Protein–RNA interactions for Protein: Q96Q05

TRAPPC9, Trafficking protein particle complex subunit 9, humanhuman

Predictions only

Length 1,148 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRAPPC9Q96Q05 POLK-210ENST00000508526 2019 ntTSL 1 (best) BASIC5.97□□□□□ -1.45
TRAPPC9Q96Q05 MRRFP1-201ENST00000435941 1675 ntBASIC5.97□□□□□ -1.45
TRAPPC9Q96Q05 HELZ-207ENST00000580168 6279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.97□□□□□ -1.45
TRAPPC9Q96Q05 LARP7-210ENST00000509061 2332 ntTSL 1 (best) BASIC5.97□□□□□ -1.45
TRAPPC9Q96Q05 SCN1A-217ENST00000637988 8562 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC5.96□□□□□ -1.45
TRAPPC9Q96Q05 PIK3C2A-201ENST00000265970 8227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.96□□□□□ -1.45
TRAPPC9Q96Q05 USP37-205ENST00000454775 5019 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.96□□□□□ -1.45
TRAPPC9Q96Q05 RIMS1-219ENST00000523963 3097 ntTSL 2 BASIC5.96□□□□□ -1.45
TRAPPC9Q96Q05 ALG13-203ENST00000394780 4133 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.96□□□□□ -1.45
TRAPPC9Q96Q05 RBM22-202ENST00000447771 1386 ntTSL 2 BASIC5.96□□□□□ -1.45
TRAPPC9Q96Q05 AC016747.4-201ENST00000462959 1383 ntTSL 2 BASIC5.96□□□□□ -1.45
TRAPPC9Q96Q05 OR9K1P-202ENST00000641111 3217 ntBASIC5.96□□□□□ -1.46
TRAPPC9Q96Q05 ZNF33A-202ENST00000374618 6122 ntTSL 4 BASIC5.96□□□□□ -1.46
TRAPPC9Q96Q05 AL034546.1-201ENST00000623740 3693 ntBASIC5.96□□□□□ -1.46
TRAPPC9Q96Q05 AL442071.1-201ENST00000289890 558 ntTSL 3 BASIC5.96□□□□□ -1.46
TRAPPC9Q96Q05 COX6B1P3-201ENST00000312310 260 ntBASIC5.96□□□□□ -1.46
TRAPPC9Q96Q05 SNORA21-201ENST00000362423 132 ntBASIC5.96□□□□□ -1.46
TRAPPC9Q96Q05 SNORA63.3-201ENST00000362682 132 ntBASIC5.96□□□□□ -1.46
TRAPPC9Q96Q05 RNU6-792P-201ENST00000363490 107 ntBASIC5.96□□□□□ -1.46
TRAPPC9Q96Q05 ZCCHC6-202ENST00000375947 611 ntTSL 5 BASIC5.96□□□□□ -1.46
TRAPPC9Q96Q05 TRPM3-206ENST00000377097 554 ntTSL 2 BASIC5.96□□□□□ -1.46
TRAPPC9Q96Q05 SNORA51.9-201ENST00000384295 124 ntBASIC5.96□□□□□ -1.46
TRAPPC9Q96Q05 MIR433-201ENST00000384837 93 ntBASIC5.96□□□□□ -1.46
TRAPPC9Q96Q05 TRDC-201ENST00000390477 720 ntAPPRIS P1 BASIC5.96□□□□□ -1.46
TRAPPC9Q96Q05 AL929472.2-201ENST00000419993 481 ntTSL 5 BASIC5.96□□□□□ -1.46
TRAPPC9Q96Q05 AC074035.1-201ENST00000420725 1184 ntTSL 1 (best) BASIC5.96□□□□□ -1.46
TRAPPC9Q96Q05 NAP1L4P2-201ENST00000425958 899 ntBASIC5.96□□□□□ -1.46
TRAPPC9Q96Q05 AC242426.1-201ENST00000435270 960 ntBASIC5.96□□□□□ -1.46
TRAPPC9Q96Q05 AL353681.1-201ENST00000435828 731 ntTSL 3 BASIC5.96□□□□□ -1.46
TRAPPC9Q96Q05 AC011891.1-201ENST00000437088 432 ntTSL 3 BASIC5.96□□□□□ -1.46
TRAPPC9Q96Q05 AL450472.1-201ENST00000439434 405 ntTSL 2 BASIC5.96□□□□□ -1.46
TRAPPC9Q96Q05 CATSPER2P1-205ENST00000446479 419 ntTSL 1 (best) BASIC5.96□□□□□ -1.46
