Protein–RNA interactions for Protein: Q14699

RFTN1, Raftlin, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 578 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RFTN1Q14699 RABGAP1L-214ENST00000478442 648 ntTSL 1 (best) BASIC5.67□□□□□ -1.5
RFTN1Q14699 NPM1P28-201ENST00000492269 840 ntBASIC5.67□□□□□ -1.5
RFTN1Q14699 RPSAP51-201ENST00000497462 645 ntBASIC5.67□□□□□ -1.5
RFTN1Q14699 LINC02271-202ENST00000506379 596 ntTSL 4 BASIC5.67□□□□□ -1.5
RFTN1Q14699 OSMR-AS1-201ENST00000506463 800 ntTSL 3 BASIC5.67□□□□□ -1.5
RFTN1Q14699 AC138409.2-202ENST00000507274 458 ntBASIC5.67□□□□□ -1.5
RFTN1Q14699 SSX6-203ENST00000509958 336 ntTSL 3 BASIC5.67□□□□□ -1.5
RFTN1Q14699 OR5AM1P-201ENST00000532136 1032 ntBASIC5.67□□□□□ -1.5
RFTN1Q14699 AC234775.3-201ENST00000564612 656 ntBASIC5.67□□□□□ -1.5
RFTN1Q14699 AC015720.2-201ENST00000567709 334 ntBASIC5.67□□□□□ -1.5
RFTN1Q14699 MIR1273E-201ENST00000581165 102 ntBASIC5.67□□□□□ -1.5
RFTN1Q14699 AC026786.2-201ENST00000606110 392 ntTSL 3 BASIC5.67□□□□□ -1.5
RFTN1Q14699 AC105265.3-202ENST00000610188 459 ntTSL 5 BASIC5.67□□□□□ -1.5
RFTN1Q14699 MIR6133-201ENST00000617057 108 ntBASIC5.67□□□□□ -1.5
RFTN1Q14699 SNORA11.6-201ENST00000619030 128 ntBASIC5.67□□□□□ -1.5
RFTN1Q14699 MIR325HG-202ENST00000626832 598 ntTSL 4 BASIC5.67□□□□□ -1.5
RFTN1Q14699 OR51Q1-202ENST00000641085 1096 ntAPPRIS P1 BASIC5.67□□□□□ -1.5
RFTN1Q14699 MAMDC2-AS1-201ENST00000377178 1504 ntTSL 1 (best) BASIC5.67□□□□□ -1.5
RFTN1Q14699 OR2J3-202ENST00000641151 3297 ntAPPRIS P1 BASIC5.67□□□□□ -1.5
RFTN1Q14699 AC011287.1-206ENST00000638774 2642 ntTSL 5 BASIC5.67□□□□□ -1.5
RFTN1Q14699 CCDC62-205ENST00000537566 3537 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC5.67□□□□□ -1.5
RFTN1Q14699 CTAGE5-219ENST00000640607 4239 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC5.67□□□□□ -1.5
RFTN1Q14699 ESRRG-204ENST00000361525 5363 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.67□□□□□ -1.5
RFTN1Q14699 NDUFS1-207ENST00000455934 3361 ntTSL 2 BASIC5.67□□□□□ -1.5
RFTN1Q14699 BBOX1-202ENST00000525090 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.67□□□□□ -1.5
RFTN1Q14699 AF127577.4-201ENST00000432230 5929 ntTSL 5 BASIC5.67□□□□□ -1.5
RFTN1Q14699 AC079601.1-201ENST00000547824 2791 ntTSL 1 (best) BASIC5.67□□□□□ -1.5
RFTN1Q14699 AC011933.2-201ENST00000578539 2790 ntBASIC5.67□□□□□ -1.5
RFTN1Q14699 ERCC6L-201ENST00000334463 4243 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.66□□□□□ -1.5
RFTN1Q14699 MCM10-202ENST00000378714 4547 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.66□□□□□ -1.5
RFTN1Q14699 NELL2-201ENST00000333837 2943 ntTSL 2 BASIC5.66□□□□□ -1.5
RFTN1Q14699 DDX18P6-201ENST00000450119 1997 ntBASIC5.66□□□□□ -1.5
