Protein–RNA interactions for Protein: B4DXG7

cDNA FLJ57652, highly similar to Ephrin-A3, humanhuman

Predictions only

Length 233 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
B4DXG7 DYRK1A-202ENST00000339659 8654 ntTSL 1 (best) BASIC5.14□□□□□ -1.59
B4DXG7 MIPEPP2-201ENST00000422560 1819 ntBASIC5.13□□□□□ -1.59
B4DXG7 ACADSB-201ENST00000358776 5859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.13□□□□□ -1.59
B4DXG7 ZNF701-202ENST00000391785 2634 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.13□□□□□ -1.59
B4DXG7 ATF2-212ENST00000426833 4132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.13□□□□□ -1.59
B4DXG7 ZNF518B-201ENST00000326756 6894 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC5.13□□□□□ -1.59
B4DXG7 ADAM18-202ENST00000379866 2314 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.13□□□□□ -1.59
B4DXG7 FGL2-201ENST00000248598 4261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.13□□□□□ -1.59
B4DXG7 IFI16-205ENST00000368132 2704 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.13□□□□□ -1.59
B4DXG7 LINC01091-203ENST00000514823 5262 ntTSL 1 (best) BASIC5.13□□□□□ -1.59
B4DXG7 ALB-220ENST00000621628 1606 ntTSL 5 BASIC5.13□□□□□ -1.59
B4DXG7 OR1L4-201ENST00000259466 936 ntAPPRIS P1 BASIC5.13□□□□□ -1.59
B4DXG7 LINC00314-201ENST00000324988 607 ntTSL 1 (best) BASIC5.13□□□□□ -1.59
B4DXG7 AL353751.1-201ENST00000354541 495 ntTSL 3 BASIC5.13□□□□□ -1.59
B4DXG7 FAS-203ENST00000355279 983 ntTSL 1 (best) BASIC5.13□□□□□ -1.59
B4DXG7 RN7SKP269-201ENST00000365545 319 ntBASIC5.13□□□□□ -1.59
B4DXG7 HSPB11-202ENST00000371376 765 ntTSL 3 BASIC5.13□□□□□ -1.59
B4DXG7 SMARCA2-207ENST00000382186 955 ntTSL 3 BASIC5.13□□□□□ -1.59
B4DXG7 TRAJ38-201ENST00000390499 62 ntAPPRIS P1 BASIC5.13□□□□□ -1.59
B4DXG7 RN7SKP286-201ENST00000410894 299 ntBASIC5.13□□□□□ -1.59
B4DXG7 REREP1Y-201ENST00000422655 198 ntBASIC5.13□□□□□ -1.59
B4DXG7 REREP2Y-201ENST00000439103 200 ntBASIC5.13□□□□□ -1.59
B4DXG7 AL390119.1-201ENST00000440329 312 ntBASIC5.13□□□□□ -1.59
B4DXG7 AC019185.1-201ENST00000442718 389 ntBASIC5.13□□□□□ -1.59
B4DXG7 AC007655.1-201ENST00000444324 357 ntTSL 3 BASIC5.13□□□□□ -1.59
B4DXG7 AC004692.2-203ENST00000458590 497 ntTSL 4 BASIC5.13□□□□□ -1.59
B4DXG7 LRRC77P-202ENST00000463642 457 ntTSL 4 BASIC5.13□□□□□ -1.59
B4DXG7 RPS23P2-201ENST00000463671 415 ntBASIC5.13□□□□□ -1.59
B4DXG7 AC104109.1-201ENST00000498563 436 ntBASIC5.13□□□□□ -1.59
B4DXG7 THAP6-212ENST00000508105 1103 ntTSL 1 (best) BASIC5.13□□□□□ -1.59
B4DXG7 NPM1P21-201ENST00000513394 762 ntBASIC5.13□□□□□ -1.59
