Protein–RNA interactions for Protein: O43365

HOXA3, Homeobox protein Hox-A3, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 443 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXA3O43365 MRPS21P9-201ENST00000571150 257 ntBASIC5.51□□□□□ -1.53
HOXA3O43365 STRADA-207ENST00000578008 1153 ntTSL 5 BASIC5.51□□□□□ -1.53
HOXA3O43365 LAMTOR5-AS1-203ENST00000585330 463 ntTSL 2 BASIC5.51□□□□□ -1.53
HOXA3O43365 AC009955.2-201ENST00000597288 542 ntBASIC5.51□□□□□ -1.53
HOXA3O43365 AC020914.2-201ENST00000598220 430 ntTSL 4 BASIC5.51□□□□□ -1.53
HOXA3O43365 AP003465.2-201ENST00000602571 373 ntBASIC5.51□□□□□ -1.53
HOXA3O43365 AC012175.1-201ENST00000603755 531 ntBASIC5.51□□□□□ -1.53
HOXA3O43365 AC004890.3-201ENST00000605566 1095 ntBASIC5.51□□□□□ -1.53
HOXA3O43365 C5orf63-207ENST00000606937 607 ntTSL 2 BASIC5.51□□□□□ -1.53
HOXA3O43365 AC005332.10-201ENST00000612725 619 ntBASIC5.51□□□□□ -1.53
HOXA3O43365 STMN1P1-201ENST00000617809 440 ntBASIC5.51□□□□□ -1.53
HOXA3O43365 AC073968.1-201ENST00000618594 637 ntBASIC5.51□□□□□ -1.53
HOXA3O43365 AC018755.4-201ENST00000619715 454 ntBASIC5.51□□□□□ -1.53
HOXA3O43365 AL590240.3-201ENST00000621416 943 ntBASIC5.51□□□□□ -1.53
HOXA3O43365 AC244517.7-201ENST00000625144 398 ntTSL 3 BASIC5.51□□□□□ -1.53
HOXA3O43365 LAMTOR5-AS1-233ENST00000625451 470 ntTSL 5 BASIC5.51□□□□□ -1.53
HOXA3O43365 SAMD12-AS1-201ENST00000625758 718 ntTSL 5 BASIC5.51□□□□□ -1.53
HOXA3O43365 AC098617.1-218ENST00000628836 624 ntTSL 5 BASIC5.51□□□□□ -1.53
HOXA3O43365 AC099329.1-203ENST00000629885 767 ntTSL 5 BASIC5.51□□□□□ -1.53
HOXA3O43365 AF001550.2-201ENST00000636643 217 ntBASIC5.51□□□□□ -1.53
HOXA3O43365 OR3A3-203ENST00000641141 3800 ntAPPRIS P1 BASIC5.51□□□□□ -1.53
HOXA3O43365 AL121949.2-201ENST00000403446 1548 ntBASIC5.51□□□□□ -1.53
HOXA3O43365 THAP6-202ENST00000380837 3423 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.51□□□□□ -1.53
HOXA3O43365 AC025263.1-201ENST00000501387 2538 ntTSL 1 (best) BASIC5.51□□□□□ -1.53
HOXA3O43365 AC010168.2-201ENST00000562691 5428 ntBASIC5.51□□□□□ -1.53
HOXA3O43365 CDKAL1-201ENST00000274695 3272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.51□□□□□ -1.53
HOXA3O43365 YWHAZ-219ENST00000522542 1394 ntTSL 2 BASIC5.51□□□□□ -1.53
HOXA3O43365 AC027514.1-201ENST00000588561 1603 ntBASIC5.51□□□□□ -1.53
HOXA3O43365 FOXJ3-203ENST00000372571 4468 ntTSL 2 BASIC5.51□□□□□ -1.53
HOXA3O43365 KIF27-201ENST00000297814 4653 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.51□□□□□ -1.53
HOXA3O43365 AC092646.2-201ENST00000431242 2095 ntBASIC5.51□□□□□ -1.53
HOXA3O43365 AC114401.1-201ENST00000484222 2084 ntTSL 2 BASIC5.51□□□□□ -1.53
HOXA3O43365 ZNF449-201ENST00000339249 3773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.51□□□□□ -1.53
