Protein–RNA interactions for Protein: Q9C0C6

CIPC, CLOCK-interacting pacemaker, humanhuman

Predictions only

Length 399 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CIPCQ9C0C6 AC115223.1-201ENST00000466377 870 ntBASIC5.98□□□□□ -1.45
CIPCQ9C0C6 RPL5P12-201ENST00000477071 851 ntBASIC5.98□□□□□ -1.45
CIPCQ9C0C6 RPS3AP6-201ENST00000484430 795 ntBASIC5.98□□□□□ -1.45
CIPCQ9C0C6 NAMPTP2-201ENST00000505629 1115 ntBASIC5.98□□□□□ -1.45
CIPCQ9C0C6 AC096571.1-202ENST00000506634 735 ntBASIC5.98□□□□□ -1.45
CIPCQ9C0C6 AC139720.1-201ENST00000509497 512 ntTSL 3 BASIC5.98□□□□□ -1.45
CIPCQ9C0C6 AC096577.1-202ENST00000515649 448 ntTSL 3 BASIC5.98□□□□□ -1.45
CIPCQ9C0C6 LINC00861-202ENST00000517869 606 ntTSL 5 BASIC5.98□□□□□ -1.45
CIPCQ9C0C6 AC064802.1-201ENST00000521523 866 ntTSL 2 BASIC5.98□□□□□ -1.45
CIPCQ9C0C6 AL049629.1-201ENST00000534431 648 ntTSL 3 BASIC5.98□□□□□ -1.45
CIPCQ9C0C6 RERG-AS1-201ENST00000541243 337 ntTSL 2 BASIC5.98□□□□□ -1.45
CIPCQ9C0C6 LINC02325-202ENST00000554260 567 ntTSL 4 BASIC5.98□□□□□ -1.45
CIPCQ9C0C6 AC022404.1-201ENST00000555320 273 ntBASIC5.98□□□□□ -1.45
CIPCQ9C0C6 ARPP19-204ENST00000563277 955 ntTSL 2 BASIC5.98□□□□□ -1.45
CIPCQ9C0C6 GOLGA8M-203ENST00000568033 557 ntTSL 4 BASIC5.98□□□□□ -1.45
CIPCQ9C0C6 AC007431.2-201ENST00000577189 563 ntTSL 2 BASIC5.98□□□□□ -1.45
CIPCQ9C0C6 AP000897.2-201ENST00000579509 1057 ntTSL 3 BASIC5.98□□□□□ -1.45
CIPCQ9C0C6 LINC01050-201ENST00000604485 760 ntTSL 3 BASIC5.98□□□□□ -1.45
CIPCQ9C0C6 AC097376.2-202ENST00000608345 433 ntTSL 3 BASIC5.98□□□□□ -1.45
CIPCQ9C0C6 AC109309.2-201ENST00000612597 332 ntBASIC5.98□□□□□ -1.45
CIPCQ9C0C6 AC018926.1-201ENST00000616335 435 ntBASIC5.98□□□□□ -1.45
CIPCQ9C0C6 LINC02033-201ENST00000623207 971 ntTSL 2 BASIC5.98□□□□□ -1.45
CIPCQ9C0C6 PIGX-210ENST00000639143 831 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC5.98□□□□□ -1.45
CIPCQ9C0C6 ROR1-AS1-202ENST00000424995 2189 ntTSL 2 BASIC5.98□□□□□ -1.45
CIPCQ9C0C6 VCAM1-201ENST00000294728 3083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.98□□□□□ -1.45
CIPCQ9C0C6 LINC00698-203ENST00000468072 1957 ntTSL 1 (best) BASIC5.98□□□□□ -1.45
CIPCQ9C0C6 AQP4-201ENST00000383168 5274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.98□□□□□ -1.45
CIPCQ9C0C6 LGALS8-220ENST00000526634 1852 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.98□□□□□ -1.45
CIPCQ9C0C6 ZNF260-204ENST00000592282 5055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.98□□□□□ -1.45
CIPCQ9C0C6 OR13C1P-202ENST00000641378 2919 ntBASIC5.98□□□□□ -1.45
CIPCQ9C0C6 OR6C4-202ENST00000641569 5141 ntAPPRIS P1 BASIC5.98□□□□□ -1.45
CIPCQ9C0C6 AP002833.3-201ENST00000625075 2265 ntBASIC5.97□□□□□ -1.45
