RCC2P2-201ENST00000422174 918 ntBASIC5.77□□□□□ -1.49
GRIK2Q13002 AL162408.1-201ENST00000428853 433 ntTSL 5 BASIC5.77□□□□□ -1.49
GRIK2Q13002 AP001476.3-201ENST00000429512 415 ntTSL 3 BASIC5.77□□□□□ -1.49
GRIK2Q13002 BX276092.6-201ENST00000430476 250 ntBASIC5.77□□□□□ -1.49
GRIK2Q13002 LBX1-AS1-202ENST00000434878 418 ntTSL 5 BASIC5.77□□□□□ -1.49
GRIK2Q13002 AL390119.1-201ENST00000440329 312 ntBASIC5.77□□□□□ -1.49
GRIK2Q13002 MTCO3P43-201ENST00000440974 771 ntBASIC5.77□□□□□ -1.49
GRIK2Q13002 AC005297.1-201ENST00000444765 862 ntBASIC5.77□□□□□ -1.49
GRIK2Q13002 BX276092.8-201ENST00000455722 250 ntBASIC5.77□□□□□ -1.49
GRIK2Q13002 LINC02339-201ENST00000472649 752 ntTSL 1 (best) BASIC5.77□□□□□ -1.49
GRIK2Q13002 AC007370.1-201ENST00000503163 316 ntTSL 2 BASIC5.77□□□□□ -1.49
GRIK2Q13002 LINC02488-201ENST00000504287 652 ntTSL 2 BASIC5.77□□□□□ -1.49
GRIK2Q13002 AC025187.1-201ENST00000506305 686 ntTSL 3 BASIC5.77□□□□□ -1.49
GRIK2Q13002 RNU6-1334P-201ENST00000516032 105 ntBASIC5.77□□□□□ -1.49
GRIK2Q13002 PYDC2-201ENST00000518817 294 ntAPPRIS P1 BASIC5.77□□□□□ -1.49
GRIK2Q13002 AC104997.1-201ENST00000519761 717 ntBASIC5.77□□□□□ -1.49
GRIK2Q13002 LINC01947-201ENST00000523742 566 ntTSL 4 BASIC5.77□□□□□ -1.49
GRIK2Q13002 BMPR1APS2-201ENST00000527904 1012 ntBASIC5.77□□□□□ -1.49
GRIK2Q13002 AC134775.1-201ENST00000531268 464 ntTSL 2 BASIC5.77□□□□□ -1.49
GRIK2Q13002 ZNF418-210ENST00000600989 597 ntTSL 5 BASIC5.77□□□□□ -1.49
GRIK2Q13002 LINC00632-204ENST00000602830 597 ntTSL 4 BASIC5.77□□□□□ -1.49
GRIK2Q13002 AC097376.2-202ENST00000608345 433 ntTSL 3 BASIC5.77□□□□□ -1.49
GRIK2Q13002 AP000720.1-201ENST00000625091 483 ntBASIC5.77□□□□□ -1.49
GRIK2Q13002 DAOA-212ENST00000640578 378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.77□□□□□ -1.49
GRIK2Q13002 OR11H2-202ENST00000641517 1085 ntBASIC5.77□□□□□ -1.49
GRIK2Q13002 SAMMSON-227ENST00000642114 1199 ntBASIC5.77□□□□□ -1.49
GRIK2Q13002 RALYL-211ENST00000523850 1684 ntTSL 2 BASIC5.77□□□□□ -1.49
GRIK2Q13002 ARIH1-201ENST00000379887 21681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.77□□□□□ -1.49
GRIK2Q13002 ANK3-216ENST00000503366 5792 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC5.77□□□□□ -1.49
GRIK2Q13002 CLEC12A-205ENST00000434319 1515 ntTSL 1 (best) BASIC5.77□□□□□ -1.49
GRIK2Q13002 CASC19-248ENST00000641674 1356 ntBASIC5.77□□□□□ -1.49
GRIK2Q13002 ZC3H14-201ENST00000251038 18281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.77□□□□□ -1.49
GRIK2Q13002 YES1P1-201ENST00000418510 1628 ntBASIC5.77□□□□□ -1.49
GRIK2Q13002 STRBP-204ENST00000447404 6161 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.77□□□□□ -1.49
GRIK2Q13002 FLG2-201ENST00000388718 9124 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.77□□□□□ -1.49
GRIK2Q13002 DCDC1-207ENST00000452803 1706 ntTSL 1 (best) BASIC5.77□□□□□ -1.49
GRIK2Q13002 AC140479.2-201ENST00000421567 3130 ntBASIC5.77□□□□□ -1.49
GRIK2Q13002 KIAA1328-201ENST00000280020 4853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.76□□□□□ -1.49
GRIK2Q13002 AL132656.3-201ENST00000606384 1595 ntBASIC5.76□□□□□ -1.49
GRIK2Q13002 CCR2-201ENST00000292301 2671 ntTSL 5 BASIC5.76□□□□□ -1.49
GRIK2Q13002 TRIM64B-201ENST00000329862 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.76□□□□□ -1.49
