Protein–RNA interactions for Protein: Q9P0V3

SH3BP4, SH3 domain-binding protein 4, humanhuman

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Length 963 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SH3BP4Q9P0V3 RNFT1P2-201ENST00000443064 757 ntBASIC5.74□□□□□ -1.49
SH3BP4Q9P0V3 AC007179.2-204ENST00000444001 765 ntTSL 3 BASIC5.74□□□□□ -1.49
SH3BP4Q9P0V3 AL512593.1-201ENST00000444758 779 ntBASIC5.74□□□□□ -1.49
SH3BP4Q9P0V3 LINC00867-203ENST00000445161 580 ntTSL 2 BASIC5.74□□□□□ -1.49
SH3BP4Q9P0V3 EXOSC3P1-201ENST00000448649 500 ntBASIC5.74□□□□□ -1.49
SH3BP4Q9P0V3 Z99714.1-201ENST00000450463 807 ntBASIC5.74□□□□□ -1.49
SH3BP4Q9P0V3 LINC01911-201ENST00000450667 806 ntTSL 5 BASIC5.74□□□□□ -1.49
SH3BP4Q9P0V3 AC096639.1-201ENST00000456240 347 ntTSL 5 BASIC5.74□□□□□ -1.49
SH3BP4Q9P0V3 PCDH9-AS4-201ENST00000456459 436 ntTSL 3 BASIC5.74□□□□□ -1.49
SH3BP4Q9P0V3 SNORD11.1-201ENST00000459482 85 ntBASIC5.74□□□□□ -1.49
SH3BP4Q9P0V3 AC096992.1-201ENST00000459808 709 ntBASIC5.74□□□□□ -1.49
SH3BP4Q9P0V3 RN7SL552P-201ENST00000462094 276 ntBASIC5.74□□□□□ -1.49
SH3BP4Q9P0V3 AC068633.1-202ENST00000476460 458 ntTSL 2 BASIC5.74□□□□□ -1.49
SH3BP4Q9P0V3 HMGB1P38-201ENST00000490557 577 ntBASIC5.74□□□□□ -1.49
SH3BP4Q9P0V3 SNRPCP11-201ENST00000492453 205 ntBASIC5.74□□□□□ -1.49
SH3BP4Q9P0V3 AC090150.1-201ENST00000521408 585 ntTSL 4 BASIC5.74□□□□□ -1.49
SH3BP4Q9P0V3 AC010376.1-201ENST00000522101 334 ntBASIC5.74□□□□□ -1.49
SH3BP4Q9P0V3 OR56A7P-201ENST00000524865 941 ntBASIC5.74□□□□□ -1.49
SH3BP4Q9P0V3 NAV2-AS1-201ENST00000526642 660 ntTSL 3 BASIC5.74□□□□□ -1.49
SH3BP4Q9P0V3 LRTOMT-218ENST00000541614 726 ntTSL 1 (best) BASIC5.74□□□□□ -1.49
SH3BP4Q9P0V3 AC135279.1-201ENST00000543493 504 ntBASIC5.74□□□□□ -1.49
SH3BP4Q9P0V3 OLR1-210ENST00000544577 924 ntTSL 5 BASIC5.74□□□□□ -1.49
SH3BP4Q9P0V3 BICD1-206ENST00000551086 423 ntTSL 3 BASIC5.74□□□□□ -1.49
SH3BP4Q9P0V3 AL133297.1-201ENST00000568149 404 ntTSL 2 BASIC5.74□□□□□ -1.49
SH3BP4Q9P0V3 AC012594.1-252ENST00000595011 876 ntTSL 5 BASIC5.74□□□□□ -1.49
SH3BP4Q9P0V3 AC146944.4-201ENST00000602697 718 ntBASIC5.74□□□□□ -1.49
SH3BP4Q9P0V3 AC022022.2-201ENST00000602989 360 ntBASIC5.74□□□□□ -1.49
SH3BP4Q9P0V3 AL450336.1-201ENST00000605180 586 ntBASIC5.74□□□□□ -1.49
SH3BP4Q9P0V3 AP005229.2-201ENST00000609980 697 ntBASIC5.74□□□□□ -1.49
SH3BP4Q9P0V3 AC015922.4-201ENST00000612568 690 ntBASIC5.74□□□□□ -1.49
SH3BP4Q9P0V3 uc_338.26-201ENST00000612659 160 ntBASIC5.74□□□□□ -1.49
SH3BP4Q9P0V3 AC012676.3-201ENST00000614983 479 ntBASIC5.74□□□□□ -1.49
SH3BP4Q9P0V3 MIR1264-201ENST00000616374 69 ntBASIC5.74□□□□□ -1.49
SH3BP4Q9P0V3 RFPL4AP6-201ENST00000616792 846 ntBASIC5.74□□□□□ -1.49
SH3BP4Q9P0V3 Metazoa_SRP.81-201ENST00000618466 316 ntBASIC5.74□□□□□ -1.49
SH3BP4Q9P0V3 AC010325.3-201ENST00000641084 394 ntBASIC5.74□□□□□ -1.49
SH3BP4Q9P0V3 DYNC2LI1-201ENST00000260605 1399 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.74□□□□□ -1.49
SH3BP4Q9P0V3 NRG3-208ENST00000556918 1581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.74□□□□□ -1.49
