Protein–RNA interactions for Protein: Q13797

ITGA9, Integrin alpha-9, humanhuman

Predictions only

Length 1,035 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ITGA9Q13797 LINC01204-202ENST00000435394 2214 ntTSL 1 (best) BASIC5.66□□□□□ -1.5
ITGA9Q13797 AIG1-208ENST00000494282 3393 ntTSL 1 (best) BASIC5.66□□□□□ -1.5
ITGA9Q13797 ZNF611-201ENST00000319783 3153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.65□□□□□ -1.5
ITGA9Q13797 VPS13C-204ENST00000395898 11012 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.65□□□□□ -1.5
ITGA9Q13797 ABCC13-202ENST00000463099 3842 ntBASIC5.65□□□□□ -1.5
ITGA9Q13797 SPARCL1-202ENST00000418378 2994 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.65□□□□□ -1.5
ITGA9Q13797 DTNA-227ENST00000597599 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC5.65□□□□□ -1.5
ITGA9Q13797 KCNJ1-206ENST00000440599 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.65□□□□□ -1.5
ITGA9Q13797 DEFB118-201ENST00000253381 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.65□□□□□ -1.5
ITGA9Q13797 SNORA64.1-201ENST00000362600 132 ntBASIC5.65□□□□□ -1.5
ITGA9Q13797 RN7SKP15-201ENST00000364742 309 ntBASIC5.65□□□□□ -1.5
ITGA9Q13797 RNA5SP30-201ENST00000365552 115 ntBASIC5.65□□□□□ -1.5
ITGA9Q13797 COMMD6-204ENST00000377619 594 ntTSL 2 BASIC5.65□□□□□ -1.5
ITGA9Q13797 AL050305.1-201ENST00000399993 1230 ntBASIC5.65□□□□□ -1.5
ITGA9Q13797 AC096921.1-201ENST00000411661 375 ntBASIC5.65□□□□□ -1.5
ITGA9Q13797 SDHDP6-201ENST00000414693 480 ntBASIC5.65□□□□□ -1.5
ITGA9Q13797 AC092687.1-201ENST00000418835 389 ntTSL 3 BASIC5.65□□□□□ -1.5
ITGA9Q13797 AL513188.1-201ENST00000421167 614 ntTSL 3 BASIC5.65□□□□□ -1.5
ITGA9Q13797 AC113412.1-201ENST00000425840 504 ntBASIC5.65□□□□□ -1.5
ITGA9Q13797 BX119321.1-201ENST00000428912 797 ntBASIC5.65□□□□□ -1.5
ITGA9Q13797 AC060234.3-201ENST00000430438 559 ntTSL 5 BASIC5.65□□□□□ -1.5
ITGA9Q13797 GAPDHP34-201ENST00000432112 823 ntBASIC5.65□□□□□ -1.5
ITGA9Q13797 TMEM183AP1-205ENST00000432739 290 ntBASIC5.65□□□□□ -1.5
ITGA9Q13797 RPS23P6-201ENST00000466136 431 ntBASIC5.65□□□□□ -1.5
ITGA9Q13797 LINC00483-204ENST00000502517 940 ntTSL 1 (best) BASIC5.65□□□□□ -1.5
ITGA9Q13797 AC109481.1-201ENST00000509173 282 ntBASIC5.65□□□□□ -1.5
ITGA9Q13797 RAD21-204ENST00000518055 896 ntTSL 2 BASIC5.65□□□□□ -1.5
ITGA9Q13797 AC022826.1-201ENST00000519383 805 ntBASIC5.65□□□□□ -1.5
ITGA9Q13797 OR8A2P-201ENST00000528631 952 ntBASIC5.65□□□□□ -1.5
ITGA9Q13797 TRIM51DP-201ENST00000529746 596 ntBASIC5.65□□□□□ -1.5
ITGA9Q13797 AC139697.1-201ENST00000548429 745 ntBASIC5.65□□□□□ -1.5
ITGA9Q13797 AC090109.1-201ENST00000548885 819 ntTSL 3 BASIC5.65□□□□□ -1.5
ITGA9Q13797 DPPA2P4-201ENST00000563717 878 ntBASIC5.65□□□□□ -1.5
