Protein–RNA interactions for Protein: Q9HBJ7

USP29, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 29, humanhuman

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Length 922 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP29Q9HBJ7 SYTL2-208ENST00000524452 2733 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC6.06□□□□□ -1.44
USP29Q9HBJ7 NDRG3-202ENST00000359675 2917 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC6.06□□□□□ -1.44
USP29Q9HBJ7 TOR1AIP1-202ENST00000435319 3397 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.06□□□□□ -1.44
USP29Q9HBJ7 KIAA1841-205ENST00000453873 4294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.06□□□□□ -1.44
USP29Q9HBJ7 ECT2L-205ENST00000541398 4483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.06□□□□□ -1.44
USP29Q9HBJ7 PTPRD-206ENST00000397617 8248 ntTSL 5 BASIC6.06□□□□□ -1.44
USP29Q9HBJ7 N4BP2L2-204ENST00000399396 2872 ntTSL 5 BASIC6.06□□□□□ -1.44
USP29Q9HBJ7 AC008627.1-201ENST00000517511 1704 ntBASIC6.06□□□□□ -1.44
USP29Q9HBJ7 FGL2-201ENST00000248598 4261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.06□□□□□ -1.44
USP29Q9HBJ7 ADAM20-201ENST00000256389 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.06□□□□□ -1.44
USP29Q9HBJ7 OR56A4-204ENST00000641835 3613 ntAPPRIS P1 BASIC6.06□□□□□ -1.44
USP29Q9HBJ7 PRSS37-201ENST00000350549 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.06□□□□□ -1.44
USP29Q9HBJ7 MIR323A-201ENST00000362199 86 ntBASIC6.06□□□□□ -1.44
USP29Q9HBJ7 U3.10-201ENST00000364459 214 ntBASIC6.06□□□□□ -1.44
USP29Q9HBJ7 GCSAML-201ENST00000366488 3820 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.06□□□□□ -1.44
USP29Q9HBJ7 SNRPEP6-201ENST00000407465 277 ntBASIC6.06□□□□□ -1.44
USP29Q9HBJ7 AC017048.1-201ENST00000412153 495 ntTSL 2 BASIC6.06□□□□□ -1.44
USP29Q9HBJ7 RPS4XP5-201ENST00000419038 768 ntBASIC6.06□□□□□ -1.44
USP29Q9HBJ7 AL139008.2-201ENST00000420315 395 ntTSL 3 BASIC6.06□□□□□ -1.44
USP29Q9HBJ7 AC009506.2-201ENST00000420635 840 ntBASIC6.06□□□□□ -1.44
USP29Q9HBJ7 MTND4P24-201ENST00000424002 397 ntBASIC6.06□□□□□ -1.44
USP29Q9HBJ7 UBE2D3P3-201ENST00000426992 425 ntBASIC6.06□□□□□ -1.44
USP29Q9HBJ7 CDY8P-201ENST00000428380 1279 ntBASIC6.06□□□□□ -1.44
USP29Q9HBJ7 AL162408.1-201ENST00000428853 433 ntTSL 5 BASIC6.06□□□□□ -1.44
USP29Q9HBJ7 HTR5BP-202ENST00000434708 1193 ntTSL 1 (best) BASIC6.06□□□□□ -1.44
USP29Q9HBJ7 UBE2L5P-201ENST00000436446 465 ntAPPRIS P1 BASIC6.06□□□□□ -1.44
USP29Q9HBJ7 AC096775.1-201ENST00000437724 448 ntBASIC6.06□□□□□ -1.44
USP29Q9HBJ7 XKRY2-201ENST00000442362 1093 ntBASIC6.06□□□□□ -1.44
USP29Q9HBJ7 LINC01880-201ENST00000446593 561 ntTSL 4 BASIC6.06□□□□□ -1.44
