Protein–RNA interactions for Protein: Q9HBJ7

USP29, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 29, humanhuman

Predictions only

Length 922 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP29Q9HBJ7 AL121594.2-201ENST00000541658 472 ntBASIC6.05□□□□□ -1.44
USP29Q9HBJ7 LINC02411-203ENST00000546180 959 ntTSL 4 BASIC6.05□□□□□ -1.44
USP29Q9HBJ7 PCED1B-AS1-203ENST00000547626 420 ntTSL 2 BASIC6.05□□□□□ -1.44
USP29Q9HBJ7 AC079600.1-201ENST00000550326 297 ntBASIC6.05□□□□□ -1.44
USP29Q9HBJ7 AC103996.3-201ENST00000553477 442 ntTSL 3 BASIC6.05□□□□□ -1.44
USP29Q9HBJ7 INO80-AS1-201ENST00000558967 312 ntTSL 5 BASIC6.05□□□□□ -1.44
USP29Q9HBJ7 THSD4-AS1-201ENST00000561571 554 ntTSL 5 BASIC6.05□□□□□ -1.44
USP29Q9HBJ7 RPL26-204ENST00000578812 1002 ntTSL 2 BASIC6.05□□□□□ -1.44
USP29Q9HBJ7 AC022211.1-201ENST00000579554 717 ntTSL 3 BASIC6.05□□□□□ -1.44
USP29Q9HBJ7 CXXC1P1-203ENST00000589302 746 ntTSL 3 BASIC6.05□□□□□ -1.44
USP29Q9HBJ7 AC006116.4-201ENST00000589671 452 ntTSL 2 BASIC6.05□□□□□ -1.44
USP29Q9HBJ7 ZNF92P2-201ENST00000600543 1059 ntBASIC6.05□□□□□ -1.44
USP29Q9HBJ7 LINC01320-205ENST00000604250 857 ntTSL 5 BASIC6.05□□□□□ -1.44
USP29Q9HBJ7 LINC01050-201ENST00000604485 760 ntTSL 3 BASIC6.05□□□□□ -1.44
USP29Q9HBJ7 AL445670.1-201ENST00000618889 801 ntBASIC6.05□□□□□ -1.44
USP29Q9HBJ7 Metazoa_SRP.130-201ENST00000622625 267 ntBASIC6.05□□□□□ -1.44
USP29Q9HBJ7 AP000943.4-201ENST00000622912 357 ntBASIC6.05□□□□□ -1.44
USP29Q9HBJ7 AP003485.1-201ENST00000625093 753 ntBASIC6.05□□□□□ -1.44
USP29Q9HBJ7 ASAH2-202ENST00000395526 6880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.05□□□□□ -1.44
USP29Q9HBJ7 NLRP11-201ENST00000589093 3417 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.05□□□□□ -1.44
USP29Q9HBJ7 TTC37-201ENST00000358746 5706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.05□□□□□ -1.44
USP29Q9HBJ7 AC012254.3-201ENST00000591183 2117 ntBASIC6.05□□□□□ -1.44
USP29Q9HBJ7 ZRANB3-211ENST00000619650 2494 ntTSL 5 BASIC6.05□□□□□ -1.44
USP29Q9HBJ7 AC099506.1-201ENST00000567359 4037 ntTSL 1 (best) BASIC6.05□□□□□ -1.44
USP29Q9HBJ7 POLR2B-213ENST00000639658 3300 ntTSL 5 BASIC6.05□□□□□ -1.44
USP29Q9HBJ7 ANKRD46-204ENST00000519597 2779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.05□□□□□ -1.44
USP29Q9HBJ7 CA1-225ENST00000626824 2405 ntTSL 5 BASIC6.05□□□□□ -1.44
USP29Q9HBJ7 NRXN1-242ENST00000635519 3553 ntTSL 5 BASIC6.05□□□□□ -1.44
USP29Q9HBJ7 LINC02141-201ENST00000568279 6586 ntTSL 1 (best) BASIC6.04□□□□□ -1.44
USP29Q9HBJ7 CCDC62-205ENST00000537566 3537 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC6.04□□□□□ -1.44
USP29Q9HBJ7 VPS13B-203ENST00000358544 14094 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC6.04□□□□□ -1.44
USP29Q9HBJ7 MEIOB-201ENST00000325962 1694 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.04□□□□□ -1.44
