Protein–RNA interactions for Protein: O43300

LRRTM2, Leucine-rich repeat transmembrane neuronal protein 2, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LRRTM2O43300 RN7SKP124-201ENST00000364730 341 ntBASIC5.33□□□□□ -1.56
LRRTM2O43300 LINC02246-202ENST00000418954 717 ntTSL 2 BASIC5.33□□□□□ -1.56
LRRTM2O43300 MS4A6A-202ENST00000420732 863 ntTSL 1 (best) BASIC5.33□□□□□ -1.56
LRRTM2O43300 TXNIP-201ENST00000425134 1225 ntTSL 2 BASIC5.33□□□□□ -1.56
LRRTM2O43300 AC113412.1-201ENST00000425840 504 ntBASIC5.33□□□□□ -1.56
LRRTM2O43300 AC127526.2-201ENST00000426436 775 ntBASIC5.33□□□□□ -1.56
LRRTM2O43300 LINC02528-202ENST00000434437 535 ntTSL 2 BASIC5.33□□□□□ -1.56
LRRTM2O43300 Z84478.1-201ENST00000438230 1219 ntBASIC5.33□□□□□ -1.56
LRRTM2O43300 AC022387.1-201ENST00000444770 794 ntTSL 3 BASIC5.33□□□□□ -1.56
LRRTM2O43300 AL035409.1-201ENST00000454305 497 ntTSL 2 BASIC5.33□□□□□ -1.56
LRRTM2O43300 AC004692.2-203ENST00000458590 497 ntTSL 4 BASIC5.33□□□□□ -1.56
LRRTM2O43300 LINC02339-201ENST00000472649 752 ntTSL 1 (best) BASIC5.33□□□□□ -1.56
LRRTM2O43300 RN7SL184P-201ENST00000488308 297 ntBASIC5.33□□□□□ -1.56
LRRTM2O43300 AGGF1P3-201ENST00000493675 1213 ntBASIC5.33□□□□□ -1.56
LRRTM2O43300 HMGB3P14-201ENST00000494195 599 ntBASIC5.33□□□□□ -1.56
LRRTM2O43300 NENFP3-201ENST00000503735 313 ntBASIC5.33□□□□□ -1.56
LRRTM2O43300 SNORA43.3-201ENST00000517240 103 ntBASIC5.33□□□□□ -1.56
LRRTM2O43300 AC020937.1-201ENST00000519677 1013 ntBASIC5.33□□□□□ -1.56
LRRTM2O43300 MINCR-206ENST00000524335 499 ntTSL 2 BASIC5.33□□□□□ -1.56
LRRTM2O43300 LINC01234-204ENST00000550905 589 ntTSL 3 BASIC5.33□□□□□ -1.56
LRRTM2O43300 AC126615.2-201ENST00000553003 515 ntBASIC5.33□□□□□ -1.56
LRRTM2O43300 AC090970.1-201ENST00000561207 381 ntTSL 5 BASIC5.33□□□□□ -1.56
LRRTM2O43300 AC005757.1-201ENST00000591432 472 ntTSL 4 BASIC5.33□□□□□ -1.56
LRRTM2O43300 AC006115.2-201ENST00000596823 202 ntBASIC5.33□□□□□ -1.56
LRRTM2O43300 AC073254.1-207ENST00000600482 714 ntTSL 5 BASIC5.33□□□□□ -1.56
LRRTM2O43300 HCG18-243ENST00000602498 327 ntTSL 3 BASIC5.33□□□□□ -1.56
LRRTM2O43300 AC002429.2-202ENST00000637269 394 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC5.33□□□□□ -1.56
LRRTM2O43300 AC087565.3-203ENST00000641018 837 ntBASIC5.33□□□□□ -1.56
LRRTM2O43300 AC010266.2-201ENST00000564741 3255 ntBASIC5.33□□□□□ -1.56
LRRTM2O43300 TRAPPC6B-201ENST00000330149 3242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.33□□□□□ -1.56
LRRTM2O43300 TCF7L2-206ENST00000355995 4073 ntTSL 1 (best) BASIC5.33□□□□□ -1.56
LRRTM2O43300 C15orf54-202ENST00000625107 3078 ntTSL 1 (best) BASIC5.33□□□□□ -1.56
LRRTM2O43300 ALG2-202ENST00000319033 1627 ntTSL 1 (best) BASIC5.33□□□□□ -1.56
LRRTM2O43300 PCGF5-201ENST00000336126 7018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.33□□□□□ -1.56
