Protein–RNA interactions for Protein: P08F94

PKHD1, Fibrocystin, humanhuman

Predictions only

Length 4,074 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PKHD1P08F94 LRP2BP-201ENST00000328559 5157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.27□□□□□ -1.89
PKHD1P08F94 CAST-222ENST00000508579 1758 ntTSL 2 BASIC3.27□□□□□ -1.89
PKHD1P08F94 CBFA2T2-203ENST00000346541 7737 ntTSL 1 (best) BASIC3.27□□□□□ -1.89
PKHD1P08F94 ZMYND8-207ENST00000396281 5511 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC3.27□□□□□ -1.89
PKHD1P08F94 UTY-203ENST00000362096 4990 ntTSL 1 (best) BASIC3.27□□□□□ -1.89
PKHD1P08F94 GSTCD-201ENST00000360505 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.27□□□□□ -1.89
PKHD1P08F94 BMPR2-202ENST00000374580 11461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.27□□□□□ -1.89
PKHD1P08F94 THEMIS-204ENST00000537166 3830 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC3.27□□□□□ -1.89
PKHD1P08F94 KCNJ1-204ENST00000392665 4074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.27□□□□□ -1.89
PKHD1P08F94 RUFY3-201ENST00000226328 4233 ntTSL 1 (best) BASIC3.27□□□□□ -1.89
PKHD1P08F94 NKAIN2-204ENST00000545433 3052 ntTSL 5 BASIC3.27□□□□□ -1.89
PKHD1P08F94 SSMEM1-201ENST00000297819 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.27□□□□□ -1.89
PKHD1P08F94 Y_RNA.333-201ENST00000365274 102 ntBASIC3.27□□□□□ -1.89
PKHD1P08F94 RNU1-74P-201ENST00000384108 171 ntBASIC3.27□□□□□ -1.89
PKHD1P08F94 AF186996.5-201ENST00000418098 904 ntBASIC3.27□□□□□ -1.89
PKHD1P08F94 AC006427.1-201ENST00000514359 712 ntBASIC3.27□□□□□ -1.89
PKHD1P08F94 Metazoa_SRP.93-201ENST00000622525 276 ntBASIC3.27□□□□□ -1.89
PKHD1P08F94 MFSD8-220ENST00000641243 1422 ntBASIC3.27□□□□□ -1.89
PKHD1P08F94 MIR4500HG-201ENST00000436290 1675 ntTSL 1 (best) BASIC3.27□□□□□ -1.89
PKHD1P08F94 MTAP-201ENST00000380172 6122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.27□□□□□ -1.89
PKHD1P08F94 HMMR-204ENST00000432118 2084 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC3.27□□□□□ -1.89
PKHD1P08F94 SDAD1P1-202ENST00000524156 2051 ntBASIC3.27□□□□□ -1.89
PKHD1P08F94 AL031320.2-201ENST00000591892 2079 ntTSL 5 BASIC3.27□□□□□ -1.89
PKHD1P08F94 PEG10-206ENST00000612941 6392 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC3.27□□□□□ -1.89
PKHD1P08F94 PEG10-209ENST00000617526 6392 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC3.27□□□□□ -1.89
PKHD1P08F94 VPS8-210ENST00000446204 4721 ntTSL 1 (best) BASIC3.27□□□□□ -1.89
PKHD1P08F94 ANKRD12-203ENST00000400020 9115 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.27□□□□□ -1.89
PKHD1P08F94 PIGN-220ENST00000638167 4195 ntTSL 5 BASIC3.27□□□□□ -1.89
PKHD1P08F94 LINC00700-201ENST00000413603 2097 ntTSL 2 BASIC3.27□□□□□ -1.89
PKHD1P08F94 OR4F13P-202ENST00000560066 2054 ntBASIC3.27□□□□□ -1.89
PKHD1P08F94 C12orf50-201ENST00000298699 1722 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC3.27□□□□□ -1.89