USP29Q9HBJ7 ZNF337-AS1-201ENST00000414393 4666 ntTSL 2 BASIC6.04□□□□□ -1.44
USP29Q9HBJ7 MMRN1-201ENST00000264790 4967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.04□□□□□ -1.44
USP29Q9HBJ7 FILIP1L-202ENST00000354552 3970 ntTSL 1 (best) BASIC6.04□□□□□ -1.44
USP29Q9HBJ7 ZNF525-201ENST00000467003 6107 ntTSL 4 BASIC6.04□□□□□ -1.44
USP29Q9HBJ7 MFSD8-239ENST00000641590 2479 ntBASIC6.04□□□□□ -1.44
USP29Q9HBJ7 AC006288.1-201ENST00000565320 1463 ntTSL 3 BASIC6.04□□□□□ -1.44
USP29Q9HBJ7 ARID4A-203ENST00000395168 4051 ntTSL 5 BASIC6.04□□□□□ -1.44
USP29Q9HBJ7 BX284613.1-201ENST00000452221 1641 ntBASIC6.04□□□□□ -1.44
USP29Q9HBJ7 AC016576.1-201ENST00000637153 3585 ntTSL 5 BASIC6.04□□□□□ -1.44
USP29Q9HBJ7 PDE4D-202ENST00000317118 2599 ntTSL 1 (best) BASIC6.04□□□□□ -1.44
USP29Q9HBJ7 CEACAM1-201ENST00000161559 3519 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.04□□□□□ -1.44
USP29Q9HBJ7 NUP37-201ENST00000251074 1203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.04□□□□□ -1.44
USP29Q9HBJ7 SELENOWP1-201ENST00000322792 252 ntBASIC6.04□□□□□ -1.44
USP29Q9HBJ7 RNU6-1331P-201ENST00000363658 106 ntBASIC6.04□□□□□ -1.44
USP29Q9HBJ7 ATP6V1G3-203ENST00000367382 611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.04□□□□□ -1.44
USP29Q9HBJ7 U3.23-201ENST00000391132 200 ntBASIC6.04□□□□□ -1.44
USP29Q9HBJ7 AC097717.1-233ENST00000413557 460 ntTSL 3 BASIC6.04□□□□□ -1.44
USP29Q9HBJ7 AC114803.1-201ENST00000417355 311 ntTSL 3 BASIC6.04□□□□□ -1.44
USP29Q9HBJ7 AC011752.1-203ENST00000417609 582 ntTSL 2 BASIC6.04□□□□□ -1.44
USP29Q9HBJ7 AL034347.1-201ENST00000420766 835 ntTSL 3 BASIC6.04□□□□□ -1.44
USP29Q9HBJ7 ARAFP1-201ENST00000422172 605 ntBASIC6.04□□□□□ -1.44
USP29Q9HBJ7 AL121882.1-201ENST00000422893 417 ntBASIC6.04□□□□□ -1.44
USP29Q9HBJ7 LINC01501-201ENST00000427523 409 ntTSL 3 BASIC6.04□□□□□ -1.44
USP29Q9HBJ7 IKZF3-212ENST00000439016 1246 ntTSL 5 BASIC6.04□□□□□ -1.44
USP29Q9HBJ7 C21orf91-OT1-203ENST00000439392 497 ntTSL 1 (best) BASIC6.04□□□□□ -1.44
USP29Q9HBJ7 LINC00412-201ENST00000444744 420 ntTSL 2 BASIC6.04□□□□□ -1.44
USP29Q9HBJ7 SUMO2P1-206ENST00000445436 284 ntBASIC6.04□□□□□ -1.44
USP29Q9HBJ7 AC013733.1-201ENST00000449835 985 ntTSL 4 BASIC6.04□□□□□ -1.44
USP29Q9HBJ7 RPL12P39-201ENST00000455456 496 ntBASIC6.04□□□□□ -1.44
USP29Q9HBJ7 AC011476.1-201ENST00000466725 307 ntBASIC6.04□□□□□ -1.44
USP29Q9HBJ7 AC108729.2-201ENST00000476543 840 ntBASIC6.04□□□□□ -1.44
USP29Q9HBJ7 PDCL3P4-201ENST00000489621 720 ntBASIC6.04□□□□□ -1.44
USP29Q9HBJ7 RPS26P24-201ENST00000497656 331 ntBASIC6.04□□□□□ -1.44
USP29Q9HBJ7 PCNAP1-201ENST00000505363 709 ntBASIC6.04□□□□□ -1.44
USP29Q9HBJ7 SNORD46.2-201ENST00000516021 102 ntBASIC6.04□□□□□ -1.44
USP29Q9HBJ7 TPT1-AS1-206ENST00000519454 709 ntTSL 5 BASIC6.04□□□□□ -1.44