CIPCQ9C0C6 MFSD8-201ENST00000296468 4516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.97□□□□□ -1.45
CIPCQ9C0C6 TEK-204ENST00000519097 3836 ntTSL 2 BASIC5.97□□□□□ -1.45
CIPCQ9C0C6 RNF145-206ENST00000519865 3478 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.97□□□□□ -1.45
CIPCQ9C0C6 PDE5A-203ENST00000394439 6770 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.97□□□□□ -1.45
CIPCQ9C0C6 MECOM-203ENST00000460814 3374 ntTSL 1 (best) BASIC5.97□□□□□ -1.45
CIPCQ9C0C6 ZNF699-203ENST00000591998 3358 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.97□□□□□ -1.45
CIPCQ9C0C6 EPPIN-202ENST00000354280 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.97□□□□□ -1.45
CIPCQ9C0C6 FP236241.1-201ENST00000623374 7632 ntTSL 1 (best) BASIC5.97□□□□□ -1.45
CIPCQ9C0C6 CU633967.1-211ENST00000624444 7628 ntTSL 1 (best) BASIC5.97□□□□□ -1.45
CIPCQ9C0C6 TRPC5OS-201ENST00000371970 2806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.97□□□□□ -1.45
CIPCQ9C0C6 NLN-202ENST00000502464 8354 ntTSL 5 BASIC5.97□□□□□ -1.45
CIPCQ9C0C6 OR2B6-201ENST00000244623 942 ntAPPRIS P1 BASIC5.97□□□□□ -1.45
CIPCQ9C0C6 SPINT4-201ENST00000279058 512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.97□□□□□ -1.45
CIPCQ9C0C6 OR10A2-201ENST00000307322 1053 ntAPPRIS P1 BASIC5.97□□□□□ -1.45
CIPCQ9C0C6 RNA5SP394-201ENST00000364216 119 ntBASIC5.97□□□□□ -1.45
CIPCQ9C0C6 RNA5-8SP5-201ENST00000365304 152 ntBASIC5.97□□□□□ -1.45
CIPCQ9C0C6 AL451142.1-201ENST00000375867 775 ntBASIC5.97□□□□□ -1.45
CIPCQ9C0C6 RNU6-1257P-201ENST00000384625 110 ntBASIC5.97□□□□□ -1.45
CIPCQ9C0C6 AL050305.1-201ENST00000399993 1230 ntBASIC5.97□□□□□ -1.45
CIPCQ9C0C6 LINC00463-201ENST00000413501 1147 ntTSL 3 BASIC5.97□□□□□ -1.45
CIPCQ9C0C6 AC009502.1-203ENST00000416861 496 ntTSL 2 BASIC5.97□□□□□ -1.45
CIPCQ9C0C6 AC010745.4-201ENST00000420130 740 ntTSL 5 BASIC5.97□□□□□ -1.45
CIPCQ9C0C6 AL138789.1-201ENST00000425820 960 ntTSL 2 BASIC5.97□□□□□ -1.45
CIPCQ9C0C6 AL031429.1-201ENST00000426775 749 ntTSL 2 BASIC5.97□□□□□ -1.45
CIPCQ9C0C6 ISM1-AS1-201ENST00000431407 652 ntTSL 1 (best) BASIC5.97□□□□□ -1.45
CIPCQ9C0C6 HMGB3P24-201ENST00000433260 622 ntBASIC5.97□□□□□ -1.45
CIPCQ9C0C6 AC072062.1-204ENST00000437897 1132 ntTSL 5 BASIC5.97□□□□□ -1.45
CIPCQ9C0C6 AL645931.1-201ENST00000439737 410 ntBASIC5.97□□□□□ -1.45
CIPCQ9C0C6 DNAJC19P5-201ENST00000443295 316 ntBASIC5.97□□□□□ -1.45
CIPCQ9C0C6 CUBNP2-201ENST00000443534 1139 ntBASIC5.97□□□□□ -1.45
CIPCQ9C0C6 AP000281.1-201ENST00000444036 316 ntBASIC5.97□□□□□ -1.45
CIPCQ9C0C6 LINC02096-201ENST00000445035 953 ntTSL 5 BASIC5.97□□□□□ -1.45
CIPCQ9C0C6 AL354793.1-201ENST00000446028 713 ntTSL 3 BASIC5.97□□□□□ -1.45
CIPCQ9C0C6 AC022215.1-201ENST00000481770 362 ntBASIC5.97□□□□□ -1.45
CIPCQ9C0C6 AC090543.1-201ENST00000492168 485 ntBASIC5.97□□□□□ -1.45
