Protein–RNA interactions for Protein: Q13698

CACNA1S, Voltage-dependent L-type calcium channel subunit alpha-1S, humanhuman

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Length 1,873 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CACNA1SQ13698 ATP5J2P6-201ENST00000565203 266 ntBASIC6.58□□□□□ -1.36
CACNA1SQ13698 AC005341.1-201ENST00000571086 708 ntBASIC6.58□□□□□ -1.36
CACNA1SQ13698 GAPLINC-202ENST00000579007 643 ntTSL 3 BASIC6.58□□□□□ -1.36
CACNA1SQ13698 SRD5A3-AS1-209ENST00000598819 552 ntTSL 5 BASIC6.58□□□□□ -1.36
CACNA1SQ13698 AC009597.2-201ENST00000604659 592 ntBASIC6.58□□□□□ -1.36
CACNA1SQ13698 AC015574.1-205ENST00000611285 524 ntTSL 5 BASIC6.58□□□□□ -1.36
CACNA1SQ13698 LINC00702-203ENST00000608792 6300 ntTSL 4 BASIC6.58□□□□□ -1.36
CACNA1SQ13698 ZRANB3-210ENST00000536680 6943 ntTSL 1 (best) BASIC6.58□□□□□ -1.36
CACNA1SQ13698 DAZ4-207ENST00000634662 1832 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.57□□□□□ -1.36
CACNA1SQ13698 SLC12A1-201ENST00000330289 1764 ntTSL 1 (best) BASIC6.57□□□□□ -1.36
CACNA1SQ13698 AC005703.1-201ENST00000431343 1773 ntTSL 2 BASIC6.57□□□□□ -1.36
CACNA1SQ13698 AC024337.2-201ENST00000616608 2797 ntTSL 5 BASIC6.57□□□□□ -1.36
CACNA1SQ13698 ZFP42-201ENST00000326866 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.57□□□□□ -1.36
CACNA1SQ13698 PCDH11Y-204ENST00000400457 9039 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC6.57□□□□□ -1.36
CACNA1SQ13698 SORCS1-210ENST00000622431 6701 ntTSL 5 BASIC6.57□□□□□ -1.36
CACNA1SQ13698 PHC3-203ENST00000467570 2595 ntTSL 2 BASIC6.57□□□□□ -1.36
CACNA1SQ13698 MTURN-202ENST00000324489 5605 ntTSL 1 (best) BASIC6.57□□□□□ -1.36
CACNA1SQ13698 CCR5-201ENST00000292303 3450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.57□□□□□ -1.36
CACNA1SQ13698 BPIFC-201ENST00000300399 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.57□□□□□ -1.36
CACNA1SQ13698 SPATA31D5P-202ENST00000527857 4863 ntTSL 1 (best) BASIC6.57□□□□□ -1.36
CACNA1SQ13698 CASC1-201ENST00000320267 2361 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.57□□□□□ -1.36
CACNA1SQ13698 KCNJ1-204ENST00000392665 4074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.57□□□□□ -1.36
CACNA1SQ13698 CHRM5-201ENST00000383263 5410 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.57□□□□□ -1.36
CACNA1SQ13698 PTPRO-210ENST00000544244 3978 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC6.57□□□□□ -1.36
CACNA1SQ13698 KYNUP3-201ENST00000574386 1341 ntBASIC6.57□□□□□ -1.36
CACNA1SQ13698 AQP9-201ENST00000219919 3034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.57□□□□□ -1.36
CACNA1SQ13698 CRYAB-201ENST00000227251 848 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.57□□□□□ -1.36
CACNA1SQ13698 KCNJ13-203ENST00000410029 1177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.57□□□□□ -1.36
CACNA1SQ13698 AC069213.2-201ENST00000420238 366 ntBASIC6.57□□□□□ -1.36
