Protein–RNA interactions for Protein: P45954

ACADSB, Short/branched chain specific acyl-CoA dehydrogenase, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 432 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ACADSBP45954 BCLAF1-201ENST00000353331 7110 ntTSL 5 BASIC5.79□□□□□ -1.48
ACADSBP45954 TRPC4-202ENST00000355779 2784 ntTSL 1 (best) BASIC5.79□□□□□ -1.48
ACADSBP45954 SAMSN1-203ENST00000400566 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.79□□□□□ -1.48
ACADSBP45954 AC018809.2-201ENST00000602436 3823 ntBASIC5.79□□□□□ -1.48
ACADSBP45954 INO80D-201ENST00000403263 14136 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.79□□□□□ -1.48
ACADSBP45954 EEF1A1P30-201ENST00000429708 1315 ntBASIC5.79□□□□□ -1.48
ACADSBP45954 TEDDM1-201ENST00000367565 2500 ntAPPRIS P1 BASIC5.79□□□□□ -1.48
ACADSBP45954 MTX3-204ENST00000617335 6155 ntTSL 2 BASIC5.79□□□□□ -1.48
ACADSBP45954 C4orf17-201ENST00000326581 1636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.79□□□□□ -1.48
ACADSBP45954 MYRFL-201ENST00000299350 820 ntTSL 5 BASIC5.79□□□□□ -1.48
ACADSBP45954 RNA5SP319-201ENST00000362768 119 ntBASIC5.79□□□□□ -1.48
ACADSBP45954 RN7SKP69-201ENST00000365390 305 ntBASIC5.79□□□□□ -1.48
ACADSBP45954 U3.28-201ENST00000391249 210 ntBASIC5.79□□□□□ -1.48
ACADSBP45954 RPL34-203ENST00000394668 853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.79□□□□□ -1.48
ACADSBP45954 RPSAP35-201ENST00000413753 818 ntBASIC5.79□□□□□ -1.48
ACADSBP45954 AL158827.1-201ENST00000416300 391 ntBASIC5.79□□□□□ -1.48
ACADSBP45954 SPARCL1-202ENST00000418378 2994 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.79□□□□□ -1.48
ACADSBP45954 RPL12P17-201ENST00000432393 498 ntBASIC5.79□□□□□ -1.48
ACADSBP45954 AC099670.2-201ENST00000435130 321 ntBASIC5.79□□□□□ -1.48
ACADSBP45954 C2orf80-206ENST00000451346 979 ntTSL 5 BASIC5.79□□□□□ -1.48
ACADSBP45954 RN7SKP99-201ENST00000517028 307 ntBASIC5.79□□□□□ -1.48
ACADSBP45954 AC039056.1-201ENST00000552704 467 ntTSL 3 BASIC5.79□□□□□ -1.48
ACADSBP45954 POU1F1-203ENST00000560656 647 ntTSL 5 BASIC5.79□□□□□ -1.48
ACADSBP45954 AP005242.1-201ENST00000583946 467 ntTSL 3 BASIC5.79□□□□□ -1.48
ACADSBP45954 AC022031.2-203ENST00000587346 565 ntTSL 4 BASIC5.79□□□□□ -1.48
ACADSBP45954 LINC01198-207ENST00000598084 881 ntTSL 5 BASIC5.79□□□□□ -1.48
ACADSBP45954 AL050403.2-203ENST00000603180 558 ntTSL 4 BASIC5.79□□□□□ -1.48
ACADSBP45954 AL035587.1-202ENST00000607218 984 ntTSL 3 BASIC5.79□□□□□ -1.48
ACADSBP45954 AC063952.1-204ENST00000635496 927 ntTSL 5 BASIC5.79□□□□□ -1.48
ACADSBP45954 AC087667.1-201ENST00000500180 1422 ntTSL 1 (best) BASIC5.79□□□□□ -1.48
ACADSBP45954 SENP1-205ENST00000549595 1932 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC5.79□□□□□ -1.48
ACADSBP45954 AC007750.1-202ENST00000418968 4098 ntTSL 5 BASIC5.79□□□□□ -1.48
