Protein–RNA interactions for Protein: O43365

HOXA3, Homeobox protein Hox-A3, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 443 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXA3O43365 AC003991.1-201ENST00000594469 484 ntTSL 5 BASIC5.5□□□□□ -1.53
HOXA3O43365 AC020914.7-201ENST00000594477 545 ntBASIC5.5□□□□□ -1.53
HOXA3O43365 AL451074.6-201ENST00000608512 729 ntBASIC5.5□□□□□ -1.53
HOXA3O43365 SMR3B-204ENST00000614072 783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.5□□□□□ -1.53
HOXA3O43365 AL607023.1-201ENST00000620045 248 ntBASIC5.5□□□□□ -1.53
HOXA3O43365 THOC1-220ENST00000621904 1083 ntTSL 5 BASIC5.5□□□□□ -1.53
HOXA3O43365 SNAP23-222ENST00000626061 237 ntTSL 5 BASIC5.5□□□□□ -1.53
HOXA3O43365 SNAP23-223ENST00000627440 210 ntTSL 5 BASIC5.5□□□□□ -1.53
HOXA3O43365 CACNA2D3-210ENST00000490478 3557 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.5□□□□□ -1.53
HOXA3O43365 AC027279.4-201ENST00000624371 2072 ntBASIC5.5□□□□□ -1.53
HOXA3O43365 AC021205.3-201ENST00000609680 1709 ntTSL 3 BASIC5.5□□□□□ -1.53
HOXA3O43365 MAGT1-204ENST00000610432 4019 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.5□□□□□ -1.53
HOXA3O43365 VPS35-201ENST00000299138 6790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.5□□□□□ -1.53
HOXA3O43365 EZH1-222ENST00000592743 2501 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.5□□□□□ -1.53
HOXA3O43365 PPBPP2-201ENST00000513150 1362 ntBASIC5.5□□□□□ -1.53
HOXA3O43365 NLGN4X-202ENST00000381092 3750 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC5.5□□□□□ -1.53
HOXA3O43365 KCNJ1-205ENST00000392666 2621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.5□□□□□ -1.53
HOXA3O43365 RNASE9-209ENST00000557068 2703 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC5.5□□□□□ -1.53
HOXA3O43365 Z93929.1-201ENST00000418200 1475 ntBASIC5.5□□□□□ -1.53
HOXA3O43365 ESRRG-201ENST00000359162 5197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.5□□□□□ -1.53
HOXA3O43365 TEK-201ENST00000380036 4760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.5□□□□□ -1.53
HOXA3O43365 PRDX6-201ENST00000340385 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.5□□□□□ -1.53
HOXA3O43365 EIF1-203ENST00000469257 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.49□□□□□ -1.53
HOXA3O43365 SLC14A1-201ENST00000321925 3971 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.49□□□□□ -1.53
HOXA3O43365 LINC01375-201ENST00000428485 1860 ntTSL 2 BASIC5.49□□□□□ -1.53
HOXA3O43365 MAPK10-270ENST00000641102 3538 ntBASIC5.49□□□□□ -1.53
HOXA3O43365 TEAD1-201ENST00000334310 3075 ntTSL 1 (best) BASIC5.49□□□□□ -1.53
HOXA3O43365 TEAD1-205ENST00000527575 3063 ntTSL 5 BASIC5.49□□□□□ -1.53
HOXA3O43365 GDA-209ENST00000545168 5362 ntTSL 2 BASIC5.49□□□□□ -1.53
