Protein–RNA interactions for Protein: P31415

CASQ1, Calsequestrin-1, humanhuman

Predictions only

Length 396 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CASQ1P31415 OR5B17-201ENST00000357377 946 ntAPPRIS P1 BASIC5.85□□□□□ -1.47
CASQ1P31415 SLC30A7-201ENST00000357650 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.85□□□□□ -1.47
CASQ1P31415 CDC123-202ENST00000378900 933 ntTSL 5 BASIC5.85□□□□□ -1.47
CASQ1P31415 PLIN2-203ENST00000380465 631 ntTSL 2 BASIC5.85□□□□□ -1.47
CASQ1P31415 ARSFP1-201ENST00000398758 477 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
CASQ1P31415 CEACAM1-208ENST00000403461 1263 ntTSL 1 (best) BASIC5.85□□□□□ -1.47
CASQ1P31415 AL138828.1-204ENST00000413745 898 ntTSL 5 BASIC5.85□□□□□ -1.47
CASQ1P31415 MRPL53P1-201ENST00000414323 319 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
CASQ1P31415 AC004882.2-201ENST00000420180 244 ntTSL 5 BASIC5.85□□□□□ -1.47
CASQ1P31415 RPL7AP51-201ENST00000422016 760 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
CASQ1P31415 AC012519.1-201ENST00000424588 610 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
CASQ1P31415 AC005077.1-201ENST00000449226 375 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
CASQ1P31415 PPIAP32-201ENST00000449940 472 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
CASQ1P31415 RN7SL583P-201ENST00000475692 287 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
CASQ1P31415 NIFKP7-201ENST00000503365 834 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
CASQ1P31415 CXCL11-202ENST00000503860 767 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC5.85□□□□□ -1.47
CASQ1P31415 AC139720.1-201ENST00000509497 512 ntTSL 3 BASIC5.85□□□□□ -1.47
CASQ1P31415 AC108103.1-201ENST00000511286 446 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
CASQ1P31415 AC134698.1-201ENST00000511619 643 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
CASQ1P31415 HAND2-AS1-233ENST00000515345 797 ntTSL 3 BASIC5.85□□□□□ -1.47
CASQ1P31415 AC037450.1-201ENST00000518129 647 ntTSL 3 BASIC5.85□□□□□ -1.47
CASQ1P31415 OR8G3P-201ENST00000533406 921 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
CASQ1P31415 MIR4307HG-201ENST00000548170 822 ntTSL 3 BASIC5.85□□□□□ -1.47
CASQ1P31415 AC006530.1-201ENST00000555980 571 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
CASQ1P31415 AL359232.1-202ENST00000556874 1206 ntTSL 2 BASIC5.85□□□□□ -1.47
CASQ1P31415 MIR4776-2-201ENST00000580204 80 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
CASQ1P31415 AL512430.4-201ENST00000603085 613 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
CASQ1P31415 Z93930.3-201ENST00000607919 749 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
CASQ1P31415 AL159169.2-201ENST00000610061 1269 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
CASQ1P31415 MIR6809-201ENST00000612189 116 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
CASQ1P31415 CCL23-201ENST00000612516 569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.85□□□□□ -1.47