B4DXG7 RN7SKP253-201ENST00000516424 309 ntBASIC5.13□□□□□ -1.59
B4DXG7 BAALC-AS1-205ENST00000521102 613 ntTSL 3 BASIC5.13□□□□□ -1.59
B4DXG7 AC064802.1-201ENST00000521523 866 ntTSL 2 BASIC5.13□□□□□ -1.59
B4DXG7 YWHAZ-220ENST00000522819 875 ntTSL 3 BASIC5.13□□□□□ -1.59
B4DXG7 AC079089.1-202ENST00000528800 1256 ntTSL 1 (best) BASIC5.13□□□□□ -1.59
B4DXG7 CDKN3-206ENST00000541304 1070 ntTSL 2 BASIC5.13□□□□□ -1.59
B4DXG7 VPS29-210ENST00000552130 1057 ntTSL 1 (best) BASIC5.13□□□□□ -1.59
B4DXG7 AL121790.1-201ENST00000554829 738 ntTSL 3 BASIC5.13□□□□□ -1.59
B4DXG7 AC012146.2-201ENST00000576545 416 ntBASIC5.13□□□□□ -1.59
B4DXG7 MIR1273E-201ENST00000581165 102 ntBASIC5.13□□□□□ -1.59
B4DXG7 Z98949.1-207ENST00000609157 814 ntTSL 5 BASIC5.13□□□□□ -1.59
B4DXG7 AC025574.2-201ENST00000615621 514 ntBASIC5.13□□□□□ -1.59
B4DXG7 AC022960.2-201ENST00000616300 666 ntBASIC5.13□□□□□ -1.59
B4DXG7 AJ239318.1-201ENST00000624445 607 ntTSL 1 (best) BASIC5.13□□□□□ -1.59
B4DXG7 RFC1-217ENST00000639695 867 ntTSL 5 BASIC5.13□□□□□ -1.59
B4DXG7 AC008691.1-209ENST00000642094 814 ntBASIC5.13□□□□□ -1.59
B4DXG7 C12orf50-201ENST00000298699 1722 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.13□□□□□ -1.59
B4DXG7 CEACAMP10-201ENST00000489959 1721 ntTSL 2 BASIC5.13□□□□□ -1.59
B4DXG7 LINC01179-201ENST00000507838 2163 ntTSL 1 (best) BASIC5.13□□□□□ -1.59
B4DXG7 GRAMD2B-202ENST00000502348 1363 ntTSL 2 BASIC5.13□□□□□ -1.59
B4DXG7 CD164-207ENST00000504373 1402 ntTSL 1 (best) BASIC5.13□□□□□ -1.59
B4DXG7 ADH4-207ENST00000505590 1400 ntTSL 5 BASIC5.13□□□□□ -1.59
B4DXG7 OR8J2-201ENST00000641465 2883 ntAPPRIS P1 BASIC5.13□□□□□ -1.59
B4DXG7 NDUFS1-207ENST00000455934 3361 ntTSL 2 BASIC5.13□□□□□ -1.59
B4DXG7 VPS13C-204ENST00000395898 11012 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.13□□□□□ -1.59
B4DXG7 ZNF420-202ENST00000337995 3535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.13□□□□□ -1.59
B4DXG7 LINC01923-203ENST00000456248 2528 ntTSL 2 BASIC5.13□□□□□ -1.59
B4DXG7 PGM3-211ENST00000512866 2013 ntTSL 1 (best) BASIC5.13□□□□□ -1.59
B4DXG7 DCN-202ENST00000393155 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.12□□□□□ -1.59
B4DXG7 EXPH5-201ENST00000265843 10187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.12□□□□□ -1.59
B4DXG7 PLCB1-211ENST00000617005 6458 ntTSL 5 BASIC5.12□□□□□ -1.59
B4DXG7 LIMA1-203ENST00000547825 3920 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.12□□□□□ -1.59
B4DXG7 ZNF571-203ENST00000451802 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.12□□□□□ -1.59
B4DXG7 AC073136.1-201ENST00000449426 2884 ntBASIC5.12□□□□□ -1.59