HOXA3O43365 CD84-208ENST00000534968 7885 ntTSL 1 (best) BASIC5.49□□□□□ -1.53
HOXA3O43365 NEMF-201ENST00000298310 6234 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.49□□□□□ -1.53
HOXA3O43365 NDRG3-203ENST00000373773 2098 ntTSL 1 (best) BASIC5.49□□□□□ -1.53
HOXA3O43365 AC011503.2-201ENST00000594230 1500 ntBASIC5.49□□□□□ -1.53
HOXA3O43365 NT5C2-203ENST00000404739 3365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.49□□□□□ -1.53
HOXA3O43365 IRF6-201ENST00000367021 4306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.49□□□□□ -1.53
HOXA3O43365 CFAP57-204ENST00000528956 3037 ntTSL 2 BASIC5.49□□□□□ -1.53
HOXA3O43365 AC021078.1-201ENST00000499521 8636 ntTSL 1 (best) BASIC5.49□□□□□ -1.53
HOXA3O43365 ANKRD31-203ENST00000506364 6207 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.49□□□□□ -1.53
HOXA3O43365 ZNF300-204ENST00000427179 4155 ntTSL 2 BASIC5.49□□□□□ -1.53
HOXA3O43365 TMED3-202ENST00000424155 16555 ntTSL 3 BASIC5.49□□□□□ -1.53
HOXA3O43365 ABCD3-202ENST00000370214 3538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.49□□□□□ -1.53
HOXA3O43365 PRDM2-206ENST00000413440 6175 ntTSL 1 (best) BASIC5.49□□□□□ -1.53
HOXA3O43365 ZC2HC1B-201ENST00000237275 1002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.49□□□□□ -1.53
HOXA3O43365 BPIFA2-201ENST00000253362 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.49□□□□□ -1.53
HOXA3O43365 OR51J1-201ENST00000332043 951 ntAPPRIS P1 BASIC5.49□□□□□ -1.53
HOXA3O43365 BPIFA2-202ENST00000354932 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.49□□□□□ -1.53
HOXA3O43365 RN7SKP171-201ENST00000364417 303 ntBASIC5.49□□□□□ -1.53
HOXA3O43365 EQTN-202ENST00000380032 1033 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.49□□□□□ -1.53
HOXA3O43365 SNORA26.8-201ENST00000391306 124 ntBASIC5.49□□□□□ -1.53
HOXA3O43365 RPS27AP11-201ENST00000402798 447 ntBASIC5.49□□□□□ -1.53
HOXA3O43365 MTIF3-203ENST00000405591 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.49□□□□□ -1.53
HOXA3O43365 AL133260.1-201ENST00000405720 405 ntBASIC5.49□□□□□ -1.53
HOXA3O43365 AL451081.1-201ENST00000413159 245 ntTSL 3 BASIC5.49□□□□□ -1.53
HOXA3O43365 AC105402.1-201ENST00000413336 545 ntBASIC5.49□□□□□ -1.53
HOXA3O43365 AL807757.2-201ENST00000416455 779 ntTSL 3 BASIC5.49□□□□□ -1.53
HOXA3O43365 GAPDHP57-201ENST00000424400 585 ntBASIC5.49□□□□□ -1.53
HOXA3O43365 CENPIP1-201ENST00000425713 902 ntBASIC5.49□□□□□ -1.53
HOXA3O43365 MIR181A2HG-201ENST00000429139 662 ntTSL 2 BASIC5.49□□□□□ -1.53
HOXA3O43365 MTCO1P3-201ENST00000429327 192 ntBASIC5.49□□□□□ -1.53
HOXA3O43365 LINC00390-201ENST00000432331 340 ntTSL 5 BASIC5.49□□□□□ -1.53
HOXA3O43365 AL590128.1-201ENST00000433407 286 ntBASIC5.49□□□□□ -1.53
HOXA3O43365 BRWD1-IT1-201ENST00000435608 489 ntTSL 3 BASIC5.49□□□□□ -1.53
