Protein–RNA interactions for Protein: Q15836

VAMP3, Vesicle-associated membrane protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 100 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VAMP3Q15836 pRNA.9-201ENST00000618609 89 ntBASIC3.99□□□□□ -1.77
VAMP3Q15836 MIR7159-201ENST00000620587 66 ntBASIC3.99□□□□□ -1.77
VAMP3Q15836 AC006328.2-201ENST00000623198 397 ntBASIC3.99□□□□□ -1.77
VAMP3Q15836 AC012005.2-201ENST00000624333 397 ntBASIC3.99□□□□□ -1.77
VAMP3Q15836 TEX41-255ENST00000626404 610 ntTSL 5 BASIC3.99□□□□□ -1.77
VAMP3Q15836 TTN-AS1-268ENST00000629094 604 ntTSL 5 BASIC3.99□□□□□ -1.77
VAMP3Q15836 IFI44L-201ENST00000370751 5874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.99□□□□□ -1.77
VAMP3Q15836 CD47-201ENST00000355354 5020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.99□□□□□ -1.77
VAMP3Q15836 OR4S2-202ENST00000641692 2211 ntAPPRIS P1 BASIC3.99□□□□□ -1.77
VAMP3Q15836 BCLAF1P2-201ENST00000624956 2609 ntBASIC3.99□□□□□ -1.77
VAMP3Q15836 SOHLH2-202ENST00000379881 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.99□□□□□ -1.77
VAMP3Q15836 C4orf17-201ENST00000326581 1636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC3.99□□□□□ -1.77
VAMP3Q15836 MEG8-223ENST00000638012 3757 ntTSL 5 BASIC3.99□□□□□ -1.77
VAMP3Q15836 AC008691.1-207ENST00000636819 4154 ntTSL 5 BASIC3.99□□□□□ -1.77
VAMP3Q15836 AC027290.2-201ENST00000623210 18662 ntBASIC3.99□□□□□ -1.77
VAMP3Q15836 MEMO1-202ENST00000379383 1498 ntTSL 1 (best) BASIC3.98□□□□□ -1.77
VAMP3Q15836 NUTM2B-AS1-213ENST00000619625 7611 ntTSL 2 BASIC3.98□□□□□ -1.77
VAMP3Q15836 LINC01787-201ENST00000435311 1994 ntTSL 2 BASIC3.98□□□□□ -1.77
VAMP3Q15836 INTS6-220ENST00000497989 3022 ntTSL 2 BASIC3.98□□□□□ -1.77
VAMP3Q15836 CEP120-203ENST00000328236 4710 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.98□□□□□ -1.77
VAMP3Q15836 ZNF480-202ENST00000335090 2722 ntTSL 3 BASIC3.98□□□□□ -1.77
VAMP3Q15836 SP110-202ENST00000258382 2080 ntTSL 1 (best) BASIC3.98□□□□□ -1.77
VAMP3Q15836 PWRN1-211ENST00000568609 1443 ntTSL 1 (best) BASIC3.98□□□□□ -1.77
VAMP3Q15836 AC134882.1-201ENST00000603738 1676 ntBASIC3.98□□□□□ -1.77
VAMP3Q15836 UGT2A1-203ENST00000503640 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.98□□□□□ -1.77
VAMP3Q15836 AFP-201ENST00000226359 1914 ntTSL 5 BASIC3.98□□□□□ -1.77
VAMP3Q15836 RASGRP1-209ENST00000559830 1910 ntTSL 1 (best) BASIC3.98□□□□□ -1.77
VAMP3Q15836 WFDC8-202ENST00000357199 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.98□□□□□ -1.77
VAMP3Q15836 RNA5SP321-201ENST00000362722 111 ntBASIC3.98□□□□□ -1.77
VAMP3Q15836 RN7SKP76-201ENST00000364419 323 ntBASIC3.98□□□□□ -1.77
VAMP3Q15836 RAET1G-201ENST00000367360 1107 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC3.98□□□□□ -1.77
