Protein–RNA interactions for Protein: Q96JM4

LRRIQ1, Leucine-rich repeat and IQ domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,722 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LRRIQ1Q96JM4 LINC02293-202ENST00000548385 358 ntTSL 3 BASIC8.05□□□□□ -1.12
LRRIQ1Q96JM4 AC015845.2-201ENST00000581805 472 ntTSL 2 BASIC8.05□□□□□ -1.12
LRRIQ1Q96JM4 MIR4737-201ENST00000583979 81 ntBASIC8.05□□□□□ -1.12
LRRIQ1Q96JM4 AC005899.1-201ENST00000584125 563 ntTSL 5 BASIC8.05□□□□□ -1.12
LRRIQ1Q96JM4 MIR6133-201ENST00000617057 108 ntBASIC8.05□□□□□ -1.12
LRRIQ1Q96JM4 MIR7641-1-201ENST00000627518 61 ntBASIC8.05□□□□□ -1.12
LRRIQ1Q96JM4 AC138907.8-201ENST00000623981 2256 ntBASIC8.05□□□□□ -1.12
LRRIQ1Q96JM4 CLCA3P-201ENST00000284054 2407 ntTSL 5 BASIC8.05□□□□□ -1.12
LRRIQ1Q96JM4 CFAP57-208ENST00000610710 4162 ntTSL 5 BASIC8.05□□□□□ -1.12
LRRIQ1Q96JM4 ZNF365-204ENST00000395251 2695 ntTSL 1 (best) BASIC8.05□□□□□ -1.12
LRRIQ1Q96JM4 IGF2BP2-AS1-202ENST00000456447 1531 ntTSL 1 (best) BASIC8.05□□□□□ -1.12
LRRIQ1Q96JM4 LINC01152-201ENST00000472655 3578 ntTSL 1 (best) BASIC8.05□□□□□ -1.12
LRRIQ1Q96JM4 ALS2-201ENST00000264276 6644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.04□□□□□ -1.12
LRRIQ1Q96JM4 MOCS2-203ENST00000450852 1337 ntTSL 1 (best) BASIC8.04□□□□□ -1.12
LRRIQ1Q96JM4 CPNE3-203ENST00000517490 4865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.04□□□□□ -1.12
LRRIQ1Q96JM4 UTY-205ENST00000382896 6661 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.04□□□□□ -1.12
LRRIQ1Q96JM4 UTY-211ENST00000540140 6652 ntTSL 1 (best) BASIC8.04□□□□□ -1.12
LRRIQ1Q96JM4 DTNA-204ENST00000348997 4518 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.04□□□□□ -1.12
LRRIQ1Q96JM4 DMD-222ENST00000474231 5209 ntTSL 5 BASIC8.04□□□□□ -1.12
LRRIQ1Q96JM4 OR9G4-201ENST00000302957 984 ntBASIC8.04□□□□□ -1.12
LRRIQ1Q96JM4 ELSPBP1-201ENST00000339841 1052 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC8.04□□□□□ -1.12
LRRIQ1Q96JM4 AL590399.4-201ENST00000436561 601 ntBASIC8.04□□□□□ -1.12
LRRIQ1Q96JM4 AC092941.2-201ENST00000444379 1008 ntTSL 3 BASIC8.04□□□□□ -1.12
LRRIQ1Q96JM4 RPS29P33-201ENST00000456717 146 ntBASIC8.04□□□□□ -1.12
LRRIQ1Q96JM4 SPRY4-AS1-205ENST00000514303 152 ntTSL 3 BASIC8.04□□□□□ -1.12
LRRIQ1Q96JM4 AC005000.1-201ENST00000536192 288 ntBASIC8.04□□□□□ -1.12
LRRIQ1Q96JM4 AC005856.1-201ENST00000585921 286 ntTSL 3 BASIC8.04□□□□□ -1.12
LRRIQ1Q96JM4 MIR4500HG-205ENST00000606590 579 ntTSL 4 BASIC8.04□□□□□ -1.12
LRRIQ1Q96JM4 AC010632.3-201ENST00000611377 369 ntBASIC8.04□□□□□ -1.12
LRRIQ1Q96JM4 AJ009632.2-207ENST00000634659 527 ntTSL 5 BASIC8.04□□□□□ -1.12
LRRIQ1Q96JM4 NUP214-202ENST00000411637 7538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.04□□□□□ -1.12
LRRIQ1Q96JM4 RWDD2A-201ENST00000369724 3744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.04□□□□□ -1.12
