Protein–RNA interactions for Protein: Q12772

SREBF2, Sterol regulatory element-binding protein 2, humanhuman

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Length 1,141 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SREBF2Q12772 MTND6P2-201ENST00000512226 524 ntBASIC6.36□□□□□ -1.39
SREBF2Q12772 SAMD15-202ENST00000533095 412 ntTSL 5 BASIC6.36□□□□□ -1.39
SREBF2Q12772 LINC00871-201ENST00000555246 408 ntTSL 5 BASIC6.36□□□□□ -1.39
SREBF2Q12772 AC012409.1-202ENST00000558449 639 ntTSL 2 BASIC6.36□□□□□ -1.39
SREBF2Q12772 AC018558.5-201ENST00000565840 952 ntBASIC6.36□□□□□ -1.39
SREBF2Q12772 LINC00921-201ENST00000572123 243 ntTSL 5 BASIC6.36□□□□□ -1.39
SREBF2Q12772 ZNF227-204ENST00000586228 569 ntTSL 2 BASIC6.36□□□□□ -1.39
SREBF2Q12772 AL353729.2-201ENST00000605859 1249 ntBASIC6.36□□□□□ -1.39
SREBF2Q12772 SHMT1-211ENST00000618902 378 ntTSL 5 BASIC6.36□□□□□ -1.39
SREBF2Q12772 AC069542.2-201ENST00000624816 216 ntBASIC6.36□□□□□ -1.39
SREBF2Q12772 SBNO1-202ENST00000420886 10981 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC6.36□□□□□ -1.39
SREBF2Q12772 VEGFD-201ENST00000297904 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.36□□□□□ -1.39
SREBF2Q12772 USP7-202ENST00000381886 3587 ntTSL 1 (best) BASIC6.36□□□□□ -1.39
SREBF2Q12772 ETV1-207ENST00000405358 4181 ntTSL 5 BASIC6.36□□□□□ -1.39
SREBF2Q12772 RPGRIP1L-205ENST00000563746 4193 ntTSL 1 (best) BASIC6.36□□□□□ -1.39
SREBF2Q12772 CLCN3-204ENST00000504131 5592 ntTSL 5 BASIC6.36□□□□□ -1.39
SREBF2Q12772 ORC4-214ENST00000535373 6710 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.36□□□□□ -1.39
SREBF2Q12772 SLC26A7-201ENST00000276609 5263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.36□□□□□ -1.39
SREBF2Q12772 AC018809.2-201ENST00000602436 3823 ntBASIC6.36□□□□□ -1.39
SREBF2Q12772 CD84-208ENST00000534968 7885 ntTSL 1 (best) BASIC6.36□□□□□ -1.39
SREBF2Q12772 WDR63-202ENST00000326813 2888 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC6.36□□□□□ -1.39
SREBF2Q12772 OR4K13-202ENST00000641664 5980 ntAPPRIS P1 BASIC6.35□□□□□ -1.39
SREBF2Q12772 YPEL5-204ENST00000402003 2197 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.35□□□□□ -1.39
SREBF2Q12772 SLC4A4-202ENST00000340595 7640 ntTSL 1 (best) BASIC6.35□□□□□ -1.39
SREBF2Q12772 KSR2-201ENST00000339824 17726 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.35□□□□□ -1.39
SREBF2Q12772 ST6GALNAC3-201ENST00000328299 6861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.35□□□□□ -1.39
SREBF2Q12772 AL080276.2-201ENST00000637995 2090 ntTSL 3 BASIC6.35□□□□□ -1.39
SREBF2Q12772 SCOC-204ENST00000394205 1964 ntTSL 2 BASIC6.35□□□□□ -1.39
SREBF2Q12772 PCDH15-202ENST00000361849 7017 ntTSL 5 BASIC6.35□□□□□ -1.39
SREBF2Q12772 PCDH15-205ENST00000373957 7032 ntTSL 5 BASIC6.35□□□□□ -1.39
SREBF2Q12772 PSG1-206ENST00000595356 1903 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.35□□□□□ -1.39
