Protein–RNA interactions for Protein: Q9C0D0

PHACTR1, Phosphatase and actin regulator 1, humanhuman

Predictions only

Length 580 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PHACTR1Q9C0D0 PROM1-219ENST00000539194 3884 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.4□□□□□ -1.23
PHACTR1Q9C0D0 AC007402.1-201ENST00000440698 3939 ntTSL 2 BASIC7.39□□□□□ -1.23
PHACTR1Q9C0D0 BUB1-202ENST00000409311 3287 ntTSL 1 (best) BASIC7.39□□□□□ -1.23
PHACTR1Q9C0D0 OR7G2-202ENST00000641081 3015 ntAPPRIS ALT2 BASIC7.39□□□□□ -1.23
PHACTR1Q9C0D0 EXTL2-201ENST00000370113 2835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.39□□□□□ -1.23
PHACTR1Q9C0D0 IL31RA-201ENST00000297015 2695 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.39□□□□□ -1.23
PHACTR1Q9C0D0 ADAM5-208ENST00000505455 1998 ntTSL 1 (best) BASIC7.39□□□□□ -1.23
PHACTR1Q9C0D0 ZNF148-201ENST00000360647 9651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.39□□□□□ -1.23
PHACTR1Q9C0D0 VIP-201ENST00000367243 1581 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC7.39□□□□□ -1.23
PHACTR1Q9C0D0 AC017104.4-201ENST00000636283 1592 ntBASIC7.39□□□□□ -1.23
PHACTR1Q9C0D0 CCR9-204ENST00000422395 1331 ntTSL 1 (best) BASIC7.39□□□□□ -1.23
PHACTR1Q9C0D0 SLC9B1P3-201ENST00000452667 1334 ntBASIC7.39□□□□□ -1.23
PHACTR1Q9C0D0 HMGB1P5-201ENST00000255320 642 ntBASIC7.39□□□□□ -1.23
PHACTR1Q9C0D0 ADK-201ENST00000286621 1169 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC7.39□□□□□ -1.23
PHACTR1Q9C0D0 SPAG11A-202ENST00000326625 445 ntTSL 5 BASIC7.39□□□□□ -1.23
PHACTR1Q9C0D0 SGMS1-201ENST00000361543 1096 ntTSL 1 (best) BASIC7.39□□□□□ -1.23
PHACTR1Q9C0D0 RN7SKP76-201ENST00000364419 323 ntBASIC7.39□□□□□ -1.23
PHACTR1Q9C0D0 TRBV25-1-202ENST00000390398 381 ntAPPRIS P1 BASIC7.39□□□□□ -1.23
PHACTR1Q9C0D0 RNU6-1009P-201ENST00000390996 107 ntBASIC7.39□□□□□ -1.23
PHACTR1Q9C0D0 KRT18P52-201ENST00000404956 846 ntBASIC7.39□□□□□ -1.23
PHACTR1Q9C0D0 EEF1GP7-201ENST00000422983 703 ntBASIC7.39□□□□□ -1.23
PHACTR1Q9C0D0 RPL23AP34-201ENST00000423483 410 ntBASIC7.39□□□□□ -1.23
PHACTR1Q9C0D0 FDPSP1-201ENST00000424976 1071 ntBASIC7.39□□□□□ -1.23
PHACTR1Q9C0D0 TRBV10-2-201ENST00000426318 395 ntAPPRIS P1 BASIC7.39□□□□□ -1.23
PHACTR1Q9C0D0 LINC00575-201ENST00000426551 910 ntTSL 1 (best) BASIC7.39□□□□□ -1.23
PHACTR1Q9C0D0 SEPT7P5-201ENST00000434048 306 ntBASIC7.39□□□□□ -1.23
PHACTR1Q9C0D0 AL358972.1-201ENST00000434356 466 ntTSL 2 BASIC7.39□□□□□ -1.23
PHACTR1Q9C0D0 AL353653.1-202ENST00000435177 539 ntTSL 3 BASIC7.39□□□□□ -1.23
PHACTR1Q9C0D0 HMGB1P45-201ENST00000435986 653 ntBASIC7.39□□□□□ -1.23
PHACTR1Q9C0D0 LINC01423-202ENST00000436845 423 ntTSL 2 BASIC7.39□□□□□ -1.23
PHACTR1Q9C0D0 OR3B1P-201ENST00000437536 893 ntBASIC7.39□□□□□ -1.23