LRRIQ1Q96JM4 OR10G7-202ENST00000641585 3449 ntAPPRIS P1 BASIC8.04□□□□□ -1.12
LRRIQ1Q96JM4 REV3L-203ENST00000368805 10461 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.04□□□□□ -1.12
LRRIQ1Q96JM4 ASTE1-208ENST00000514044 2504 ntTSL 1 (best) BASIC8.04□□□□□ -1.12
LRRIQ1Q96JM4 CPEB4-201ENST00000265085 9483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.04□□□□□ -1.12
LRRIQ1Q96JM4 LMO3-225ENST00000541295 3498 ntTSL 2 BASIC8.04□□□□□ -1.12
LRRIQ1Q96JM4 SNX10-202ENST00000396376 2491 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC8.04□□□□□ -1.12
LRRIQ1Q96JM4 AC104581.5-201ENST00000624171 7141 ntBASIC8.04□□□□□ -1.12
LRRIQ1Q96JM4 AL033384.1-202ENST00000431554 3104 ntTSL 1 (best) BASIC8.04□□□□□ -1.12
LRRIQ1Q96JM4 AC091045.1-201ENST00000561460 2277 ntTSL 5 BASIC8.04□□□□□ -1.12
LRRIQ1Q96JM4 KIAA1958-203ENST00000536272 7650 ntTSL 1 (best) BASIC8.04□□□□□ -1.12
LRRIQ1Q96JM4 GAPDHP15-201ENST00000398586 975 ntBASIC8.03□□□□□ -1.12
LRRIQ1Q96JM4 LINC01690-201ENST00000424837 576 ntTSL 2 BASIC8.03□□□□□ -1.12
LRRIQ1Q96JM4 AF230666.1-201ENST00000429151 786 ntTSL 2 BASIC8.03□□□□□ -1.12
LRRIQ1Q96JM4 RPL5P25-201ENST00000441148 775 ntBASIC8.03□□□□□ -1.12
LRRIQ1Q96JM4 AC084048.1-201ENST00000505494 640 ntTSL 3 BASIC8.03□□□□□ -1.12
LRRIQ1Q96JM4 AC039056.1-201ENST00000552704 467 ntTSL 3 BASIC8.03□□□□□ -1.12
LRRIQ1Q96JM4 AC026464.3-201ENST00000563634 564 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC8.03□□□□□ -1.12
LRRIQ1Q96JM4 BNIP3P35-201ENST00000604530 490 ntBASIC8.03□□□□□ -1.12
LRRIQ1Q96JM4 ZNRD1ASP-221ENST00000637794 1074 ntBASIC8.03□□□□□ -1.12
LRRIQ1Q96JM4 SELE-205ENST00000367777 3576 ntTSL 5 BASIC8.03□□□□□ -1.12
LRRIQ1Q96JM4 BX284613.1-201ENST00000452221 1641 ntBASIC8.03□□□□□ -1.12
LRRIQ1Q96JM4 EPG5-201ENST00000282041 12633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.03□□□□□ -1.12
LRRIQ1Q96JM4 MFSD4BP1-201ENST00000513330 1552 ntBASIC8.03□□□□□ -1.12
LRRIQ1Q96JM4 SELE-204ENST00000367776 3576 ntTSL 5 BASIC8.03□□□□□ -1.12
LRRIQ1Q96JM4 TNPO1-201ENST00000337273 11183 ntTSL 1 (best) BASIC8.03□□□□□ -1.12
LRRIQ1Q96JM4 NEDD9-202ENST00000379446 4536 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.03□□□□□ -1.12
LRRIQ1Q96JM4 KLHL13-202ENST00000371876 5331 ntTSL 1 (best) BASIC8.03□□□□□ -1.12
LRRIQ1Q96JM4 KALRN-204ENST00000360013 10806 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC8.03□□□□□ -1.12
LRRIQ1Q96JM4 AC006210.2-201ENST00000367074 1545 ntBASIC8.03□□□□□ -1.12
LRRIQ1Q96JM4 HMGB3P7-201ENST00000400214 611 ntBASIC8.03□□□□□ -1.12
LRRIQ1Q96JM4 GTF2IP5-201ENST00000414608 731 ntBASIC8.03□□□□□ -1.12
LRRIQ1Q96JM4 OR2AM1P-201ENST00000422137 422 ntBASIC8.03□□□□□ -1.12
LRRIQ1Q96JM4 AL513533.1-201ENST00000453728 415 ntBASIC8.03□□□□□ -1.12
LRRIQ1Q96JM4 RN7SKP248-201ENST00000516278 305 ntBASIC8.03□□□□□ -1.12
LRRIQ1Q96JM4 AP001804.1-201ENST00000526868 919 ntBASIC8.03□□□□□ -1.12