TRAPPC9Q96Q05 PEX5L-AS2-201ENST00000462801 630 ntTSL 2 BASIC5.96□□□□□ -1.46
TRAPPC9Q96Q05 RBBP4P1-201ENST00000502424 1276 ntBASIC5.96□□□□□ -1.46
TRAPPC9Q96Q05 MTCO2P9-201ENST00000503214 694 ntBASIC5.96□□□□□ -1.46
TRAPPC9Q96Q05 IGKV3D-25-201ENST00000519599 235 ntBASIC5.96□□□□□ -1.46
TRAPPC9Q96Q05 AC090150.1-201ENST00000521408 585 ntTSL 4 BASIC5.96□□□□□ -1.46
TRAPPC9Q96Q05 TMEM68-213ENST00000522576 826 ntTSL 2 BASIC5.96□□□□□ -1.46
TRAPPC9Q96Q05 AP003031.2-204ENST00000527219 567 ntTSL 4 BASIC5.96□□□□□ -1.46
TRAPPC9Q96Q05 AP002370.2-202ENST00000533669 908 ntTSL 5 BASIC5.96□□□□□ -1.46
TRAPPC9Q96Q05 NELL2-211ENST00000548826 559 ntTSL 2 BASIC5.96□□□□□ -1.46
TRAPPC9Q96Q05 AC011603.3-201ENST00000549516 279 ntTSL 3 BASIC5.96□□□□□ -1.46
TRAPPC9Q96Q05 AC012050.1-201ENST00000558185 472 ntTSL 3 BASIC5.96□□□□□ -1.46
TRAPPC9Q96Q05 AC022523.1-201ENST00000560360 364 ntTSL 5 BASIC5.96□□□□□ -1.46
TRAPPC9Q96Q05 AC092332.1-201ENST00000563684 829 ntBASIC5.96□□□□□ -1.46
TRAPPC9Q96Q05 AC009019.1-203ENST00000568603 515 ntTSL 5 BASIC5.96□□□□□ -1.46
TRAPPC9Q96Q05 AC100844.1-201ENST00000580622 440 ntTSL 5 BASIC5.96□□□□□ -1.46
TRAPPC9Q96Q05 MIR4660-201ENST00000583549 74 ntBASIC5.96□□□□□ -1.46
TRAPPC9Q96Q05 LINC01476-202ENST00000584262 635 ntTSL 4 BASIC5.96□□□□□ -1.46
TRAPPC9Q96Q05 ZNF486-202ENST00000597083 734 ntTSL 3 BASIC5.96□□□□□ -1.46
TRAPPC9Q96Q05 TMSB15B-207ENST00000598087 947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.96□□□□□ -1.46
TRAPPC9Q96Q05 AL021368.3-201ENST00000607119 578 ntBASIC5.96□□□□□ -1.46
TRAPPC9Q96Q05 RFPL4AP6-201ENST00000616792 846 ntBASIC5.96□□□□□ -1.46
TRAPPC9Q96Q05 AL158062.1-201ENST00000619632 745 ntBASIC5.96□□□□□ -1.46
TRAPPC9Q96Q05 AJ009632.2-203ENST00000634708 1205 ntTSL 5 BASIC5.96□□□□□ -1.46
TRAPPC9Q96Q05 MAP2-205ENST00000392194 5303 ntTSL 1 (best) BASIC5.96□□□□□ -1.46
TRAPPC9Q96Q05 LINC02010-202ENST00000471638 1829 ntTSL 1 (best) BASIC5.96□□□□□ -1.46
TRAPPC9Q96Q05 CD86-203ENST00000393627 1405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.96□□□□□ -1.46
TRAPPC9Q96Q05 AL591135.1-201ENST00000401578 5914 ntBASIC5.96□□□□□ -1.46
TRAPPC9Q96Q05 HHLA2-211ENST00000619531 2548 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC5.96□□□□□ -1.46
TRAPPC9Q96Q05 RAB30-216ENST00000612684 9783 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC5.96□□□□□ -1.46
TRAPPC9Q96Q05 MKKS-202ENST00000399054 2663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.96□□□□□ -1.46
TRAPPC9Q96Q05 ZNF81-202ENST00000338637 7859 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC5.96□□□□□ -1.46
TRAPPC9Q96Q05 DPH5-203ENST00000370109 1316 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC5.96□□□□□ -1.46
TRAPPC9Q96Q05 AC008163.1-201ENST00000636281 1455 ntTSL 5 BASIC5.96□□□□□ -1.46