LRRTM2O43300 ZNF195-201ENST00000005082 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.33□□□□□ -1.56
LRRTM2O43300 AC104964.3-201ENST00000606115 2860 ntBASIC5.33□□□□□ -1.56
LRRTM2O43300 LINC01538-201ENST00000588074 2408 ntTSL 1 (best) BASIC5.33□□□□□ -1.56
LRRTM2O43300 TCF7L2-219ENST00000542695 4136 ntTSL 5 BASIC5.33□□□□□ -1.56
LRRTM2O43300 GRIA4-204ENST00000428631 2778 ntTSL 1 (best) BASIC5.33□□□□□ -1.56
LRRTM2O43300 AL022311.1-201ENST00000623726 19416 ntBASIC5.33□□□□□ -1.56
LRRTM2O43300 ATXN7-208ENST00000484332 2741 ntTSL 1 (best) BASIC5.32□□□□□ -1.56
LRRTM2O43300 MAPRE2-202ENST00000413393 4173 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC5.32□□□□□ -1.56
LRRTM2O43300 C15orf41-201ENST00000338183 2578 ntTSL 5 BASIC5.32□□□□□ -1.56
LRRTM2O43300 NTRK3-205ENST00000394480 19984 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC5.32□□□□□ -1.56
LRRTM2O43300 CPED1-203ENST00000423795 2189 ntTSL 1 (best) BASIC5.32□□□□□ -1.56
LRRTM2O43300 PATL1-201ENST00000300146 4072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.32□□□□□ -1.56
LRRTM2O43300 MAPRE2-211ENST00000589699 4080 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC5.32□□□□□ -1.56
LRRTM2O43300 SLCO1C1-208ENST00000545102 2868 ntTSL 2 BASIC5.32□□□□□ -1.56
LRRTM2O43300 GPHN-204ENST00000543237 2459 ntTSL 2 BASIC5.32□□□□□ -1.56
LRRTM2O43300 ERBIN-208ENST00000506030 4386 ntTSL 1 (best) BASIC5.32□□□□□ -1.56
LRRTM2O43300 LINC00343-202ENST00000415294 1320 ntTSL 5 BASIC5.32□□□□□ -1.56
LRRTM2O43300 AC235565.1-201ENST00000456962 1325 ntBASIC5.32□□□□□ -1.56
LRRTM2O43300 MRRFP1-201ENST00000435941 1675 ntBASIC5.32□□□□□ -1.56
LRRTM2O43300 RNA5SP500-201ENST00000364486 119 ntBASIC5.32□□□□□ -1.56
LRRTM2O43300 AL672167.2-201ENST00000377164 879 ntBASIC5.32□□□□□ -1.56
LRRTM2O43300 RNU6-171P-201ENST00000384354 107 ntBASIC5.32□□□□□ -1.56
LRRTM2O43300 MRM2-202ENST00000407040 582 ntTSL 3 BASIC5.32□□□□□ -1.56
LRRTM2O43300 BMS1P17-202ENST00000416720 316 ntBASIC5.32□□□□□ -1.56
LRRTM2O43300 RPS15AP30-201ENST00000420976 390 ntBASIC5.32□□□□□ -1.56
LRRTM2O43300 SETP10-201ENST00000424368 814 ntBASIC5.32□□□□□ -1.56
LRRTM2O43300 HNRNPA1P29-201ENST00000426409 879 ntBASIC5.32□□□□□ -1.56
LRRTM2O43300 MAGI2-AS1-201ENST00000428298 472 ntTSL 3 BASIC5.32□□□□□ -1.56
LRRTM2O43300 NPSR1-AS1-206ENST00000439852 710 ntTSL 1 (best) BASIC5.32□□□□□ -1.56
LRRTM2O43300 CUBNP2-201ENST00000443534 1139 ntBASIC5.32□□□□□ -1.56
LRRTM2O43300 AC007386.1-201ENST00000455212 582 ntBASIC5.32□□□□□ -1.56
LRRTM2O43300 OR2AO1P-201ENST00000476497 403 ntBASIC5.32□□□□□ -1.56
LRRTM2O43300 AC093270.2-201ENST00000486157 792 ntBASIC5.32□□□□□ -1.56
LRRTM2O43300 RPL23AP40-201ENST00000487630 390 ntBASIC5.32□□□□□ -1.56