PHACTR1Q9C0D0 LINC01525-201ENST00000442182 511 ntTSL 2 BASIC7.39□□□□□ -1.23
PHACTR1Q9C0D0 AC073284.1-201ENST00000448086 404 ntTSL 3 BASIC7.39□□□□□ -1.23
PHACTR1Q9C0D0 AC007879.3-202ENST00000448786 823 ntTSL 1 (best) BASIC7.39□□□□□ -1.23
PHACTR1Q9C0D0 OR7E102P-201ENST00000448855 1015 ntBASIC7.39□□□□□ -1.23
PHACTR1Q9C0D0 PSPHP1-201ENST00000450062 261 ntBASIC7.39□□□□□ -1.23
PHACTR1Q9C0D0 AL034399.1-201ENST00000451535 380 ntBASIC7.39□□□□□ -1.23
PHACTR1Q9C0D0 ETV5-AS1-201ENST00000453370 560 ntTSL 4 BASIC7.39□□□□□ -1.23
PHACTR1Q9C0D0 AC092832.2-201ENST00000456621 389 ntTSL 2 BASIC7.39□□□□□ -1.23
PHACTR1Q9C0D0 HSPE1P22-201ENST00000456856 327 ntBASIC7.39□□□□□ -1.23
PHACTR1Q9C0D0 RPL10P6-201ENST00000457497 318 ntBASIC7.39□□□□□ -1.23
PHACTR1Q9C0D0 AL390961.3-201ENST00000458171 485 ntTSL 5 BASIC7.39□□□□□ -1.23
PHACTR1Q9C0D0 AL133232.1-201ENST00000458293 483 ntTSL 5 BASIC7.39□□□□□ -1.23
PHACTR1Q9C0D0 RPL30P9-201ENST00000465586 330 ntBASIC7.39□□□□□ -1.23
PHACTR1Q9C0D0 RN7SL160P-201ENST00000468558 284 ntBASIC7.39□□□□□ -1.23
PHACTR1Q9C0D0 RN7SL414P-201ENST00000469545 294 ntBASIC7.39□□□□□ -1.23
PHACTR1Q9C0D0 ALG13-214ENST00000482742 620 ntTSL 2 BASIC7.39□□□□□ -1.23
PHACTR1Q9C0D0 AC091951.2-201ENST00000500762 203 ntBASIC7.39□□□□□ -1.23
PHACTR1Q9C0D0 DYNLL1P6-201ENST00000503440 264 ntBASIC7.39□□□□□ -1.23
PHACTR1Q9C0D0 ADGRL3-AS1-202ENST00000504135 542 ntTSL 5 BASIC7.39□□□□□ -1.23
PHACTR1Q9C0D0 NMNAT1P4-201ENST00000505598 840 ntBASIC7.39□□□□□ -1.23
PHACTR1Q9C0D0 SELENOP-204ENST00000507920 786 ntTSL 5 BASIC7.39□□□□□ -1.23
PHACTR1Q9C0D0 AC092674.1-201ENST00000513871 571 ntTSL 4 BASIC7.39□□□□□ -1.23
PHACTR1Q9C0D0 AC010342.1-201ENST00000514047 877 ntBASIC7.39□□□□□ -1.23
PHACTR1Q9C0D0 AC016813.1-201ENST00000521511 735 ntTSL 3 BASIC7.39□□□□□ -1.23
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PHACTR1Q9C0D0 AC105243.1-202ENST00000583942 847 ntTSL 3 BASIC7.39□□□□□ -1.23
PHACTR1Q9C0D0 AC018521.6-201ENST00000584276 335 ntTSL 5 BASIC7.39□□□□□ -1.23
PHACTR1Q9C0D0 ZNF559-205ENST00000586255 1016 ntTSL 1 (best) BASIC7.39□□□□□ -1.23
PHACTR1Q9C0D0 AC010928.1-202ENST00000589354 473 ntTSL 3 BASIC7.39□□□□□ -1.23
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PHACTR1Q9C0D0 AL137190.1-201ENST00000603288 282 ntBASIC7.39□□□□□ -1.23
PHACTR1Q9C0D0 AL109936.2-201ENST00000605350 650 ntBASIC7.39□□□□□ -1.23
PHACTR1Q9C0D0 ACYP2-208ENST00000606865 674 ntTSL 5 BASIC7.39□□□□□ -1.23
PHACTR1Q9C0D0 AC024560.3-201ENST00000608482 349 ntBASIC7.39□□□□□ -1.23
PHACTR1Q9C0D0 AP000894.4-201ENST00000610185 483 ntBASIC7.39□□□□□ -1.23
PHACTR1Q9C0D0 AC002553.4-201ENST00000616896 331 ntBASIC7.39□□□□□ -1.23
PHACTR1Q9C0D0 AC034229.6-201ENST00000623704 224 ntBASIC7.39□□□□□ -1.23
