Protein–RNA interactions for Protein: Q96Q05

TRAPPC9, Trafficking protein particle complex subunit 9, humanhuman

Predictions only

Length 1,148 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRAPPC9Q96Q05 AC130365.2-201ENST00000525882 1201 ntBASIC5.95□□□□□ -1.46
TRAPPC9Q96Q05 AC004923.2-201ENST00000529649 369 ntBASIC5.95□□□□□ -1.46
TRAPPC9Q96Q05 MTND5P21-201ENST00000531961 522 ntBASIC5.95□□□□□ -1.46
TRAPPC9Q96Q05 AC002056.2-201ENST00000532913 284 ntTSL 5 BASIC5.95□□□□□ -1.46
TRAPPC9Q96Q05 CLEC2B-202ENST00000538152 745 ntTSL 2 BASIC5.95□□□□□ -1.46
TRAPPC9Q96Q05 TNFSF11-205ENST00000544862 818 ntTSL 1 (best) BASIC5.95□□□□□ -1.46
TRAPPC9Q96Q05 AC125612.1-201ENST00000547580 377 ntBASIC5.95□□□□□ -1.46
TRAPPC9Q96Q05 LINC02392-201ENST00000548172 537 ntTSL 4 BASIC5.95□□□□□ -1.46
TRAPPC9Q96Q05 PPFIA2-AS1-202ENST00000549161 1080 ntTSL 3 BASIC5.95□□□□□ -1.46
TRAPPC9Q96Q05 LINC02316-201ENST00000553346 768 ntTSL 3 BASIC5.95□□□□□ -1.46
TRAPPC9Q96Q05 AC139099.3-202ENST00000574856 439 ntTSL 2 BASIC5.95□□□□□ -1.46
TRAPPC9Q96Q05 AC127024.4-201ENST00000585212 308 ntTSL 5 BASIC5.95□□□□□ -1.46
TRAPPC9Q96Q05 AC010320.2-201ENST00000593857 551 ntTSL 4 BASIC5.95□□□□□ -1.46
TRAPPC9Q96Q05 BNIP3P39-201ENST00000601077 554 ntBASIC5.95□□□□□ -1.46
TRAPPC9Q96Q05 ABI1P1-201ENST00000603375 1120 ntBASIC5.95□□□□□ -1.46
TRAPPC9Q96Q05 AL365181.4-201ENST00000609800 547 ntBASIC5.95□□□□□ -1.46
TRAPPC9Q96Q05 AC092266.1-201ENST00000610958 165 ntBASIC5.95□□□□□ -1.46
TRAPPC9Q96Q05 AL512652.1-201ENST00000619006 500 ntBASIC5.95□□□□□ -1.46
TRAPPC9Q96Q05 OR2L8-201ENST00000623922 939 ntAPPRIS P1 BASIC5.95□□□□□ -1.46
TRAPPC9Q96Q05 AJ009632.2-209ENST00000634853 933 ntTSL 5 BASIC5.95□□□□□ -1.46
TRAPPC9Q96Q05 AL590396.2-201ENST00000636511 1041 ntBASIC5.95□□□□□ -1.46
TRAPPC9Q96Q05 ZNF493-202ENST00000355504 4386 ntTSL 1 (best) BASIC5.95□□□□□ -1.46
TRAPPC9Q96Q05 TLR2-201ENST00000260010 4200 ntAPPRIS P1 BASIC5.95□□□□□ -1.46
TRAPPC9Q96Q05 ALKBH3-AS1-201ENST00000499194 1906 ntTSL 2 BASIC5.95□□□□□ -1.46
TRAPPC9Q96Q05 PALMD-203ENST00000605497 1942 ntTSL 1 (best) BASIC5.95□□□□□ -1.46
TRAPPC9Q96Q05 AP001541.1-201ENST00000623322 1904 ntBASIC5.95□□□□□ -1.46
TRAPPC9Q96Q05 NFKBIZ-203ENST00000394054 3787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.95□□□□□ -1.46
TRAPPC9Q96Q05 EYA4-211ENST00000525849 3456 ntTSL 5 BASIC5.95□□□□□ -1.46
TRAPPC9Q96Q05 ZNF192P1-201ENST00000440790 1628 ntTSL 5 BASIC5.95□□□□□ -1.46
TRAPPC9Q96Q05 MYO5A-201ENST00000356338 11971 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC5.95□□□□□ -1.46
TRAPPC9Q96Q05 RRM1-201ENST00000300738 3076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.95□□□□□ -1.46
TRAPPC9Q96Q05 MAPK10-328ENST00000641553 4009 ntBASIC5.95□□□□□ -1.46
TRAPPC9Q96Q05 CRNDE-212ENST00000613942 2601 ntTSL 5 BASIC5.95□□□□□ -1.46