ACADSBP45954 ZNF81-202ENST00000338637 7859 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC5.79□□□□□ -1.48
ACADSBP45954 AC245100.4-204ENST00000635587 1555 ntTSL 5 BASIC5.79□□□□□ -1.48
ACADSBP45954 CEACAM1-201ENST00000161559 3519 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.79□□□□□ -1.48
ACADSBP45954 AL138820.1-201ENST00000617901 5305 ntBASIC5.79□□□□□ -1.48
ACADSBP45954 CASC19-248ENST00000641674 1356 ntBASIC5.79□□□□□ -1.48
ACADSBP45954 EBF1-211ENST00000622875 4430 ntTSL 5 BASIC5.79□□□□□ -1.48
ACADSBP45954 RPL7-204ENST00000396467 1526 ntTSL 3 BASIC5.79□□□□□ -1.48
ACADSBP45954 AC007342.5-201ENST00000571340 2142 ntBASIC5.78□□□□□ -1.48
ACADSBP45954 LGALS8-222ENST00000527974 1349 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC5.78□□□□□ -1.48
ACADSBP45954 AASDH-210ENST00000602986 3480 ntTSL 5 BASIC5.78□□□□□ -1.48
ACADSBP45954 LIX1-AS1-201ENST00000504578 1793 ntTSL 5 BASIC5.78□□□□□ -1.48
ACADSBP45954 AKAP6-212ENST00000557272 4601 ntTSL 5 BASIC5.78□□□□□ -1.48
ACADSBP45954 MMP8-201ENST00000236826 3056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.78□□□□□ -1.48
ACADSBP45954 RNA5SP453-201ENST00000362503 119 ntBASIC5.78□□□□□ -1.48
ACADSBP45954 SNORD56.6-201ENST00000384569 71 ntBASIC5.78□□□□□ -1.48
ACADSBP45954 AL355994.1-201ENST00000424379 260 ntBASIC5.78□□□□□ -1.48
ACADSBP45954 FTLP19-201ENST00000433300 394 ntBASIC5.78□□□□□ -1.48
ACADSBP45954 AL390119.1-201ENST00000440329 312 ntBASIC5.78□□□□□ -1.48
ACADSBP45954 ADAM29-203ENST00000445694 3244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.78□□□□□ -1.48
ACADSBP45954 AC016724.1-201ENST00000453215 421 ntBASIC5.78□□□□□ -1.48
ACADSBP45954 AL022329.1-203ENST00000453811 451 ntTSL 3 BASIC5.78□□□□□ -1.48
ACADSBP45954 RN7SL51P-201ENST00000468230 285 ntBASIC5.78□□□□□ -1.48
ACADSBP45954 SEPT7P9-201ENST00000475691 413 ntTSL 1 (best) BASIC5.78□□□□□ -1.48
ACADSBP45954 AC090638.1-201ENST00000498296 909 ntBASIC5.78□□□□□ -1.48
ACADSBP45954 GOLGA5P1-201ENST00000507317 980 ntBASIC5.78□□□□□ -1.48
ACADSBP45954 SEMA6A-AS1-202ENST00000508424 862 ntTSL 3 BASIC5.78□□□□□ -1.48
ACADSBP45954 AC021106.1-201ENST00000509020 1058 ntBASIC5.78□□□□□ -1.48
ACADSBP45954 AC010451.1-201ENST00000509057 556 ntTSL 3 BASIC5.78□□□□□ -1.48
ACADSBP45954 AC079226.2-201ENST00000509283 518 ntTSL 2 BASIC5.78□□□□□ -1.48
ACADSBP45954 MTND6P2-201ENST00000512226 524 ntBASIC5.78□□□□□ -1.48
ACADSBP45954 AC104212.3-201ENST00000522044 444 ntTSL 3 BASIC5.78□□□□□ -1.48
ACADSBP45954 AP001266.2-201ENST00000534505 464 ntTSL 4 BASIC5.78□□□□□ -1.48
ACADSBP45954 AC078878.1-201ENST00000539832 958 ntBASIC5.78□□□□□ -1.48
ACADSBP45954 AC006206.1-201ENST00000544842 3387 ntBASIC5.78□□□□□ -1.48
ACADSBP45954 AC103740.1-201ENST00000558888 7427 ntTSL 2 BASIC5.78□□□□□ -1.48
