Protein–RNA interactions for Protein: P31415

CASQ1, Calsequestrin-1, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CASQ1P31415 KCNJ1-206ENST00000440599 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.88□□□□□ -1.47
CASQ1P31415 MRPL35-202ENST00000337109 3727 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC5.88□□□□□ -1.47
CASQ1P31415 AC008079.2-201ENST00000623543 20396 ntBASIC5.88□□□□□ -1.47
CASQ1P31415 RAPH1-207ENST00000423104 1860 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.88□□□□□ -1.47
CASQ1P31415 RAPH1-209ENST00000439222 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.88□□□□□ -1.47
CASQ1P31415 ARHGAP24-201ENST00000264343 4572 ntTSL 1 (best) BASIC5.87□□□□□ -1.47
CASQ1P31415 CEPT1-211ENST00000615636 1966 ntTSL 5 BASIC5.87□□□□□ -1.47
CASQ1P31415 INTU-201ENST00000335251 13233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.87□□□□□ -1.47
CASQ1P31415 NDUFS1-207ENST00000455934 3361 ntTSL 2 BASIC5.87□□□□□ -1.47
CASQ1P31415 LRRC19-201ENST00000380055 3609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.87□□□□□ -1.47
CASQ1P31415 PREPL-201ENST00000260648 3672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.87□□□□□ -1.47
CASQ1P31415 CDH19-201ENST00000262150 6341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.87□□□□□ -1.47
CASQ1P31415 OR8U1-201ENST00000302270 930 ntAPPRIS P1 BASIC5.87□□□□□ -1.47
CASQ1P31415 WFDC11-201ENST00000324384 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.87□□□□□ -1.47
CASQ1P31415 AL159987.1-201ENST00000347911 293 ntBASIC5.87□□□□□ -1.47
CASQ1P31415 ADIG-201ENST00000373348 430 ntTSL 2 BASIC5.87□□□□□ -1.47
CASQ1P31415 TRGV3-201ENST00000390346 537 ntAPPRIS P1 BASIC5.87□□□□□ -1.47
CASQ1P31415 AC104463.1-201ENST00000411431 365 ntTSL 5 BASIC5.87□□□□□ -1.47
CASQ1P31415 AL031846.1-202ENST00000424436 592 ntTSL 2 BASIC5.87□□□□□ -1.47
CASQ1P31415 GAPDHP19-201ENST00000431768 1005 ntBASIC5.87□□□□□ -1.47
CASQ1P31415 LINC01506-201ENST00000432148 495 ntTSL 2 BASIC5.87□□□□□ -1.47
CASQ1P31415 LINC00383-201ENST00000433664 817 ntTSL 3 BASIC5.87□□□□□ -1.47
CASQ1P31415 NPM1P48-201ENST00000436002 853 ntBASIC5.87□□□□□ -1.47
CASQ1P31415 TRMT2B-AS1-201ENST00000443801 205 ntTSL 5 BASIC5.87□□□□□ -1.47
CASQ1P31415 WDR82P2-201ENST00000444540 928 ntBASIC5.87□□□□□ -1.47
CASQ1P31415 AL157385.1-201ENST00000446973 268 ntBASIC5.87□□□□□ -1.47
CASQ1P31415 AC009518.1-201ENST00000452219 559 ntTSL 4 BASIC5.87□□□□□ -1.47
CASQ1P31415 RN7SL57P-201ENST00000493687 290 ntBASIC5.87□□□□□ -1.47
CASQ1P31415 AC107396.1-201ENST00000509641 735 ntTSL 5 BASIC5.87□□□□□ -1.47
CASQ1P31415 HMGN1P17-201ENST00000513734 295 ntBASIC5.87□□□□□ -1.47
CASQ1P31415 RN7SKP34-201ENST00000516142 244 ntBASIC5.87□□□□□ -1.47
CASQ1P31415 TRDN-205ENST00000546248 1179 ntTSL 1 (best) BASIC5.87□□□□□ -1.47
CASQ1P31415 AC046158.2-201ENST00000568764 707 ntTSL 3 BASIC5.87□□□□□ -1.47
CASQ1P31415 LINC02186-201ENST00000575767 885 ntTSL 1 (best) BASIC5.87□□□□□ -1.47
CASQ1P31415 AC005244.1-201ENST00000582566 339 ntBASIC5.87□□□□□ -1.47
CASQ1P31415 ZNF137P-202ENST00000597158 308 ntTSL 3 BASIC5.87□□□□□ -1.47
CASQ1P31415 OSTC-205ENST00000613215 876 ntTSL 2 BASIC5.87□□□□□ -1.47
CASQ1P31415 AC115220.1-201ENST00000330020 1453 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC5.87□□□□□ -1.47
CASQ1P31415 FGG-205ENST00000407946 1636 ntTSL 5 BASIC5.87□□□□□ -1.47
CASQ1P31415 ERVFRD-3-201ENST00000578561 1617 ntBASIC5.87□□□□□ -1.47
CASQ1P31415 CEP164P1-202ENST00000456938 2472 ntTSL 1 (best) BASIC5.87□□□□□ -1.47
CASQ1P31415 AC092821.1-204ENST00000518709 3552 ntTSL 5 BASIC5.87□□□□□ -1.47
CASQ1P31415 PSMA4-201ENST00000044462 4411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.87□□□□□ -1.47
CASQ1P31415 FANCD2-202ENST00000383807 5102 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.86□□□□□ -1.47