ITGA9Q13797 AL391425.1-202ENST00000617518 774 ntTSL 5 BASIC5.65□□□□□ -1.5
ITGA9Q13797 LINC01955-201ENST00000626392 792 ntTSL 5 BASIC5.65□□□□□ -1.5
ITGA9Q13797 IGLV10-54-202ENST00000640991 351 ntTSL 5 BASIC5.65□□□□□ -1.5
ITGA9Q13797 NADK2-203ENST00000397338 3614 ntTSL 2 BASIC5.65□□□□□ -1.51
ITGA9Q13797 AC090220.1-201ENST00000593078 1699 ntBASIC5.65□□□□□ -1.51
ITGA9Q13797 RRP15-201ENST00000366932 7771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.65□□□□□ -1.51
ITGA9Q13797 NFIB-204ENST00000380953 2381 ntTSL 1 (best) BASIC5.65□□□□□ -1.51
ITGA9Q13797 LRP1B-201ENST00000389484 16535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.65□□□□□ -1.51
ITGA9Q13797 DENND4A-201ENST00000431932 5875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.65□□□□□ -1.51
ITGA9Q13797 CTAGE5-219ENST00000640607 4239 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC5.65□□□□□ -1.51
ITGA9Q13797 DLC1-209ENST00000511869 2451 ntTSL 1 (best) BASIC5.65□□□□□ -1.51
ITGA9Q13797 CD164-207ENST00000504373 1402 ntTSL 1 (best) BASIC5.65□□□□□ -1.51
ITGA9Q13797 TRAPPC11-209ENST00000512476 2546 ntTSL 1 (best) BASIC5.65□□□□□ -1.51
ITGA9Q13797 HSPA13-201ENST00000285667 3986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.65□□□□□ -1.51
ITGA9Q13797 CALU-203ENST00000479257 2572 ntTSL 1 (best) BASIC5.64□□□□□ -1.51
ITGA9Q13797 MYBPC1-201ENST00000361466 3899 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC5.64□□□□□ -1.51
ITGA9Q13797 ZNF26-201ENST00000328654 17601 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.64□□□□□ -1.51
ITGA9Q13797 DDX58-201ENST00000379868 4089 ntTSL 5 BASIC5.64□□□□□ -1.51
ITGA9Q13797 DROSHA-212ENST00000511367 5305 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC5.64□□□□□ -1.51
ITGA9Q13797 IKZF2-201ENST00000342002 3747 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.64□□□□□ -1.51
ITGA9Q13797 DLG1-213ENST00000443183 2516 ntTSL 2 BASIC5.64□□□□□ -1.51
ITGA9Q13797 AC068870.3-201ENST00000625077 2536 ntBASIC5.64□□□□□ -1.51
ITGA9Q13797 RNA5SP326-201ENST00000363209 110 ntBASIC5.64□□□□□ -1.51
ITGA9Q13797 RNA5SP394-201ENST00000364216 119 ntBASIC5.64□□□□□ -1.51
ITGA9Q13797 RN7SKP292-201ENST00000365522 317 ntBASIC5.64□□□□□ -1.51
ITGA9Q13797 OR6C65-201ENST00000379665 1076 ntAPPRIS P1 BASIC5.64□□□□□ -1.51
ITGA9Q13797 TRDC-201ENST00000390477 720 ntAPPRIS P1 BASIC5.64□□□□□ -1.51
ITGA9Q13797 TRAJ38-201ENST00000390499 62 ntAPPRIS P1 BASIC5.64□□□□□ -1.51
ITGA9Q13797 CAPSL-201ENST00000397366 969 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC5.64□□□□□ -1.51
ITGA9Q13797 RMRPP5-201ENST00000411156 267 ntBASIC5.64□□□□□ -1.51
ITGA9Q13797 AC007389.1-203ENST00000414811 556 ntTSL 4 BASIC5.64□□□□□ -1.51