CACNA1SQ13698 AC008073.2-201ENST00000428344 792 ntTSL 5 BASIC6.57□□□□□ -1.36
CACNA1SQ13698 FLJ27354-202ENST00000443562 770 ntTSL 3 BASIC6.57□□□□□ -1.36
CACNA1SQ13698 AL445524.1-204ENST00000454631 458 ntTSL 3 BASIC6.57□□□□□ -1.36
CACNA1SQ13698 SNORD125-201ENST00000459538 96 ntBASIC6.57□□□□□ -1.36
CACNA1SQ13698 LINC02231-201ENST00000510459 447 ntTSL 3 BASIC6.57□□□□□ -1.36
CACNA1SQ13698 LINC02429-202ENST00000513836 694 ntTSL 3 BASIC6.57□□□□□ -1.36
CACNA1SQ13698 OR5AN2P-201ENST00000534535 896 ntBASIC6.57□□□□□ -1.36
CACNA1SQ13698 AC002563.1-201ENST00000535109 451 ntTSL 3 BASIC6.57□□□□□ -1.36
CACNA1SQ13698 L34079.2-201ENST00000597119 561 ntTSL 3 BASIC6.57□□□□□ -1.36
CACNA1SQ13698 AC006600.2-201ENST00000624834 2506 ntBASIC6.57□□□□□ -1.36
CACNA1SQ13698 C3orf58-202ENST00000441925 3260 ntTSL 2 BASIC6.57□□□□□ -1.36
CACNA1SQ13698 BX284613.1-201ENST00000452221 1641 ntBASIC6.57□□□□□ -1.36
CACNA1SQ13698 NCOA6-202ENST00000374796 9311 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.57□□□□□ -1.36
CACNA1SQ13698 ZNF224-201ENST00000336976 3980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.57□□□□□ -1.36
CACNA1SQ13698 RAG1-201ENST00000299440 6564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.57□□□□□ -1.36
CACNA1SQ13698 DCTN5-201ENST00000300087 11011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.57□□□□□ -1.36
CACNA1SQ13698 KMO-203ENST00000366558 1868 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.57□□□□□ -1.36
CACNA1SQ13698 SORBS1-202ENST00000306402 5858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.56□□□□□ -1.36
CACNA1SQ13698 PRRC1-204ENST00000512635 2726 ntTSL 1 (best) BASIC6.56□□□□□ -1.36
CACNA1SQ13698 FAM170B-AS1-203ENST00000442525 2000 ntTSL 2 BASIC6.56□□□□□ -1.36
CACNA1SQ13698 ATP5A1P1-201ENST00000454088 1321 ntBASIC6.56□□□□□ -1.36
CACNA1SQ13698 DLG2-211ENST00000426717 5927 ntTSL 1 (best) BASIC6.56□□□□□ -1.36
CACNA1SQ13698 CLEC12A-202ENST00000350667 699 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.56□□□□□ -1.36
CACNA1SQ13698 KRTAP3-2-201ENST00000391587 702 ntAPPRIS P1 BASIC6.56□□□□□ -1.36
CACNA1SQ13698 NPM1P40-201ENST00000412758 733 ntBASIC6.56□□□□□ -1.36
CACNA1SQ13698 MTND4LP17-201ENST00000414607 293 ntBASIC6.56□□□□□ -1.36
CACNA1SQ13698 P2RY10P2-201ENST00000416730 913 ntBASIC6.56□□□□□ -1.36
CACNA1SQ13698 DPYD-IT1-201ENST00000424982 401 ntTSL 3 BASIC6.56□□□□□ -1.36
CACNA1SQ13698 AL161621.1-201ENST00000444796 340 ntTSL 3 BASIC6.56□□□□□ -1.36
CACNA1SQ13698 MSMO1-203ENST00000504317 1026 ntTSL 1 (best) BASIC6.56□□□□□ -1.36
CACNA1SQ13698 AC079921.1-201ENST00000509449 946 ntTSL 3 BASIC6.56□□□□□ -1.36
CACNA1SQ13698 IGHVII-44-2-201ENST00000517728 250 ntBASIC6.56□□□□□ -1.36
CACNA1SQ13698 AC025437.5-201ENST00000522769 314 ntTSL 3 BASIC6.56□□□□□ -1.36
CACNA1SQ13698 OR4A6P-201ENST00000534364 970 ntBASIC6.56□□□□□ -1.36
CACNA1SQ13698 AC068790.4-201ENST00000602474 263 ntBASIC6.56□□□□□ -1.36
CACNA1SQ13698 AC005084.1-201ENST00000605160 304 ntBASIC6.56□□□□□ -1.36
