Protein–RNA interactions for Protein: Q15431

SYCP1, Synaptonemal complex protein 1, humanhuman

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Length 976 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SYCP1Q15431 BX323845.3-201ENST00000428215 527 ntBASIC6.13□□□□□ -1.43
SYCP1Q15431 AL354896.1-201ENST00000430214 561 ntTSL 4 BASIC6.13□□□□□ -1.43
SYCP1Q15431 AC023481.1-201ENST00000435368 938 ntTSL 3 BASIC6.13□□□□□ -1.43
SYCP1Q15431 AL583854.1-201ENST00000438818 613 ntTSL 5 BASIC6.13□□□□□ -1.43
SYCP1Q15431 AP000470.1-201ENST00000448063 693 ntTSL 5 BASIC6.13□□□□□ -1.43
SYCP1Q15431 GAS5-218ENST00000448718 565 ntTSL 2 BASIC6.13□□□□□ -1.43
SYCP1Q15431 NXT1P1-201ENST00000458481 316 ntBASIC6.13□□□□□ -1.43
SYCP1Q15431 ACA64.1-201ENST00000459171 127 ntBASIC6.13□□□□□ -1.43
SYCP1Q15431 CREM-220ENST00000463314 964 ntTSL 2 BASIC6.13□□□□□ -1.43
SYCP1Q15431 ATP5LP5-201ENST00000483050 299 ntBASIC6.13□□□□□ -1.43
SYCP1Q15431 LSM3P4-201ENST00000502948 309 ntBASIC6.13□□□□□ -1.43
SYCP1Q15431 LINC02218-202ENST00000504998 582 ntTSL 4 BASIC6.13□□□□□ -1.43
SYCP1Q15431 DUTP7-201ENST00000507982 486 ntBASIC6.13□□□□□ -1.43
SYCP1Q15431 AC010181.1-202ENST00000509191 798 ntTSL 3 BASIC6.13□□□□□ -1.43
SYCP1Q15431 RNA5SP438-201ENST00000516561 112 ntBASIC6.13□□□□□ -1.43
SYCP1Q15431 AC011853.1-201ENST00000518911 454 ntBASIC6.13□□□□□ -1.43
SYCP1Q15431 AL139354.1-201ENST00000554319 645 ntTSL 5 BASIC6.13□□□□□ -1.43
SYCP1Q15431 AC015660.3-201ENST00000559569 198 ntTSL 3 BASIC6.13□□□□□ -1.43
SYCP1Q15431 AC068722.1-202ENST00000559600 655 ntTSL 3 BASIC6.13□□□□□ -1.43
SYCP1Q15431 AC233702.9-201ENST00000581528 203 ntBASIC6.13□□□□□ -1.43
SYCP1Q15431 AC107926.1-201ENST00000581673 621 ntTSL 3 BASIC6.13□□□□□ -1.43
SYCP1Q15431 AP2S1-210ENST00000601649 315 ntTSL 3 BASIC6.13□□□□□ -1.43
SYCP1Q15431 AL359091.2-201ENST00000609303 556 ntBASIC6.13□□□□□ -1.43
SYCP1Q15431 AC129778.1-202ENST00000623812 261 ntBASIC6.13□□□□□ -1.43
SYCP1Q15431 AL591379.1-207ENST00000635982 261 ntBASIC6.13□□□□□ -1.43
SYCP1Q15431 AMYH02020865.1-205ENST00000636189 261 ntBASIC6.13□□□□□ -1.43
SYCP1Q15431 PRKCH-228ENST00000640011 285 ntTSL 5 BASIC6.13□□□□□ -1.43
SYCP1Q15431 MAK-203ENST00000474039 3859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.13□□□□□ -1.43
SYCP1Q15431 RGS17-202ENST00000367225 7773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.13□□□□□ -1.43
SYCP1Q15431 AC022417.1-201ENST00000624768 1303 ntBASIC6.13□□□□□ -1.43
SYCP1Q15431 EEF1A1P14-201ENST00000421195 1376 ntBASIC6.13□□□□□ -1.43
SYCP1Q15431 C1orf140-202ENST00000439004 4340 ntTSL 1 (best) BASIC6.13□□□□□ -1.43
SYCP1Q15431 CD200R1L-204ENST00000488794 1597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.13□□□□□ -1.43
SYCP1Q15431 AC019072.1-201ENST00000604535 1551 ntBASIC6.13□□□□□ -1.43
