Protein–RNA interactions for Protein: Q9NZN3

EHD3, EH domain-containing protein 3, humanhuman

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Length 535 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EHD3Q9NZN3 RNU6-319P-201ENST00000516025 108 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
EHD3Q9NZN3 UBTFL10-201ENST00000528532 562 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
EHD3Q9NZN3 AC087897.2-201ENST00000552639 678 ntTSL 1 (best) BASIC5.85□□□□□ -1.47
EHD3Q9NZN3 MT1CP-201ENST00000567054 174 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
EHD3Q9NZN3 LINC00556-201ENST00000569603 412 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
EHD3Q9NZN3 AC217774.1-201ENST00000578936 517 ntTSL 4 BASIC5.85□□□□□ -1.47
EHD3Q9NZN3 AC119868.1-202ENST00000584741 347 ntTSL 2 BASIC5.85□□□□□ -1.47
EHD3Q9NZN3 AP001357.1-201ENST00000586304 1053 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
EHD3Q9NZN3 AC020916.2-201ENST00000591242 360 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
EHD3Q9NZN3 AC011500.1-201ENST00000601963 469 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
EHD3Q9NZN3 AL022067.1-201ENST00000602426 454 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
EHD3Q9NZN3 AL160237.3-201ENST00000604114 1013 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
EHD3Q9NZN3 QTRT1P1-201ENST00000604344 1078 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
EHD3Q9NZN3 RPSAP75-201ENST00000605848 301 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
EHD3Q9NZN3 OR7A19P-201ENST00000608051 733 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
EHD3Q9NZN3 Metazoa_SRP.199-201ENST00000615501 281 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
EHD3Q9NZN3 AL133342.1-201ENST00000618168 366 ntTSL 3 BASIC5.85□□□□□ -1.47
EHD3Q9NZN3 AL137067.2-201ENST00000621202 131 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
EHD3Q9NZN3 AP002791.1-201ENST00000623291 381 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
EHD3Q9NZN3 AC017104.5-201ENST00000637647 639 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
EHD3Q9NZN3 PYGO1-202ENST00000563719 2653 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.85□□□□□ -1.47
EHD3Q9NZN3 PSG1-202ENST00000312439 1882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.85□□□□□ -1.47
EHD3Q9NZN3 AC006484.1-201ENST00000435086 1884 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
EHD3Q9NZN3 RAPH1-204ENST00000418114 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.85□□□□□ -1.47
EHD3Q9NZN3 RAPH1-205ENST00000419464 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.85□□□□□ -1.47
EHD3Q9NZN3 OR10AB1P-202ENST00000641219 1686 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
EHD3Q9NZN3 GTPBP10-201ENST00000222511 7531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.85□□□□□ -1.47
EHD3Q9NZN3 SLX4IP-201ENST00000334534 6062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.85□□□□□ -1.47
EHD3Q9NZN3 LINC01844-201ENST00000432677 2237 ntTSL 1 (best) BASIC5.84□□□□□ -1.47
EHD3Q9NZN3 SMG1-201ENST00000330588 1588 ntTSL 5 BASIC5.84□□□□□ -1.47
EHD3Q9NZN3 ZNF679-202ENST00000421025 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.84□□□□□ -1.47