CIPCQ9C0C6 AL136038.1-201ENST00000497246 351 ntBASIC5.97□□□□□ -1.45
CIPCQ9C0C6 AC108727.2-201ENST00000512277 392 ntTSL 3 BASIC5.97□□□□□ -1.45
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CIPCQ9C0C6 MTND2P32-201ENST00000521584 1038 ntBASIC5.97□□□□□ -1.45
CIPCQ9C0C6 AC113423.1-201ENST00000523279 289 ntTSL 3 BASIC5.97□□□□□ -1.45
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CIPCQ9C0C6 AC084759.1-201ENST00000561168 290 ntBASIC5.97□□□□□ -1.45
CIPCQ9C0C6 AL049838.1-201ENST00000563647 981 ntBASIC5.97□□□□□ -1.45
CIPCQ9C0C6 MIR4260-201ENST00000583107 67 ntBASIC5.97□□□□□ -1.45
CIPCQ9C0C6 AC004223.2-201ENST00000590309 544 ntBASIC5.97□□□□□ -1.45
CIPCQ9C0C6 ZNF836-203ENST00000597065 808 ntTSL 1 (best) BASIC5.97□□□□□ -1.45
CIPCQ9C0C6 AC112220.2-201ENST00000605513 533 ntBASIC5.97□□□□□ -1.45
CIPCQ9C0C6 RN7SL544P-201ENST00000617232 284 ntBASIC5.97□□□□□ -1.45
CIPCQ9C0C6 AL445670.1-201ENST00000618889 801 ntBASIC5.97□□□□□ -1.45
CIPCQ9C0C6 RN7SL763P-201ENST00000620922 284 ntBASIC5.97□□□□□ -1.45
CIPCQ9C0C6 AC068880.4-201ENST00000623082 495 ntBASIC5.97□□□□□ -1.45
CIPCQ9C0C6 AC079298.3-203ENST00000623269 555 ntTSL 3 BASIC5.97□□□□□ -1.45
CIPCQ9C0C6 AL137789.1-204ENST00000623503 666 ntTSL 5 BASIC5.97□□□□□ -1.45
CIPCQ9C0C6 AP001043.1-201ENST00000626259 773 ntTSL 5 BASIC5.97□□□□□ -1.45
CIPCQ9C0C6 ART3-202ENST00000349321 1528 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.97□□□□□ -1.45
CIPCQ9C0C6 AC106754.1-201ENST00000562632 1513 ntBASIC5.97□□□□□ -1.45
CIPCQ9C0C6 AASDH-203ENST00000502617 3004 ntTSL 1 (best) BASIC5.97□□□□□ -1.45
CIPCQ9C0C6 ESRRG-204ENST00000361525 5363 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.97□□□□□ -1.45
CIPCQ9C0C6 CUBN-202ENST00000377833 11949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.97□□□□□ -1.45
CIPCQ9C0C6 PDE4D-202ENST00000317118 2599 ntTSL 1 (best) BASIC5.97□□□□□ -1.45
CIPCQ9C0C6 FAM197Y8-201ENST00000426661 2340 ntTSL 2 BASIC5.97□□□□□ -1.45
CIPCQ9C0C6 FAM197Y6-202ENST00000442145 2340 ntTSL 2 BASIC5.97□□□□□ -1.45
CIPCQ9C0C6 MAGEB16-204ENST00000399989 1818 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC5.97□□□□□ -1.45
CIPCQ9C0C6 MUT-201ENST00000274813 3749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.97□□□□□ -1.45
CIPCQ9C0C6 TRIM22-201ENST00000379965 2989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.97□□□□□ -1.45
CIPCQ9C0C6 ADGRL3-210ENST00000508946 4758 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.97□□□□□ -1.45
CIPCQ9C0C6 PKIA-201ENST00000352966 1736 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.96□□□□□ -1.45
CIPCQ9C0C6 AC078880.4-201ENST00000617627 1749 ntBASIC5.96□□□□□ -1.45
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