SYCP1Q15431 FGG-201ENST00000336098 1659 ntTSL 2 BASIC6.13□□□□□ -1.43
SYCP1Q15431 C2orf66-201ENST00000342506 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.13□□□□□ -1.43
SYCP1Q15431 EDA2R-202ENST00000374719 3418 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.13□□□□□ -1.43
SYCP1Q15431 AC010531.4-202ENST00000569872 1718 ntTSL 2 BASIC6.13□□□□□ -1.43
SYCP1Q15431 PREPL-201ENST00000260648 3672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.13□□□□□ -1.43
SYCP1Q15431 ALS2CR12-202ENST00000392257 1943 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.13□□□□□ -1.43
SYCP1Q15431 DDX18P6-201ENST00000450119 1997 ntBASIC6.13□□□□□ -1.43
SYCP1Q15431 TTC3-204ENST00000399017 10363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.13□□□□□ -1.43
SYCP1Q15431 MOSPD2-201ENST00000380492 4163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.13□□□□□ -1.43
SYCP1Q15431 FNIP1-202ENST00000307968 6388 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.13□□□□□ -1.43
SYCP1Q15431 AC114947.2-201ENST00000565748 2125 ntBASIC6.13□□□□□ -1.43
SYCP1Q15431 MARCH1-202ENST00000339875 2476 ntTSL 1 (best) BASIC6.13□□□□□ -1.43
SYCP1Q15431 LINC01933-204ENST00000524295 3591 ntTSL 2 BASIC6.12□□□□□ -1.43
SYCP1Q15431 NBPF10-201ENST00000583866 13042 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.12□□□□□ -1.43
SYCP1Q15431 SLC15A2-201ENST00000295605 2379 ntTSL 2 BASIC6.12□□□□□ -1.43
SYCP1Q15431 GAPDHP24-201ENST00000328713 983 ntBASIC6.12□□□□□ -1.43
SYCP1Q15431 RNU1-150P-201ENST00000362491 162 ntBASIC6.12□□□□□ -1.43
SYCP1Q15431 RNA5SP477-201ENST00000362639 119 ntBASIC6.12□□□□□ -1.43
SYCP1Q15431 RNA5SP30-201ENST00000365552 115 ntBASIC6.12□□□□□ -1.43
SYCP1Q15431 AC007618.1-201ENST00000366455 732 ntBASIC6.12□□□□□ -1.43
SYCP1Q15431 PAGE2-202ENST00000374968 551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.12□□□□□ -1.43
SYCP1Q15431 CCL8-201ENST00000394620 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.12□□□□□ -1.43
SYCP1Q15431 RNASE11-202ENST00000398009 1034 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC6.12□□□□□ -1.43
SYCP1Q15431 AK4P4-201ENST00000419465 646 ntBASIC6.12□□□□□ -1.43
SYCP1Q15431 NENFP1-201ENST00000419476 466 ntBASIC6.12□□□□□ -1.43
SYCP1Q15431 OR5K2-201ENST00000427338 1060 ntAPPRIS P1 BASIC6.12□□□□□ -1.43
SYCP1Q15431 AC007679.3-201ENST00000434035 414 ntBASIC6.12□□□□□ -1.43
SYCP1Q15431 AC019117.1-202ENST00000439046 589 ntTSL 3 BASIC6.12□□□□□ -1.43
SYCP1Q15431 GSTM2-206ENST00000442650 1478 ntTSL 5 BASIC6.12□□□□□ -1.43
SYCP1Q15431 CSMD3-204ENST00000455883 12485 ntTSL 1 (best) BASIC6.12□□□□□ -1.43
SYCP1Q15431 AC245028.2-201ENST00000458673 253 ntBASIC6.12□□□□□ -1.43
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SYCP1Q15431 RPS17P15-201ENST00000475609 349 ntBASIC6.12□□□□□ -1.43