PKHD1P08F94 ZNF682-207ENST00000595736 1710 ntTSL 2 BASIC3.27□□□□□ -1.89
PKHD1P08F94 SAMMSON-226ENST00000642089 1582 ntBASIC3.27□□□□□ -1.89
PKHD1P08F94 ANXA1-201ENST00000257497 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.27□□□□□ -1.89
PKHD1P08F94 SPOCK1-201ENST00000282223 4488 ntTSL 5 BASIC3.27□□□□□ -1.89
PKHD1P08F94 DDX58-202ENST00000379883 4353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.27□□□□□ -1.89
PKHD1P08F94 ATP5A1P1-201ENST00000454088 1321 ntBASIC3.27□□□□□ -1.89
PKHD1P08F94 SNORD46.1-201ENST00000364139 104 ntBASIC3.27□□□□□ -1.89
PKHD1P08F94 CARD6-202ENST00000381677 1094 ntTSL 1 (best) BASIC3.27□□□□□ -1.89
PKHD1P08F94 U3.30-201ENST00000391308 210 ntBASIC3.27□□□□□ -1.89
PKHD1P08F94 LINC01291-202ENST00000418204 441 ntTSL 5 BASIC3.27□□□□□ -1.89
PKHD1P08F94 LINC01341-201ENST00000419361 552 ntTSL 2 BASIC3.27□□□□□ -1.89
PKHD1P08F94 LINC02020-202ENST00000421006 575 ntTSL 4 BASIC3.27□□□□□ -1.89
PKHD1P08F94 AC016027.5-201ENST00000427227 210 ntBASIC3.27□□□□□ -1.89
PKHD1P08F94 SPATA13-AS1-201ENST00000430733 433 ntTSL 3 BASIC3.27□□□□□ -1.89
PKHD1P08F94 DSTNP2-201ENST00000504533 515 ntBASIC3.27□□□□□ -1.89
PKHD1P08F94 AC104119.1-201ENST00000508829 339 ntTSL 5 BASIC3.27□□□□□ -1.89
PKHD1P08F94 AC087783.1-201ENST00000527135 564 ntTSL 4 BASIC3.27□□□□□ -1.89
PKHD1P08F94 AC020915.5-201ENST00000596836 964 ntBASIC3.27□□□□□ -1.89
PKHD1P08F94 AL445465.1-206ENST00000609544 528 ntTSL 5 BASIC3.27□□□□□ -1.89
PKHD1P08F94 NAIP-208ENST00000517649 6124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.27□□□□□ -1.89
PKHD1P08F94 OR7E25P-202ENST00000641088 5937 ntBASIC3.27□□□□□ -1.89
PKHD1P08F94 ZNF827-203ENST00000508784 7463 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.27□□□□□ -1.89
PKHD1P08F94 PTBP3-205ENST00000374257 7240 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC3.27□□□□□ -1.89
PKHD1P08F94 OR8G1-202ENST00000641972 5055 ntAPPRIS P1 BASIC3.27□□□□□ -1.89
PKHD1P08F94 TLR4-202ENST00000394487 3908 ntTSL 1 (best) BASIC3.27□□□□□ -1.89
PKHD1P08F94 PIEZO2-203ENST00000503781 8259 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC3.27□□□□□ -1.89
PKHD1P08F94 ACSL5-204ENST00000393081 3380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.27□□□□□ -1.89
PKHD1P08F94 ADGRE1-202ENST00000312053 3128 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC3.27□□□□□ -1.89
PKHD1P08F94 AC127164.1-201ENST00000548738 4196 ntTSL 2 BASIC3.27□□□□□ -1.89
PKHD1P08F94 DECR1-215ENST00000522161 1766 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC3.27□□□□□ -1.89
PKHD1P08F94 EPS15-203ENST00000371733 5225 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC3.27□□□□□ -1.89
PKHD1P08F94 BNIP2-202ENST00000415213 1509 ntTSL 2 BASIC3.27□□□□□ -1.89
PKHD1P08F94 MTCO1P15-201ENST00000529569 1526 ntBASIC3.27□□□□□ -1.89
PKHD1P08F94 UNC79-201ENST00000256339 8400 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC3.27□□□□□ -1.89
PKHD1P08F94 ARID1B-232ENST00000637904 5913 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC3.27□□□□□ -1.89