ITGA9Q13797 AC008060.2-201ENST00000415333 468 ntTSL 3 BASIC5.64□□□□□ -1.51
ITGA9Q13797 AC099654.1-202ENST00000415836 564 ntTSL 4 BASIC5.64□□□□□ -1.51
ITGA9Q13797 AL133482.1-201ENST00000415988 498 ntBASIC5.64□□□□□ -1.51
ITGA9Q13797 NENFP1-201ENST00000419476 466 ntBASIC5.64□□□□□ -1.51
ITGA9Q13797 AC093155.2-201ENST00000420734 937 ntBASIC5.64□□□□□ -1.51
ITGA9Q13797 AC006455.6-201ENST00000426192 893 ntBASIC5.64□□□□□ -1.51
ITGA9Q13797 RPS29P14-201ENST00000431518 171 ntBASIC5.64□□□□□ -1.51
ITGA9Q13797 TCEA1P3-201ENST00000443005 880 ntBASIC5.64□□□□□ -1.51
ITGA9Q13797 AC073109.1-201ENST00000445066 978 ntBASIC5.64□□□□□ -1.51
ITGA9Q13797 AC087501.1-201ENST00000445617 715 ntTSL 5 BASIC5.64□□□□□ -1.51
ITGA9Q13797 AC006482.1-201ENST00000448898 273 ntTSL 3 BASIC5.64□□□□□ -1.51
ITGA9Q13797 SNORD125-201ENST00000459538 96 ntBASIC5.64□□□□□ -1.51
ITGA9Q13797 UBFD1P1-201ENST00000473259 814 ntBASIC5.64□□□□□ -1.51
ITGA9Q13797 TFDP2-211ENST00000479040 1201 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.64□□□□□ -1.51
ITGA9Q13797 COX6B1P2-201ENST00000489624 230 ntBASIC5.64□□□□□ -1.51
ITGA9Q13797 RPS17P5-201ENST00000498293 408 ntBASIC5.64□□□□□ -1.51
ITGA9Q13797 AP001960.1-201ENST00000506494 658 ntBASIC5.64□□□□□ -1.51
ITGA9Q13797 RNU6-551P-201ENST00000516661 103 ntBASIC5.64□□□□□ -1.51
ITGA9Q13797 AC083923.2-201ENST00000519880 574 ntTSL 4 BASIC5.64□□□□□ -1.51
ITGA9Q13797 BAALC-AS1-205ENST00000521102 613 ntTSL 3 BASIC5.64□□□□□ -1.51
ITGA9Q13797 AC011131.1-201ENST00000521224 252 ntTSL 2 BASIC5.64□□□□□ -1.51
ITGA9Q13797 LINC02422-201ENST00000535163 852 ntTSL 3 BASIC5.64□□□□□ -1.51
ITGA9Q13797 AC005692.2-201ENST00000566521 596 ntTSL 3 BASIC5.64□□□□□ -1.51
ITGA9Q13797 DHFRP1-201ENST00000579682 559 ntBASIC5.64□□□□□ -1.51
ITGA9Q13797 MIR4311-201ENST00000580794 100 ntBASIC5.64□□□□□ -1.51
ITGA9Q13797 MRO-208ENST00000588444 866 ntTSL 3 BASIC5.64□□□□□ -1.51
ITGA9Q13797 AC008521.2-201ENST00000591021 259 ntBASIC5.64□□□□□ -1.51
ITGA9Q13797 AC138035.1-202ENST00000604669 683 ntTSL 1 (best) BASIC5.64□□□□□ -1.51
ITGA9Q13797 AC112211.1-201ENST00000607832 305 ntTSL 3 BASIC5.64□□□□□ -1.51
ITGA9Q13797 Z98949.1-207ENST00000609157 814 ntTSL 5 BASIC5.64□□□□□ -1.51
ITGA9Q13797 AC005162.3-202ENST00000609495 483 ntTSL 5 BASIC5.64□□□□□ -1.51
ITGA9Q13797 AL162574.1-201ENST00000615702 950 ntBASIC5.64□□□□□ -1.51
ITGA9Q13797 LINC01620-204ENST00000623295 700 ntTSL 1 (best) BASIC5.64□□□□□ -1.51
ITGA9Q13797 ZNF143-201ENST00000299606 2562 ntTSL 5 BASIC5.64□□□□□ -1.51
ITGA9Q13797 MYO16-201ENST00000251041 3492 ntTSL 5 BASIC5.64□□□□□ -1.51
ITGA9Q13797 NR3C2-202ENST00000344721 5712 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.64□□□□□ -1.51
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 126.9 ms