LRRIQ1Q96JM4 AP002765.2-201ENST00000532961 666 ntTSL 3 BASIC8.03□□□□□ -1.12
LRRIQ1Q96JM4 LINC02408-202ENST00000538573 559 ntTSL 4 BASIC8.03□□□□□ -1.12
LRRIQ1Q96JM4 DIAPH2-AS1-204ENST00000579945 974 ntTSL 1 (best) BASIC8.03□□□□□ -1.12
LRRIQ1Q96JM4 AC011626.1-201ENST00000604710 562 ntBASIC8.03□□□□□ -1.12
LRRIQ1Q96JM4 EIF3FP1-201ENST00000613970 806 ntBASIC8.03□□□□□ -1.12
LRRIQ1Q96JM4 GPR65-201ENST00000267549 4522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.03□□□□□ -1.12
LRRIQ1Q96JM4 ZNF229-203ENST00000613197 4835 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.03□□□□□ -1.12
LRRIQ1Q96JM4 LINC01478-201ENST00000587877 2068 ntTSL 1 (best) BASIC8.03□□□□□ -1.12
LRRIQ1Q96JM4 CNTNAP2-203ENST00000463592 6076 ntTSL 1 (best) BASIC8.02□□□□□ -1.12
LRRIQ1Q96JM4 AKAP13-203ENST00000394518 13215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.02□□□□□ -1.12
LRRIQ1Q96JM4 BDNF-AS-202ENST00000499568 2039 ntTSL 1 (best) BASIC8.02□□□□□ -1.13
LRRIQ1Q96JM4 TMEM257-201ENST00000408967 2441 ntAPPRIS P1 BASIC8.02□□□□□ -1.13
LRRIQ1Q96JM4 KIAA1217-202ENST00000376451 7383 ntTSL 1 (best) BASIC8.02□□□□□ -1.13
LRRIQ1Q96JM4 BANF2-202ENST00000377805 444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.02□□□□□ -1.13
LRRIQ1Q96JM4 NUDT19P3-201ENST00000404698 555 ntBASIC8.02□□□□□ -1.13
LRRIQ1Q96JM4 RNA5SP113-201ENST00000410486 84 ntBASIC8.02□□□□□ -1.13
LRRIQ1Q96JM4 AC092920.1-201ENST00000428516 678 ntTSL 5 BASIC8.02□□□□□ -1.13
LRRIQ1Q96JM4 AC099670.2-201ENST00000435130 321 ntBASIC8.02□□□□□ -1.13
LRRIQ1Q96JM4 snoU13.29-201ENST00000459370 104 ntBASIC8.02□□□□□ -1.13
LRRIQ1Q96JM4 RPS17P2-201ENST00000461663 408 ntBASIC8.02□□□□□ -1.13
LRRIQ1Q96JM4 AC010350.1-201ENST00000504908 231 ntBASIC8.02□□□□□ -1.13
LRRIQ1Q96JM4 AC090809.1-201ENST00000524132 570 ntTSL 4 BASIC8.02□□□□□ -1.13
LRRIQ1Q96JM4 AC105254.2-201ENST00000603636 436 ntBASIC8.02□□□□□ -1.13
LRRIQ1Q96JM4 Metazoa_SRP.55-201ENST00000618452 275 ntBASIC8.02□□□□□ -1.13
LRRIQ1Q96JM4 AP000346.3-201ENST00000622821 210 ntBASIC8.02□□□□□ -1.13
LRRIQ1Q96JM4 SNHG5-214ENST00000623001 598 ntTSL 2 BASIC8.02□□□□□ -1.13
LRRIQ1Q96JM4 SCN8A-201ENST00000354534 11556 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.02□□□□□ -1.13
LRRIQ1Q96JM4 RBMS2-201ENST00000262031 8382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.02□□□□□ -1.13
LRRIQ1Q96JM4 SLCO1A2-212ENST00000458504 2008 ntTSL 2 BASIC8.02□□□□□ -1.13
LRRIQ1Q96JM4 SLITRK4-202ENST00000356928 3074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC8.02□□□□□ -1.13
LRRIQ1Q96JM4 USP26-203ENST00000511190 3665 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC8.02□□□□□ -1.13
LRRIQ1Q96JM4 LINC02523-201ENST00000423208 2963 ntTSL 1 (best) BASIC8.01□□□□□ -1.13
LRRIQ1Q96JM4 HCG18-239ENST00000454129 4433 ntTSL 4 BASIC8.01□□□□□ -1.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 83.3 ms