Protein–RNA interactions for Protein: Q12830

BPTF, Nucleosome-remodeling factor subunit BPTF, humanhuman

Predictions only

Length 3,046 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BPTFQ12830 AL353770.4-201ENST00000614936 468 ntTSL 5 BASIC5.33□□□□□ -1.56
BPTFQ12830 AL590491.2-203ENST00000614969 468 ntTSL 4 BASIC5.33□□□□□ -1.56
BPTFQ12830 GVQW2-203ENST00000641401 327 ntAPPRIS P1 BASIC5.33□□□□□ -1.56
BPTFQ12830 DLEU7-AS1-201ENST00000413510 1806 ntTSL 1 (best) BASIC5.33□□□□□ -1.56
BPTFQ12830 HSPA8P14-201ENST00000552265 1805 ntBASIC5.33□□□□□ -1.56
BPTFQ12830 SMC2-203ENST00000374793 5909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.33□□□□□ -1.56
BPTFQ12830 CEP164P1-202ENST00000456938 2472 ntTSL 1 (best) BASIC5.33□□□□□ -1.56
BPTFQ12830 KIAA1958-203ENST00000536272 7650 ntTSL 1 (best) BASIC5.33□□□□□ -1.56
BPTFQ12830 Z99129.3-201ENST00000624363 6430 ntTSL 2 BASIC5.32□□□□□ -1.56
BPTFQ12830 ZNF286A-202ENST00000395894 5443 ntTSL 1 (best) BASIC5.32□□□□□ -1.56
BPTFQ12830 ADGRL2-222ENST00000627151 5789 ntTSL 5 BASIC5.32□□□□□ -1.56
BPTFQ12830 ZC3H11A-201ENST00000332127 5015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.32□□□□□ -1.56
BPTFQ12830 U3.36-201ENST00000408418 213 ntBASIC5.32□□□□□ -1.56
BPTFQ12830 AL445190.1-201ENST00000416448 288 ntTSL 5 BASIC5.32□□□□□ -1.56
BPTFQ12830 KNOP1P3-201ENST00000446933 426 ntBASIC5.32□□□□□ -1.56
BPTFQ12830 SNORD125-201ENST00000459538 96 ntBASIC5.32□□□□□ -1.56
BPTFQ12830 AC109462.1-201ENST00000491087 368 ntBASIC5.32□□□□□ -1.56
BPTFQ12830 AC093607.1-202ENST00000499715 559 ntTSL 4 BASIC5.32□□□□□ -1.56
BPTFQ12830 LINC00491-204ENST00000513815 582 ntTSL 4 BASIC5.32□□□□□ -1.56
BPTFQ12830 LINC02319-201ENST00000555852 349 ntTSL 3 BASIC5.32□□□□□ -1.56
BPTFQ12830 AL121834.1-201ENST00000572284 509 ntBASIC5.32□□□□□ -1.56
BPTFQ12830 XIST-210ENST00000602863 775 ntTSL 3 BASIC5.32□□□□□ -1.56
BPTFQ12830 UNC13B-210ENST00000636694 8012 ntTSL 5 BASIC5.32□□□□□ -1.56
BPTFQ12830 AASDH-201ENST00000205214 3590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.32□□□□□ -1.56
BPTFQ12830 SEC31A-201ENST00000264405 3447 ntTSL 2 BASIC5.32□□□□□ -1.56
BPTFQ12830 NBPF19-206ENST00000621744 14425 ntTSL 5 BASIC5.32□□□□□ -1.56
BPTFQ12830 PSMA8-205ENST00000612461 1619 ntTSL 5 BASIC5.32□□□□□ -1.56
BPTFQ12830 NUP107-201ENST00000229179 6457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.32□□□□□ -1.56
BPTFQ12830 CLSPN-206ENST00000520551 4010 ntTSL 1 (best) BASIC5.32□□□□□ -1.56
BPTFQ12830 KLF7-202ENST00000412414 7954 ntTSL 2 BASIC5.32□□□□□ -1.56
BPTFQ12830 KCNA2-214ENST00000640774 6673 ntTSL 5 BASIC5.32□□□□□ -1.56
BPTFQ12830 MAPK10-328ENST00000641553 4009 ntBASIC5.32□□□□□ -1.56
BPTFQ12830 OR11H1-201ENST00000252835 982 ntAPPRIS P1 BASIC5.32□□□□□ -1.56
