Protein–RNA interactions for Protein: P28358

HOXD10, Homeobox protein Hox-D10, humanhuman

Predictions only

Length 340 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXD10P28358 RNU6ATAC7P-201ENST00000408111 127 ntBASIC6.37□□□□□ -1.39
HOXD10P28358 AC092675.1-201ENST00000409490 561 ntTSL 4 BASIC6.37□□□□□ -1.39
HOXD10P28358 DPH5-204ENST00000427040 609 ntTSL 1 (best) BASIC6.37□□□□□ -1.39
HOXD10P28358 EIF2S2P3-201ENST00000428356 999 ntBASIC6.37□□□□□ -1.39
HOXD10P28358 AL049749.1-201ENST00000430281 632 ntTSL 2 BASIC6.37□□□□□ -1.39
HOXD10P28358 IKZF3-212ENST00000439016 1246 ntTSL 5 BASIC6.37□□□□□ -1.39
HOXD10P28358 AC092647.3-201ENST00000443044 633 ntBASIC6.37□□□□□ -1.39
HOXD10P28358 AC009963.4-201ENST00000448535 339 ntBASIC6.37□□□□□ -1.39
HOXD10P28358 UBE2Q2P10-201ENST00000514854 900 ntBASIC6.37□□□□□ -1.39
HOXD10P28358 LINC02404-201ENST00000546710 1188 ntTSL 5 BASIC6.37□□□□□ -1.39
HOXD10P28358 OR11J2P-201ENST00000555298 907 ntBASIC6.37□□□□□ -1.39
HOXD10P28358 AL121989.1-201ENST00000585888 746 ntTSL 3 BASIC6.37□□□□□ -1.39
HOXD10P28358 AC060766.1-201ENST00000590824 627 ntBASIC6.37□□□□□ -1.39
HOXD10P28358 AC018695.3-201ENST00000602617 408 ntTSL 2 BASIC6.37□□□□□ -1.39
HOXD10P28358 AC095055.1-201ENST00000603472 1113 ntBASIC6.37□□□□□ -1.39
HOXD10P28358 FAM25E-202ENST00000608562 189 ntBASIC6.37□□□□□ -1.39
HOXD10P28358 AC091953.3-201ENST00000623220 236 ntBASIC6.37□□□□□ -1.39
HOXD10P28358 AC012593.1-212ENST00000627058 580 ntTSL 5 BASIC6.37□□□□□ -1.39
HOXD10P28358 AC011287.1-204ENST00000640300 1213 ntTSL 5 BASIC6.37□□□□□ -1.39
HOXD10P28358 SRPK2-201ENST00000357311 3700 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.37□□□□□ -1.39
HOXD10P28358 ADGRF5-201ENST00000265417 5668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.37□□□□□ -1.39
HOXD10P28358 SBNO1-201ENST00000267176 11121 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC6.37□□□□□ -1.39
HOXD10P28358 PIAS2-204ENST00000585916 11075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.37□□□□□ -1.39
HOXD10P28358 ZC3H11A-201ENST00000332127 5015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.37□□□□□ -1.39
HOXD10P28358 FYB1-204ENST00000505428 2789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.37□□□□□ -1.39
HOXD10P28358 ST8SIA4-201ENST00000231461 6303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.37□□□□□ -1.39
HOXD10P28358 ABCC9-204ENST00000538350 2672 ntTSL 2 BASIC6.37□□□□□ -1.39
HOXD10P28358 ELAVL4-202ENST00000371819 2467 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC6.37□□□□□ -1.39
HOXD10P28358 RAPGEF4-215ENST00000540783 3974 ntTSL 2 BASIC6.37□□□□□ -1.39
HOXD10P28358 SLFN12-201ENST00000304905 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.37□□□□□ -1.39
HOXD10P28358 GCSAML-201ENST00000366488 3820 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.37□□□□□ -1.39