SREBF2Q12772 NAV1-201ENST00000367295 11645 ntTSL 1 (best) BASIC6.35□□□□□ -1.39
SREBF2Q12772 AL669831.5-218ENST00000591702 1873 ntBASIC6.35□□□□□ -1.39
SREBF2Q12772 TET1P1-201ENST00000426627 2301 ntBASIC6.35□□□□□ -1.39
SREBF2Q12772 FOXM1-202ENST00000359843 3315 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC6.35□□□□□ -1.39
SREBF2Q12772 OR10A5-201ENST00000299454 1054 ntAPPRIS P1 BASIC6.35□□□□□ -1.39
SREBF2Q12772 OR5AS1-201ENST00000313555 975 ntAPPRIS P1 BASIC6.35□□□□□ -1.39
SREBF2Q12772 MANSC4-201ENST00000381273 1023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.35□□□□□ -1.39
SREBF2Q12772 LINC01820-201ENST00000418415 570 ntTSL 2 BASIC6.35□□□□□ -1.39
SREBF2Q12772 AL139819.1-201ENST00000429420 471 ntTSL 3 BASIC6.35□□□□□ -1.39
SREBF2Q12772 Z82198.2-201ENST00000434741 567 ntTSL 4 BASIC6.35□□□□□ -1.39
SREBF2Q12772 AC009127.1-201ENST00000467090 155 ntBASIC6.35□□□□□ -1.39
SREBF2Q12772 AC079080.1-201ENST00000479841 822 ntBASIC6.35□□□□□ -1.39
SREBF2Q12772 RPL5P22-201ENST00000480199 884 ntBASIC6.35□□□□□ -1.39
SREBF2Q12772 PHC3-208ENST00000481639 1075 ntTSL 1 (best) BASIC6.35□□□□□ -1.39
SREBF2Q12772 AL133372.1-201ENST00000493565 745 ntBASIC6.35□□□□□ -1.39
SREBF2Q12772 RN7SL591P-201ENST00000496150 292 ntBASIC6.35□□□□□ -1.39
SREBF2Q12772 CSNK1A1P3-201ENST00000504105 330 ntBASIC6.35□□□□□ -1.39
SREBF2Q12772 AC104071.1-201ENST00000505636 602 ntTSL 3 BASIC6.35□□□□□ -1.39
SREBF2Q12772 CENPK-210ENST00000510354 1124 ntTSL 5 BASIC6.35□□□□□ -1.39
SREBF2Q12772 AC020551.1-201ENST00000512036 539 ntTSL 3 BASIC6.35□□□□□ -1.39
SREBF2Q12772 AC113349.1-201ENST00000512105 583 ntTSL 4 BASIC6.35□□□□□ -1.39
SREBF2Q12772 AC144548.2-201ENST00000550231 946 ntTSL 3 BASIC6.35□□□□□ -1.39
SREBF2Q12772 AC039056.1-201ENST00000552704 467 ntTSL 3 BASIC6.35□□□□□ -1.39
SREBF2Q12772 AP003400.2-201ENST00000624036 666 ntBASIC6.35□□□□□ -1.39
SREBF2Q12772 GVQW2-203ENST00000641401 327 ntAPPRIS P1 BASIC6.35□□□□□ -1.39
SREBF2Q12772 AC073869.10-201ENST00000642016 354 ntBASIC6.35□□□□□ -1.39
SREBF2Q12772 ZEB1-208ENST00000542815 3217 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC6.35□□□□□ -1.39
SREBF2Q12772 OOSP2-201ENST00000278855 1633 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.35□□□□□ -1.39
SREBF2Q12772 ZNF19-206ENST00000565100 2087 ntTSL 5 BASIC6.35□□□□□ -1.39
SREBF2Q12772 IL20-202ENST00000367098 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.35□□□□□ -1.39
SREBF2Q12772 ZNF273-204ENST00000476120 2000 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC6.35□□□□□ -1.39
SREBF2Q12772 RUFY3-201ENST00000226328 4233 ntTSL 1 (best) BASIC6.35□□□□□ -1.39
SREBF2Q12772 LAMTOR3-202ENST00000499666 4226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.35□□□□□ -1.39
SREBF2Q12772 SLC35A5-201ENST00000261034 2444 ntTSL 5 BASIC6.35□□□□□ -1.39
SREBF2Q12772 ZC3H11A-201ENST00000332127 5015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.35□□□□□ -1.39