CASQ1P31415 SLC10A7-203ENST00000432059 3747 ntTSL 1 (best) BASIC5.86□□□□□ -1.47
CASQ1P31415 USP16-201ENST00000334352 3004 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC5.86□□□□□ -1.47
CASQ1P31415 NBPF14-206ENST00000614999 10080 ntTSL 5 BASIC5.86□□□□□ -1.47
CASQ1P31415 EPPIN-202ENST00000354280 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.86□□□□□ -1.47
CASQ1P31415 OSGEPL1-201ENST00000264151 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.86□□□□□ -1.47
CASQ1P31415 DNAH14-208ENST00000430092 13763 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.86□□□□□ -1.47
CASQ1P31415 NAT1-208ENST00000520546 1446 ntAPPRIS P1 BASIC5.86□□□□□ -1.47
CASQ1P31415 SULT1C2-205ENST00000437390 1359 ntTSL 2 BASIC5.86□□□□□ -1.47
CASQ1P31415 FAM26D-202ENST00000368597 1311 ntTSL 1 (best) BASIC5.86□□□□□ -1.47
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CASQ1P31415 OR5D16-201ENST00000378396 987 ntAPPRIS P1 BASIC5.86□□□□□ -1.47
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CASQ1P31415 AC092865.3-201ENST00000425390 1026 ntBASIC5.86□□□□□ -1.47
CASQ1P31415 AC245291.3-201ENST00000443400 292 ntBASIC5.86□□□□□ -1.47
CASQ1P31415 RPS12P31-201ENST00000491419 398 ntBASIC5.86□□□□□ -1.47
CASQ1P31415 AC092916.1-201ENST00000497896 411 ntTSL 3 BASIC5.86□□□□□ -1.47
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CASQ1P31415 ZFAND1-204ENST00000517588 633 ntTSL 2 BASIC5.86□□□□□ -1.47
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CASQ1P31415 AP006245.2-201ENST00000522004 300 ntBASIC5.86□□□□□ -1.47
CASQ1P31415 AC131935.1-201ENST00000524621 333 ntBASIC5.86□□□□□ -1.47
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CASQ1P31415 LINC01676-204ENST00000595309 871 ntTSL 5 BASIC5.86□□□□□ -1.47
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CASQ1P31415 Metazoa_SRP.70-201ENST00000612622 273 ntBASIC5.86□□□□□ -1.47
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CASQ1P31415 MGC4859-201ENST00000634803 3118 ntTSL 1 (best) BASIC5.86□□□□□ -1.47
CASQ1P31415 SMC2-AS1-201ENST00000603487 7020 ntTSL 2 BASIC5.86□□□□□ -1.47
CASQ1P31415 WDR63-203ENST00000370596 2905 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.86□□□□□ -1.47
CASQ1P31415 PCDH15-209ENST00000395433 6942 ntTSL 5 BASIC5.86□□□□□ -1.47
CASQ1P31415 ZNF682-201ENST00000358523 2161 ntTSL 2 BASIC5.86□□□□□ -1.47
CASQ1P31415 C2CD6-201ENST00000286195 2104 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.86□□□□□ -1.47
CASQ1P31415 AC107021.2-201ENST00000567714 2095 ntBASIC5.86□□□□□ -1.47
CASQ1P31415 ANO3-202ENST00000525139 3257 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC5.86□□□□□ -1.47
CASQ1P31415 SSR1-202ENST00000397511 3248 ntTSL 5 BASIC5.86□□□□□ -1.47
CASQ1P31415 FAM83B-201ENST00000306858 3167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.85□□□□□ -1.47
CASQ1P31415 EMSY-206ENST00000525038 4376 ntTSL 1 (best) BASIC5.85□□□□□ -1.47
CASQ1P31415 COPS4-209ENST00000511653 1695 ntTSL 1 (best) BASIC5.85□□□□□ -1.47
CASQ1P31415 MYO3A-203ENST00000376302 2723 ntTSL 1 (best) BASIC5.85□□□□□ -1.47
CASQ1P31415 LINC01933-204ENST00000524295 3591 ntTSL 2 BASIC5.85□□□□□ -1.47
CASQ1P31415 QRSL1P1-201ENST00000400977 1540 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
CASQ1P31415 CASC8-203ENST00000502082 1420 ntTSL 1 (best) BASIC5.85□□□□□ -1.47
CASQ1P31415 ELF2-203ENST00000379550 3278 ntTSL 5 BASIC5.85□□□□□ -1.47
CASQ1P31415 MS4A7-211ENST00000534016 1378 ntTSL 2 BASIC5.85□□□□□ -1.47
CASQ1P31415 GKN2-201ENST00000328895 800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.85□□□□□ -1.47
CASQ1P31415 OR56A3-201ENST00000329564 948 ntAPPRIS P1 BASIC5.85□□□□□ -1.47
CASQ1P31415 AC017079.1-201ENST00000333650 415 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
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