PKHD1P08F94 IGKV7-3-201ENST00000357453 298 ntBASIC3.27□□□□□ -1.89
PKHD1P08F94 RN7SKP280-201ENST00000364196 304 ntBASIC3.27□□□□□ -1.89
PKHD1P08F94 AK3P5-201ENST00000432033 519 ntBASIC3.27□□□□□ -1.89
PKHD1P08F94 AC023424.1-201ENST00000496058 459 ntBASIC3.27□□□□□ -1.89
PKHD1P08F94 DAB1-AS1-208ENST00000586465 748 ntTSL 5 BASIC3.27□□□□□ -1.89
PKHD1P08F94 HMGN2-210ENST00000619352 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.27□□□□□ -1.89
PKHD1P08F94 AC002429.2-202ENST00000637269 394 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC3.27□□□□□ -1.89
PKHD1P08F94 CDK6-201ENST00000265734 11612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.26□□□□□ -1.89
PKHD1P08F94 AC018765.1-201ENST00000623357 3446 ntBASIC3.26□□□□□ -1.89
PKHD1P08F94 DMBT1-203ENST00000344338 7656 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.26□□□□□ -1.89
PKHD1P08F94 DMBT1-205ENST00000368955 7656 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC3.26□□□□□ -1.89
PKHD1P08F94 ZNF726-205ENST00000575986 1522 ntTSL 1 (best) BASIC3.26□□□□□ -1.89
PKHD1P08F94 ASB14-202ENST00000487349 3179 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC3.26□□□□□ -1.89
PKHD1P08F94 CTNND1-208ENST00000428599 6016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.26□□□□□ -1.89
PKHD1P08F94 CTNND1-232ENST00000532649 6026 ntTSL 1 (best) BASIC3.26□□□□□ -1.89
PKHD1P08F94 CTNND1-237ENST00000534579 6024 ntTSL 5 BASIC3.26□□□□□ -1.89
PKHD1P08F94 GOLGB1-201ENST00000340645 11187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC3.26□□□□□ -1.89
PKHD1P08F94 HBS1L-205ENST00000367837 7163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.26□□□□□ -1.89
PKHD1P08F94 IKZF3-217ENST00000623724 9787 ntTSL 1 (best) BASIC3.26□□□□□ -1.89
PKHD1P08F94 CPEB2-AS1-202ENST00000501916 1806 ntTSL 2 BASIC3.26□□□□□ -1.89
PKHD1P08F94 RIMS2-205ENST00000436393 4384 ntTSL 2 BASIC3.26□□□□□ -1.89
PKHD1P08F94 CXorf65-201ENST00000374251 601 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.26□□□□□ -1.89
PKHD1P08F94 EIF1AX-AS1-201ENST00000424026 378 ntTSL 5 BASIC3.26□□□□□ -1.89
PKHD1P08F94 RPL23AP93-201ENST00000440847 484 ntBASIC3.26□□□□□ -1.89
PKHD1P08F94 EIF4E-204ENST00000504432 1132 ntTSL 5 BASIC3.26□□□□□ -1.89
PKHD1P08F94 IGHVIII-13-1-201ENST00000517613 291 ntBASIC3.26□□□□□ -1.89
PKHD1P08F94 AC012339.2-201ENST00000523996 453 ntBASIC3.26□□□□□ -1.89
PKHD1P08F94 MED28P5-201ENST00000528254 438 ntBASIC3.26□□□□□ -1.89
PKHD1P08F94 OR7E128P-201ENST00000532736 1024 ntBASIC3.26□□□□□ -1.89
PKHD1P08F94 OR4C13-201ENST00000555099 1029 ntAPPRIS P1 BASIC3.26□□□□□ -1.89
PKHD1P08F94 AC105254.2-201ENST00000603636 436 ntBASIC3.26□□□□□ -1.89
PKHD1P08F94 IGKV1OR2-9-201ENST00000603957 287 ntBASIC3.26□□□□□ -1.89
PKHD1P08F94 IGKV1OR2-11-201ENST00000604120 287 ntBASIC3.26□□□□□ -1.89
PKHD1P08F94 AL121890.3-201ENST00000618494 516 ntBASIC3.26□□□□□ -1.89
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