CASQ1P31415 AL161457.2-202ENST00000629161 743 ntTSL 5 BASIC5.85□□□□□ -1.47
CASQ1P31415 DARS-AS1-230ENST00000631306 530 ntTSL 5 BASIC5.85□□□□□ -1.47
CASQ1P31415 AC010325.3-201ENST00000641084 394 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
CASQ1P31415 SAMSN1-206ENST00000619120 2028 ntTSL 1 (best) BASIC5.85□□□□□ -1.47
CASQ1P31415 VPS13D-213ENST00000613099 16245 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC5.85□□□□□ -1.47
CASQ1P31415 AC100778.3-201ENST00000580060 1750 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
CASQ1P31415 ZNF92-203ENST00000431504 2947 ntTSL 1 (best) BASIC5.85□□□□□ -1.47
CASQ1P31415 DOCK9-207ENST00000442173 7643 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.84□□□□□ -1.47
CASQ1P31415 EIF3E-206ENST00000519030 1324 ntTSL 5 BASIC5.84□□□□□ -1.47
CASQ1P31415 SLC24A2-202ENST00000341998 10749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.84□□□□□ -1.47
CASQ1P31415 ZNF117-201ENST00000282869 9080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.84□□□□□ -1.47
CASQ1P31415 AL353784.1-201ENST00000422842 2300 ntTSL 1 (best) BASIC5.84□□□□□ -1.47
CASQ1P31415 SCGB3A2-201ENST00000296694 515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.84□□□□□ -1.47
CASQ1P31415 RNA5SP30-201ENST00000365552 115 ntBASIC5.84□□□□□ -1.47
CASQ1P31415 TRAJ4-201ENST00000390533 63 ntAPPRIS P1 BASIC5.84□□□□□ -1.47
CASQ1P31415 AC007966.1-201ENST00000421998 1179 ntTSL 1 (best) BASIC5.84□□□□□ -1.47
CASQ1P31415 AC007161.1-204ENST00000423039 460 ntBASIC5.84□□□□□ -1.47
CASQ1P31415 AC244453.3-201ENST00000426275 459 ntTSL 5 BASIC5.84□□□□□ -1.47
CASQ1P31415 CA1-201ENST00000431316 1232 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.84□□□□□ -1.47
CASQ1P31415 AC090018.1-201ENST00000434369 367 ntBASIC5.84□□□□□ -1.47
CASQ1P31415 AC019117.1-202ENST00000439046 589 ntTSL 3 BASIC5.84□□□□□ -1.47
CASQ1P31415 AL450023.1-201ENST00000450868 751 ntBASIC5.84□□□□□ -1.47
CASQ1P31415 TMSB4X-204ENST00000451311 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.84□□□□□ -1.47
CASQ1P31415 RN7SL393P-201ENST00000463588 296 ntBASIC5.84□□□□□ -1.47
CASQ1P31415 DAP3-209ENST00000465375 729 ntTSL 2 BASIC5.84□□□□□ -1.47
CASQ1P31415 PTPN20-212ENST00000502254 599 ntTSL 1 (best) BASIC5.84□□□□□ -1.47
CASQ1P31415 SCGB3A2-202ENST00000504320 440 ntTSL 3 BASIC5.84□□□□□ -1.47
CASQ1P31415 AC069272.1-201ENST00000514843 680 ntTSL 3 BASIC5.84□□□□□ -1.47
CASQ1P31415 AC097537.1-201ENST00000514864 1213 ntTSL 1 (best) BASIC5.84□□□□□ -1.47
CASQ1P31415 SCARNA6.1-201ENST00000516989 238 ntBASIC5.84□□□□□ -1.47
CASQ1P31415 TBCA-207ENST00000520039 157 ntTSL 3 BASIC5.84□□□□□ -1.47
CASQ1P31415 ST3GAL3-232ENST00000531451 420 ntTSL 1 (best) BASIC5.84□□□□□ -1.47
CASQ1P31415 AC107918.3-201ENST00000533272 382 ntBASIC5.84□□□□□ -1.47
CASQ1P31415 GPRC5D-AS1-205ENST00000540198 404 ntTSL 5 BASIC5.84□□□□□ -1.47
CASQ1P31415 OR11H3P-201ENST00000554547 982 ntBASIC5.84□□□□□ -1.47