USP29Q9HBJ7 AC087439.2-201ENST00000519498 552 ntTSL 3 BASIC6.04□□□□□ -1.44
USP29Q9HBJ7 AC008601.1-201ENST00000519892 527 ntTSL 4 BASIC6.04□□□□□ -1.44
USP29Q9HBJ7 AC079414.1-201ENST00000563114 488 ntTSL 1 (best) BASIC6.04□□□□□ -1.44
USP29Q9HBJ7 AC130371.1-201ENST00000577023 230 ntTSL 5 BASIC6.04□□□□□ -1.44
USP29Q9HBJ7 AC005703.3-201ENST00000579159 373 ntTSL 3 BASIC6.04□□□□□ -1.44
USP29Q9HBJ7 GTSCR1-201ENST00000582578 470 ntTSL 3 BASIC6.04□□□□□ -1.44
USP29Q9HBJ7 AL354733.2-210ENST00000586211 647 ntTSL 5 BASIC6.04□□□□□ -1.44
USP29Q9HBJ7 AC060780.2-201ENST00000589047 198 ntBASIC6.04□□□□□ -1.44
USP29Q9HBJ7 ZNF528-211ENST00000598192 625 ntTSL 3 BASIC6.04□□□□□ -1.44
USP29Q9HBJ7 LINC01125-220ENST00000599501 965 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.04□□□□□ -1.44
USP29Q9HBJ7 AC145423.1-201ENST00000605712 336 ntBASIC6.04□□□□□ -1.44
USP29Q9HBJ7 AC027449.1-201ENST00000608890 407 ntBASIC6.04□□□□□ -1.44
USP29Q9HBJ7 MIR6809-201ENST00000612189 116 ntBASIC6.04□□□□□ -1.44
USP29Q9HBJ7 MIR6793-201ENST00000612376 63 ntBASIC6.04□□□□□ -1.44
USP29Q9HBJ7 ELSPBP1-206ENST00000619003 893 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.04□□□□□ -1.44
USP29Q9HBJ7 AL136228.1-201ENST00000622221 319 ntBASIC6.04□□□□□ -1.44
USP29Q9HBJ7 AC004160.1-201ENST00000625468 929 ntTSL 5 BASIC6.04□□□□□ -1.44
USP29Q9HBJ7 LINC01125-249ENST00000627399 1067 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC6.04□□□□□ -1.44
USP29Q9HBJ7 AL161457.2-201ENST00000629181 630 ntTSL 5 BASIC6.04□□□□□ -1.44
USP29Q9HBJ7 OR4G3P-201ENST00000633500 913 ntBASIC6.04□□□□□ -1.44
USP29Q9HBJ7 NAMPTP1-201ENST00000440465 2514 ntBASIC6.04□□□□□ -1.44
USP29Q9HBJ7 GPAM-202ENST00000369425 5664 ntTSL 1 (best) BASIC6.04□□□□□ -1.44
USP29Q9HBJ7 CARD6-201ENST00000254691 4221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.04□□□□□ -1.44
USP29Q9HBJ7 ZNF571-202ENST00000358744 2049 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.04□□□□□ -1.44
USP29Q9HBJ7 LINC00906-206ENST00000589921 3444 ntTSL 1 (best) BASIC6.04□□□□□ -1.44
USP29Q9HBJ7 RAB30-216ENST00000612684 9783 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC6.04□□□□□ -1.44
USP29Q9HBJ7 CPS1-IT1-201ENST00000628368 2306 ntBASIC6.04□□□□□ -1.44
USP29Q9HBJ7 RYR2-201ENST00000360064 14850 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.04□□□□□ -1.44
USP29Q9HBJ7 BBX-201ENST00000325805 3517 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.04□□□□□ -1.44
USP29Q9HBJ7 PIGN-239ENST00000639902 4439 ntTSL 5 BASIC6.04□□□□□ -1.44
USP29Q9HBJ7 SETDB2-205ENST00000611815 5313 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.04□□□□□ -1.44
USP29Q9HBJ7 MEPE-202ENST00000395102 2123 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.04□□□□□ -1.44
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 74.5 ms