LRRTM2O43300 PDCL3P4-201ENST00000489621 720 ntBASIC5.32□□□□□ -1.56
LRRTM2O43300 AC091917.2-201ENST00000505002 744 ntBASIC5.32□□□□□ -1.56
LRRTM2O43300 AC017091.1-202ENST00000510941 504 ntTSL 3 BASIC5.32□□□□□ -1.56
LRRTM2O43300 AC111000.6-201ENST00000514471 709 ntBASIC5.32□□□□□ -1.56
LRRTM2O43300 AC091819.2-201ENST00000522292 490 ntTSL 3 BASIC5.32□□□□□ -1.56
LRRTM2O43300 AC068672.3-201ENST00000524017 824 ntTSL 3 BASIC5.32□□□□□ -1.56
LRRTM2O43300 HMGN2P36-201ENST00000529541 409 ntBASIC5.32□□□□□ -1.56
LRRTM2O43300 AL163952.1-202ENST00000569625 600 ntBASIC5.32□□□□□ -1.56
LRRTM2O43300 AC015727.1-201ENST00000572792 512 ntTSL 5 BASIC5.32□□□□□ -1.56
LRRTM2O43300 AC012588.1-201ENST00000583852 358 ntTSL 3 BASIC5.32□□□□□ -1.56
LRRTM2O43300 AP001381.1-201ENST00000584109 534 ntTSL 5 BASIC5.32□□□□□ -1.56
LRRTM2O43300 AL157938.2-209ENST00000589128 792 ntTSL 2 BASIC5.32□□□□□ -1.56
LRRTM2O43300 AC002398.1-201ENST00000589397 427 ntTSL 5 BASIC5.32□□□□□ -1.56
LRRTM2O43300 AC008280.3-201ENST00000606436 732 ntTSL 5 BASIC5.32□□□□□ -1.56
LRRTM2O43300 AC245041.2-202ENST00000613389 493 ntTSL 5 BASIC5.32□□□□□ -1.56
LRRTM2O43300 AL513314.2-202ENST00000617077 536 ntTSL 5 BASIC5.32□□□□□ -1.56
LRRTM2O43300 RN7SL544P-201ENST00000617232 284 ntBASIC5.32□□□□□ -1.56
LRRTM2O43300 RN7SL763P-201ENST00000620922 284 ntBASIC5.32□□□□□ -1.56
LRRTM2O43300 CASC19-222ENST00000641321 1173 ntBASIC5.32□□□□□ -1.56
LRRTM2O43300 SLFN5-201ENST00000299977 10591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.32□□□□□ -1.56
LRRTM2O43300 OR2AT4-203ENST00000641541 8795 ntAPPRIS P1 BASIC5.32□□□□□ -1.56
LRRTM2O43300 LIMA1-215ENST00000552823 3254 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC5.32□□□□□ -1.56
LRRTM2O43300 AC006484.1-201ENST00000435086 1884 ntBASIC5.32□□□□□ -1.56
LRRTM2O43300 ZNF347-201ENST00000334197 7960 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.32□□□□□ -1.56
LRRTM2O43300 NELL2-205ENST00000452445 3196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.32□□□□□ -1.56
LRRTM2O43300 AP4S1-212ENST00000622409 4113 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC5.32□□□□□ -1.56
LRRTM2O43300 PEAK1-201ENST00000312493 11512 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.32□□□□□ -1.56
LRRTM2O43300 CAV1-205ENST00000405348 2443 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC5.32□□□□□ -1.56
LRRTM2O43300 LCA5L-203ENST00000380671 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.32□□□□□ -1.56
LRRTM2O43300 SLC26A7-208ENST00000523719 2902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.31□□□□□ -1.56
LRRTM2O43300 C5orf51-204ENST00000612065 1391 ntTSL 5 BASIC5.31□□□□□ -1.56
LRRTM2O43300 LINC01581-202ENST00000558874 3173 ntTSL 1 (best) BASIC5.31□□□□□ -1.56
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