Protein–RNA interactions for Protein: Q15906

VPS72, Vacuolar protein sorting-associated protein 72 homolog, humanhuman

Predictions only

Length 364 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VPS72Q15906 EFCAB9-201ENST00000398186 702 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC7.41□□□□□ -1.22
VPS72Q15906 DHFRP5-201ENST00000406944 564 ntBASIC7.41□□□□□ -1.22
VPS72Q15906 LINC00342-201ENST00000412393 654 ntTSL 3 BASIC7.41□□□□□ -1.22
VPS72Q15906 AC106901.1-201ENST00000425086 698 ntBASIC7.41□□□□□ -1.22
VPS72Q15906 AC007422.1-201ENST00000433065 1008 ntTSL 5 BASIC7.41□□□□□ -1.22
VPS72Q15906 SCAND3P1-201ENST00000439854 1060 ntBASIC7.41□□□□□ -1.22
VPS72Q15906 LINC01986-201ENST00000440867 590 ntTSL 5 BASIC7.41□□□□□ -1.22
VPS72Q15906 AL162739.1-201ENST00000450606 307 ntBASIC7.41□□□□□ -1.22
VPS72Q15906 AL356390.1-201ENST00000455684 397 ntBASIC7.41□□□□□ -1.22
VPS72Q15906 AC011287.2-201ENST00000456809 842 ntTSL 5 BASIC7.41□□□□□ -1.22
VPS72Q15906 PLGLA-202ENST00000482249 475 ntTSL 3 BASIC7.41□□□□□ -1.22
VPS72Q15906 AC138965.1-202ENST00000502354 547 ntTSL 5 BASIC7.41□□□□□ -1.22
VPS72Q15906 AC016651.1-201ENST00000502680 822 ntTSL 3 BASIC7.41□□□□□ -1.22
VPS72Q15906 AC140125.3-201ENST00000505248 547 ntTSL 4 BASIC7.41□□□□□ -1.22
VPS72Q15906 CYP4F27P-201ENST00000514557 494 ntBASIC7.41□□□□□ -1.22
VPS72Q15906 RFPL4AP3-201ENST00000515267 345 ntBASIC7.41□□□□□ -1.22
VPS72Q15906 E2F5-204ENST00000517476 1094 ntTSL 2 BASIC7.41□□□□□ -1.22
VPS72Q15906 OR7G1-201ENST00000541538 936 ntAPPRIS P1 BASIC7.41□□□□□ -1.22
VPS72Q15906 AC087477.3-201ENST00000559214 552 ntTSL 4 BASIC7.41□□□□□ -1.22
VPS72Q15906 AC013652.1-202ENST00000561058 570 ntTSL 4 BASIC7.41□□□□□ -1.22
VPS72Q15906 OR4H6P-201ENST00000563771 921 ntBASIC7.41□□□□□ -1.22
VPS72Q15906 MTND4LP25-201ENST00000570218 163 ntBASIC7.41□□□□□ -1.22
VPS72Q15906 AC005670.2-201ENST00000571841 889 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.41□□□□□ -1.22
VPS72Q15906 AC005244.2-201ENST00000585228 718 ntTSL 3 BASIC7.41□□□□□ -1.22
VPS72Q15906 AC092683.1-203ENST00000594050 654 ntTSL 5 BASIC7.41□□□□□ -1.22
VPS72Q15906 AP003117.1-201ENST00000602771 554 ntBASIC7.41□□□□□ -1.22
VPS72Q15906 AC027334.1-201ENST00000603257 310 ntBASIC7.41□□□□□ -1.22
VPS72Q15906 KATNBL1P1-201ENST00000605192 748 ntBASIC7.41□□□□□ -1.22
VPS72Q15906 AL355974.3-201ENST00000617383 467 ntBASIC7.41□□□□□ -1.22
VPS72Q15906 AC068631.1-223ENST00000625877 472 ntTSL 5 BASIC7.41□□□□□ -1.22
VPS72Q15906 OR7D2-203ENST00000642043 3157 ntAPPRIS P1 BASIC7.41□□□□□ -1.22
VPS72Q15906 LINC00704-201ENST00000430998 1478 ntTSL 1 (best) BASIC7.41□□□□□ -1.22
VPS72Q15906 AC024341.1-201ENST00000526444 1552 ntBASIC7.41□□□□□ -1.22
VPS72Q15906 ENPP2-207ENST00000522167 1695 ntTSL 2 BASIC7.41□□□□□ -1.22
VPS72Q15906 NRG3-202ENST00000372142 3136 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.41□□□□□ -1.22