B4DXG7 SPARCL1-202ENST00000418378 2994 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.12□□□□□ -1.59
B4DXG7 GHR-210ENST00000615111 4814 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.12□□□□□ -1.59
B4DXG7 PSG1-202ENST00000312439 1882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.12□□□□□ -1.59
B4DXG7 ADAM29-202ENST00000404450 3171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.12□□□□□ -1.59
B4DXG7 MRPS36-201ENST00000256441 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.12□□□□□ -1.59
B4DXG7 RNA5SP234-201ENST00000363916 119 ntBASIC5.12□□□□□ -1.59
B4DXG7 CDC123-202ENST00000378900 933 ntTSL 5 BASIC5.12□□□□□ -1.59
B4DXG7 RNU1-136P-201ENST00000384181 164 ntBASIC5.12□□□□□ -1.59
B4DXG7 RMRPP5-201ENST00000411156 267 ntBASIC5.12□□□□□ -1.59
B4DXG7 ERI3-IT1-201ENST00000414156 619 ntTSL 3 BASIC5.12□□□□□ -1.59
B4DXG7 MIRLET7DHG-201ENST00000416309 1294 ntTSL 1 (best) BASIC5.12□□□□□ -1.59
B4DXG7 RANP7-201ENST00000418085 644 ntBASIC5.12□□□□□ -1.59
B4DXG7 RPL34P3-201ENST00000421454 338 ntBASIC5.12□□□□□ -1.59
B4DXG7 LINC02518-201ENST00000421737 524 ntTSL 3 BASIC5.12□□□□□ -1.59
B4DXG7 AC113412.1-201ENST00000425840 504 ntBASIC5.12□□□□□ -1.59
B4DXG7 PQLC2L-202ENST00000426338 1197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.12□□□□□ -1.59
B4DXG7 ALG13-AS1-201ENST00000430794 195 ntTSL 5 BASIC5.12□□□□□ -1.59
B4DXG7 AC012075.1-201ENST00000436549 580 ntBASIC5.12□□□□□ -1.59
B4DXG7 VDAC2P4-201ENST00000452925 711 ntBASIC5.12□□□□□ -1.59
B4DXG7 EPDR1-204ENST00000476620 555 ntTSL 4 BASIC5.12□□□□□ -1.59
B4DXG7 AC087672.1-201ENST00000479876 766 ntBASIC5.12□□□□□ -1.59
B4DXG7 OARD1-211ENST00000480585 829 ntTSL 3 BASIC5.12□□□□□ -1.59
B4DXG7 AC023424.1-201ENST00000496058 459 ntBASIC5.12□□□□□ -1.59
B4DXG7 GAPDHP62-201ENST00000515313 990 ntBASIC5.12□□□□□ -1.59
B4DXG7 RNU4ATAC18P-201ENST00000516179 126 ntBASIC5.12□□□□□ -1.59
B4DXG7 TMEM97P2-201ENST00000517841 403 ntBASIC5.12□□□□□ -1.59
B4DXG7 AC111149.1-201ENST00000522560 343 ntTSL 3 BASIC5.12□□□□□ -1.59
B4DXG7 AC068672.3-201ENST00000524017 824 ntTSL 3 BASIC5.12□□□□□ -1.59
B4DXG7 AC026401.1-201ENST00000549756 530 ntTSL 3 BASIC5.12□□□□□ -1.59
B4DXG7 AC016257.1-201ENST00000550088 641 ntTSL 2 BASIC5.12□□□□□ -1.59
B4DXG7 PWRN4-201ENST00000563016 420 ntTSL 5 BASIC5.12□□□□□ -1.59
B4DXG7 AC087301.1-201ENST00000579037 321 ntTSL 3 BASIC5.12□□□□□ -1.59
B4DXG7 MIR4505-201ENST00000582238 73 ntBASIC5.12□□□□□ -1.59
B4DXG7 AC104695.2-201ENST00000605056 775 ntBASIC5.12□□□□□ -1.59
B4DXG7 MIR6729-201ENST00000618194 65 ntBASIC5.12□□□□□ -1.59
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 82.3 ms