Protein–RNA interactions for Protein: Q13232

NME3, Nucleoside diphosphate kinase 3, humanhuman

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Length 169 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NME3Q13232 SNORA16A-201ENST00000384342 137 ntBASIC5.72□□□□□ -1.49
NME3Q13232 U3.23-201ENST00000391132 200 ntBASIC5.72□□□□□ -1.49
NME3Q13232 AC073257.2-201ENST00000413991 528 ntTSL 3 BASIC5.72□□□□□ -1.49
NME3Q13232 CHEK2P5-201ENST00000423877 246 ntBASIC5.72□□□□□ -1.49
NME3Q13232 AC000111.1-201ENST00000441019 221 ntTSL 3 BASIC5.72□□□□□ -1.49
NME3Q13232 AC016395.1-201ENST00000444086 465 ntTSL 3 BASIC5.72□□□□□ -1.49
NME3Q13232 PPIAP20-201ENST00000449839 135 ntBASIC5.72□□□□□ -1.49
NME3Q13232 AC100832.1-201ENST00000471945 383 ntBASIC5.72□□□□□ -1.49
NME3Q13232 AL136038.1-201ENST00000497246 351 ntBASIC5.72□□□□□ -1.49
NME3Q13232 AC090638.1-201ENST00000498296 909 ntBASIC5.72□□□□□ -1.49
NME3Q13232 OSMR-AS1-201ENST00000506463 800 ntTSL 3 BASIC5.72□□□□□ -1.49
NME3Q13232 AP003059.1-201ENST00000526206 432 ntTSL 5 BASIC5.72□□□□□ -1.49
NME3Q13232 AP001266.2-201ENST00000534505 464 ntTSL 4 BASIC5.72□□□□□ -1.49
NME3Q13232 AL157938.2-209ENST00000589128 792 ntTSL 2 BASIC5.72□□□□□ -1.49
NME3Q13232 AC087468.1-201ENST00000604365 630 ntBASIC5.72□□□□□ -1.49
NME3Q13232 TULP3P1-203ENST00000606237 586 ntTSL 4 BASIC5.72□□□□□ -1.49
NME3Q13232 AL160400.1-201ENST00000606385 1030 ntTSL 1 (best) BASIC5.72□□□□□ -1.49
NME3Q13232 AJ239318.1-201ENST00000624445 607 ntTSL 1 (best) BASIC5.72□□□□□ -1.49
NME3Q13232 AC005618.4-201ENST00000625053 554 ntBASIC5.72□□□□□ -1.49
NME3Q13232 AL049767.1-202ENST00000637826 242 ntBASIC5.72□□□□□ -1.49
NME3Q13232 RFC1-217ENST00000639695 867 ntTSL 5 BASIC5.72□□□□□ -1.49
NME3Q13232 NSF-206ENST00000575068 2667 ntTSL 2 BASIC5.72□□□□□ -1.49
NME3Q13232 ZCCHC8-201ENST00000536306 2904 ntTSL 1 (best) BASIC5.72□□□□□ -1.49
NME3Q13232 SCN2A-207ENST00000631182 8430 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC5.72□□□□□ -1.49
NME3Q13232 CCNT1-205ENST00000618666 6915 ntTSL 2 BASIC5.72□□□□□ -1.49
NME3Q13232 EIF3M-208ENST00000531120 5051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.72□□□□□ -1.49
NME3Q13232 EMSY-206ENST00000525038 4376 ntTSL 1 (best) BASIC5.72□□□□□ -1.49
NME3Q13232 SLC1A3-201ENST00000265113 4170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.72□□□□□ -1.49
NME3Q13232 PTPRC-209ENST00000442510 5164 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC5.72□□□□□ -1.49
NME3Q13232 ATP5A1P1-201ENST00000454088 1321 ntBASIC5.72□□□□□ -1.49
NME3Q13232 XPNPEP3-201ENST00000357137 7988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.71□□□□□ -1.49
NME3Q13232 SAMSN1-203ENST00000400566 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.71□□□□□ -1.5
NME3Q13232 AC022893.1-201ENST00000517664 3549 ntTSL 2 BASIC5.71□□□□□ -1.5
NME3Q13232 NELL2-205ENST00000452445 3196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.71□□□□□ -1.5
NME3Q13232 IGF2BP2-AS1-202ENST00000456447 1531 ntTSL 1 (best) BASIC5.71□□□□□ -1.5