TRAPPC9Q96Q05 BRIP1-201ENST00000259008 6048 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.94□□□□□ -1.46
TRAPPC9Q96Q05 AL354854.1-201ENST00000455940 1363 ntBASIC5.94□□□□□ -1.46
TRAPPC9Q96Q05 PHLDB2-214ENST00000495180 4159 ntTSL 2 BASIC5.94□□□□□ -1.46
TRAPPC9Q96Q05 GTF3C3-202ENST00000409364 1736 ntTSL 1 (best) BASIC5.94□□□□□ -1.46
TRAPPC9Q96Q05 SEMA3A-201ENST00000265362 8225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.94□□□□□ -1.46
TRAPPC9Q96Q05 AASDH-201ENST00000205214 3590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.94□□□□□ -1.46
TRAPPC9Q96Q05 STYX-202ENST00000442123 4554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.94□□□□□ -1.46
TRAPPC9Q96Q05 SLC26A5-207ENST00000393729 2422 ntTSL 5 BASIC5.94□□□□□ -1.46
TRAPPC9Q96Q05 TRPC4-204ENST00000379673 2760 ntTSL 1 (best) BASIC5.94□□□□□ -1.46
TRAPPC9Q96Q05 KARSP1-201ENST00000451871 1752 ntBASIC5.94□□□□□ -1.46
TRAPPC9Q96Q05 RAD1P1-201ENST00000231383 813 ntBASIC5.94□□□□□ -1.46
TRAPPC9Q96Q05 GCNT6-201ENST00000379591 934 ntBASIC5.94□□□□□ -1.46
TRAPPC9Q96Q05 PIGP-204ENST00000399102 688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.94□□□□□ -1.46
TRAPPC9Q96Q05 RPA3-204ENST00000406109 434 ntTSL 3 BASIC5.94□□□□□ -1.46
TRAPPC9Q96Q05 RPL26P37-201ENST00000411983 438 ntBASIC5.94□□□□□ -1.46
TRAPPC9Q96Q05 AC079809.1-201ENST00000415468 276 ntBASIC5.94□□□□□ -1.46
TRAPPC9Q96Q05 LINC01953-201ENST00000426870 717 ntTSL 5 BASIC5.94□□□□□ -1.46
TRAPPC9Q96Q05 LINC01473-202ENST00000427108 695 ntTSL 5 BASIC5.94□□□□□ -1.46
TRAPPC9Q96Q05 AC068631.1-204ENST00000428501 534 ntTSL 3 BASIC5.94□□□□□ -1.46
TRAPPC9Q96Q05 AL136231.1-201ENST00000429407 730 ntBASIC5.94□□□□□ -1.46
TRAPPC9Q96Q05 PTP4A1P3-201ENST00000433661 420 ntBASIC5.94□□□□□ -1.46
TRAPPC9Q96Q05 RPS3AP38-201ENST00000435889 763 ntBASIC5.94□□□□□ -1.46
TRAPPC9Q96Q05 MTCYBP29-201ENST00000436327 1006 ntBASIC5.94□□□□□ -1.46
TRAPPC9Q96Q05 AL353662.1-201ENST00000439099 327 ntBASIC5.94□□□□□ -1.46
TRAPPC9Q96Q05 DNAJA1P5-201ENST00000440278 943 ntBASIC5.94□□□□□ -1.46
TRAPPC9Q96Q05 AC024084.1-201ENST00000440744 455 ntTSL 5 BASIC5.94□□□□□ -1.46
TRAPPC9Q96Q05 AL353898.1-201ENST00000444055 238 ntBASIC5.94□□□□□ -1.46
TRAPPC9Q96Q05 MED28P3-201ENST00000444288 531 ntBASIC5.94□□□□□ -1.46
TRAPPC9Q96Q05 AC104457.2-201ENST00000446055 467 ntTSL 2 BASIC5.94□□□□□ -1.46
TRAPPC9Q96Q05 MIR205HG-209ENST00000458250 406 ntTSL 3 BASIC5.94□□□□□ -1.46
TRAPPC9Q96Q05 AC068633.1-202ENST00000476460 458 ntTSL 2 BASIC5.94□□□□□ -1.46
TRAPPC9Q96Q05 NPM1P17-201ENST00000479221 602 ntBASIC5.94□□□□□ -1.46
TRAPPC9Q96Q05 AC104411.1-201ENST00000480817 320 ntTSL 3 BASIC5.94□□□□□ -1.46
TRAPPC9Q96Q05 CR383658.1-201ENST00000514609 734 ntBASIC5.94□□□□□ -1.46
TRAPPC9Q96Q05 BFSP2-AS1-201ENST00000515542 894 ntTSL 1 (best) BASIC5.94□□□□□ -1.46
