Protein–RNA interactions for Protein: P35452

HOXD12, Homeobox protein Hox-D12, humanhuman

Predictions only

Length 270 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXD12P35452 OR2M1P-201ENST00000318104 951 ntBASIC6.05□□□□□ -1.44
HOXD12P35452 KRTAP23-1-201ENST00000334160 211 ntAPPRIS P1 BASIC6.05□□□□□ -1.44
HOXD12P35452 RN7SKP160-201ENST00000363804 340 ntBASIC6.05□□□□□ -1.44
HOXD12P35452 GCNT6-201ENST00000379591 934 ntBASIC6.05□□□□□ -1.44
HOXD12P35452 AL356057.1-202ENST00000402263 756 ntBASIC6.05□□□□□ -1.44
HOXD12P35452 AC016739.1-201ENST00000405359 345 ntBASIC6.05□□□□□ -1.44
HOXD12P35452 AMZ2P2-201ENST00000406819 1057 ntBASIC6.05□□□□□ -1.44
HOXD12P35452 MIR1178-201ENST00000408396 91 ntBASIC6.05□□□□□ -1.44
HOXD12P35452 AC099566.1-204ENST00000413825 943 ntTSL 3 BASIC6.05□□□□□ -1.44
HOXD12P35452 AC063965.1-201ENST00000416679 499 ntTSL 3 BASIC6.05□□□□□ -1.44
HOXD12P35452 LINC01752-201ENST00000417299 438 ntTSL 2 BASIC6.05□□□□□ -1.44
HOXD12P35452 Z98742.1-201ENST00000419801 632 ntTSL 3 BASIC6.05□□□□□ -1.44
HOXD12P35452 SFR1P2-201ENST00000421841 730 ntBASIC6.05□□□□□ -1.44
HOXD12P35452 AC066595.1-201ENST00000426697 399 ntTSL 3 BASIC6.05□□□□□ -1.44
HOXD12P35452 AC003991.1-210ENST00000434733 1048 ntTSL 3 BASIC6.05□□□□□ -1.44
HOXD12P35452 RPL12P18-201ENST00000437175 325 ntBASIC6.05□□□□□ -1.44
HOXD12P35452 HSPE1P22-201ENST00000456856 327 ntBASIC6.05□□□□□ -1.44
HOXD12P35452 AC004069.1-201ENST00000504082 549 ntTSL 4 BASIC6.05□□□□□ -1.44
HOXD12P35452 HAUS1P1-201ENST00000505275 832 ntBASIC6.05□□□□□ -1.44
HOXD12P35452 LINC02432-203ENST00000511213 719 ntTSL 2 BASIC6.05□□□□□ -1.44
HOXD12P35452 AC006296.1-201ENST00000514401 591 ntTSL 2 BASIC6.05□□□□□ -1.44
HOXD12P35452 RNA5SP362-201ENST00000516048 118 ntBASIC6.05□□□□□ -1.44
HOXD12P35452 AC040970.1-202ENST00000517908 505 ntTSL 3 BASIC6.05□□□□□ -1.44
HOXD12P35452 IGLV2-28-201ENST00000520681 304 ntBASIC6.05□□□□□ -1.44
HOXD12P35452 THUMPD3-AS1-215ENST00000521609 793 ntTSL 5 BASIC6.05□□□□□ -1.44
HOXD12P35452 LINC01033-204ENST00000523194 715 ntTSL 2 BASIC6.05□□□□□ -1.44
HOXD12P35452 PCNAP4-201ENST00000532690 730 ntBASIC6.05□□□□□ -1.44
HOXD12P35452 SULT6B1-205ENST00000535679 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.05□□□□□ -1.44
HOXD12P35452 DCN-209ENST00000546745 1026 ntTSL 3 BASIC6.05□□□□□ -1.44
HOXD12P35452 AC021351.1-202ENST00000561394 701 ntTSL 3 BASIC6.05□□□□□ -1.44
HOXD12P35452 ARPP19-205ENST00000563566 568 ntTSL 4 BASIC6.05□□□□□ -1.44
HOXD12P35452 MIR1273E-201ENST00000581165 102 ntBASIC6.05□□□□□ -1.44
HOXD12P35452 SLC14A2-AS1-204ENST00000592899 359 ntTSL 3 BASIC6.05□□□□□ -1.44