VPS72Q15906 FGF13-201ENST00000305414 1939 ntTSL 1 (best) BASIC7.4□□□□□ -1.22
VPS72Q15906 PSG1-206ENST00000595356 1903 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.4□□□□□ -1.22
VPS72Q15906 ZNF273-204ENST00000476120 2000 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC7.4□□□□□ -1.22
VPS72Q15906 DSC2-201ENST00000251081 4826 ntTSL 1 (best) BASIC7.4□□□□□ -1.22
VPS72Q15906 GON4L-204ENST00000437809 7713 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC7.4□□□□□ -1.22
VPS72Q15906 ZNF227-201ENST00000313040 3043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.4□□□□□ -1.22
VPS72Q15906 PLD5-203ENST00000427495 3018 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.4□□□□□ -1.22
VPS72Q15906 NR5A2-203ENST00000367362 5086 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.4□□□□□ -1.22
VPS72Q15906 ZNF81-204ENST00000376954 7933 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.4□□□□□ -1.22
VPS72Q15906 OLMALINC-203ENST00000641087 3779 ntBASIC7.4□□□□□ -1.22
VPS72Q15906 SPINK7-201ENST00000274565 557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.4□□□□□ -1.22
VPS72Q15906 SNORA62-201ENST00000365493 153 ntBASIC7.4□□□□□ -1.22
VPS72Q15906 RNU1-149P-201ENST00000390870 161 ntBASIC7.4□□□□□ -1.22
VPS72Q15906 KLRC3-202ENST00000396439 1028 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.4□□□□□ -1.22
VPS72Q15906 SFR1P2-201ENST00000421841 730 ntBASIC7.4□□□□□ -1.22
VPS72Q15906 AC007064.3-201ENST00000422608 359 ntBASIC7.4□□□□□ -1.22
VPS72Q15906 MTCYBP32-201ENST00000427945 1084 ntBASIC7.4□□□□□ -1.22
VPS72Q15906 Z85994.2-201ENST00000434327 452 ntBASIC7.4□□□□□ -1.22
VPS72Q15906 AC020559.1-201ENST00000444229 583 ntTSL 2 BASIC7.4□□□□□ -1.22
VPS72Q15906 AL356981.1-201ENST00000454879 684 ntBASIC7.4□□□□□ -1.22
VPS72Q15906 AKR1C2-203ENST00000455190 1098 ntTSL 2 BASIC7.4□□□□□ -1.22
VPS72Q15906 RNU1-88P-201ENST00000459274 128 ntBASIC7.4□□□□□ -1.22
VPS72Q15906 AC096741.1-201ENST00000472250 846 ntBASIC7.4□□□□□ -1.22
VPS72Q15906 LINC01192-206ENST00000489012 818 ntTSL 5 BASIC7.4□□□□□ -1.22
VPS72Q15906 AC008897.1-201ENST00000494006 347 ntBASIC7.4□□□□□ -1.22
VPS72Q15906 AC118282.1-201ENST00000506408 765 ntBASIC7.4□□□□□ -1.22
VPS72Q15906 CENPK-210ENST00000510354 1124 ntTSL 5 BASIC7.4□□□□□ -1.22
VPS72Q15906 LINC01088-208ENST00000511895 795 ntTSL 2 BASIC7.4□□□□□ -1.22
VPS72Q15906 AC124854.1-201ENST00000512210 511 ntTSL 3 BASIC7.4□□□□□ -1.22
VPS72Q15906 AC005000.1-201ENST00000536192 288 ntBASIC7.4□□□□□ -1.22
VPS72Q15906 AC068775.2-201ENST00000539033 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.4□□□□□ -1.22
VPS72Q15906 AC078820.1-201ENST00000548702 742 ntTSL 3 BASIC7.4□□□□□ -1.22
VPS72Q15906 AL355112.1-201ENST00000550309 1236 ntTSL 1 (best) BASIC7.4□□□□□ -1.22
VPS72Q15906 AC209154.1-201ENST00000582156 337 ntBASIC7.4□□□□□ -1.22