PHACTR1Q9C0D0 CAST-203ENST00000338252 2972 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.39□□□□□ -1.23
PHACTR1Q9C0D0 ZNF426-202ENST00000535489 2375 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.39□□□□□ -1.23
PHACTR1Q9C0D0 AC099062.1-202ENST00000640362 3864 ntTSL 5 BASIC7.39□□□□□ -1.23
PHACTR1Q9C0D0 PHLDB2-202ENST00000393925 5543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.38□□□□□ -1.23
PHACTR1Q9C0D0 BMPR1B-201ENST00000264568 1807 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.38□□□□□ -1.23
PHACTR1Q9C0D0 MED6-212ENST00000615788 1700 ntTSL 5 BASIC7.38□□□□□ -1.23
PHACTR1Q9C0D0 AC078880.4-201ENST00000617627 1749 ntBASIC7.38□□□□□ -1.23
PHACTR1Q9C0D0 CACNB4-219ENST00000636108 1698 ntTSL 5 BASIC7.38□□□□□ -1.23
PHACTR1Q9C0D0 MCCC1-210ENST00000492597 2774 ntTSL 1 (best) BASIC7.38□□□□□ -1.23
PHACTR1Q9C0D0 LRRC37B-220ENST00000584368 2773 ntTSL 1 (best) BASIC7.38□□□□□ -1.23
PHACTR1Q9C0D0 ADGRL3-206ENST00000507164 4982 ntTSL 5 BASIC7.38□□□□□ -1.23
PHACTR1Q9C0D0 LARP1B-203ENST00000432347 2707 ntTSL 1 (best) BASIC7.38□□□□□ -1.23
PHACTR1Q9C0D0 FGA-201ENST00000302053 3678 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.38□□□□□ -1.23
PHACTR1Q9C0D0 MTMR8-201ENST00000374852 2639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.38□□□□□ -1.23
PHACTR1Q9C0D0 TLK2-214ENST00000582809 3608 ntTSL 1 (best) BASIC7.38□□□□□ -1.23
PHACTR1Q9C0D0 ZNF763-202ENST00000358987 1518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.38□□□□□ -1.23
PHACTR1Q9C0D0 SERPINA9-205ENST00000448305 1520 ntTSL 1 (best) BASIC7.38□□□□□ -1.23
PHACTR1Q9C0D0 MMACHC-203ENST00000616135 1510 ntTSL 2 BASIC7.38□□□□□ -1.23
PHACTR1Q9C0D0 Z99496.1-201ENST00000469424 1477 ntBASIC7.38□□□□□ -1.23
PHACTR1Q9C0D0 AC092979.1-201ENST00000488190 1414 ntTSL 1 (best) BASIC7.38□□□□□ -1.23
PHACTR1Q9C0D0 AC126323.2-201ENST00000559985 2369 ntTSL 5 BASIC7.38□□□□□ -1.23
PHACTR1Q9C0D0 AC092111.2-201ENST00000611627 1414 ntBASIC7.38□□□□□ -1.23
PHACTR1Q9C0D0 AP3M1-201ENST00000355264 5124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.38□□□□□ -1.23
PHACTR1Q9C0D0 CCDC150P1-201ENST00000537123 2215 ntBASIC7.38□□□□□ -1.23
PHACTR1Q9C0D0 AC121758.1-201ENST00000557452 3942 ntTSL 2 BASIC7.38□□□□□ -1.23
PHACTR1Q9C0D0 OR5T2-201ENST00000313264 1248 ntAPPRIS P2 BASIC7.38□□□□□ -1.23
PHACTR1Q9C0D0 CFHR1-201ENST00000320493 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.38□□□□□ -1.23
PHACTR1Q9C0D0 HBS1L-202ENST00000367820 638 ntTSL 3 BASIC7.38□□□□□ -1.23
PHACTR1Q9C0D0 SNORA35-201ENST00000386104 128 ntBASIC7.38□□□□□ -1.23
PHACTR1Q9C0D0 RNU6-876P-201ENST00000391295 104 ntBASIC7.38□□□□□ -1.23
PHACTR1Q9C0D0 BCL2L15-203ENST00000393320 276 ntTSL 1 (best) BASIC7.38□□□□□ -1.23
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