BPTFQ12830 RNU4-4P-201ENST00000364588 130 ntBASIC5.32□□□□□ -1.56
BPTFQ12830 IFNA17-201ENST00000413767 980 ntAPPRIS P1 BASIC5.32□□□□□ -1.56
BPTFQ12830 RSRC1-207ENST00000475278 1195 ntTSL 5 BASIC5.32□□□□□ -1.56
BPTFQ12830 AC020890.1-201ENST00000491837 504 ntBASIC5.32□□□□□ -1.56
BPTFQ12830 LINC02271-202ENST00000506379 596 ntTSL 4 BASIC5.32□□□□□ -1.56
BPTFQ12830 UQCRB-209ENST00000523920 695 ntTSL 5 BASIC5.32□□□□□ -1.56
BPTFQ12830 AC002563.1-201ENST00000535109 451 ntTSL 3 BASIC5.32□□□□□ -1.56
BPTFQ12830 OR11H2-201ENST00000556246 948 ntAPPRIS P1 BASIC5.32□□□□□ -1.56
BPTFQ12830 CDC42EP3P1-201ENST00000601004 764 ntBASIC5.32□□□□□ -1.56
BPTFQ12830 PXT1-202ENST00000619547 619 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.32□□□□□ -1.56
BPTFQ12830 AL161637.1-201ENST00000622380 412 ntBASIC5.32□□□□□ -1.56
BPTFQ12830 AC063952.1-204ENST00000635496 927 ntTSL 5 BASIC5.32□□□□□ -1.56
BPTFQ12830 ATXN3-204ENST00000429774 6713 ntTSL 1 (best) BASIC5.32□□□□□ -1.56
BPTFQ12830 AL031123.3-201ENST00000623345 1837 ntBASIC5.32□□□□□ -1.56
BPTFQ12830 DOCK11P1-201ENST00000553480 5932 ntBASIC5.32□□□□□ -1.56
BPTFQ12830 KIF13A-205ENST00000378843 5707 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.32□□□□□ -1.56
BPTFQ12830 ADGRB3-203ENST00000546190 4569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.32□□□□□ -1.56
BPTFQ12830 LRRC37A2-201ENST00000333412 5177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.32□□□□□ -1.56
BPTFQ12830 IBTK-210ENST00000610980 5195 ntTSL 5 BASIC5.32□□□□□ -1.56
BPTFQ12830 HERC2-201ENST00000261609 15337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.32□□□□□ -1.56
BPTFQ12830 AC060780.1-202ENST00000590740 5084 ntTSL 1 (best) BASIC5.32□□□□□ -1.56
BPTFQ12830 CEP63-202ENST00000337090 5632 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC5.32□□□□□ -1.56
BPTFQ12830 NDUFA9-201ENST00000266544 8363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.32□□□□□ -1.56
BPTFQ12830 PSD3-204ENST00000440756 11690 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.32□□□□□ -1.56
BPTFQ12830 AL590065.1-201ENST00000603371 4774 ntBASIC5.32□□□□□ -1.56
BPTFQ12830 SFTPD-AS1-201ENST00000608229 5001 ntBASIC5.32□□□□□ -1.56
BPTFQ12830 CLEC12A-202ENST00000350667 699 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.31□□□□□ -1.56
BPTFQ12830 MIR133B-201ENST00000362210 119 ntBASIC5.31□□□□□ -1.56
BPTFQ12830 RNA5SP479-201ENST00000364858 117 ntBASIC5.31□□□□□ -1.56
BPTFQ12830 SH3BGR-203ENST00000380634 816 ntTSL 5 BASIC5.31□□□□□ -1.56
BPTFQ12830 MIR1193-201ENST00000408109 78 ntBASIC5.31□□□□□ -1.56
BPTFQ12830 RN7SKP16-201ENST00000410180 299 ntBASIC5.31□□□□□ -1.56
BPTFQ12830 AC138761.5-201ENST00000433967 325 ntBASIC5.31□□□□□ -1.56