USP29Q9HBJ7 CDY20P-201ENST00000447528 1279 ntBASIC6.06□□□□□ -1.44
USP29Q9HBJ7 HLA-DPA3-207ENST00000454398 229 ntBASIC6.06□□□□□ -1.44
USP29Q9HBJ7 AKR1C2-203ENST00000455190 1098 ntTSL 2 BASIC6.06□□□□□ -1.44
USP29Q9HBJ7 AC104849.1-201ENST00000462623 405 ntBASIC6.06□□□□□ -1.44
USP29Q9HBJ7 PEX5L-AS1-201ENST00000466064 827 ntTSL 2 BASIC6.06□□□□□ -1.44
USP29Q9HBJ7 AC023245.1-201ENST00000468501 517 ntBASIC6.06□□□□□ -1.44
USP29Q9HBJ7 CMAHP-205ENST00000471416 1118 ntTSL 2 BASIC6.06□□□□□ -1.44
USP29Q9HBJ7 RN7SL214P-201ENST00000487317 265 ntBASIC6.06□□□□□ -1.44
USP29Q9HBJ7 LINC01192-207ENST00000492553 836 ntTSL 5 BASIC6.06□□□□□ -1.44
USP29Q9HBJ7 RN7SL284P-201ENST00000498823 275 ntBASIC6.06□□□□□ -1.44
USP29Q9HBJ7 AC118282.1-201ENST00000506408 765 ntBASIC6.06□□□□□ -1.44
USP29Q9HBJ7 AC093535.1-201ENST00000515808 747 ntTSL 3 BASIC6.06□□□□□ -1.44
USP29Q9HBJ7 RN7SKP238-201ENST00000516483 249 ntBASIC6.06□□□□□ -1.44
USP29Q9HBJ7 RNA5SP340-201ENST00000517132 107 ntBASIC6.06□□□□□ -1.44
USP29Q9HBJ7 LINC00861-202ENST00000517869 606 ntTSL 5 BASIC6.06□□□□□ -1.44
USP29Q9HBJ7 PMP2-202ENST00000519260 1264 ntTSL 1 (best) BASIC6.06□□□□□ -1.44
USP29Q9HBJ7 AC022826.1-201ENST00000519383 805 ntBASIC6.06□□□□□ -1.44
USP29Q9HBJ7 AC027701.1-202ENST00000520988 459 ntTSL 3 BASIC6.06□□□□□ -1.44
USP29Q9HBJ7 OR52B2-201ENST00000530810 1079 ntAPPRIS P1 BASIC6.06□□□□□ -1.44
USP29Q9HBJ7 AC068339.2-201ENST00000534395 618 ntBASIC6.06□□□□□ -1.44
USP29Q9HBJ7 OR8X1P-201ENST00000534542 869 ntBASIC6.06□□□□□ -1.44
USP29Q9HBJ7 AL355112.1-201ENST00000550309 1236 ntTSL 1 (best) BASIC6.06□□□□□ -1.44
USP29Q9HBJ7 AC025423.4-201ENST00000553141 785 ntTSL 3 BASIC6.06□□□□□ -1.44
USP29Q9HBJ7 AC009396.1-201ENST00000553628 1079 ntTSL 2 BASIC6.06□□□□□ -1.44
USP29Q9HBJ7 AP000842.3-201ENST00000564354 808 ntTSL 3 BASIC6.06□□□□□ -1.44
USP29Q9HBJ7 AP001496.3-201ENST00000580230 913 ntBASIC6.06□□□□□ -1.44
USP29Q9HBJ7 AL157938.2-208ENST00000590461 877 ntTSL 5 BASIC6.06□□□□□ -1.44
USP29Q9HBJ7 AC025857.2-201ENST00000602711 238 ntBASIC6.06□□□□□ -1.44
USP29Q9HBJ7 PROX1-AS1-219ENST00000610094 791 ntTSL 5 BASIC6.06□□□□□ -1.44
USP29Q9HBJ7 MIR6768-201ENST00000610734 72 ntBASIC6.06□□□□□ -1.44
USP29Q9HBJ7 AL050303.3-201ENST00000613704 284 ntBASIC6.06□□□□□ -1.44
USP29Q9HBJ7 RNA5SP439-201ENST00000617595 124 ntBASIC6.06□□□□□ -1.44
USP29Q9HBJ7 SSX4B-202ENST00000619890 1092 ntTSL 5 BASIC6.06□□□□□ -1.44
USP29Q9HBJ7 SSX4-202ENST00000620320 1092 ntTSL 5 BASIC6.06□□□□□ -1.44
USP29Q9HBJ7 AC023490.1-202ENST00000620909 820 ntTSL 5 BASIC6.06□□□□□ -1.44
USP29Q9HBJ7 PCBP1-AS1-282ENST00000625783 826 ntTSL 5 BASIC6.06□□□□□ -1.44
USP29Q9HBJ7 UGP2-232ENST00000640075 567 ntTSL 5 BASIC6.06□□□□□ -1.44
