Protein–RNA interactions for Protein: Q01094

E2F1, Transcription factor E2F1, humanhuman

Predictions only

Length 437 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
E2F1Q01094 ZNF761-203ENST00000454407 3967 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.85□□□□□ -1.47
E2F1Q01094 HSPD1P8-201ENST00000400121 1658 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
E2F1Q01094 FLG2-201ENST00000388718 9124 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.85□□□□□ -1.47
E2F1Q01094 NBPF19-205ENST00000612881 3715 ntTSL 5 BASIC5.85□□□□□ -1.47
E2F1Q01094 Z95114.1-201ENST00000624264 14574 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
E2F1Q01094 LINC01520-201ENST00000441457 1487 ntTSL 1 (best) BASIC5.85□□□□□ -1.47
E2F1Q01094 JCHAIN-201ENST00000254801 1438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.85□□□□□ -1.47
E2F1Q01094 ZNF112-201ENST00000337401 3321 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.85□□□□□ -1.47
E2F1Q01094 RABGAP1L-206ENST00000367688 1425 ntTSL 2 BASIC5.85□□□□□ -1.47
E2F1Q01094 ANK2-226ENST00000612754 6134 ntTSL 5 BASIC5.85□□□□□ -1.47
E2F1Q01094 AC007744.1-201ENST00000607540 2289 ntTSL 5 BASIC5.85□□□□□ -1.47
E2F1Q01094 CD84-201ENST00000311224 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.85□□□□□ -1.47
E2F1Q01094 ZNF28-201ENST00000339844 650 ntTSL 4 BASIC5.85□□□□□ -1.47
E2F1Q01094 MIR16-2-201ENST00000362117 81 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
E2F1Q01094 RN7SKP128-201ENST00000364270 303 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
E2F1Q01094 RNU105B-201ENST00000364478 208 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
E2F1Q01094 LIX1L-AS1-201ENST00000366105 377 ntTSL 5 BASIC5.85□□□□□ -1.47
E2F1Q01094 BX248415.1-201ENST00000367421 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.85□□□□□ -1.47
E2F1Q01094 MIR433-201ENST00000384837 93 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
E2F1Q01094 ANAPC10P1-201ENST00000395991 556 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
E2F1Q01094 AC016739.1-201ENST00000405359 345 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
E2F1Q01094 UBE2V1P14-201ENST00000415815 558 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
E2F1Q01094 AL158050.1-201ENST00000416077 457 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
E2F1Q01094 AC093155.2-201ENST00000420734 937 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
E2F1Q01094 AL390115.1-201ENST00000425271 423 ntTSL 5 BASIC5.85□□□□□ -1.47
E2F1Q01094 BX323845.3-201ENST00000428215 527 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
E2F1Q01094 Z93403.1-202ENST00000440002 713 ntTSL 3 BASIC5.85□□□□□ -1.47
E2F1Q01094 CD200R1-203ENST00000440122 847 ntTSL 1 (best) BASIC5.85□□□□□ -1.47
E2F1Q01094 RPL7P33-201ENST00000444159 742 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
E2F1Q01094 MTCYBP11-201ENST00000447254 1109 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
E2F1Q01094 AC016027.4-201ENST00000450866 277 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
E2F1Q01094 LINC02541-202ENST00000452675 465 ntTSL 5 BASIC5.85□□□□□ -1.47
E2F1Q01094 AC023245.1-201ENST00000468501 517 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
E2F1Q01094 AC104629.2-201ENST00000468627 598 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
E2F1Q01094 AC087071.2-201ENST00000483283 575 ntTSL 4 BASIC5.85□□□□□ -1.47
E2F1Q01094 HMGB1P3-201ENST00000502802 616 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
E2F1Q01094 AC096773.1-201ENST00000506852 648 ntTSL 3 BASIC5.85□□□□□ -1.47
E2F1Q01094 C5orf64-204ENST00000507461 535 ntTSL 4 BASIC5.85□□□□□ -1.47
E2F1Q01094 AC097103.2-204ENST00000510068 569 ntTSL 3 BASIC5.85□□□□□ -1.47
E2F1Q01094 AC104827.1-202ENST00000511917 1049 ntTSL 1 (best) BASIC5.85□□□□□ -1.47
E2F1Q01094 AC012625.1-201ENST00000515153 625 ntTSL 5 BASIC5.85□□□□□ -1.47
E2F1Q01094 RNU6-1334P-201ENST00000516032 105 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
E2F1Q01094 AC021451.1-201ENST00000523498 1129 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
E2F1Q01094 AF117829.1-209ENST00000523995 767 ntTSL 2 BASIC5.85□□□□□ -1.47
E2F1Q01094 MYBL1-206ENST00000524176 2148 ntTSL 1 (best) BASIC5.85□□□□□ -1.47
E2F1Q01094 GTF2H1-208ENST00000526630 932 ntTSL 2 BASIC5.85□□□□□ -1.47
E2F1Q01094 AP001893.1-201ENST00000532866 362 ntTSL 5 BASIC5.85□□□□□ -1.47
E2F1Q01094 RPA2P3-201ENST00000533268 770 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
E2F1Q01094 AC139103.1-201ENST00000534696 1030 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
E2F1Q01094 LDHC-203ENST00000535809 757 ntTSL 5 BASIC5.85□□□□□ -1.47
E2F1Q01094 AC024224.2-201ENST00000544225 782 ntTSL 3 BASIC5.85□□□□□ -1.47
