Protein–RNA interactions for Protein: Q17RW2

COL24A1, Collagen alpha-1(XXIV) chain, humanhuman

Predictions only

Length 1,714 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COL24A1Q17RW2 DLC1-201ENST00000276297 7447 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC6.71□□□□□ -1.34
COL24A1Q17RW2 TRRAP-202ENST00000359863 12677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.7□□□□□ -1.34
COL24A1Q17RW2 FAM197Y3-202ENST00000427622 2325 ntTSL 5 BASIC6.7□□□□□ -1.34
COL24A1Q17RW2 FAM197Y7-202ENST00000433321 2325 ntTSL 2 BASIC6.7□□□□□ -1.34
COL24A1Q17RW2 FAM197Y9-201ENST00000451062 2332 ntTSL 5 BASIC6.7□□□□□ -1.34
COL24A1Q17RW2 LINC00463-201ENST00000413501 1147 ntTSL 3 BASIC6.7□□□□□ -1.34
COL24A1Q17RW2 RIMKLBP2-201ENST00000424737 654 ntBASIC6.7□□□□□ -1.34
COL24A1Q17RW2 AL159174.1-202ENST00000425588 442 ntTSL 3 BASIC6.7□□□□□ -1.34
COL24A1Q17RW2 ATP6V0E1P2-201ENST00000441771 245 ntBASIC6.7□□□□□ -1.34
COL24A1Q17RW2 IGBP1P3-201ENST00000447449 1000 ntBASIC6.7□□□□□ -1.34
COL24A1Q17RW2 MFAP5-205ENST00000535336 566 ntTSL 4 BASIC6.7□□□□□ -1.34
COL24A1Q17RW2 LINC01859-201ENST00000565584 1024 ntTSL 1 (best) BASIC6.7□□□□□ -1.34
COL24A1Q17RW2 AP001542.3-201ENST00000587619 527 ntTSL 5 BASIC6.7□□□□□ -1.34
COL24A1Q17RW2 TTN-AS1-232ENST00000589487 1077 ntTSL 5 BASIC6.7□□□□□ -1.34
COL24A1Q17RW2 UGP2-232ENST00000640075 567 ntTSL 5 BASIC6.7□□□□□ -1.34
COL24A1Q17RW2 AL353796.1-201ENST00000561542 3241 ntBASIC6.7□□□□□ -1.34
COL24A1Q17RW2 KIAA0586-201ENST00000261244 4807 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.7□□□□□ -1.34
COL24A1Q17RW2 SEC22A-201ENST00000309934 4228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.7□□□□□ -1.34
COL24A1Q17RW2 BEND2-201ENST00000380030 1938 ntTSL 1 (best) BASIC6.7□□□□□ -1.34
COL24A1Q17RW2 PKIB-211ENST00000615438 1936 ntTSL 5 BASIC6.7□□□□□ -1.34
COL24A1Q17RW2 CCNT1-201ENST00000261900 6973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.7□□□□□ -1.34
COL24A1Q17RW2 NPM1-203ENST00000393820 1598 ntTSL 1 (best) BASIC6.7□□□□□ -1.34
COL24A1Q17RW2 TXNRD1-212ENST00000526390 3808 ntTSL 5 BASIC6.7□□□□□ -1.34
COL24A1Q17RW2 NRCAM-210ENST00000425651 3915 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.7□□□□□ -1.34
COL24A1Q17RW2 DGKH-210ENST00000628433 3449 ntTSL 2 BASIC6.7□□□□□ -1.34
COL24A1Q17RW2 TRIM22-201ENST00000379965 2989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.7□□□□□ -1.34
COL24A1Q17RW2 BPIFC-201ENST00000300399 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.7□□□□□ -1.34
COL24A1Q17RW2 AP004243.1-201ENST00000529108 1433 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.7□□□□□ -1.34
COL24A1Q17RW2 ZSCAN12-201ENST00000361028 5495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.7□□□□□ -1.34