HOXD12P35452 AL589674.2-201ENST00000604304 337 ntBASIC6.05□□□□□ -1.44
HOXD12P35452 AC006924.1-201ENST00000610750 559 ntBASIC6.05□□□□□ -1.44
HOXD12P35452 AC022106.1-201ENST00000612834 766 ntBASIC6.05□□□□□ -1.44
HOXD12P35452 AP005431.1-201ENST00000618479 319 ntBASIC6.05□□□□□ -1.44
HOXD12P35452 AC010872.1-201ENST00000624225 675 ntBASIC6.05□□□□□ -1.44
HOXD12P35452 AC079776.5-201ENST00000641920 211 ntBASIC6.05□□□□□ -1.44
HOXD12P35452 AC127164.1-201ENST00000548738 4196 ntTSL 2 BASIC6.05□□□□□ -1.44
HOXD12P35452 LINC00702-203ENST00000608792 6300 ntTSL 4 BASIC6.05□□□□□ -1.44
HOXD12P35452 HHLA2-211ENST00000619531 2548 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC6.05□□□□□ -1.44
HOXD12P35452 ADGRL2-202ENST00000359929 4674 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.05□□□□□ -1.44
HOXD12P35452 NSD1-201ENST00000347982 7688 ntTSL 1 (best) BASIC6.05□□□□□ -1.44
HOXD12P35452 SLX4IP-201ENST00000334534 6062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.05□□□□□ -1.44
HOXD12P35452 RAP1GDS1-202ENST00000339360 2092 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC6.05□□□□□ -1.44
HOXD12P35452 CYP3A43-204ENST00000354829 1709 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC6.05□□□□□ -1.44
HOXD12P35452 NEPNP-201ENST00000404786 1371 ntBASIC6.05□□□□□ -1.44
HOXD12P35452 HPS5-205ENST00000438420 4147 ntTSL 1 (best) BASIC6.05□□□□□ -1.44
HOXD12P35452 AP4S1-212ENST00000622409 4113 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC6.05□□□□□ -1.44
HOXD12P35452 F13B-201ENST00000367412 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.05□□□□□ -1.44
HOXD12P35452 VPS35P1-201ENST00000563400 1518 ntBASIC6.04□□□□□ -1.44
HOXD12P35452 LINC01470-202ENST00000506723 2193 ntTSL 2 BASIC6.04□□□□□ -1.44
HOXD12P35452 CEACAM1-203ENST00000352591 3170 ntTSL 1 (best) BASIC6.04□□□□□ -1.44
HOXD12P35452 CAPRIN2-202ENST00000395805 4156 ntTSL 1 (best) BASIC6.04□□□□□ -1.44
HOXD12P35452 AC025809.2-201ENST00000625085 1802 ntBASIC6.04□□□□□ -1.44
HOXD12P35452 INSIG2-208ENST00000614681 1347 ntTSL 5 BASIC6.04□□□□□ -1.44
HOXD12P35452 YPEL5-202ENST00000379519 2499 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.04□□□□□ -1.44
HOXD12P35452 SLC1A2-202ENST00000395750 11538 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC6.04□□□□□ -1.44
HOXD12P35452 ZC2HC1B-201ENST00000237275 1002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.04□□□□□ -1.44
HOXD12P35452 OR2AE1-201ENST00000316368 1071 ntAPPRIS P1 BASIC6.04□□□□□ -1.44
HOXD12P35452 RNA5SP132-201ENST00000364725 118 ntBASIC6.04□□□□□ -1.44
HOXD12P35452 AL360271.1-201ENST00000395679 510 ntBASIC6.04□□□□□ -1.44