E2F1Q01094 AP002518.2-201ENST00000544925 393 ntTSL 5 BASIC5.85□□□□□ -1.47
E2F1Q01094 AC108721.1-201ENST00000547088 348 ntTSL 3 BASIC5.85□□□□□ -1.47
E2F1Q01094 AL157756.1-203ENST00000553269 600 ntTSL 3 BASIC5.85□□□□□ -1.47
E2F1Q01094 LINC02329-201ENST00000554753 511 ntTSL 5 BASIC5.85□□□□□ -1.47
E2F1Q01094 NPM1P5-201ENST00000557228 838 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
E2F1Q01094 CMC2-208ENST00000564249 890 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.85□□□□□ -1.47
E2F1Q01094 MIR4489-201ENST00000578869 62 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
E2F1Q01094 MIR1273E-201ENST00000581165 102 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
E2F1Q01094 AC091151.1-201ENST00000587369 726 ntTSL 1 (best) BASIC5.85□□□□□ -1.47
E2F1Q01094 Z98949.1-228ENST00000595093 798 ntTSL 5 BASIC5.85□□□□□ -1.47
E2F1Q01094 SSX4B-201ENST00000595235 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.85□□□□□ -1.47
E2F1Q01094 SSX4-201ENST00000595689 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.85□□□□□ -1.47
E2F1Q01094 BNIP3P32-201ENST00000600015 554 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
E2F1Q01094 QTRT1P1-201ENST00000604344 1078 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
E2F1Q01094 AC008280.3-201ENST00000606436 732 ntTSL 5 BASIC5.85□□□□□ -1.47
E2F1Q01094 AC141002.1-201ENST00000607025 279 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
E2F1Q01094 AP005229.2-201ENST00000609980 697 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
E2F1Q01094 SDR42E1P1-201ENST00000611327 477 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
E2F1Q01094 AL031658.2-201ENST00000616850 651 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
E2F1Q01094 AC009120.7-201ENST00000623452 780 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
E2F1Q01094 AL078595.3-201ENST00000623815 1166 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
E2F1Q01094 AL357562.1-201ENST00000624911 609 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
E2F1Q01094 MYOCOS-203ENST00000637303 564 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC5.85□□□□□ -1.47
E2F1Q01094 UGT2B11-201ENST00000446444 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.85□□□□□ -1.47
E2F1Q01094 RASSF8-201ENST00000282884 1994 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.85□□□□□ -1.47
E2F1Q01094 AC099506.1-201ENST00000567359 4037 ntTSL 1 (best) BASIC5.85□□□□□ -1.47
E2F1Q01094 OBSCN-201ENST00000284548 20432 ntTSL 2 BASIC5.85□□□□□ -1.47
E2F1Q01094 APBB2-230ENST00000543538 6992 ntTSL 5 BASIC5.85□□□□□ -1.47
E2F1Q01094 SLC12A6-218ENST00000560611 4239 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC5.85□□□□□ -1.47
E2F1Q01094 PLCB4-201ENST00000278655 5430 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC5.85□□□□□ -1.47
E2F1Q01094 MEPE-209ENST00000560249 2206 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.84□□□□□ -1.47
E2F1Q01094 CRYZ-204ENST00000370872 1592 ntTSL 1 (best) BASIC5.84□□□□□ -1.47
E2F1Q01094 ZNF679-202ENST00000421025 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.84□□□□□ -1.47
E2F1Q01094 ALKBH8-205ENST00000428149 4079 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.84□□□□□ -1.47
E2F1Q01094 CTTNBP2NL-201ENST00000271277 5897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.84□□□□□ -1.47
E2F1Q01094 NFAT5-212ENST00000627621 5875 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC5.84□□□□□ -1.47
E2F1Q01094 MMP13-201ENST00000260302 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.84□□□□□ -1.47
E2F1Q01094 AL137058.3-201ENST00000624531 3099 ntBASIC5.84□□□□□ -1.47
E2F1Q01094 PDZK1P1-202ENST00000425209 1350 ntBASIC5.84□□□□□ -1.47
E2F1Q01094 BCL2L14-213ENST00000589718 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.84□□□□□ -1.47
E2F1Q01094 PUS10-203ENST00000407787 1820 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.84□□□□□ -1.47
E2F1Q01094 KIAA1328-201ENST00000280020 4853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.84□□□□□ -1.47
E2F1Q01094 ZC2HC1B-201ENST00000237275 1002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.84□□□□□ -1.47
E2F1Q01094 KRTAP23-1-201ENST00000334160 211 ntAPPRIS P1 BASIC5.84□□□□□ -1.47
E2F1Q01094 SSX5-202ENST00000347757 1261 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.84□□□□□ -1.47
E2F1Q01094 RN7SKP160-201ENST00000363804 340 ntBASIC5.84□□□□□ -1.47
E2F1Q01094 SSX5-203ENST00000376923 1208 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.84□□□□□ -1.47
E2F1Q01094 OR51F1-201ENST00000380383 960 ntAPPRIS P5 BASIC5.84□□□□□ -1.47
E2F1Q01094 MIR105-2-201ENST00000385083 81 ntBASIC5.84□□□□□ -1.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 92.5 ms