COL24A1Q17RW2 AC087258.1-203ENST00000545400 1629 ntTSL 2 BASIC6.7□□□□□ -1.34
COL24A1Q17RW2 ATP5A1P4-201ENST00000556888 1605 ntBASIC6.7□□□□□ -1.34
COL24A1Q17RW2 GABRA1-218ENST00000637827 1838 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.7□□□□□ -1.34
COL24A1Q17RW2 AP002530.1-201ENST00000405705 684 ntBASIC6.7□□□□□ -1.34
COL24A1Q17RW2 AL009179.1-201ENST00000406085 265 ntBASIC6.7□□□□□ -1.34
COL24A1Q17RW2 ELOCP19-201ENST00000411919 318 ntBASIC6.7□□□□□ -1.34
COL24A1Q17RW2 RNF10P1-201ENST00000418589 369 ntBASIC6.7□□□□□ -1.34
COL24A1Q17RW2 AC092651.1-201ENST00000426110 312 ntBASIC6.7□□□□□ -1.34
COL24A1Q17RW2 AL450992.2-201ENST00000434182 506 ntTSL 5 BASIC6.7□□□□□ -1.34
COL24A1Q17RW2 GAPDHP56-201ENST00000506031 988 ntBASIC6.7□□□□□ -1.34
COL24A1Q17RW2 AC109464.1-201ENST00000511091 819 ntBASIC6.7□□□□□ -1.34
COL24A1Q17RW2 AC026402.1-201ENST00000513642 170 ntBASIC6.7□□□□□ -1.34
COL24A1Q17RW2 AC008147.3-201ENST00000548666 354 ntBASIC6.7□□□□□ -1.34
COL24A1Q17RW2 AC008149.1-201ENST00000551844 525 ntTSL 4 BASIC6.7□□□□□ -1.34
COL24A1Q17RW2 AC025271.2-201ENST00000566990 800 ntTSL 3 BASIC6.7□□□□□ -1.34
COL24A1Q17RW2 AC005899.1-201ENST00000584125 563 ntTSL 5 BASIC6.7□□□□□ -1.34
COL24A1Q17RW2 LINC00254-202ENST00000633813 439 ntTSL 3 BASIC6.7□□□□□ -1.34
COL24A1Q17RW2 AC134980.1-209ENST00000639059 2317 ntTSL 2 BASIC6.7□□□□□ -1.34
COL24A1Q17RW2 TRRAP-201ENST00000355540 12590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.7□□□□□ -1.34
COL24A1Q17RW2 PTPRO-210ENST00000544244 3978 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC6.7□□□□□ -1.34
COL24A1Q17RW2 SLC12A1-201ENST00000330289 1764 ntTSL 1 (best) BASIC6.69□□□□□ -1.34
COL24A1Q17RW2 AC007681.1-201ENST00000604271 3438 ntTSL 4 BASIC6.69□□□□□ -1.34
COL24A1Q17RW2 ZFY-202ENST00000383052 5113 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.69□□□□□ -1.34
COL24A1Q17RW2 KLHL13-202ENST00000371876 5331 ntTSL 1 (best) BASIC6.69□□□□□ -1.34
COL24A1Q17RW2 AGBL1-201ENST00000441037 3551 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.69□□□□□ -1.34
COL24A1Q17RW2 AC139713.2-209ENST00000509873 1303 ntTSL 1 (best) BASIC6.69□□□□□ -1.34
COL24A1Q17RW2 FER1L6-201ENST00000522917 6051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.69□□□□□ -1.34
COL24A1Q17RW2 TRRAP-207ENST00000628380 12644 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.69□□□□□ -1.34
COL24A1Q17RW2 PHTF2-207ENST00000424760 1977 ntTSL 2 BASIC6.69□□□□□ -1.34
COL24A1Q17RW2 BAALC-AS1-201ENST00000499522 1353 ntTSL 5 BASIC6.69□□□□□ -1.34
COL24A1Q17RW2 U3.3-201ENST00000362986 216 ntBASIC6.69□□□□□ -1.34
COL24A1Q17RW2 MIR105-1-201ENST00000385222 81 ntBASIC6.69□□□□□ -1.34
