Protein–RNA interactions for Protein: Q13619

CUL4A, Cullin-4A, humanhuman

Predictions only

Length 759 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CUL4AQ13619 BNIP3P7-201ENST00000605641 516 ntBASIC6.39□□□□□ -1.39
CUL4AQ13619 AC099654.6-201ENST00000636487 512 ntBASIC6.39□□□□□ -1.39
CUL4AQ13619 AC008691.1-209ENST00000642094 814 ntBASIC6.39□□□□□ -1.39
CUL4AQ13619 MCF2L2-202ENST00000414362 3031 ntTSL 2 BASIC6.39□□□□□ -1.39
CUL4AQ13619 MMRN1-201ENST00000264790 4967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.39□□□□□ -1.39
CUL4AQ13619 CASP10-202ENST00000286186 5928 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC6.39□□□□□ -1.39
CUL4AQ13619 OR5AS1-202ENST00000641320 7860 ntAPPRIS P1 BASIC6.39□□□□□ -1.39
CUL4AQ13619 CENPI-204ENST00000423383 2314 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC6.39□□□□□ -1.39
CUL4AQ13619 AC130360.2-201ENST00000533477 1556 ntBASIC6.39□□□□□ -1.39
CUL4AQ13619 DNM1P47-203ENST00000571780 12667 ntBASIC6.39□□□□□ -1.39
CUL4AQ13619 ASXL2-203ENST00000435504 12878 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC6.39□□□□□ -1.39
CUL4AQ13619 SYT14-206ENST00000537238 5208 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.38□□□□□ -1.39
CUL4AQ13619 CEP164P1-202ENST00000456938 2472 ntTSL 1 (best) BASIC6.38□□□□□ -1.39
CUL4AQ13619 OR2AT4-202ENST00000641504 8661 ntAPPRIS P1 BASIC6.38□□□□□ -1.39
CUL4AQ13619 OR7C1-203ENST00000641666 11711 ntAPPRIS P1 BASIC6.38□□□□□ -1.39
CUL4AQ13619 RNU1-65P-201ENST00000363919 148 ntBASIC6.38□□□□□ -1.39
CUL4AQ13619 TOMM7-203ENST00000405021 455 ntTSL 2 BASIC6.38□□□□□ -1.39
CUL4AQ13619 AHSA2-203ENST00000410073 479 ntTSL 5 BASIC6.38□□□□□ -1.39
CUL4AQ13619 AC245060.4-201ENST00000413293 1121 ntBASIC6.38□□□□□ -1.39
CUL4AQ13619 AL355581.1-201ENST00000415964 830 ntTSL 2 BASIC6.38□□□□□ -1.39
CUL4AQ13619 EEF1A1P29-201ENST00000416082 1096 ntBASIC6.38□□□□□ -1.39
CUL4AQ13619 LINC01589-201ENST00000422971 548 ntTSL 1 (best) BASIC6.38□□□□□ -1.39
CUL4AQ13619 YY1P1-201ENST00000427625 668 ntBASIC6.38□□□□□ -1.39
CUL4AQ13619 AC124944.2-201ENST00000429866 1242 ntBASIC6.38□□□□□ -1.39
CUL4AQ13619 AC023481.1-201ENST00000435368 938 ntTSL 3 BASIC6.38□□□□□ -1.39
CUL4AQ13619 LINC01422-203ENST00000447149 509 ntTSL 4 BASIC6.38□□□□□ -1.39
CUL4AQ13619 Z99916.1-201ENST00000454253 482 ntTSL 3 BASIC6.38□□□□□ -1.39
CUL4AQ13619 AC109992.2-201ENST00000460977 765 ntTSL 3 BASIC6.38□□□□□ -1.39
CUL4AQ13619 RPL9P15-201ENST00000491096 532 ntBASIC6.38□□□□□ -1.39
CUL4AQ13619 RPS24P16-201ENST00000497294 392 ntBASIC6.38□□□□□ -1.39
CUL4AQ13619 TRIM77BP-201ENST00000524985 1119 ntBASIC6.38□□□□□ -1.39
CUL4AQ13619 AP006259.1-201ENST00000528520 561 ntTSL 2 BASIC6.38□□□□□ -1.39
CUL4AQ13619 AC018558.1-201ENST00000562591 459 ntTSL 1 (best) BASIC6.38□□□□□ -1.39