ACADSBP45954 AC009117.3-202ENST00000563825 557 ntTSL 4 BASIC5.78□□□□□ -1.48
ACADSBP45954 AC087500.2-201ENST00000575056 498 ntTSL 5 BASIC5.78□□□□□ -1.48
ACADSBP45954 AL589674.2-201ENST00000604304 337 ntBASIC5.78□□□□□ -1.48
ACADSBP45954 TULP3P1-203ENST00000606237 586 ntTSL 4 BASIC5.78□□□□□ -1.48
ACADSBP45954 AC010245.2-201ENST00000606908 1167 ntBASIC5.78□□□□□ -1.48
ACADSBP45954 HNF1A-AS1-205ENST00000619441 343 ntTSL 3 BASIC5.78□□□□□ -1.48
ACADSBP45954 LINC01553-203ENST00000521074 4329 ntTSL 1 (best) BASIC5.78□□□□□ -1.48
ACADSBP45954 IGF2BP2-AS1-202ENST00000456447 1531 ntTSL 1 (best) BASIC5.78□□□□□ -1.48
ACADSBP45954 MOXD1-201ENST00000336749 2950 ntTSL 1 (best) BASIC5.78□□□□□ -1.48
ACADSBP45954 METTL15-201ENST00000303459 4068 ntTSL 2 BASIC5.78□□□□□ -1.48
ACADSBP45954 AL121839.2-201ENST00000565058 6943 ntBASIC5.78□□□□□ -1.48
ACADSBP45954 SGIP1-203ENST00000371037 7768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.78□□□□□ -1.48
ACADSBP45954 AC007938.2-201ENST00000604666 2634 ntBASIC5.78□□□□□ -1.48
ACADSBP45954 FRAS1-207ENST00000512123 15624 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.77□□□□□ -1.48
ACADSBP45954 RAPH1-207ENST00000423104 1860 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.77□□□□□ -1.49
ACADSBP45954 RAPH1-209ENST00000439222 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.77□□□□□ -1.49
ACADSBP45954 HIF1AN-201ENST00000299163 13011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.77□□□□□ -1.49
ACADSBP45954 RYR3-201ENST00000389232 15552 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.77□□□□□ -1.49
ACADSBP45954 OR1L4-201ENST00000259466 936 ntAPPRIS P1 BASIC5.77□□□□□ -1.49
ACADSBP45954 LDHC-201ENST00000280704 1256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.77□□□□□ -1.49
ACADSBP45954 TRAJ38-201ENST00000390499 62 ntAPPRIS P1 BASIC5.77□□□□□ -1.49
ACADSBP45954 AC073257.2-201ENST00000413991 528 ntTSL 3 BASIC5.77□□□□□ -1.49
ACADSBP45954 ATP13A4-AS1-202ENST00000431512 394 ntTSL 3 BASIC5.77□□□□□ -1.49
ACADSBP45954 AC017002.1-201ENST00000432268 881 ntTSL 5 BASIC5.77□□□□□ -1.49
ACADSBP45954 LINC02094-201ENST00000437646 520 ntTSL 2 BASIC5.77□□□□□ -1.49
ACADSBP45954 AC023271.1-201ENST00000445936 1090 ntBASIC5.77□□□□□ -1.49
ACADSBP45954 LINC01422-203ENST00000447149 509 ntTSL 4 BASIC5.77□□□□□ -1.49
ACADSBP45954 AC105399.1-202ENST00000447303 205 ntBASIC5.77□□□□□ -1.49
ACADSBP45954 AL672138.1-201ENST00000450604 1015 ntBASIC5.77□□□□□ -1.49
ACADSBP45954 LINC01436-201ENST00000457157 1048 ntTSL 2 BASIC5.77□□□□□ -1.49
ACADSBP45954 NCK1-AS1-201ENST00000461864 1194 ntTSL 2 BASIC5.77□□□□□ -1.49
ACADSBP45954 AC090589.1-201ENST00000473109 362 ntBASIC5.77□□□□□ -1.49
ACADSBP45954 EIF1P7-201ENST00000487533 337 ntBASIC5.77□□□□□ -1.49
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 78.4 ms