VAMP3Q15836 NOX1-203ENST00000372964 661 ntTSL 2 BASIC3.98□□□□□ -1.77
VAMP3Q15836 SSX1-201ENST00000376919 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.98□□□□□ -1.77
VAMP3Q15836 COMMD6-204ENST00000377619 594 ntTSL 2 BASIC3.98□□□□□ -1.77
VAMP3Q15836 EEF1AKMT1-201ENST00000382754 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.98□□□□□ -1.77
VAMP3Q15836 RNU1-136P-201ENST00000384181 164 ntBASIC3.98□□□□□ -1.77
VAMP3Q15836 AL034417.1-201ENST00000399343 800 ntBASIC3.98□□□□□ -1.77
VAMP3Q15836 PSG11-203ENST00000403486 1163 ntTSL 2 BASIC3.98□□□□□ -1.77
VAMP3Q15836 RPL23AP48-201ENST00000406913 488 ntBASIC3.98□□□□□ -1.77
VAMP3Q15836 RN7SKP268-201ENST00000411107 316 ntBASIC3.98□□□□□ -1.77
VAMP3Q15836 AL024497.1-201ENST00000412954 631 ntTSL 5 BASIC3.98□□□□□ -1.77
VAMP3Q15836 SMIM2-IT1-201ENST00000415082 478 ntTSL 3 BASIC3.98□□□□□ -1.77
VAMP3Q15836 AC093158.1-201ENST00000415549 791 ntTSL 3 BASIC3.98□□□□□ -1.77
VAMP3Q15836 AC105275.1-201ENST00000417794 491 ntTSL 3 BASIC3.98□□□□□ -1.77
VAMP3Q15836 KCND3-AS1-201ENST00000419258 383 ntTSL 3 BASIC3.98□□□□□ -1.77
VAMP3Q15836 NPM1P26-201ENST00000426339 738 ntBASIC3.98□□□□□ -1.77
VAMP3Q15836 AL392003.1-201ENST00000434394 243 ntBASIC3.98□□□□□ -1.77
VAMP3Q15836 AC139712.3-201ENST00000443926 639 ntTSL 2 BASIC3.98□□□□□ -1.77
VAMP3Q15836 SRP68P2-201ENST00000456184 254 ntBASIC3.98□□□□□ -1.77
VAMP3Q15836 FAM74A1-201ENST00000465257 623 ntTSL 1 (best) BASIC3.98□□□□□ -1.77
VAMP3Q15836 AC006511.1-201ENST00000470614 315 ntBASIC3.98□□□□□ -1.77
VAMP3Q15836 EFCAB10-204ENST00000485614 799 ntTSL 5 BASIC3.98□□□□□ -1.77
VAMP3Q15836 PRELID3BP7-201ENST00000503606 469 ntBASIC3.98□□□□□ -1.77
VAMP3Q15836 AC113382.2-201ENST00000506911 646 ntTSL 3 BASIC3.98□□□□□ -1.77
VAMP3Q15836 LINC01184-206ENST00000508878 968 ntTSL 5 BASIC3.98□□□□□ -1.77
VAMP3Q15836 RNU2-30P-201ENST00000516209 141 ntBASIC3.98□□□□□ -1.77
VAMP3Q15836 LINC01030-201ENST00000517505 738 ntTSL 3 BASIC3.98□□□□□ -1.77
VAMP3Q15836 AP005902.2-201ENST00000518393 307 ntBASIC3.98□□□□□ -1.77
VAMP3Q15836 IGHVIII-2-1-201ENST00000518843 291 ntBASIC3.98□□□□□ -1.77
VAMP3Q15836 RBPMS-207ENST00000519647 780 ntTSL 5 BASIC3.98□□□□□ -1.77
VAMP3Q15836 AC103831.1-201ENST00000522228 422 ntTSL 3 BASIC3.98□□□□□ -1.77
VAMP3Q15836 AC011410.1-201ENST00000524175 705 ntTSL 5 BASIC3.98□□□□□ -1.77
VAMP3Q15836 LINC02553-201ENST00000529088 734 ntTSL 5 BASIC3.98□□□□□ -1.77
VAMP3Q15836 AP002498.1-201ENST00000530190 568 ntTSL 3 BASIC3.98□□□□□ -1.77
VAMP3Q15836 AC079089.1-203ENST00000533300 431 ntTSL 5 BASIC3.98□□□□□ -1.77
VAMP3Q15836 AL121594.2-201ENST00000541658 472 ntBASIC3.98□□□□□ -1.77
VAMP3Q15836 LINC02443-204ENST00000544717 754 ntTSL 5 BASIC3.98□□□□□ -1.77