TRAPPC9Q96Q05 ZNF177-202ENST00000589262 1920 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC5.95□□□□□ -1.46
TRAPPC9Q96Q05 PKIB-207ENST00000392491 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.95□□□□□ -1.46
TRAPPC9Q96Q05 IL21-AS1-201ENST00000417927 3748 ntTSL 1 (best) BASIC5.95□□□□□ -1.46
TRAPPC9Q96Q05 OR10A6-203ENST00000641238 6052 ntAPPRIS P1 BASIC5.95□□□□□ -1.46
TRAPPC9Q96Q05 OR2A12-202ENST00000641592 4163 ntAPPRIS P1 BASIC5.95□□□□□ -1.46
TRAPPC9Q96Q05 MAP3K7-201ENST00000369320 3328 ntTSL 5 BASIC5.95□□□□□ -1.46
TRAPPC9Q96Q05 LYPD6B-201ENST00000280115 1100 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.95□□□□□ -1.46
TRAPPC9Q96Q05 OR4K13-201ENST00000315693 915 ntAPPRIS P1 BASIC5.95□□□□□ -1.46
TRAPPC9Q96Q05 TMEM202-201ENST00000341689 1012 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC5.95□□□□□ -1.46
TRAPPC9Q96Q05 SNORA43.1-201ENST00000364863 140 ntBASIC5.95□□□□□ -1.46
TRAPPC9Q96Q05 LINC00161-201ENST00000412526 870 ntTSL 2 BASIC5.95□□□□□ -1.46
TRAPPC9Q96Q05 AL109610.1-201ENST00000414598 431 ntTSL 3 BASIC5.95□□□□□ -1.46
TRAPPC9Q96Q05 AC107079.1-201ENST00000416509 669 ntTSL 2 BASIC5.95□□□□□ -1.46
TRAPPC9Q96Q05 PTP4A1P1-201ENST00000420539 515 ntBASIC5.95□□□□□ -1.46
TRAPPC9Q96Q05 AL162430.2-201ENST00000422306 435 ntTSL 3 BASIC5.95□□□□□ -1.46
TRAPPC9Q96Q05 AC093084.1-201ENST00000424233 687 ntBASIC5.95□□□□□ -1.46
TRAPPC9Q96Q05 AC130360.1-201ENST00000425489 1117 ntBASIC5.95□□□□□ -1.46
TRAPPC9Q96Q05 AL357832.1-201ENST00000427460 420 ntTSL 3 BASIC5.95□□□□□ -1.46
TRAPPC9Q96Q05 AC023141.3-201ENST00000436698 278 ntBASIC5.95□□□□□ -1.46
TRAPPC9Q96Q05 LINC00380-201ENST00000442478 353 ntTSL 2 BASIC5.95□□□□□ -1.46
TRAPPC9Q96Q05 AC016908.1-201ENST00000442571 1219 ntBASIC5.95□□□□□ -1.46
TRAPPC9Q96Q05 RPL6P30-201ENST00000443382 862 ntBASIC5.95□□□□□ -1.46
TRAPPC9Q96Q05 GAPDHP23-201ENST00000444823 993 ntBASIC5.95□□□□□ -1.46
TRAPPC9Q96Q05 GXYLT1P1-201ENST00000446657 490 ntBASIC5.95□□□□□ -1.46
TRAPPC9Q96Q05 AC002553.3-201ENST00000453002 341 ntBASIC5.95□□□□□ -1.46
TRAPPC9Q96Q05 OR2AF1P-201ENST00000454899 889 ntBASIC5.95□□□□□ -1.46
TRAPPC9Q96Q05 AC008080.2-201ENST00000455149 577 ntTSL 4 BASIC5.95□□□□□ -1.46
TRAPPC9Q96Q05 AC068228.1-201ENST00000461723 211 ntBASIC5.95□□□□□ -1.46
TRAPPC9Q96Q05 AC007003.1-201ENST00000472463 736 ntTSL 1 (best) BASIC5.95□□□□□ -1.46
TRAPPC9Q96Q05 AC098859.2-201ENST00000506232 563 ntTSL 4 BASIC5.95□□□□□ -1.46
TRAPPC9Q96Q05 AC093225.1-201ENST00000506867 1408 ntBASIC5.95□□□□□ -1.46
TRAPPC9Q96Q05 AC116634.1-201ENST00000506926 447 ntTSL 5 BASIC5.95□□□□□ -1.46
TRAPPC9Q96Q05 LINC02196-201ENST00000512838 568 ntTSL 4 BASIC5.95□□□□□ -1.46
TRAPPC9Q96Q05 FTH1P11-201ENST00000517577 551 ntBASIC5.95□□□□□ -1.46
TRAPPC9Q96Q05 AP001208.1-201ENST00000518612 408 ntTSL 3 BASIC5.95□□□□□ -1.46
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 79.7 ms