HOXD12P35452 AL390115.1-201ENST00000425271 423 ntTSL 5 BASIC6.04□□□□□ -1.44
HOXD12P35452 AL353148.1-203ENST00000452286 665 ntTSL 3 BASIC6.04□□□□□ -1.44
HOXD12P35452 AC069277.2-201ENST00000454211 432 ntBASIC6.04□□□□□ -1.44
HOXD12P35452 LARP7P4-201ENST00000481075 878 ntBASIC6.04□□□□□ -1.44
HOXD12P35452 AC114728.1-201ENST00000488289 483 ntBASIC6.04□□□□□ -1.44
HOXD12P35452 LINC01612-201ENST00000504509 469 ntTSL 3 BASIC6.04□□□□□ -1.44
HOXD12P35452 SNORA58-201ENST00000505219 137 ntBASIC6.04□□□□□ -1.44
HOXD12P35452 LINC01217-201ENST00000514427 562 ntTSL 4 BASIC6.04□□□□□ -1.44
HOXD12P35452 AC097537.1-201ENST00000514864 1213 ntTSL 1 (best) BASIC6.04□□□□□ -1.44
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HOXD12P35452 AC074029.2-201ENST00000551045 634 ntBASIC6.04□□□□□ -1.44
HOXD12P35452 AL355922.5-201ENST00000553534 351 ntTSL 3 BASIC6.04□□□□□ -1.44
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HOXD12P35452 AL356801.1-201ENST00000559320 294 ntBASIC6.04□□□□□ -1.44
HOXD12P35452 THSD4-AS1-201ENST00000561571 554 ntTSL 5 BASIC6.04□□□□□ -1.44
HOXD12P35452 AC106785.3-201ENST00000564064 847 ntBASIC6.04□□□□□ -1.44
HOXD12P35452 LINC00921-201ENST00000572123 243 ntTSL 5 BASIC6.04□□□□□ -1.44
HOXD12P35452 MIR4760-201ENST00000585040 80 ntBASIC6.04□□□□□ -1.44
HOXD12P35452 AC091151.1-201ENST00000587369 726 ntTSL 1 (best) BASIC6.04□□□□□ -1.44
HOXD12P35452 SNX6P1-201ENST00000601728 1224 ntBASIC6.04□□□□□ -1.44
HOXD12P35452 BMS1P7-201ENST00000602440 1052 ntBASIC6.04□□□□□ -1.44
HOXD12P35452 LINC00458-206ENST00000607494 849 ntTSL 3 BASIC6.04□□□□□ -1.44
HOXD12P35452 AL355802.4-201ENST00000607635 548 ntBASIC6.04□□□□□ -1.44
HOXD12P35452 ASNSD1-209ENST00000607829 581 ntTSL 2 BASIC6.04□□□□□ -1.44
HOXD12P35452 MKKS-203ENST00000609375 882 ntTSL 2 BASIC6.04□□□□□ -1.44
HOXD12P35452 AL445493.3-201ENST00000619568 477 ntBASIC6.04□□□□□ -1.44
HOXD12P35452 AL691477.1-201ENST00000624398 162 ntBASIC6.04□□□□□ -1.44
HOXD12P35452 AC004160.1-201ENST00000625468 929 ntTSL 5 BASIC6.04□□□□□ -1.44
HOXD12P35452 MIR193BHG-214ENST00000641765 509 ntBASIC6.04□□□□□ -1.44
HOXD12P35452 PROM1-201ENST00000447510 3977 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.04□□□□□ -1.44
HOXD12P35452 STK32A-202ENST00000397936 5393 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.04□□□□□ -1.44
HOXD12P35452 CASC19-281ENST00000642118 1554 ntBASIC6.04□□□□□ -1.44
HOXD12P35452 ZNF578-201ENST00000421239 2017 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.04□□□□□ -1.44
HOXD12P35452 MPDZ-202ENST00000319217 7722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.04□□□□□ -1.44
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