GRIK2Q13002 AC090220.1-201ENST00000593078 1699 ntBASIC5.76□□□□□ -1.49
GRIK2Q13002 ARHGAP21-202ENST00000376410 3526 ntTSL 5 BASIC5.76□□□□□ -1.49
GRIK2Q13002 GRIA4-204ENST00000428631 2778 ntTSL 1 (best) BASIC5.76□□□□□ -1.49
GRIK2Q13002 CRNDE-212ENST00000613942 2601 ntTSL 5 BASIC5.76□□□□□ -1.49
GRIK2Q13002 EDA2R-204ENST00000451436 3464 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC5.76□□□□□ -1.49
GRIK2Q13002 MIR7-1-201ENST00000384871 110 ntBASIC5.76□□□□□ -1.49
GRIK2Q13002 OR1F12-201ENST00000402365 945 ntBASIC5.76□□□□□ -1.49
GRIK2Q13002 NPM1P37-201ENST00000403105 874 ntBASIC5.76□□□□□ -1.49
GRIK2Q13002 MRM2-202ENST00000407040 582 ntTSL 3 BASIC5.76□□□□□ -1.49
GRIK2Q13002 AC020559.1-201ENST00000444229 583 ntTSL 2 BASIC5.76□□□□□ -1.49
GRIK2Q13002 AC019117.1-204ENST00000451792 442 ntTSL 3 BASIC5.76□□□□□ -1.49
GRIK2Q13002 NFU1-207ENST00000462320 558 ntTSL 4 BASIC5.76□□□□□ -1.49
GRIK2Q13002 OR2AO1P-201ENST00000476497 403 ntBASIC5.76□□□□□ -1.49
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GRIK2Q13002 RN7SL547P-201ENST00000490793 290 ntBASIC5.76□□□□□ -1.49
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GRIK2Q13002 OR8Q1P-201ENST00000526467 655 ntBASIC5.76□□□□□ -1.49
GRIK2Q13002 HNF1A-AS1-203ENST00000537361 659 ntTSL 3 BASIC5.76□□□□□ -1.49
GRIK2Q13002 TRPT1-216ENST00000546133 382 ntTSL 2 BASIC5.76□□□□□ -1.49
GRIK2Q13002 MIR762HG-201ENST00000564901 648 ntTSL 2 BASIC5.76□□□□□ -1.49
GRIK2Q13002 GS1-279B7.1-203ENST00000565520 609 ntTSL 5 BASIC5.76□□□□□ -1.49
GRIK2Q13002 AC142086.4-201ENST00000568904 650 ntTSL 3 BASIC5.76□□□□□ -1.49
GRIK2Q13002 GARSP1-201ENST00000570895 719 ntBASIC5.76□□□□□ -1.49
GRIK2Q13002 AC093330.1-201ENST00000583326 568 ntTSL 4 BASIC5.76□□□□□ -1.49
GRIK2Q13002 AC022916.2-201ENST00000590144 559 ntTSL 4 BASIC5.76□□□□□ -1.49
GRIK2Q13002 FKBP1AP1-201ENST00000594588 318 ntBASIC5.76□□□□□ -1.49
GRIK2Q13002 TMSB15B-207ENST00000598087 947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.76□□□□□ -1.49
GRIK2Q13002 DARS-AS1-217ENST00000599279 544 ntTSL 5 BASIC5.76□□□□□ -1.49
GRIK2Q13002 LINC01050-201ENST00000604485 760 ntTSL 3 BASIC5.76□□□□□ -1.49
GRIK2Q13002 AC145423.1-201ENST00000605712 336 ntBASIC5.76□□□□□ -1.49
GRIK2Q13002 AL133481.2-203ENST00000607558 139 ntBASIC5.76□□□□□ -1.49
GRIK2Q13002 AC037198.3-201ENST00000616754 526 ntBASIC5.76□□□□□ -1.49
GRIK2Q13002 AL109620.1-201ENST00000618738 1197 ntBASIC5.76□□□□□ -1.49
GRIK2Q13002 SATB1-AS1-243ENST00000627546 589 ntTSL 5 BASIC5.76□□□□□ -1.49
GRIK2Q13002 SLC8A1-AS1-239ENST00000631142 623 ntTSL 5 BASIC5.76□□□□□ -1.49
GRIK2Q13002 LINC01708-202ENST00000634316 859 ntTSL 5 BASIC5.76□□□□□ -1.49
GRIK2Q13002 AL034546.1-201ENST00000623740 3693 ntBASIC5.76□□□□□ -1.49
GRIK2Q13002 AL359955.1-201ENST00000455242 3275 ntBASIC5.76□□□□□ -1.49
GRIK2Q13002 ADAM21-201ENST00000603540 2658 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC5.76□□□□□ -1.49
GRIK2Q13002 ESRRG-219ENST00000487276 3015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.76□□□□□ -1.49
GRIK2Q13002 OR2AT4-202ENST00000641504 8661 ntAPPRIS P1 BASIC5.76□□□□□ -1.49
GRIK2Q13002 NRXN1-242ENST00000635519 3553 ntTSL 5 BASIC5.76□□□□□ -1.49
GRIK2Q13002 TLR2-201ENST00000260010 4200 ntAPPRIS P1 BASIC5.75□□□□□ -1.49
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