NME3Q13232 OR11H6-201ENST00000315519 993 ntAPPRIS P1 BASIC5.71□□□□□ -1.5
NME3Q13232 RNA5SP234-201ENST00000363916 119 ntBASIC5.71□□□□□ -1.5
NME3Q13232 SNORD56.6-201ENST00000384569 71 ntBASIC5.71□□□□□ -1.5
NME3Q13232 OR2A25-201ENST00000408898 1014 ntAPPRIS P1 BASIC5.71□□□□□ -1.5
NME3Q13232 RN7SKP206-201ENST00000410823 293 ntBASIC5.71□□□□□ -1.5
NME3Q13232 AC013268.2-201ENST00000420753 337 ntBASIC5.71□□□□□ -1.5
NME3Q13232 HNRNPA1P29-201ENST00000426409 879 ntBASIC5.71□□□□□ -1.5
NME3Q13232 LINC01344-202ENST00000449842 571 ntTSL 3 BASIC5.71□□□□□ -1.5
NME3Q13232 AP006216.2-201ENST00000457746 333 ntTSL 5 BASIC5.71□□□□□ -1.5
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NME3Q13232 AC094108.1-201ENST00000502494 527 ntTSL 3 BASIC5.71□□□□□ -1.5
NME3Q13232 AC106872.4-201ENST00000510050 523 ntBASIC5.71□□□□□ -1.5
NME3Q13232 AC097515.1-201ENST00000512370 435 ntTSL 2 BASIC5.71□□□□□ -1.5
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NME3Q13232 AC090970.1-201ENST00000561207 381 ntTSL 5 BASIC5.71□□□□□ -1.5
NME3Q13232 LINC01904-201ENST00000564872 861 ntTSL 1 (best) BASIC5.71□□□□□ -1.5
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NME3Q13232 LINC00254-202ENST00000633813 439 ntTSL 3 BASIC5.71□□□□□ -1.5
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NME3Q13232 C1orf27-201ENST00000287859 3792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.71□□□□□ -1.5
NME3Q13232 TCF4-268ENST00000629387 3789 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC5.71□□□□□ -1.5
NME3Q13232 ZNF93-201ENST00000343769 2648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.71□□□□□ -1.5
NME3Q13232 ZBTB38-202ENST00000441582 3662 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.71□□□□□ -1.5
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NME3Q13232 AC007938.2-201ENST00000604666 2634 ntBASIC5.7□□□□□ -1.5
NME3Q13232 AP000473.2-201ENST00000602659 1537 ntBASIC5.7□□□□□ -1.5
NME3Q13232 KAT6B-201ENST00000287239 8287 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.7□□□□□ -1.5
NME3Q13232 MYO5A-201ENST00000356338 11971 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC5.7□□□□□ -1.5
NME3Q13232 GPR52-201ENST00000367685 1088 ntAPPRIS P1 BASIC5.7□□□□□ -1.5
NME3Q13232 AL391422.1-201ENST00000402155 436 ntBASIC5.7□□□□□ -1.5
NME3Q13232 AC016994.1-201ENST00000425419 552 ntTSL 4 BASIC5.7□□□□□ -1.5
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NME3Q13232 AC073465.2-201ENST00000440938 498 ntBASIC5.7□□□□□ -1.5
NME3Q13232 NCK1-AS1-201ENST00000461864 1194 ntTSL 2 BASIC5.7□□□□□ -1.5
NME3Q13232 LINC02040-201ENST00000481004 556 ntTSL 5 BASIC5.7□□□□□ -1.5
NME3Q13232 RN7SL184P-201ENST00000488308 297 ntBASIC5.7□□□□□ -1.5
NME3Q13232 RN7SL547P-201ENST00000490793 290 ntBASIC5.7□□□□□ -1.5
NME3Q13232 AC007370.1-201ENST00000503163 316 ntTSL 2 BASIC5.7□□□□□ -1.5
NME3Q13232 AC010451.1-201ENST00000509057 556 ntTSL 3 BASIC5.7□□□□□ -1.5
NME3Q13232 LINC02505-202ENST00000510597 776 ntTSL 3 BASIC5.7□□□□□ -1.5
NME3Q13232 MTND6P2-201ENST00000512226 524 ntBASIC5.7□□□□□ -1.5
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