CUL4AQ13619 GS1-279B7.1-203ENST00000565520 609 ntTSL 5 BASIC6.38□□□□□ -1.39
CUL4AQ13619 AC130371.1-201ENST00000577023 230 ntTSL 5 BASIC6.38□□□□□ -1.39
CUL4AQ13619 PRPF19P1-201ENST00000584766 898 ntBASIC6.38□□□□□ -1.39
CUL4AQ13619 MIR6839-201ENST00000620425 113 ntBASIC6.38□□□□□ -1.39
CUL4AQ13619 FO681491.1-202ENST00000623392 737 ntBASIC6.38□□□□□ -1.39
CUL4AQ13619 AC129778.1-202ENST00000623812 261 ntBASIC6.38□□□□□ -1.39
CUL4AQ13619 AL390318.1-201ENST00000624564 687 ntBASIC6.38□□□□□ -1.39
CUL4AQ13619 AP003400.3-201ENST00000624904 346 ntBASIC6.38□□□□□ -1.39
CUL4AQ13619 AP001052.1-201ENST00000626421 99 ntBASIC6.38□□□□□ -1.39
CUL4AQ13619 AL591379.1-207ENST00000635982 261 ntBASIC6.38□□□□□ -1.39
CUL4AQ13619 AMYH02020865.1-205ENST00000636189 261 ntBASIC6.38□□□□□ -1.39
CUL4AQ13619 PRKCH-228ENST00000640011 285 ntTSL 5 BASIC6.38□□□□□ -1.39
CUL4AQ13619 UNC5C-205ENST00000610318 9403 ntTSL 5 BASIC6.38□□□□□ -1.39
CUL4AQ13619 DDX58-201ENST00000379868 4089 ntTSL 5 BASIC6.38□□□□□ -1.39
CUL4AQ13619 KTN1-202ENST00000395308 4134 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.38□□□□□ -1.39
CUL4AQ13619 NEPNP-201ENST00000404786 1371 ntBASIC6.38□□□□□ -1.39
CUL4AQ13619 RBM44-206ENST00000611254 1427 ntTSL 2 BASIC6.38□□□□□ -1.39
CUL4AQ13619 MEIOB-201ENST00000325962 1694 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.38□□□□□ -1.39
CUL4AQ13619 AC021205.3-201ENST00000609680 1709 ntTSL 3 BASIC6.38□□□□□ -1.39
CUL4AQ13619 MAP3K2-201ENST00000344908 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.38□□□□□ -1.39
CUL4AQ13619 ZNF410-211ENST00000555044 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.38□□□□□ -1.39
CUL4AQ13619 KDM3B-209ENST00000542866 3634 ntTSL 2 BASIC6.38□□□□□ -1.39
CUL4AQ13619 AL121594.3-201ENST00000557565 3857 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.38□□□□□ -1.39
CUL4AQ13619 MCM10-202ENST00000378714 4547 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.38□□□□□ -1.39
CUL4AQ13619 TTC37-201ENST00000358746 5706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.37□□□□□ -1.39
CUL4AQ13619 MTERF1-203ENST00000419292 3882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.37□□□□□ -1.39
CUL4AQ13619 AC011503.2-201ENST00000594230 1500 ntBASIC6.37□□□□□ -1.39
CUL4AQ13619 SAMD13-201ENST00000370668 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.37□□□□□ -1.39
CUL4AQ13619 IFIT1P1-201ENST00000400497 1449 ntBASIC6.37□□□□□ -1.39
CUL4AQ13619 SLC9B1P1-201ENST00000331172 1337 ntBASIC6.37□□□□□ -1.39
CUL4AQ13619 EEF1A1P21-201ENST00000512363 1344 ntBASIC6.37□□□□□ -1.39
CUL4AQ13619 DEFB118-201ENST00000253381 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.37□□□□□ -1.39
CUL4AQ13619 MYRFL-201ENST00000299350 820 ntTSL 5 BASIC6.37□□□□□ -1.39