EHD3Q9NZN3 RAPGEF2-201ENST00000264431 6949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.84□□□□□ -1.47
EHD3Q9NZN3 EBF1-211ENST00000622875 4430 ntTSL 5 BASIC5.84□□□□□ -1.47
EHD3Q9NZN3 ALS2CR12-203ENST00000405148 2013 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC5.84□□□□□ -1.47
EHD3Q9NZN3 CFAP70-202ENST00000340329 1403 ntTSL 5 BASIC5.84□□□□□ -1.47
EHD3Q9NZN3 LINC02008-201ENST00000470263 1951 ntTSL 1 (best) BASIC5.84□□□□□ -1.47
EHD3Q9NZN3 SH3D19-201ENST00000304527 5273 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC5.84□□□□□ -1.47
EHD3Q9NZN3 BAALC-AS1-201ENST00000499522 1353 ntTSL 5 BASIC5.84□□□□□ -1.47
EHD3Q9NZN3 ZNF177-202ENST00000589262 1920 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC5.84□□□□□ -1.47
EHD3Q9NZN3 LINC00032-203ENST00000640247 1374 ntTSL 5 BASIC5.84□□□□□ -1.47
EHD3Q9NZN3 IKZF3-210ENST00000377958 1837 ntTSL 1 (best) BASIC5.84□□□□□ -1.47
EHD3Q9NZN3 CLEC4A-201ENST00000229332 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.84□□□□□ -1.47
EHD3Q9NZN3 OR4K13-201ENST00000315693 915 ntAPPRIS P1 BASIC5.84□□□□□ -1.47
EHD3Q9NZN3 C10orf120-201ENST00000329446 1064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.84□□□□□ -1.47
EHD3Q9NZN3 SSX3-202ENST00000376893 800 ntTSL 2 BASIC5.84□□□□□ -1.47
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EHD3Q9NZN3 AL365338.1-201ENST00000422282 858 ntBASIC5.84□□□□□ -1.47
EHD3Q9NZN3 TCEAL3-AS1-201ENST00000424887 361 ntTSL 5 BASIC5.84□□□□□ -1.47
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EHD3Q9NZN3 ZFAND6-204ENST00000558087 909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.84□□□□□ -1.47
EHD3Q9NZN3 AC127522.1-201ENST00000560531 751 ntTSL 2 BASIC5.84□□□□□ -1.47
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EHD3Q9NZN3 DUXAP3-201ENST00000603616 594 ntBASIC5.84□□□□□ -1.47
EHD3Q9NZN3 AP001823.1-201ENST00000604056 1003 ntBASIC5.84□□□□□ -1.47
EHD3Q9NZN3 SMAGP-208ENST00000605627 577 ntTSL 5 BASIC5.84□□□□□ -1.47
EHD3Q9NZN3 RNU4-5P-201ENST00000607255 135 ntBASIC5.84□□□□□ -1.47
EHD3Q9NZN3 AC021851.1-201ENST00000608537 1082 ntBASIC5.84□□□□□ -1.47
EHD3Q9NZN3 AC093388.1-201ENST00000609166 430 ntBASIC5.84□□□□□ -1.47
EHD3Q9NZN3 AL161457.2-204ENST00000609241 869 ntTSL 5 BASIC5.84□□□□□ -1.47
EHD3Q9NZN3 AL669942.2-201ENST00000620352 697 ntBASIC5.84□□□□□ -1.47
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EHD3Q9NZN3 AC090617.9-201ENST00000623751 147 ntBASIC5.84□□□□□ -1.47
EHD3Q9NZN3 LINC01435-220ENST00000630847 714 ntTSL 5 BASIC5.84□□□□□ -1.47
EHD3Q9NZN3 COPS7B-225ENST00000631349 189 ntTSL 5 BASIC5.84□□□□□ -1.47
EHD3Q9NZN3 AF067845.4-201ENST00000633198 480 ntTSL 3 BASIC5.84□□□□□ -1.47
EHD3Q9NZN3 TTC33-206ENST00000636863 1149 ntTSL 5 BASIC5.84□□□□□ -1.47
EHD3Q9NZN3 AC010325.3-201ENST00000641084 394 ntBASIC5.84□□□□□ -1.47
EHD3Q9NZN3 LYVE1-201ENST00000256178 3273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.84□□□□□ -1.47
EHD3Q9NZN3 BRCA1-203ENST00000357654 7094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.84□□□□□ -1.47
EHD3Q9NZN3 FBXO9-201ENST00000244426 4559 ntTSL 1 (best) BASIC5.84□□□□□ -1.47
EHD3Q9NZN3 ZNF727-201ENST00000456806 1679 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC5.84□□□□□ -1.47
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