Protein–RNA interactions for Protein: Q12946

FOXF1, Forkhead box protein F1, humanhuman

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Length 379 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FOXF1Q12946 AC007786.3-201ENST00000615154 596 ntBASIC4.92□□□□□ -1.62
FOXF1Q12946 AC005840.5-201ENST00000619166 599 ntBASIC4.92□□□□□ -1.62
FOXF1Q12946 PXT1-202ENST00000619547 619 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.92□□□□□ -1.62
FOXF1Q12946 AC135068.5-201ENST00000624197 983 ntBASIC4.92□□□□□ -1.62
FOXF1Q12946 MIR4302-201ENST00000638058 60 ntBASIC4.92□□□□□ -1.62
FOXF1Q12946 AC073869.8-201ENST00000641806 335 ntBASIC4.92□□□□□ -1.62
FOXF1Q12946 AMY1C-201ENST00000370079 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.92□□□□□ -1.62
FOXF1Q12946 AC100757.1-201ENST00000616872 1835 ntBASIC4.92□□□□□ -1.62
FOXF1Q12946 TRPM3-209ENST00000377110 12258 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC4.92□□□□□ -1.62
FOXF1Q12946 DBT-202ENST00000370132 10799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.92□□□□□ -1.62
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FOXF1Q12946 AL158064.2-203ENST00000639897 2003 ntTSL 5 BASIC4.92□□□□□ -1.62
FOXF1Q12946 OR2J3-202ENST00000641151 3297 ntAPPRIS P1 BASIC4.92□□□□□ -1.62
FOXF1Q12946 CACNB4-221ENST00000636130 7748 ntTSL 5 BASIC4.92□□□□□ -1.62
FOXF1Q12946 LGALS8-220ENST00000526634 1852 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.92□□□□□ -1.62
FOXF1Q12946 AL138820.1-201ENST00000617901 5305 ntBASIC4.92□□□□□ -1.62
FOXF1Q12946 ZNF93-201ENST00000343769 2648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.92□□□□□ -1.62
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FOXF1Q12946 SETD2-202ENST00000409792 8142 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.91□□□□□ -1.62
FOXF1Q12946 FRAS1-207ENST00000512123 15624 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.91□□□□□ -1.62
FOXF1Q12946 AC006600.2-201ENST00000624834 2506 ntBASIC4.91□□□□□ -1.62
FOXF1Q12946 MMRN1-201ENST00000264790 4967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.91□□□□□ -1.62
FOXF1Q12946 PATE4-201ENST00000457514 1983 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC4.91□□□□□ -1.62
FOXF1Q12946 ATP2C1-210ENST00000505330 4888 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC4.91□□□□□ -1.62
FOXF1Q12946 CASP1-215ENST00000533400 2001 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC4.91□□□□□ -1.62
FOXF1Q12946 DTNA-231ENST00000598774 2418 ntTSL 1 (best) BASIC4.91□□□□□ -1.62
FOXF1Q12946 CDH19-201ENST00000262150 6341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.91□□□□□ -1.62
FOXF1Q12946 CLCN3-204ENST00000504131 5592 ntTSL 5 BASIC4.91□□□□□ -1.62
FOXF1Q12946 ADGRL2-222ENST00000627151 5789 ntTSL 5 BASIC4.91□□□□□ -1.62
FOXF1Q12946 RNA5SP335-201ENST00000363817 110 ntBASIC4.91□□□□□ -1.62
FOXF1Q12946 MIR143-201ENST00000385300 106 ntBASIC4.91□□□□□ -1.62
FOXF1Q12946 AL133388.1-201ENST00000404509 287 ntBASIC4.91□□□□□ -1.62
FOXF1Q12946 OR3A2-201ENST00000408891 1076 ntBASIC4.91□□□□□ -1.62
FOXF1Q12946 RN7SKP59-201ENST00000410520 314 ntBASIC4.91□□□□□ -1.62
FOXF1Q12946 PQLC2L-202ENST00000426338 1197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.91□□□□□ -1.62
FOXF1Q12946 TXNDC12-AS1-201ENST00000428794 391 ntTSL 3 BASIC4.91□□□□□ -1.62
FOXF1Q12946 CYCSP6-201ENST00000434498 302 ntBASIC4.91□□□□□ -1.62
FOXF1Q12946 MTND2P40-201ENST00000436718 841 ntBASIC4.91□□□□□ -1.62
FOXF1Q12946 AC008269.1-201ENST00000438070 646 ntTSL 3 BASIC4.91□□□□□ -1.62
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FOXF1Q12946 AC097110.1-201ENST00000507344 768 ntTSL 2 BASIC4.91□□□□□ -1.62
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FOXF1Q12946 ZNF33A-202ENST00000374618 6122 ntTSL 4 BASIC4.91□□□□□ -1.62
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FOXF1Q12946 SNORA5.1-201ENST00000384275 131 ntBASIC4.9□□□□□ -1.63
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FOXF1Q12946 RNU6ATAC18P-201ENST00000408413 101 ntBASIC4.9□□□□□ -1.63
FOXF1Q12946 RN7SKP206-201ENST00000410823 293 ntBASIC4.9□□□□□ -1.63
FOXF1Q12946 VTI1BP4-201ENST00000427516 527 ntBASIC4.9□□□□□ -1.63
FOXF1Q12946 BX119904.3-201ENST00000428194 957 ntBASIC4.9□□□□□ -1.63
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FOXF1Q12946 AC093607.1-202ENST00000499715 559 ntTSL 4 BASIC4.9□□□□□ -1.63
FOXF1Q12946 RPEP1-201ENST00000504507 658 ntBASIC4.9□□□□□ -1.63
FOXF1Q12946 LINC02502-201ENST00000505122 642 ntTSL 4 BASIC4.9□□□□□ -1.63
FOXF1Q12946 AC026782.2-201ENST00000510845 636 ntBASIC4.9□□□□□ -1.63
FOXF1Q12946 AC106732.1-201ENST00000512458 550 ntTSL 4 BASIC4.9□□□□□ -1.63
FOXF1Q12946 AC018680.1-201ENST00000513332 875 ntTSL 3 BASIC4.9□□□□□ -1.63
FOXF1Q12946 HDAC2-AS2-217ENST00000523087 493 ntTSL 3 BASIC4.9□□□□□ -1.63
FOXF1Q12946 AC068672.3-201ENST00000524017 824 ntTSL 3 BASIC4.9□□□□□ -1.63
FOXF1Q12946 AP003501.1-201ENST00000524453 744 ntTSL 3 BASIC4.9□□□□□ -1.63
FOXF1Q12946 AC026464.3-201ENST00000563634 564 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC4.9□□□□□ -1.63
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