HOXA3O43365 SEPT14-201ENST00000388975 3785 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.51□□□□□ -1.53
HOXA3O43365 AC004784.1-201ENST00000635495 1833 ntTSL 5 BASIC5.51□□□□□ -1.53
HOXA3O43365 ZNF733P-202ENST00000444809 1573 ntBASIC5.5□□□□□ -1.53
HOXA3O43365 SERPINB7-206ENST00000540675 2193 ntTSL 2 BASIC5.5□□□□□ -1.53
HOXA3O43365 MYPN-202ENST00000358913 6013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.5□□□□□ -1.53
HOXA3O43365 C8orf34-208ENST00000523686 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC5.5□□□□□ -1.53
HOXA3O43365 CDKAL1-202ENST00000378610 3115 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.5□□□□□ -1.53
HOXA3O43365 AL133243.4-201ENST00000623116 3109 ntBASIC5.5□□□□□ -1.53
HOXA3O43365 SCN2A-209ENST00000636071 8881 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC5.5□□□□□ -1.53
HOXA3O43365 SCN2A-214ENST00000636985 8856 ntTSL 5 BASIC5.5□□□□□ -1.53
HOXA3O43365 CLNK-204ENST00000515667 4180 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC5.5□□□□□ -1.53
HOXA3O43365 FAM19A1-201ENST00000478136 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.5□□□□□ -1.53
HOXA3O43365 AC073429.2-201ENST00000569694 1444 ntBASIC5.5□□□□□ -1.53
HOXA3O43365 AL355852.1-201ENST00000454081 1771 ntBASIC5.5□□□□□ -1.53
HOXA3O43365 NXF2B-203ENST00000604395 2143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.5□□□□□ -1.53
HOXA3O43365 NXF2-201ENST00000604790 2143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.5□□□□□ -1.53
HOXA3O43365 NAA15-208ENST00000515576 2456 ntTSL 2 BASIC5.5□□□□□ -1.53
HOXA3O43365 NCOR1-205ENST00000395857 9501 ntTSL 5 BASIC5.5□□□□□ -1.53
HOXA3O43365 FAT4-202ENST00000394329 16123 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.5□□□□□ -1.53
HOXA3O43365 GFPT1-202ENST00000361060 8632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.5□□□□□ -1.53
HOXA3O43365 ADAM2-201ENST00000265708 2672 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.5□□□□□ -1.53
HOXA3O43365 SPA17-201ENST00000227135 853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.5□□□□□ -1.53
HOXA3O43365 OR1L1-201ENST00000309623 933 ntAPPRIS P1 BASIC5.5□□□□□ -1.53
HOXA3O43365 RNU6-707P-201ENST00000364647 95 ntBASIC5.5□□□□□ -1.53
HOXA3O43365 RN7SKP187-201ENST00000365536 330 ntBASIC5.5□□□□□ -1.53
HOXA3O43365 OR1L1-202ENST00000373686 1083 ntBASIC5.5□□□□□ -1.53
HOXA3O43365 TXNDC8-203ENST00000374511 472 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.5□□□□□ -1.53
HOXA3O43365 TMEM225-201ENST00000375026 1107 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.5□□□□□ -1.53
HOXA3O43365 DFNB59-201ENST00000375129 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.5□□□□□ -1.53
HOXA3O43365 PPIAP26-201ENST00000377951 522 ntBASIC5.5□□□□□ -1.53