HOXA3O43365 RPL32-206ENST00000435983 620 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.49□□□□□ -1.53
HOXA3O43365 ATP6V1G1P4-201ENST00000438388 335 ntBASIC5.49□□□□□ -1.53
HOXA3O43365 GAPDHP20-201ENST00000444107 1007 ntBASIC5.49□□□□□ -1.53
HOXA3O43365 AC079117.1-201ENST00000445178 1000 ntTSL 1 (best) BASIC5.49□□□□□ -1.53
HOXA3O43365 AC087501.1-201ENST00000445617 715 ntTSL 5 BASIC5.49□□□□□ -1.53
HOXA3O43365 AC234771.2-201ENST00000445718 597 ntBASIC5.49□□□□□ -1.53
HOXA3O43365 AL929288.2-201ENST00000446368 407 ntBASIC5.49□□□□□ -1.53
HOXA3O43365 MOB4-207ENST00000448447 1021 ntTSL 2 BASIC5.49□□□□□ -1.53
HOXA3O43365 RHEBP2-201ENST00000450289 600 ntBASIC5.49□□□□□ -1.53
HOXA3O43365 VNN3-210ENST00000450865 596 ntTSL 4 BASIC5.49□□□□□ -1.53
HOXA3O43365 SRRM1P2-201ENST00000464531 1192 ntBASIC5.49□□□□□ -1.53
HOXA3O43365 FOXP1-AS1-201ENST00000465742 700 ntTSL 1 (best) BASIC5.49□□□□□ -1.53
HOXA3O43365 CCDC75P1-201ENST00000469247 791 ntBASIC5.49□□□□□ -1.53
HOXA3O43365 AC026254.2-201ENST00000475295 371 ntBASIC5.49□□□□□ -1.53
HOXA3O43365 RPS26P24-201ENST00000497656 331 ntBASIC5.49□□□□□ -1.53
HOXA3O43365 AC073358.1-201ENST00000505671 684 ntBASIC5.49□□□□□ -1.53
HOXA3O43365 LTV1P1-201ENST00000510683 1237 ntBASIC5.49□□□□□ -1.53
HOXA3O43365 LINC02100-201ENST00000512978 238 ntTSL 3 BASIC5.49□□□□□ -1.53
HOXA3O43365 HNRNPKP5-201ENST00000515300 253 ntBASIC5.49□□□□□ -1.53
HOXA3O43365 TPT1-AS1-207ENST00000520310 563 ntTSL 5 BASIC5.49□□□□□ -1.53
HOXA3O43365 AC105999.2-201ENST00000521363 881 ntTSL 2 BASIC5.49□□□□□ -1.53
HOXA3O43365 LRTOMT-215ENST00000538478 814 ntTSL 2 BASIC5.49□□□□□ -1.53
HOXA3O43365 LINC02384-207ENST00000542875 551 ntTSL 4 BASIC5.49□□□□□ -1.53
HOXA3O43365 AP000593.3-201ENST00000546065 578 ntTSL 2 BASIC5.49□□□□□ -1.53
HOXA3O43365 RACGAP1-216ENST00000548961 387 ntTSL 3 BASIC5.49□□□□□ -1.53
HOXA3O43365 AC078778.2-201ENST00000553061 567 ntTSL 5 BASIC5.49□□□□□ -1.53
HOXA3O43365 AC023310.2-201ENST00000553844 547 ntBASIC5.49□□□□□ -1.53
HOXA3O43365 AL136501.1-201ENST00000555913 790 ntTSL 2 BASIC5.49□□□□□ -1.53
HOXA3O43365 PSMA6-214ENST00000556506 763 ntTSL 5 BASIC5.49□□□□□ -1.53
HOXA3O43365 AC015660.3-201ENST00000559569 198 ntTSL 3 BASIC5.49□□□□□ -1.53
HOXA3O43365 HNRNPA1P74-201ENST00000560782 835 ntBASIC5.49□□□□□ -1.53
HOXA3O43365 AC244034.2-201ENST00000562504 509 ntBASIC5.49□□□□□ -1.53
HOXA3O43365 AC008551.1-201ENST00000575612 405 ntTSL 5 BASIC5.49□□□□□ -1.53
HOXA3O43365 AC135050.5-201ENST00000576336 543 ntTSL 4 BASIC5.49□□□□□ -1.53
HOXA3O43365 AC116003.2-201ENST00000579278 748 ntTSL 2 BASIC5.49□□□□□ -1.53
HOXA3O43365 MIR4801-201ENST00000582704 82 ntBASIC5.49□□□□□ -1.53
HOXA3O43365 AL589935.1-201ENST00000602418 488 ntTSL 4 BASIC5.49□□□□□ -1.53
HOXA3O43365 WISP1-OT1-201ENST00000602893 642 ntBASIC5.49□□□□□ -1.53
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