TRAPPC9Q96Q05 RNA5SP434-201ENST00000516647 121 ntBASIC5.94□□□□□ -1.46
TRAPPC9Q96Q05 AC008663.1-201ENST00000519821 455 ntTSL 4 BASIC5.94□□□□□ -1.46
TRAPPC9Q96Q05 AC010768.4-201ENST00000528183 520 ntTSL 3 BASIC5.94□□□□□ -1.46
TRAPPC9Q96Q05 C3orf14-207ENST00000542214 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.94□□□□□ -1.46
TRAPPC9Q96Q05 SYNE2-210ENST00000553455 674 ntTSL 2 BASIC5.94□□□□□ -1.46
TRAPPC9Q96Q05 AC079414.1-201ENST00000563114 488 ntTSL 1 (best) BASIC5.94□□□□□ -1.46
TRAPPC9Q96Q05 PWRN1-207ENST00000565893 818 ntTSL 3 BASIC5.94□□□□□ -1.46
TRAPPC9Q96Q05 AC012370.2-201ENST00000597541 1080 ntTSL 5 BASIC5.94□□□□□ -1.46
TRAPPC9Q96Q05 AL356580.1-201ENST00000604129 159 ntTSL 5 BASIC5.94□□□□□ -1.46
TRAPPC9Q96Q05 AL139022.2-201ENST00000606934 443 ntBASIC5.94□□□□□ -1.46
TRAPPC9Q96Q05 AC004801.6-201ENST00000616571 978 ntBASIC5.94□□□□□ -1.46
TRAPPC9Q96Q05 REV3L-214ENST00000619481 969 ntTSL 5 BASIC5.94□□□□□ -1.46
TRAPPC9Q96Q05 BANCR-201ENST00000624238 473 ntTSL 2 BASIC5.94□□□□□ -1.46
TRAPPC9Q96Q05 AC134980.1-203ENST00000640541 570 ntTSL 4 BASIC5.94□□□□□ -1.46
TRAPPC9Q96Q05 UOX-205ENST00000640983 544 ntTSL 4 BASIC5.94□□□□□ -1.46
TRAPPC9Q96Q05 ADH6-202ENST00000394897 3337 ntTSL 2 BASIC5.94□□□□□ -1.46
TRAPPC9Q96Q05 UBE3A-205ENST00000566215 3176 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.94□□□□□ -1.46
TRAPPC9Q96Q05 TRIM64B-201ENST00000329862 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.94□□□□□ -1.46
TRAPPC9Q96Q05 KMT2D-201ENST00000301067 19419 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.94□□□□□ -1.46
TRAPPC9Q96Q05 YPEL5-204ENST00000402003 2197 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.94□□□□□ -1.46
TRAPPC9Q96Q05 ELMO1-203ENST00000396045 2524 ntTSL 1 (best) BASIC5.94□□□□□ -1.46
TRAPPC9Q96Q05 ROR1-204ENST00000545203 5362 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.94□□□□□ -1.46
TRAPPC9Q96Q05 LINC00102-201ENST00000445785 1340 ntTSL 1 (best) BASIC5.94□□□□□ -1.46
TRAPPC9Q96Q05 KCNH7-205ENST00000621889 1893 ntTSL 5 BASIC5.94□□□□□ -1.46
TRAPPC9Q96Q05 RGPD1-206ENST00000641458 5271 ntAPPRIS ALT2 BASIC5.94□□□□□ -1.46
TRAPPC9Q96Q05 LYARP1-201ENST00000436977 1501 ntBASIC5.94□□□□□ -1.46
TRAPPC9Q96Q05 ASAH2-203ENST00000443575 1942 ntTSL 5 BASIC5.93□□□□□ -1.46
TRAPPC9Q96Q05 FANCD2-203ENST00000419585 5185 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.93□□□□□ -1.46
TRAPPC9Q96Q05 NELL2-201ENST00000333837 2943 ntTSL 2 BASIC5.93□□□□□ -1.46
TRAPPC9Q96Q05 ETV1-208ENST00000420159 6231 ntTSL 2 BASIC5.93□□□□□ -1.46
TRAPPC9Q96Q05 GRIK1-201ENST00000327783 3179 ntTSL 5 BASIC5.93□□□□□ -1.46
TRAPPC9Q96Q05 CAV1-205ENST00000405348 2443 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC5.93□□□□□ -1.46
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 96.8 ms