HOXA3O43365 MIR525-201ENST00000384978 85 ntBASIC5.5□□□□□ -1.53
HOXA3O43365 PCDH9-AS2-201ENST00000419371 538 ntTSL 3 BASIC5.5□□□□□ -1.53
HOXA3O43365 AL139184.1-202ENST00000422303 222 ntBASIC5.5□□□□□ -1.53
HOXA3O43365 AL021026.1-201ENST00000422841 658 ntTSL 3 BASIC5.5□□□□□ -1.53
HOXA3O43365 AL049610.1-201ENST00000423374 372 ntBASIC5.5□□□□□ -1.53
HOXA3O43365 GTF2IP23-201ENST00000423746 351 ntBASIC5.5□□□□□ -1.53
HOXA3O43365 AC002069.1-201ENST00000429649 1159 ntBASIC5.5□□□□□ -1.53
HOXA3O43365 AL162734.1-201ENST00000432858 157 ntTSL 5 BASIC5.5□□□□□ -1.53
HOXA3O43365 AL359378.1-201ENST00000439891 400 ntTSL 5 BASIC5.5□□□□□ -1.53
HOXA3O43365 MTCO1P19-201ENST00000443487 500 ntBASIC5.5□□□□□ -1.53
HOXA3O43365 AC044781.1-201ENST00000446193 570 ntTSL 3 BASIC5.5□□□□□ -1.53
HOXA3O43365 NPM1P49-201ENST00000448027 714 ntBASIC5.5□□□□□ -1.53
HOXA3O43365 AC026391.1-201ENST00000450677 537 ntTSL 3 BASIC5.5□□□□□ -1.53
HOXA3O43365 AC092164.1-201ENST00000452212 726 ntTSL 2 BASIC5.5□□□□□ -1.53
HOXA3O43365 RANP1-206ENST00000455094 651 ntBASIC5.5□□□□□ -1.53
HOXA3O43365 PSMC1P13-201ENST00000458195 985 ntBASIC5.5□□□□□ -1.53
HOXA3O43365 ZNF286A-205ENST00000472486 827 ntTSL 2 BASIC5.5□□□□□ -1.53
HOXA3O43365 AC090114.3-201ENST00000479267 829 ntBASIC5.5□□□□□ -1.53
HOXA3O43365 WBP1LP4-201ENST00000505043 344 ntBASIC5.5□□□□□ -1.53
HOXA3O43365 AC112198.1-201ENST00000505369 1220 ntBASIC5.5□□□□□ -1.53
HOXA3O43365 AC109927.2-201ENST00000506416 303 ntBASIC5.5□□□□□ -1.53
HOXA3O43365 AC096754.1-201ENST00000508904 818 ntBASIC5.5□□□□□ -1.53
HOXA3O43365 SNX18P23-201ENST00000510867 677 ntBASIC5.5□□□□□ -1.53
HOXA3O43365 AC139713.2-204ENST00000511042 342 ntTSL 5 BASIC5.5□□□□□ -1.53
HOXA3O43365 AC091965.2-201ENST00000512324 613 ntBASIC5.5□□□□□ -1.53
HOXA3O43365 LECT2-203ENST00000512872 762 ntTSL 5 BASIC5.5□□□□□ -1.53
HOXA3O43365 AP001636.3-202ENST00000525714 894 ntTSL 3 BASIC5.5□□□□□ -1.53
HOXA3O43365 AP000842.2-202ENST00000526211 569 ntTSL 4 BASIC5.5□□□□□ -1.53
HOXA3O43365 OR5AZ1P-201ENST00000527448 943 ntBASIC5.5□□□□□ -1.53
HOXA3O43365 AP002004.1-202ENST00000528437 586 ntTSL 2 BASIC5.5□□□□□ -1.53
HOXA3O43365 AC124293.1-201ENST00000530034 493 ntBASIC5.5□□□□□ -1.53
HOXA3O43365 FAXC-204ENST00000538471 941 ntTSL 1 (best) BASIC5.5□□□□□ -1.53
HOXA3O43365 AP002373.1-201ENST00000544347 729 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC5.5□□□□□ -1.53
HOXA3O43365 AC092747.2-201ENST00000545069 983 ntBASIC5.5□□□□□ -1.53
HOXA3O43365 AP000619.2-201ENST00000546014 969 ntBASIC5.5□□□□□ -1.53
HOXA3O43365 AC117377.1-201ENST00000547633 1038 ntTSL 1 (best) BASIC5.5□□□□□ -1.53
HOXA3O43365 AC138811.2-201ENST00000567078 764 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC5.5□□□□□ -1.53
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