VPS72Q15906 AC104984.2-201ENST00000582938 385 ntTSL 3 BASIC7.4□□□□□ -1.22
VPS72Q15906 FAM60CP-201ENST00000591086 664 ntBASIC7.4□□□□□ -1.22
VPS72Q15906 AC048344.4-201ENST00000619744 527 ntBASIC7.4□□□□□ -1.22
VPS72Q15906 SATB1-AS1-243ENST00000627546 589 ntTSL 5 BASIC7.4□□□□□ -1.22
VPS72Q15906 CASC19-221ENST00000641309 1382 ntBASIC7.4□□□□□ -1.22
VPS72Q15906 ITPR1-205ENST00000456211 9717 ntTSL 1 (best) BASIC7.4□□□□□ -1.22
VPS72Q15906 AC092111.2-201ENST00000611627 1414 ntBASIC7.4□□□□□ -1.22
VPS72Q15906 ZNF721-201ENST00000338977 4492 ntTSL 2 BASIC7.4□□□□□ -1.22
VPS72Q15906 SPAG9-209ENST00000510283 4949 ntTSL 2 BASIC7.4□□□□□ -1.22
VPS72Q15906 CDKAL1-204ENST00000613575 1673 ntTSL 1 (best) BASIC7.4□□□□□ -1.23
VPS72Q15906 NLRP3P1-201ENST00000622303 1785 ntBASIC7.4□□□□□ -1.23
VPS72Q15906 RIMKLB-207ENST00000538135 5392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.4□□□□□ -1.23
VPS72Q15906 AK9-201ENST00000285397 2566 ntTSL 1 (best) BASIC7.4□□□□□ -1.23
VPS72Q15906 LINC02523-201ENST00000423208 2963 ntTSL 1 (best) BASIC7.4□□□□□ -1.23
VPS72Q15906 PROX1-203ENST00000435016 3075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.4□□□□□ -1.23
VPS72Q15906 OR9K1P-202ENST00000641111 3217 ntBASIC7.4□□□□□ -1.23
VPS72Q15906 KIAA2012-204ENST00000498697 3772 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.4□□□□□ -1.23
VPS72Q15906 WDCP-201ENST00000295148 3817 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC7.4□□□□□ -1.23
VPS72Q15906 ATP13A4-202ENST00000342695 4208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.4□□□□□ -1.23
VPS72Q15906 CHST12-201ENST00000258711 15979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.4□□□□□ -1.23
VPS72Q15906 ROR1-204ENST00000545203 5362 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.4□□□□□ -1.23
VPS72Q15906 DNAJC15-201ENST00000379221 7853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.4□□□□□ -1.23
VPS72Q15906 TRIP12-201ENST00000283943 9874 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.4□□□□□ -1.23
VPS72Q15906 IARS-202ENST00000375643 4656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.39□□□□□ -1.23
VPS72Q15906 LRRTM4-205ENST00000409911 2976 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC7.39□□□□□ -1.23
VPS72Q15906 RNF213-220ENST00000582970 21055 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.39□□□□□ -1.23
VPS72Q15906 FOXP1-212ENST00000491238 2250 ntTSL 2 BASIC7.39□□□□□ -1.23
VPS72Q15906 PEAK1-202ENST00000558305 4644 ntTSL 4 BASIC7.39□□□□□ -1.23
VPS72Q15906 ITGA1-201ENST00000282588 10757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.39□□□□□ -1.23
VPS72Q15906 EMC2-201ENST00000220853 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.39□□□□□ -1.23
VPS72Q15906 AC126755.2-208ENST00000327792 462 ntBASIC7.39□□□□□ -1.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 84.2 ms