CACNA1SQ13698 AC079414.3-201ENST00000612986 1090 ntBASIC6.56□□□□□ -1.36
CACNA1SQ13698 AC015712.7-201ENST00000615211 635 ntBASIC6.56□□□□□ -1.36
CACNA1SQ13698 PIK3C3-202ENST00000398870 9206 ntTSL 2 BASIC6.56□□□□□ -1.36
CACNA1SQ13698 STAG1-201ENST00000236698 5951 ntTSL 1 (best) BASIC6.56□□□□□ -1.36
CACNA1SQ13698 AC007996.1-201ENST00000620414 2821 ntBASIC6.56□□□□□ -1.36
CACNA1SQ13698 PRDM2-206ENST00000413440 6175 ntTSL 1 (best) BASIC6.56□□□□□ -1.36
CACNA1SQ13698 AC007114.2-201ENST00000576014 4281 ntBASIC6.56□□□□□ -1.36
CACNA1SQ13698 DPY19L3-202ENST00000392250 5998 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.56□□□□□ -1.36
CACNA1SQ13698 NFATC3-202ENST00000346183 6040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.56□□□□□ -1.36
CACNA1SQ13698 LEPROT-206ENST00000613538 4625 ntTSL 1 (best) BASIC6.56□□□□□ -1.36
CACNA1SQ13698 OR5AN1-202ENST00000641850 8468 ntAPPRIS P1 BASIC6.56□□□□□ -1.36
CACNA1SQ13698 LINC01630-202ENST00000578152 3188 ntTSL 2 BASIC6.56□□□□□ -1.36
CACNA1SQ13698 AC104581.5-201ENST00000624171 7141 ntBASIC6.56□□□□□ -1.36
CACNA1SQ13698 SSMEM1-201ENST00000297819 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.56□□□□□ -1.36
CACNA1SQ13698 U3.10-201ENST00000364459 214 ntBASIC6.56□□□□□ -1.36
CACNA1SQ13698 AC068538.1-201ENST00000376856 336 ntBASIC6.56□□□□□ -1.36
CACNA1SQ13698 RNU4-64P-201ENST00000410795 131 ntBASIC6.56□□□□□ -1.36
CACNA1SQ13698 AL590399.2-201ENST00000427536 309 ntBASIC6.56□□□□□ -1.36
CACNA1SQ13698 AL034405.1-201ENST00000432062 526 ntTSL 2 BASIC6.56□□□□□ -1.36
CACNA1SQ13698 Z82198.2-201ENST00000434741 567 ntTSL 4 BASIC6.56□□□□□ -1.36
CACNA1SQ13698 AC122136.1-201ENST00000443971 478 ntTSL 3 BASIC6.56□□□□□ -1.36
CACNA1SQ13698 RPL31P44-201ENST00000447680 377 ntBASIC6.56□□□□□ -1.36
CACNA1SQ13698 NDUFA12P1-201ENST00000455914 406 ntBASIC6.56□□□□□ -1.36
CACNA1SQ13698 PRELID3BP5-201ENST00000508612 460 ntBASIC6.56□□□□□ -1.36
CACNA1SQ13698 CENPK-210ENST00000510354 1124 ntTSL 5 BASIC6.56□□□□□ -1.36
CACNA1SQ13698 HHIP-AS1-203ENST00000512359 646 ntTSL 3 BASIC6.56□□□□□ -1.36
CACNA1SQ13698 AC122688.1-201ENST00000541494 223 ntBASIC6.56□□□□□ -1.36
CACNA1SQ13698 ERVK-28-203ENST00000600419 457 ntTSL 1 (best) BASIC6.56□□□□□ -1.36
CACNA1SQ13698 SLC4A8-202ENST00000358657 11731 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.56□□□□□ -1.36
CACNA1SQ13698 IFRD1-217ENST00000621379 3232 ntTSL 2 BASIC6.55□□□□□ -1.36
CACNA1SQ13698 RPE65-201ENST00000262340 2610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.55□□□□□ -1.36
CACNA1SQ13698 BBIP1-207ENST00000448814 2119 ntTSL 1 (best) BASIC6.55□□□□□ -1.36
CACNA1SQ13698 FAM197Y3-202ENST00000427622 2325 ntTSL 5 BASIC6.55□□□□□ -1.36
CACNA1SQ13698 FAM197Y7-202ENST00000433321 2325 ntTSL 2 BASIC6.55□□□□□ -1.36
CACNA1SQ13698 AKAP5-202ENST00000394718 6487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.55□□□□□ -1.36
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