BPTFQ12830 AC018467.1-203ENST00000440785 506 ntTSL 3 BASIC5.31□□□□□ -1.56
BPTFQ12830 AC099344.3-201ENST00000454489 626 ntTSL 3 BASIC5.31□□□□□ -1.56
BPTFQ12830 TAAR4P-201ENST00000454843 1039 ntBASIC5.31□□□□□ -1.56
BPTFQ12830 RN7SL481P-201ENST00000477764 299 ntBASIC5.31□□□□□ -1.56
BPTFQ12830 AC010230.1-202ENST00000506265 592 ntTSL 5 BASIC5.31□□□□□ -1.56
BPTFQ12830 AC026402.1-201ENST00000513642 170 ntBASIC5.31□□□□□ -1.56
BPTFQ12830 AC106729.1-201ENST00000567777 466 ntTSL 3 BASIC5.31□□□□□ -1.56
BPTFQ12830 PCBP1-AS1-286ENST00000625888 765 ntTSL 5 BASIC5.31□□□□□ -1.56
BPTFQ12830 CYP3A7-CYP3A51P-202ENST00000620220 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.31□□□□□ -1.56
BPTFQ12830 LINC01249-201ENST00000412134 2663 ntTSL 1 (best) BASIC5.31□□□□□ -1.56
BPTFQ12830 FOXP2-202ENST00000360232 1412 ntTSL 1 (best) BASIC5.31□□□□□ -1.56
BPTFQ12830 SON-204ENST00000381692 2463 ntTSL 1 (best) BASIC5.31□□□□□ -1.56
BPTFQ12830 KIAA1549L-201ENST00000265654 4492 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC5.31□□□□□ -1.56
BPTFQ12830 ART3-203ENST00000355810 1561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.31□□□□□ -1.56
BPTFQ12830 MSL3P1-202ENST00000440028 1468 ntBASIC5.31□□□□□ -1.56
BPTFQ12830 CU638689.4-201ENST00000623047 5990 ntTSL 5 BASIC5.31□□□□□ -1.56
BPTFQ12830 VEZF1-204ENST00000584396 2342 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.31□□□□□ -1.56
BPTFQ12830 FAM184A-212ENST00000522284 2721 ntTSL 1 (best) BASIC5.31□□□□□ -1.56
BPTFQ12830 AC005294.1-201ENST00000355509 281 ntBASIC5.31□□□□□ -1.56
BPTFQ12830 SPRR2G-201ENST00000368748 568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.31□□□□□ -1.56
BPTFQ12830 AL133482.1-201ENST00000415988 498 ntBASIC5.31□□□□□ -1.56
BPTFQ12830 AL451062.2-201ENST00000427515 271 ntBASIC5.31□□□□□ -1.56
BPTFQ12830 CLEC5A-203ENST00000439991 501 ntTSL 3 BASIC5.31□□□□□ -1.56
BPTFQ12830 AC107396.1-201ENST00000509641 735 ntTSL 5 BASIC5.31□□□□□ -1.56
BPTFQ12830 AC134349.2-201ENST00000535136 910 ntBASIC5.31□□□□□ -1.56
BPTFQ12830 AC100775.1-201ENST00000590942 522 ntTSL 3 BASIC5.31□□□□□ -1.56
BPTFQ12830 AC239809.3-206ENST00000596091 741 ntTSL 5 BASIC5.31□□□□□ -1.56
BPTFQ12830 WBP1LP8-201ENST00000617401 327 ntBASIC5.31□□□□□ -1.56
BPTFQ12830 KLHL13-203ENST00000371878 3234 ntTSL 2 BASIC5.31□□□□□ -1.56
BPTFQ12830 ATF2-212ENST00000426833 4132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.31□□□□□ -1.56
BPTFQ12830 AC006600.2-201ENST00000624834 2506 ntBASIC5.31□□□□□ -1.56
BPTFQ12830 ALB-202ENST00000401494 1659 ntTSL 5 BASIC5.31□□□□□ -1.56
BPTFQ12830 RNA5SP123-201ENST00000363244 119 ntBASIC5.31□□□□□ -1.56
BPTFQ12830 SNORA70.4-201ENST00000365509 134 ntBASIC5.31□□□□□ -1.56
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