Protein–RNA interactions for Protein: Q8NEK5

ZNF548, Zinc finger protein 548, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 533 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZNF548Q8NEK5 MIR4505-201ENST00000582238 73 ntBASIC5.76□□□□□ -1.49
ZNF548Q8NEK5 FO393422.1-201ENST00000603908 708 ntBASIC5.76□□□□□ -1.49
ZNF548Q8NEK5 SNORA35B-201ENST00000607417 129 ntBASIC5.76□□□□□ -1.49
ZNF548Q8NEK5 LINC02266-201ENST00000610239 1151 ntTSL 3 BASIC5.76□□□□□ -1.49
ZNF548Q8NEK5 LINC01620-204ENST00000623295 700 ntTSL 1 (best) BASIC5.76□□□□□ -1.49
ZNF548Q8NEK5 AL691477.1-201ENST00000624398 162 ntBASIC5.76□□□□□ -1.49
ZNF548Q8NEK5 AP001153.1-201ENST00000641024 338 ntBASIC5.76□□□□□ -1.49
ZNF548Q8NEK5 OR11H2-202ENST00000641517 1085 ntBASIC5.76□□□□□ -1.49
ZNF548Q8NEK5 AL136985.3-202ENST00000636386 2708 ntTSL 5 BASIC5.76□□□□□ -1.49
ZNF548Q8NEK5 BRCA1-203ENST00000357654 7094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.76□□□□□ -1.49
ZNF548Q8NEK5 ZNF630-202ENST00000409324 2455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.76□□□□□ -1.49
ZNF548Q8NEK5 CNTNAP4-205ENST00000476707 4355 ntTSL 2 BASIC5.76□□□□□ -1.49
ZNF548Q8NEK5 TRIM64-201ENST00000533122 2691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.76□□□□□ -1.49
ZNF548Q8NEK5 AL161756.3-201ENST00000641216 2071 ntBASIC5.76□□□□□ -1.49
ZNF548Q8NEK5 LINC02141-201ENST00000568279 6586 ntTSL 1 (best) BASIC5.76□□□□□ -1.49
ZNF548Q8NEK5 IFNE-201ENST00000448696 1475 ntAPPRIS P1 BASIC5.76□□□□□ -1.49
ZNF548Q8NEK5 NAT1-201ENST00000307719 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.76□□□□□ -1.49
ZNF548Q8NEK5 PARD3B-214ENST00000622699 7442 ntTSL 5 BASIC5.75□□□□□ -1.49
ZNF548Q8NEK5 CTAGE5-204ENST00000341749 2912 ntTSL 1 (best) BASIC5.75□□□□□ -1.49
ZNF548Q8NEK5 SRGAP1-201ENST00000355086 23331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.75□□□□□ -1.49
ZNF548Q8NEK5 PEX5L-202ENST00000392649 8540 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.75□□□□□ -1.49
ZNF548Q8NEK5 LINC01844-201ENST00000432677 2237 ntTSL 1 (best) BASIC5.75□□□□□ -1.49
ZNF548Q8NEK5 ZNF480-205ENST00000595962 4738 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.75□□□□□ -1.49
ZNF548Q8NEK5 ZNF402P-201ENST00000404435 3100 ntBASIC5.75□□□□□ -1.49
ZNF548Q8NEK5 LINC01152-201ENST00000472655 3578 ntTSL 1 (best) BASIC5.75□□□□□ -1.49
ZNF548Q8NEK5 AC087516.1-201ENST00000561236 2428 ntBASIC5.75□□□□□ -1.49
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ZNF548Q8NEK5 AL513548.1-201ENST00000562904 1724 ntBASIC5.75□□□□□ -1.49
ZNF548Q8NEK5 GPR174-201ENST00000276077 1258 ntAPPRIS P1 BASIC5.75□□□□□ -1.49
ZNF548Q8NEK5 AC007618.1-201ENST00000366455 732 ntBASIC5.75□□□□□ -1.49
ZNF548Q8NEK5 C6orf48-208ENST00000395788 815 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.75□□□□□ -1.49
ZNF548Q8NEK5 AL139039.2-201ENST00000407436 479 ntBASIC5.75□□□□□ -1.49
ZNF548Q8NEK5 NME1P1-201ENST00000420914 382 ntBASIC5.75□□□□□ -1.49
ZNF548Q8NEK5 BX510359.3-201ENST00000422168 306 ntBASIC5.75□□□□□ -1.49
ZNF548Q8NEK5 AL662874.1-201ENST00000426065 230 ntBASIC5.75□□□□□ -1.49
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ZNF548Q8NEK5 AC105271.1-201ENST00000442876 497 ntTSL 3 BASIC5.75□□□□□ -1.49
ZNF548Q8NEK5 AL353743.2-203ENST00000443630 492 ntTSL 3 BASIC5.75□□□□□ -1.49
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ZNF548Q8NEK5 AL353148.1-203ENST00000452286 665 ntTSL 3 BASIC5.75□□□□□ -1.49
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ZNF548Q8NEK5 PDZRN4-203ENST00000539469 3041 ntTSL 1 (best) BASIC5.74□□□□□ -1.49
ZNF548Q8NEK5 TRIP12-204ENST00000389045 5355 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.74□□□□□ -1.49
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ZNF548Q8NEK5 ZSCAN12P1-201ENST00000406489 419 ntBASIC5.74□□□□□ -1.49
ZNF548Q8NEK5 MYL6P5-201ENST00000412707 459 ntBASIC5.74□□□□□ -1.49
ZNF548Q8NEK5 AC079630.1-201ENST00000412812 585 ntTSL 4 BASIC5.74□□□□□ -1.49
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ZNF548Q8NEK5 Z98742.1-201ENST00000419801 632 ntTSL 3 BASIC5.74□□□□□ -1.49
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ZNF548Q8NEK5 AL445528.1-201ENST00000426330 420 ntBASIC5.74□□□□□ -1.49
ZNF548Q8NEK5 LINC01501-201ENST00000427523 409 ntTSL 3 BASIC5.74□□□□□ -1.49
ZNF548Q8NEK5 DEFA9P-201ENST00000433042 285 ntBASIC5.74□□□□□ -1.49
ZNF548Q8NEK5 HMGB3P24-201ENST00000433260 622 ntBASIC5.74□□□□□ -1.49
ZNF548Q8NEK5 LYPLA1P1-201ENST00000434514 622 ntBASIC5.74□□□□□ -1.49
ZNF548Q8NEK5 AL049649.1-201ENST00000444792 1105 ntTSL 5 BASIC5.74□□□□□ -1.49
ZNF548Q8NEK5 AL354793.1-201ENST00000446028 713 ntTSL 3 BASIC5.74□□□□□ -1.49
ZNF548Q8NEK5 AC003991.1-202ENST00000447058 777 ntTSL 3 BASIC5.74□□□□□ -1.49
ZNF548Q8NEK5 AC013733.1-201ENST00000449835 985 ntTSL 4 BASIC5.74□□□□□ -1.49
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