USP29Q9HBJ7 FAM229B-201ENST00000368656 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.06□□□□□ -1.44
USP29Q9HBJ7 COL14A1-209ENST00000537875 3119 ntTSL 5 BASIC6.06□□□□□ -1.44
USP29Q9HBJ7 GTF2H5-201ENST00000607778 7481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.06□□□□□ -1.44
USP29Q9HBJ7 DHX32-201ENST00000284690 3070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.06□□□□□ -1.44
USP29Q9HBJ7 AL132656.2-201ENST00000482985 1837 ntTSL 5 BASIC6.06□□□□□ -1.44
USP29Q9HBJ7 LINC01277-201ENST00000419957 2398 ntTSL 2 BASIC6.06□□□□□ -1.44
USP29Q9HBJ7 MAPKAPK5P1-201ENST00000431810 1376 ntBASIC6.06□□□□□ -1.44
USP29Q9HBJ7 NOL4-202ENST00000535384 1853 ntTSL 2 BASIC6.05□□□□□ -1.44
USP29Q9HBJ7 CDH13-209ENST00000567109 8042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.05□□□□□ -1.44
USP29Q9HBJ7 PNISR-202ENST00000438806 3142 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.05□□□□□ -1.44
USP29Q9HBJ7 STATH-201ENST00000246895 598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.05□□□□□ -1.44
USP29Q9HBJ7 OR8U1-201ENST00000302270 930 ntAPPRIS P1 BASIC6.05□□□□□ -1.44
USP29Q9HBJ7 RNA5SP477-201ENST00000362639 119 ntBASIC6.05□□□□□ -1.44
USP29Q9HBJ7 MIR421-201ENST00000365696 85 ntBASIC6.05□□□□□ -1.44
USP29Q9HBJ7 FAIM-204ENST00000393035 946 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.05□□□□□ -1.44
USP29Q9HBJ7 AL353692.2-201ENST00000407054 335 ntBASIC6.05□□□□□ -1.44
USP29Q9HBJ7 AC003975.1-201ENST00000411856 837 ntTSL 3 BASIC6.05□□□□□ -1.44
USP29Q9HBJ7 AC017078.1-201ENST00000416146 368 ntBASIC6.05□□□□□ -1.44
USP29Q9HBJ7 VN1R37P-201ENST00000419096 748 ntBASIC6.05□□□□□ -1.44
USP29Q9HBJ7 CHEK2P5-201ENST00000423877 246 ntBASIC6.05□□□□□ -1.44
USP29Q9HBJ7 NPM1P26-201ENST00000426339 738 ntBASIC6.05□□□□□ -1.44
USP29Q9HBJ7 MTND6P12-201ENST00000428247 522 ntBASIC6.05□□□□□ -1.44
USP29Q9HBJ7 GAPDHP75-201ENST00000433910 943 ntBASIC6.05□□□□□ -1.44
USP29Q9HBJ7 AC005077.1-201ENST00000449226 375 ntBASIC6.05□□□□□ -1.44
USP29Q9HBJ7 MTATP6P14-201ENST00000455189 673 ntBASIC6.05□□□□□ -1.44
USP29Q9HBJ7 RN7SL174P-201ENST00000475578 289 ntBASIC6.05□□□□□ -1.44
USP29Q9HBJ7 PSMA2P2-201ENST00000504319 686 ntBASIC6.05□□□□□ -1.44
USP29Q9HBJ7 OSMR-AS1-201ENST00000506463 800 ntTSL 3 BASIC6.05□□□□□ -1.44
USP29Q9HBJ7 AC010468.3-201ENST00000508225 458 ntBASIC6.05□□□□□ -1.44
USP29Q9HBJ7 AC010260.1-201ENST00000511484 664 ntTSL 3 BASIC6.05□□□□□ -1.44
USP29Q9HBJ7 OR5H7P-201ENST00000514084 930 ntBASIC6.05□□□□□ -1.44
USP29Q9HBJ7 AC097486.1-201ENST00000515331 210 ntBASIC6.05□□□□□ -1.44
USP29Q9HBJ7 AP001372.4-201ENST00000524889 472 ntBASIC6.05□□□□□ -1.44
USP29Q9HBJ7 AP000873.2-204ENST00000530825 375 ntTSL 3 BASIC6.05□□□□□ -1.44
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