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COL24A1Q17RW2 SORCS3-AS1-201ENST00000449805 1278 ntTSL 1 (best) BASIC6.69□□□□□ -1.34
COL24A1Q17RW2 OR11I1P-201ENST00000486033 954 ntBASIC6.69□□□□□ -1.34
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COL24A1Q17RW2 GMFG-202ENST00000594700 397 ntTSL 2 BASIC6.69□□□□□ -1.34
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COL24A1Q17RW2 ASB15-206ENST00000451558 4788 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.69□□□□□ -1.34
COL24A1Q17RW2 ITPR1-204ENST00000443694 9513 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC6.69□□□□□ -1.34
COL24A1Q17RW2 ZNF253-203ENST00000589717 3519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.69□□□□□ -1.34
COL24A1Q17RW2 OGT-201ENST00000373701 3310 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC6.69□□□□□ -1.34
COL24A1Q17RW2 ATP5A1P1-201ENST00000454088 1321 ntBASIC6.69□□□□□ -1.34
COL24A1Q17RW2 TMEM133-201ENST00000303130 1953 ntAPPRIS P1 BASIC6.69□□□□□ -1.34
COL24A1Q17RW2 SLC12A6-218ENST00000560611 4239 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC6.68□□□□□ -1.34
COL24A1Q17RW2 GFPT1-202ENST00000361060 8632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.68□□□□□ -1.34
COL24A1Q17RW2 POLQ-201ENST00000264233 8775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.68□□□□□ -1.34
COL24A1Q17RW2 ART3-203ENST00000355810 1561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.68□□□□□ -1.34
COL24A1Q17RW2 AC008505.1-201ENST00000637582 2025 ntTSL 5 BASIC6.68□□□□□ -1.34
COL24A1Q17RW2 SAMM50P1-201ENST00000455403 1399 ntBASIC6.68□□□□□ -1.34
COL24A1Q17RW2 LMO7-203ENST00000357063 8237 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.68□□□□□ -1.34
COL24A1Q17RW2 ADTRP-201ENST00000229583 891 ntTSL 2 BASIC6.68□□□□□ -1.34
COL24A1Q17RW2 OR4N5-201ENST00000333629 927 ntAPPRIS P1 BASIC6.68□□□□□ -1.34
COL24A1Q17RW2 RNASE9-201ENST00000338904 1049 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.68□□□□□ -1.34
COL24A1Q17RW2 AL033380.1-201ENST00000442781 421 ntTSL 2 BASIC6.68□□□□□ -1.34
COL24A1Q17RW2 TRBV2-201ENST00000455382 421 ntAPPRIS P1 BASIC6.68□□□□□ -1.34
COL24A1Q17RW2 AC092754.1-201ENST00000472975 479 ntBASIC6.68□□□□□ -1.34
COL24A1Q17RW2 RPS4XP20-201ENST00000505751 772 ntBASIC6.68□□□□□ -1.34
COL24A1Q17RW2 AP005436.1-201ENST00000531454 488 ntTSL 2 BASIC6.68□□□□□ -1.34
COL24A1Q17RW2 YWHABP2-201ENST00000540201 713 ntBASIC6.68□□□□□ -1.34
COL24A1Q17RW2 AC122688.1-201ENST00000541494 223 ntBASIC6.68□□□□□ -1.34
COL24A1Q17RW2 RNASE9-204ENST00000553541 1136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.68□□□□□ -1.34
COL24A1Q17RW2 RNASE9-206ENST00000554964 1101 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.68□□□□□ -1.34
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