RFTN1Q14699 CASP1-208ENST00000527979 1521 ntTSL 5 BASIC5.66□□□□□ -1.5
RFTN1Q14699 FP236241.1-201ENST00000623374 7632 ntTSL 1 (best) BASIC5.66□□□□□ -1.5
RFTN1Q14699 CU633967.1-211ENST00000624444 7628 ntTSL 1 (best) BASIC5.66□□□□□ -1.5
RFTN1Q14699 RPL39P5-201ENST00000273411 449 ntTSL 1 (best) BASIC5.66□□□□□ -1.5
RFTN1Q14699 SPRR2D-201ENST00000360379 682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.66□□□□□ -1.5
RFTN1Q14699 MIR143-201ENST00000385300 106 ntBASIC5.66□□□□□ -1.5
RFTN1Q14699 AL391422.1-201ENST00000402155 436 ntBASIC5.66□□□□□ -1.5
RFTN1Q14699 AC012499.1-201ENST00000412133 741 ntTSL 5 BASIC5.66□□□□□ -1.5
RFTN1Q14699 OR6E1P-201ENST00000414424 923 ntBASIC5.66□□□□□ -1.5
RFTN1Q14699 AL360007.1-201ENST00000426166 349 ntTSL 3 BASIC5.66□□□□□ -1.5
RFTN1Q14699 RPL12P18-201ENST00000437175 325 ntBASIC5.66□□□□□ -1.5
RFTN1Q14699 AP000281.1-201ENST00000444036 316 ntBASIC5.66□□□□□ -1.5
RFTN1Q14699 IGBP1P3-201ENST00000447449 1000 ntBASIC5.66□□□□□ -1.5
RFTN1Q14699 AP000470.1-201ENST00000448063 693 ntTSL 5 BASIC5.66□□□□□ -1.5
RFTN1Q14699 LINC01344-202ENST00000449842 571 ntTSL 3 BASIC5.66□□□□□ -1.5
RFTN1Q14699 AC016724.1-201ENST00000453215 421 ntBASIC5.66□□□□□ -1.5
RFTN1Q14699 AL358876.1-201ENST00000453364 1075 ntBASIC5.66□□□□□ -1.5
RFTN1Q14699 SETP20-201ENST00000457046 852 ntBASIC5.66□□□□□ -1.5
RFTN1Q14699 IQCJ-SCHIP1-AS1-201ENST00000460574 508 ntTSL 3 BASIC5.66□□□□□ -1.5
RFTN1Q14699 AC064802.1-201ENST00000521523 866 ntTSL 2 BASIC5.66□□□□□ -1.5
RFTN1Q14699 IGKV3D-34-201ENST00000522638 302 ntBASIC5.66□□□□□ -1.5
RFTN1Q14699 AC022616.2-201ENST00000523185 300 ntBASIC5.66□□□□□ -1.5
RFTN1Q14699 AP001267.3-204ENST00000528578 423 ntTSL 3 BASIC5.66□□□□□ -1.5
RFTN1Q14699 LINC00933-205ENST00000560917 449 ntTSL 3 BASIC5.66□□□□□ -1.5
RFTN1Q14699 AC087500.2-201ENST00000575056 498 ntTSL 5 BASIC5.66□□□□□ -1.5
RFTN1Q14699 LINC01835-202ENST00000589345 450 ntTSL 3 BASIC5.66□□□□□ -1.5
RFTN1Q14699 AC012616.1-201ENST00000600294 197 ntBASIC5.66□□□□□ -1.5
RFTN1Q14699 LINC01320-210ENST00000626008 929 ntTSL 5 BASIC5.66□□□□□ -1.5
RFTN1Q14699 TRIQK-206ENST00000518748 3563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.66□□□□□ -1.5
RFTN1Q14699 MGAM2-201ENST00000477922 7867 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.66□□□□□ -1.5
RFTN1Q14699 AASDH-202ENST00000451613 3182 ntTSL 1 (best) BASIC5.66□□□□□ -1.5
RFTN1Q14699 AC004158.1-201ENST00000564508 4319 ntBASIC5.66□□□□□ -1.5
RFTN1Q14699 FAM19A2-215ENST00000551619 2718 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.66□□□□□ -1.5
RFTN1Q14699 SAMD9L-204ENST00000437805 5757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.66□□□□□ -1.5
RFTN1Q14699 MYBPC1-207ENST00000545503 3569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.66□□□□□ -1.5