VAMP3Q15836 LINC02451-201ENST00000546982 565 ntTSL 4 BASIC3.98□□□□□ -1.77
VAMP3Q15836 HAGLR-211ENST00000549329 609 ntTSL 4 BASIC3.98□□□□□ -1.77
VAMP3Q15836 PPIAP6-201ENST00000557078 499 ntBASIC3.98□□□□□ -1.77
VAMP3Q15836 AC066612.1-202ENST00000561094 518 ntTSL 5 BASIC3.98□□□□□ -1.77
VAMP3Q15836 AC013489.1-201ENST00000561140 598 ntTSL 3 BASIC3.98□□□□□ -1.77
VAMP3Q15836 AP005121.1-201ENST00000578243 469 ntTSL 3 BASIC3.98□□□□□ -1.77
VAMP3Q15836 AC068020.1-201ENST00000594215 661 ntBASIC3.98□□□□□ -1.77
VAMP3Q15836 ZRANB2-AS2-215ENST00000596952 624 ntTSL 5 BASIC3.98□□□□□ -1.77
VAMP3Q15836 AC130352.1-201ENST00000602979 661 ntBASIC3.98□□□□□ -1.77
VAMP3Q15836 AC092032.1-201ENST00000603090 165 ntBASIC3.98□□□□□ -1.77
VAMP3Q15836 AC107031.1-201ENST00000604939 347 ntTSL 2 BASIC3.98□□□□□ -1.77
VAMP3Q15836 ZNF248-209ENST00000615949 518 ntTSL 5 BASIC3.98□□□□□ -1.77
VAMP3Q15836 FAM74A6-203ENST00000615956 481 ntBASIC3.98□□□□□ -1.77
VAMP3Q15836 AC009237.17-201ENST00000618111 748 ntBASIC3.98□□□□□ -1.77
VAMP3Q15836 AC139769.3-201ENST00000618383 175 ntBASIC3.98□□□□□ -1.77
VAMP3Q15836 AC013727.1-201ENST00000618581 839 ntTSL 5 BASIC3.98□□□□□ -1.77
VAMP3Q15836 AC018558.4-201ENST00000622153 281 ntBASIC3.98□□□□□ -1.77
VAMP3Q15836 AP002505.2-201ENST00000623585 696 ntBASIC3.98□□□□□ -1.77
VAMP3Q15836 DARS-AS1-227ENST00000627442 633 ntTSL 5 BASIC3.98□□□□□ -1.77
VAMP3Q15836 ATPAF1-212ENST00000542495 1779 ntTSL 2 BASIC3.98□□□□□ -1.77
VAMP3Q15836 CDH19-201ENST00000262150 6341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.98□□□□□ -1.77
VAMP3Q15836 ZNF573-208ENST00000536220 2257 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC3.98□□□□□ -1.77
VAMP3Q15836 MACF1-231ENST00000564288 24828 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC3.98□□□□□ -1.77
VAMP3Q15836 AL031119.1-201ENST00000404707 1879 ntBASIC3.98□□□□□ -1.77
VAMP3Q15836 CKAP5-210ENST00000529230 7121 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.98□□□□□ -1.77
VAMP3Q15836 CTAGE5-217ENST00000557038 2869 ntTSL 1 (best) BASIC3.98□□□□□ -1.77
VAMP3Q15836 GSTM2-206ENST00000442650 1478 ntTSL 5 BASIC3.98□□□□□ -1.77
VAMP3Q15836 CTAGE5-201ENST00000280082 2554 ntTSL 1 (best) BASIC3.98□□□□□ -1.77
VAMP3Q15836 SLC1A3-216ENST00000613445 4030 ntTSL 5 BASIC3.98□□□□□ -1.77
VAMP3Q15836 KLRD1-204ENST00000381908 15549 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC3.97□□□□□ -1.77
VAMP3Q15836 PYHIN1-204ENST00000392252 1597 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.97□□□□□ -1.77
VAMP3Q15836 CCDC102B-210ENST00000584156 1554 ntTSL 1 (best) BASIC3.97□□□□□ -1.77
VAMP3Q15836 LIMA1-214ENST00000552783 3612 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.97□□□□□ -1.77
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 97.1 ms