CUL4AQ13619 OR56A4-201ENST00000330728 1209 ntBASIC6.37□□□□□ -1.39
CUL4AQ13619 OR9A2-201ENST00000350513 1038 ntAPPRIS P1 BASIC6.37□□□□□ -1.39
CUL4AQ13619 MIR375-201ENST00000362103 64 ntBASIC6.37□□□□□ -1.39
CUL4AQ13619 RN7SKP275-201ENST00000364626 301 ntBASIC6.37□□□□□ -1.39
CUL4AQ13619 LST1-207ENST00000376092 285 ntTSL 1 (best) BASIC6.37□□□□□ -1.39
CUL4AQ13619 RPL34-203ENST00000394668 853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.37□□□□□ -1.39
CUL4AQ13619 RMRPP5-201ENST00000411156 267 ntBASIC6.37□□□□□ -1.39
CUL4AQ13619 AL136131.2-201ENST00000424283 348 ntTSL 3 BASIC6.37□□□□□ -1.39
CUL4AQ13619 AKR1B10P1-201ENST00000425765 942 ntBASIC6.37□□□□□ -1.39
CUL4AQ13619 AP001476.3-201ENST00000429512 415 ntTSL 3 BASIC6.37□□□□□ -1.39
CUL4AQ13619 AL392003.1-201ENST00000434394 243 ntBASIC6.37□□□□□ -1.39
CUL4AQ13619 AC110602.1-201ENST00000437414 318 ntBASIC6.37□□□□□ -1.39
CUL4AQ13619 AC017074.2-201ENST00000439382 607 ntTSL 2 BASIC6.37□□□□□ -1.39
CUL4AQ13619 AL136988.2-201ENST00000440729 861 ntTSL 3 BASIC6.37□□□□□ -1.39
CUL4AQ13619 AC006019.3-201ENST00000446335 698 ntTSL 3 BASIC6.37□□□□□ -1.39
CUL4AQ13619 AC006482.1-201ENST00000448898 273 ntTSL 3 BASIC6.37□□□□□ -1.39
CUL4AQ13619 AC118758.1-202ENST00000454719 225 ntBASIC6.37□□□□□ -1.39
CUL4AQ13619 AC092666.1-203ENST00000495144 698 ntTSL 5 BASIC6.37□□□□□ -1.39
CUL4AQ13619 AP000763.3-201ENST00000542598 334 ntTSL 5 BASIC6.37□□□□□ -1.39
CUL4AQ13619 AC025419.1-207ENST00000546198 1072 ntTSL 3 BASIC6.37□□□□□ -1.39
CUL4AQ13619 USP3-AS1-202ENST00000559357 455 ntTSL 2 BASIC6.37□□□□□ -1.39
CUL4AQ13619 AC010503.3-201ENST00000594355 540 ntBASIC6.37□□□□□ -1.39
CUL4AQ13619 AC097495.1-201ENST00000637675 546 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.37□□□□□ -1.39
CUL4AQ13619 OR56A4-203ENST00000641279 1209 ntAPPRIS P1 BASIC6.37□□□□□ -1.39
CUL4AQ13619 ERVW-1-201ENST00000493463 2925 ntAPPRIS P1 BASIC6.37□□□□□ -1.39
CUL4AQ13619 MAP3K7-203ENST00000369327 4558 ntTSL 1 (best) BASIC6.37□□□□□ -1.39
CUL4AQ13619 ZNF334-203ENST00000593880 2635 ntTSL 1 (best) BASIC6.37□□□□□ -1.39
CUL4AQ13619 ZNF143-201ENST00000299606 2562 ntTSL 5 BASIC6.37□□□□□ -1.39
CUL4AQ13619 ATF2-201ENST00000264110 4176 ntTSL 1 (best) BASIC6.37□□□□□ -1.39
CUL4AQ13619 ELAVL4-205ENST00000371824 3966 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC6.37□□□□□ -1.39
CUL4AQ13619 MID2-202ENST00000443968 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.37□□□□□ -1.39
CUL4AQ13619 AL359313.1-201ENST00000447311 2293 ntTSL 2 BASIC6.37□□□□□ -1.39
CUL4AQ13619 OR10A6-204ENST00000642108 6104 ntAPPRIS P1 BASIC6.37□□□□□ -1.39
CUL4AQ13619 UBE3A-205ENST00000566215 3176 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.36□□□□□ -1.39
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 75.9 ms