RFTN1Q14699 G3BP1-202ENST00000394123 10240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.66□□□□□ -1.5
RFTN1Q14699 AC093155.3-201ENST00000370548 2013 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.65□□□□□ -1.5
RFTN1Q14699 DDX58-201ENST00000379868 4089 ntTSL 5 BASIC5.65□□□□□ -1.5
RFTN1Q14699 SLC35A5-206ENST00000492406 4399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.65□□□□□ -1.5
RFTN1Q14699 HACD3-209ENST00000566511 1782 ntTSL 5 BASIC5.65□□□□□ -1.5
RFTN1Q14699 ERP27-201ENST00000266397 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.65□□□□□ -1.5
RFTN1Q14699 ZNF780A-204ENST00000455521 3600 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.65□□□□□ -1.5
RFTN1Q14699 MCF2L2-202ENST00000414362 3031 ntTSL 2 BASIC5.65□□□□□ -1.5
RFTN1Q14699 AGO2-201ENST00000220592 14581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.65□□□□□ -1.5
RFTN1Q14699 GRAMD1C-208ENST00000472026 1876 ntTSL 2 BASIC5.65□□□□□ -1.5
RFTN1Q14699 MPDZ-208ENST00000447879 6262 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.65□□□□□ -1.5
RFTN1Q14699 AL353751.1-201ENST00000354541 495 ntTSL 3 BASIC5.65□□□□□ -1.5
RFTN1Q14699 RN7SKP28-201ENST00000364770 305 ntBASIC5.65□□□□□ -1.5
RFTN1Q14699 RN7SKP81-201ENST00000365603 331 ntBASIC5.65□□□□□ -1.5
RFTN1Q14699 AL139095.4-201ENST00000379928 500 ntTSL 2 BASIC5.65□□□□□ -1.5
RFTN1Q14699 AC005323.2-201ENST00000399342 583 ntTSL 3 BASIC5.65□□□□□ -1.5
RFTN1Q14699 AC009468.1-201ENST00000412800 437 ntTSL 3 BASIC5.65□□□□□ -1.5
RFTN1Q14699 CBX1P3-201ENST00000413296 527 ntBASIC5.65□□□□□ -1.5
RFTN1Q14699 AC079809.1-201ENST00000415468 276 ntBASIC5.65□□□□□ -1.5
RFTN1Q14699 ALG13-AS1-201ENST00000430794 195 ntTSL 5 BASIC5.65□□□□□ -1.5
RFTN1Q14699 OR6D1P-201ENST00000436165 939 ntBASIC5.65□□□□□ -1.5
RFTN1Q14699 LINC01359-203ENST00000444349 381 ntTSL 5 BASIC5.65□□□□□ -1.5
RFTN1Q14699 AC079760.2-201ENST00000449361 681 ntTSL 5 BASIC5.65□□□□□ -1.5
RFTN1Q14699 LINC01448-201ENST00000455947 1171 ntTSL 1 (best) BASIC5.65□□□□□ -1.5
RFTN1Q14699 OARD1-207ENST00000468811 819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.65□□□□□ -1.5
RFTN1Q14699 GIMAP2-202ENST00000474605 309 ntTSL 3 BASIC5.65□□□□□ -1.5
RFTN1Q14699 AC114954.1-201ENST00000506656 820 ntTSL 3 BASIC5.65□□□□□ -1.5
RFTN1Q14699 AC027026.1-201ENST00000532323 742 ntBASIC5.65□□□□□ -1.5
RFTN1Q14699 AC008149.1-201ENST00000551844 525 ntTSL 4 BASIC5.65□□□□□ -1.5
RFTN1Q14699 AC055874.1-201ENST00000561458 479 ntTSL 2 BASIC5.65□□□□□ -1.5
RFTN1Q14699 AC139099.1-201ENST00000573737 976 ntTSL 1 (best) BASIC5.65□□□□□ -1.5
RFTN1Q14699 AC020978.7-201ENST00000575953 1187 ntBASIC5.65□□□□□ -1.5
RFTN1Q14699 AC024075.3-201ENST00000601687 453 ntTSL 5 BASIC5.65□□□□□ -1.5
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 73.7 ms