CASQ1P31415 AL133371.1-201ENST00000555481 764 ntTSL 2 BASIC5.84□□□□□ -1.47
CASQ1P31415 AC136944.1-201ENST00000567464 560 ntTSL 5 BASIC5.84□□□□□ -1.47
CASQ1P31415 AC092070.2-201ENST00000597550 545 ntTSL 4 BASIC5.84□□□□□ -1.47
CASQ1P31415 AL078624.2-201ENST00000605063 554 ntBASIC5.84□□□□□ -1.47
CASQ1P31415 AL035587.1-202ENST00000607218 984 ntTSL 3 BASIC5.84□□□□□ -1.47
CASQ1P31415 SSX4B-202ENST00000619890 1092 ntTSL 5 BASIC5.84□□□□□ -1.47
CASQ1P31415 SSX4-202ENST00000620320 1092 ntTSL 5 BASIC5.84□□□□□ -1.47
CASQ1P31415 AC025262.3-201ENST00000623666 360 ntBASIC5.84□□□□□ -1.47
CASQ1P31415 AC135068.5-201ENST00000624197 983 ntBASIC5.84□□□□□ -1.47
CASQ1P31415 SPTY2D1-AS1-206ENST00000636011 853 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.84□□□□□ -1.47
CASQ1P31415 AMY2B-201ENST00000361355 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.84□□□□□ -1.47
CASQ1P31415 EIF3M-208ENST00000531120 5051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.84□□□□□ -1.47
CASQ1P31415 KCNT2-203ENST00000451324 3146 ntTSL 1 (best) BASIC5.84□□□□□ -1.47
CASQ1P31415 GLYATL1-202ENST00000317391 1627 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.84□□□□□ -1.47
CASQ1P31415 AC091305.2-201ENST00000624049 1576 ntBASIC5.84□□□□□ -1.48
CASQ1P31415 OR10K1-203ENST00000641432 3775 ntAPPRIS P1 BASIC5.84□□□□□ -1.48
CASQ1P31415 GPATCH2L-214ENST00000621494 12396 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.84□□□□□ -1.48
CASQ1P31415 KCNJ16-202ENST00000392670 4009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.83□□□□□ -1.48
CASQ1P31415 UBE3A-205ENST00000566215 3176 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.83□□□□□ -1.48
CASQ1P31415 TRAPPC13-201ENST00000231526 2715 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC5.83□□□□□ -1.48
CASQ1P31415 C8orf4-201ENST00000315792 1854 ntAPPRIS P1 BASIC5.83□□□□□ -1.48
CASQ1P31415 DNAH7-202ENST00000409063 1845 ntTSL 1 (best) BASIC5.83□□□□□ -1.48
CASQ1P31415 PDZK1P1-202ENST00000425209 1350 ntBASIC5.83□□□□□ -1.48
CASQ1P31415 PALMD-201ENST00000263174 2510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.83□□□□□ -1.48
CASQ1P31415 TMLHE-AS1-201ENST00000433624 1702 ntTSL 1 (best) BASIC5.83□□□□□ -1.48
CASQ1P31415 DTNA-202ENST00000283365 6522 ntTSL 5 BASIC5.83□□□□□ -1.48
CASQ1P31415 RLN1-201ENST00000223862 967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.83□□□□□ -1.48
CASQ1P31415 AGBL4-201ENST00000334103 881 ntTSL 5 BASIC5.83□□□□□ -1.48
CASQ1P31415 SPRR2E-202ENST00000368751 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.83□□□□□ -1.48
CASQ1P31415 OR5L2-201ENST00000378397 936 ntAPPRIS P1 BASIC5.83□□□□□ -1.48
CASQ1P31415 MIR1271-201ENST00000408537 86 ntBASIC5.83□□□□□ -1.48
CASQ1P31415 RNA5SP198-201ENST00000410376 127 ntBASIC5.83□□□□□ -1.48
CASQ1P31415 AL035422.1-201ENST00000414193 397 ntBASIC5.83□□□□□ -1.48
CASQ1P31415 AC023347.1-202ENST00000419223 440 ntTSL 5 BASIC5.83□□□□□ -1.48
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 126.3 ms