SH3BP4Q9P0V3 TRPM6-203ENST00000361255 8271 ntTSL 1 (best) BASIC5.74□□□□□ -1.49
SH3BP4Q9P0V3 LINC01787-201ENST00000435311 1994 ntTSL 2 BASIC5.74□□□□□ -1.49
SH3BP4Q9P0V3 AL391704.1-201ENST00000422206 2368 ntTSL 1 (best) BASIC5.74□□□□□ -1.49
SH3BP4Q9P0V3 AC025470.1-201ENST00000510053 2032 ntBASIC5.74□□□□□ -1.49
SH3BP4Q9P0V3 RAB30-212ENST00000533486 9929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.74□□□□□ -1.49
SH3BP4Q9P0V3 AMN1-208ENST00000537562 1538 ntTSL 5 BASIC5.74□□□□□ -1.49
SH3BP4Q9P0V3 C6orf163-202ENST00000388923 1308 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.74□□□□□ -1.49
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SH3BP4Q9P0V3 CCR2-201ENST00000292301 2671 ntTSL 5 BASIC5.73□□□□□ -1.49
SH3BP4Q9P0V3 CRNDE-212ENST00000613942 2601 ntTSL 5 BASIC5.73□□□□□ -1.49
SH3BP4Q9P0V3 ZNF260-204ENST00000592282 5055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.73□□□□□ -1.49
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SH3BP4Q9P0V3 SCGB1D4-201ENST00000358585 439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.73□□□□□ -1.49
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SH3BP4Q9P0V3 LINC01058-201ENST00000420694 448 ntTSL 5 BASIC5.73□□□□□ -1.49
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SH3BP4Q9P0V3 LINC01728-201ENST00000428529 524 ntTSL 2 BASIC5.73□□□□□ -1.49
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SH3BP4Q9P0V3 TMEM247-203ENST00000449601 741 ntTSL 1 (best) BASIC5.73□□□□□ -1.49
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SH3BP4Q9P0V3 OR9A4-201ENST00000548136 1093 ntAPPRIS P1 BASIC5.73□□□□□ -1.49
SH3BP4Q9P0V3 C1GALT1P1-201ENST00000548895 1089 ntBASIC5.73□□□□□ -1.49
SH3BP4Q9P0V3 AC093014.1-201ENST00000548926 724 ntBASIC5.73□□□□□ -1.49
SH3BP4Q9P0V3 AL132857.1-201ENST00000555180 708 ntBASIC5.73□□□□□ -1.49
SH3BP4Q9P0V3 AL049779.3-201ENST00000557141 606 ntBASIC5.73□□□□□ -1.49
SH3BP4Q9P0V3 AC092868.3-201ENST00000560515 784 ntBASIC5.73□□□□□ -1.49
SH3BP4Q9P0V3 RPGRIP1L-208ENST00000566096 893 ntTSL 2 BASIC5.73□□□□□ -1.49
SH3BP4Q9P0V3 AC009121.2-202ENST00000572706 505 ntTSL 3 BASIC5.73□□□□□ -1.49
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SH3BP4Q9P0V3 AP005136.2-201ENST00000583253 1049 ntBASIC5.73□□□□□ -1.49
SH3BP4Q9P0V3 AC011507.1-201ENST00000585364 567 ntTSL 4 BASIC5.73□□□□□ -1.49
SH3BP4Q9P0V3 NIFKP6-201ENST00000598115 845 ntBASIC5.73□□□□□ -1.49
SH3BP4Q9P0V3 DUXAP3-201ENST00000603616 594 ntBASIC5.73□□□□□ -1.49
SH3BP4Q9P0V3 AL365400.2-201ENST00000605604 902 ntBASIC5.73□□□□□ -1.49
SH3BP4Q9P0V3 NQO2-209ENST00000606474 470 ntTSL 3 BASIC5.73□□□□□ -1.49
SH3BP4Q9P0V3 OR51C1P-201ENST00000608504 942 ntBASIC5.73□□□□□ -1.49
SH3BP4Q9P0V3 MIR6823-201ENST00000622118 61 ntBASIC5.73□□□□□ -1.49
SH3BP4Q9P0V3 AP003399.1-201ENST00000637534 361 ntBASIC5.73□□□□□ -1.49
SH3BP4Q9P0V3 AC017104.5-201ENST00000637647 639 ntBASIC5.73□□□□□ -1.49
SH3BP4Q9P0V3 METTL8-218ENST00000638989 876 ntTSL 5 BASIC5.73□□□□□ -1.49
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