SREBF2Q12772 CUBN-202ENST00000377833 11949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.35□□□□□ -1.39
SREBF2Q12772 RPTN-201ENST00000316073 3569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.34□□□□□ -1.39
SREBF2Q12772 PRUNE2-201ENST00000223609 2697 ntTSL 2 BASIC6.34□□□□□ -1.39
SREBF2Q12772 SLC7A11-201ENST00000280612 9645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.34□□□□□ -1.39
SREBF2Q12772 RIOK2-202ENST00000508447 2149 ntTSL 1 (best) BASIC6.34□□□□□ -1.39
SREBF2Q12772 CDK14-206ENST00000436577 4787 ntTSL 2 BASIC6.34□□□□□ -1.39
SREBF2Q12772 FILIP1-203ENST00000393004 7807 ntTSL 1 (best) BASIC6.34□□□□□ -1.39
SREBF2Q12772 PYHIN1-203ENST00000368140 2083 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC6.34□□□□□ -1.39
SREBF2Q12772 SNORA62-201ENST00000365493 153 ntBASIC6.34□□□□□ -1.39
SREBF2Q12772 DEFB113-201ENST00000398718 249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.34□□□□□ -1.39
SREBF2Q12772 PRR21-201ENST00000408934 1170 ntAPPRIS P1 BASIC6.34□□□□□ -1.39
SREBF2Q12772 COX6B1P1-201ENST00000415962 213 ntBASIC6.34□□□□□ -1.39
SREBF2Q12772 AC244035.2-201ENST00000425896 630 ntTSL 3 BASIC6.34□□□□□ -1.39
SREBF2Q12772 GNGT1-204ENST00000430875 628 ntTSL 2 BASIC6.34□□□□□ -1.39
SREBF2Q12772 TEX41-205ENST00000431734 529 ntTSL 4 BASIC6.34□□□□□ -1.39
SREBF2Q12772 AL031123.1-201ENST00000432823 568 ntTSL 2 BASIC6.34□□□□□ -1.39
SREBF2Q12772 NPSR1-AS1-206ENST00000439852 710 ntTSL 1 (best) BASIC6.34□□□□□ -1.39
SREBF2Q12772 AC011753.3-201ENST00000443436 406 ntBASIC6.34□□□□□ -1.39
SREBF2Q12772 LINC00483-203ENST00000450727 686 ntTSL 3 BASIC6.34□□□□□ -1.39
SREBF2Q12772 AC068587.1-201ENST00000483613 781 ntBASIC6.34□□□□□ -1.39
SREBF2Q12772 BACH1-IT1-201ENST00000504298 821 ntTSL 1 (best) BASIC6.34□□□□□ -1.39
SREBF2Q12772 LINC02382-201ENST00000515840 614 ntTSL 1 (best) BASIC6.34□□□□□ -1.39
SREBF2Q12772 MEG8-217ENST00000556637 924 ntTSL 5 BASIC6.34□□□□□ -1.39
SREBF2Q12772 AL049779.3-201ENST00000557141 606 ntBASIC6.34□□□□□ -1.39
SREBF2Q12772 AC005670.2-201ENST00000571841 889 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.34□□□□□ -1.39
SREBF2Q12772 AC022154.1-203ENST00000594850 493 ntTSL 3 BASIC6.34□□□□□ -1.39
SREBF2Q12772 NANOGP3-201ENST00000605855 286 ntBASIC6.34□□□□□ -1.39
SREBF2Q12772 AC112211.1-201ENST00000607832 305 ntTSL 3 BASIC6.34□□□□□ -1.39
SREBF2Q12772 SLC8A1-AS1-218ENST00000610721 956 ntTSL 5 BASIC6.34□□□□□ -1.39
SREBF2Q12772 RDM1-226ENST00000619828 687 ntTSL 1 (best) BASIC6.34□□□□□ -1.39
SREBF2Q12772 AC012414.7-202ENST00000622705 1090 ntBASIC6.34□□□□□ -1.39
SREBF2Q12772 OSER1-AS1-205ENST00000623343 827 ntTSL 5 BASIC6.34□□□□□ -1.39
SREBF2Q12772 AC132825.8-201ENST00000640783 297 ntBASIC6.34□□□□□ -1.39
SREBF2Q12772 MCM10-202ENST00000378714 4547 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.34□□□□□ -1.39
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