HOXD10P28358 DMD-222ENST00000474231 5209 ntTSL 5 BASIC6.37□□□□□ -1.39
HOXD10P28358 AC092070.2-203ENST00000598377 3644 ntBASIC6.37□□□□□ -1.39
HOXD10P28358 KCNA2-209ENST00000639048 10836 ntTSL 5 BASIC6.37□□□□□ -1.39
HOXD10P28358 ZNF337-AS1-201ENST00000414393 4666 ntTSL 2 BASIC6.37□□□□□ -1.39
HOXD10P28358 NLRP3P1-201ENST00000622303 1785 ntBASIC6.36□□□□□ -1.39
HOXD10P28358 ZC3H14-201ENST00000251038 18281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.36□□□□□ -1.39
HOXD10P28358 LINC01153-201ENST00000429809 2864 ntTSL 1 (best) BASIC6.36□□□□□ -1.39
HOXD10P28358 MECOM-201ENST00000264674 4900 ntTSL 1 (best) BASIC6.36□□□□□ -1.39
HOXD10P28358 PTER-202ENST00000378000 3777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.36□□□□□ -1.39
HOXD10P28358 MAMDC2-AS1-201ENST00000377178 1504 ntTSL 1 (best) BASIC6.36□□□□□ -1.39
HOXD10P28358 PANDAR-201ENST00000629595 1506 ntBASIC6.36□□□□□ -1.39
HOXD10P28358 PCNX4-201ENST00000317623 17339 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC6.36□□□□□ -1.39
HOXD10P28358 RUFY3-202ENST00000381006 3098 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.36□□□□□ -1.39
HOXD10P28358 OR6X1-201ENST00000327930 1058 ntAPPRIS P1 BASIC6.36□□□□□ -1.39
HOXD10P28358 OR9A2-201ENST00000350513 1038 ntAPPRIS P1 BASIC6.36□□□□□ -1.39
HOXD10P28358 SNORD8-201ENST00000363915 110 ntBASIC6.36□□□□□ -1.39
HOXD10P28358 PEX12P1-201ENST00000400284 1048 ntBASIC6.36□□□□□ -1.39
HOXD10P28358 SLC3A1-203ENST00000409294 792 ntTSL 2 BASIC6.36□□□□□ -1.39
HOXD10P28358 TFPI-204ENST00000409676 1119 ntTSL 1 (best) BASIC6.36□□□□□ -1.39
HOXD10P28358 RPL26P29-201ENST00000415623 438 ntBASIC6.36□□□□□ -1.39
HOXD10P28358 AL034345.2-202ENST00000416948 830 ntTSL 2 BASIC6.36□□□□□ -1.39
HOXD10P28358 AC245028.1-201ENST00000423259 256 ntBASIC6.36□□□□□ -1.39
HOXD10P28358 VDAC1P6-201ENST00000430062 855 ntBASIC6.36□□□□□ -1.39
HOXD10P28358 AL451136.1-201ENST00000435399 325 ntBASIC6.36□□□□□ -1.39
HOXD10P28358 LINC01781-202ENST00000443104 591 ntTSL 2 BASIC6.36□□□□□ -1.39
HOXD10P28358 AC016651.1-201ENST00000502680 822 ntTSL 3 BASIC6.36□□□□□ -1.39
HOXD10P28358 AC105420.1-201ENST00000504389 582 ntBASIC6.36□□□□□ -1.39
HOXD10P28358 AC105384.2-201ENST00000508433 640 ntBASIC6.36□□□□□ -1.39
HOXD10P28358 SNORA70.11-201ENST00000515987 138 ntBASIC6.36□□□□□ -1.39
HOXD10P28358 SNORA70.13-201ENST00000516116 138 ntBASIC6.36□□□□□ -1.39
HOXD10P28358 AC090592.1-202ENST00000533049 568 ntTSL 4 BASIC6.36□□□□□ -1.39
HOXD10P28358 LINC02345-203ENST00000558897 405 ntTSL 3 BASIC6.36□□□□□ -1.39
HOXD10P28358 MIR4330-201ENST00000579077 105 ntBASIC6.36□□□□□ -1.39
HOXD10P28358 AC022211.1-201ENST00000579554 717 ntTSL 3 BASIC6.36□□□□□ -1.39
HOXD10P28358 MIR4311-201ENST00000580794 100 ntBASIC6.36□□□□□ -1.39
HOXD10P28358 SMIM24-204ENST00000591708 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC6.36□□□□□ -1.39