SYCP1Q15431 PRB1-202ENST00000500254 775 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.12□□□□□ -1.43
SYCP1Q15431 CD164-207ENST00000504373 1402 ntTSL 1 (best) BASIC6.12□□□□□ -1.43
SYCP1Q15431 LINC02057-202ENST00000511794 577 ntTSL 3 BASIC6.12□□□□□ -1.43
SYCP1Q15431 OR5H7P-201ENST00000514084 930 ntBASIC6.12□□□□□ -1.43
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SYCP1Q15431 AC002056.2-201ENST00000532913 284 ntTSL 5 BASIC6.12□□□□□ -1.43
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SYCP1Q15431 OR52E8-201ENST00000537935 1061 ntAPPRIS P1 BASIC6.12□□□□□ -1.43
SYCP1Q15431 AL671883.2-201ENST00000539514 536 ntTSL 4 BASIC6.12□□□□□ -1.43
SYCP1Q15431 GPRC5D-AS1-205ENST00000540198 404 ntTSL 5 BASIC6.12□□□□□ -1.43
SYCP1Q15431 SETP1-201ENST00000556014 845 ntBASIC6.12□□□□□ -1.43
SYCP1Q15431 FRMD6-AS2-201ENST00000556617 548 ntTSL 4 BASIC6.12□□□□□ -1.43
SYCP1Q15431 TTN-AS1-226ENST00000588716 604 ntTSL 5 BASIC6.12□□□□□ -1.43
SYCP1Q15431 ZNF418-210ENST00000600989 597 ntTSL 5 BASIC6.12□□□□□ -1.43
SYCP1Q15431 AL591926.1-201ENST00000620542 217 ntBASIC6.12□□□□□ -1.43
SYCP1Q15431 AJ239318.1-201ENST00000624445 607 ntTSL 1 (best) BASIC6.12□□□□□ -1.43
SYCP1Q15431 ARHGAP24-201ENST00000264343 4572 ntTSL 1 (best) BASIC6.12□□□□□ -1.43
SYCP1Q15431 AC008691.1-207ENST00000636819 4154 ntTSL 5 BASIC6.12□□□□□ -1.43
SYCP1Q15431 PPEF1-202ENST00000361511 2890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.12□□□□□ -1.43
SYCP1Q15431 GUCY1A3-201ENST00000296518 4400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.11□□□□□ -1.43
SYCP1Q15431 C12orf4-209ENST00000545746 2168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.11□□□□□ -1.43
SYCP1Q15431 AC067956.1-201ENST00000414512 2062 ntTSL 1 (best) BASIC6.11□□□□□ -1.43
SYCP1Q15431 CLUL1-213ENST00000620089 1947 ntTSL 5 BASIC6.11□□□□□ -1.43
SYCP1Q15431 ZNF271P-205ENST00000639248 4573 ntTSL 5 BASIC6.11□□□□□ -1.43
SYCP1Q15431 CARD6-201ENST00000254691 4221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.11□□□□□ -1.43
SYCP1Q15431 FGF13-202ENST00000315930 19519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.11□□□□□ -1.43
SYCP1Q15431 SASS6-201ENST00000287482 3880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.11□□□□□ -1.43
SYCP1Q15431 RLN1-201ENST00000223862 967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.11□□□□□ -1.43
SYCP1Q15431 OR1L4-201ENST00000259466 936 ntAPPRIS P1 BASIC6.11□□□□□ -1.43
SYCP1Q15431 ELOC-201ENST00000284811 683 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC6.11□□□□□ -1.43
SYCP1Q15431 RNU6-249P-201ENST00000363016 102 ntBASIC6.11□□□□□ -1.43
SYCP1Q15431 ADPRM-201ENST00000379774 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.11□□□□□ -1.43
SYCP1Q15431 TRAJ4-201ENST00000390533 63 ntAPPRIS P1 BASIC6.11□□□□□ -1.43
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