HOXD10P28358 DARS-AS1-211ENST00000595061 720 ntTSL 5 BASIC6.36□□□□□ -1.39
HOXD10P28358 AL136164.2-201ENST00000602823 732 ntTSL 5 BASIC6.36□□□□□ -1.39
HOXD10P28358 AC091193.1-201ENST00000604640 448 ntBASIC6.36□□□□□ -1.39
HOXD10P28358 AC004890.3-201ENST00000605566 1095 ntBASIC6.36□□□□□ -1.39
HOXD10P28358 LINC01685-203ENST00000634464 1201 ntTSL 5 BASIC6.36□□□□□ -1.39
HOXD10P28358 ZNF382-201ENST00000292928 8329 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.36□□□□□ -1.39
HOXD10P28358 ZNF177-202ENST00000589262 1920 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC6.36□□□□□ -1.39
HOXD10P28358 CPNE3-203ENST00000517490 4865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.36□□□□□ -1.39
HOXD10P28358 TANC2-202ENST00000424789 11721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.36□□□□□ -1.39
HOXD10P28358 ZNF337-202ENST00000376436 3613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.36□□□□□ -1.39
HOXD10P28358 OR2M3-202ENST00000641626 9913 ntAPPRIS P1 BASIC6.36□□□□□ -1.39
HOXD10P28358 RFX4-201ENST00000229387 3378 ntTSL 1 (best) BASIC6.35□□□□□ -1.39
HOXD10P28358 TMEFF2-203ENST00000409056 3364 ntTSL 1 (best) BASIC6.35□□□□□ -1.39
HOXD10P28358 IFRD1-217ENST00000621379 3232 ntTSL 2 BASIC6.35□□□□□ -1.39
HOXD10P28358 LAMTOR3-202ENST00000499666 4226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.35□□□□□ -1.39
HOXD10P28358 RPGRIP1L-205ENST00000563746 4193 ntTSL 1 (best) BASIC6.35□□□□□ -1.39
HOXD10P28358 LINC02047-201ENST00000494761 1371 ntTSL 1 (best) BASIC6.35□□□□□ -1.39
HOXD10P28358 ARIH1-201ENST00000379887 21681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.35□□□□□ -1.39
HOXD10P28358 LPAR6-201ENST00000345941 2428 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.35□□□□□ -1.39
HOXD10P28358 ADAM7-204ENST00000520720 1870 ntTSL 1 (best) BASIC6.35□□□□□ -1.39
HOXD10P28358 FBXL21-201ENST00000297158 1305 ntBASIC6.35□□□□□ -1.39
HOXD10P28358 RNU4-4P-201ENST00000364588 130 ntBASIC6.35□□□□□ -1.39
HOXD10P28358 SVBP-202ENST00000372522 650 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC6.35□□□□□ -1.39
HOXD10P28358 BTBD9-203ENST00000403056 1155 ntTSL 5 BASIC6.35□□□□□ -1.39
HOXD10P28358 DNAJA1P4-201ENST00000406473 1166 ntBASIC6.35□□□□□ -1.39
HOXD10P28358 MRPS21P2-201ENST00000424704 264 ntBASIC6.35□□□□□ -1.39
HOXD10P28358 RBMY2QP-201ENST00000429799 1147 ntBASIC6.35□□□□□ -1.39
HOXD10P28358 AL731534.1-201ENST00000434711 269 ntBASIC6.35□□□□□ -1.39
HOXD10P28358 AC096775.1-201ENST00000437724 448 ntBASIC6.35□□□□□ -1.39
HOXD10P28358 ST13P12-201ENST00000508958 1094 ntBASIC6.35□□□□□ -1.39
HOXD10P28358 AC145141.1-201ENST00000510180 567 ntTSL 4 BASIC6.35□□□□□ -1.39
HOXD10P28358 ZFAND1-208ENST00000519523 698 ntTSL 2 BASIC6.35□□□□□ -1.39
HOXD10P28358 SDCBP-207ENST00000520168 1097 ntTSL 2 BASIC6.35□□□□□ -1.39
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 134 ms