Protein–RNA interactions for Protein: Q8NEK5

ZNF548, Zinc finger protein 548, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 533 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZNF548Q8NEK5 AL121839.2-201ENST00000565058 6943 ntBASIC5.78□□□□□ -1.48
ZNF548Q8NEK5 PCLO-201ENST00000333891 20329 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.78□□□□□ -1.48
ZNF548Q8NEK5 SLFN12-201ENST00000304905 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.78□□□□□ -1.48
ZNF548Q8NEK5 AFF2-201ENST00000286437 12280 ntTSL 2 BASIC5.78□□□□□ -1.48
ZNF548Q8NEK5 ZNF436-201ENST00000314011 4071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.78□□□□□ -1.48
ZNF548Q8NEK5 POGZ-213ENST00000491586 4130 ntTSL 5 BASIC5.77□□□□□ -1.49
ZNF548Q8NEK5 AC025470.1-201ENST00000510053 2032 ntBASIC5.77□□□□□ -1.49
ZNF548Q8NEK5 ZNF300P1-202ENST00000520773 3115 ntTSL 5 BASIC5.77□□□□□ -1.49
ZNF548Q8NEK5 AC015799.1-201ENST00000622996 3122 ntBASIC5.77□□□□□ -1.49
ZNF548Q8NEK5 TTC37-201ENST00000358746 5706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.77□□□□□ -1.49
ZNF548Q8NEK5 CCR2-201ENST00000292301 2671 ntTSL 5 BASIC5.77□□□□□ -1.49
ZNF548Q8NEK5 RNASEL-202ENST00000539397 4046 ntTSL 2 BASIC5.77□□□□□ -1.49
ZNF548Q8NEK5 LINC00698-203ENST00000468072 1957 ntTSL 1 (best) BASIC5.77□□□□□ -1.49
ZNF548Q8NEK5 AP4S1-212ENST00000622409 4113 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC5.77□□□□□ -1.49
ZNF548Q8NEK5 CRNDE-212ENST00000613942 2601 ntTSL 5 BASIC5.77□□□□□ -1.49
ZNF548Q8NEK5 TOR1AIP2-206ENST00000609928 4364 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.77□□□□□ -1.49
ZNF548Q8NEK5 RNA5SP211-201ENST00000365516 117 ntBASIC5.77□□□□□ -1.49
ZNF548Q8NEK5 OR14A2-201ENST00000366485 945 ntAPPRIS P1 BASIC5.77□□□□□ -1.49
ZNF548Q8NEK5 LINC01620-202ENST00000372910 649 ntTSL 5 BASIC5.77□□□□□ -1.49
ZNF548Q8NEK5 G6PC2-202ENST00000375363 1214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.77□□□□□ -1.49
ZNF548Q8NEK5 RNU11-201ENST00000387069 134 ntBASIC5.77□□□□□ -1.49
ZNF548Q8NEK5 TRAJ25-201ENST00000390512 60 ntAPPRIS P1 BASIC5.77□□□□□ -1.49
ZNF548Q8NEK5 AL391361.1-201ENST00000405580 489 ntBASIC5.77□□□□□ -1.49
ZNF548Q8NEK5 OR3A2-201ENST00000408891 1076 ntBASIC5.77□□□□□ -1.49
ZNF548Q8NEK5 RN7SKP29-201ENST00000410957 272 ntBASIC5.77□□□□□ -1.49
ZNF548Q8NEK5 AL031599.1-201ENST00000432694 808 ntTSL 3 BASIC5.77□□□□□ -1.49
ZNF548Q8NEK5 AC072062.1-204ENST00000437897 1132 ntTSL 5 BASIC5.77□□□□□ -1.49
ZNF548Q8NEK5 AC008080.4-202ENST00000440034 1005 ntTSL 3 BASIC5.77□□□□□ -1.49
ZNF548Q8NEK5 AL442224.1-201ENST00000443771 391 ntTSL 2 BASIC5.77□□□□□ -1.49
ZNF548Q8NEK5 AC009963.4-201ENST00000448535 339 ntBASIC5.77□□□□□ -1.49
ZNF548Q8NEK5 SDC4P-201ENST00000453285 601 ntBASIC5.77□□□□□ -1.49
ZNF548Q8NEK5 AC004692.2-203ENST00000458590 497 ntTSL 4 BASIC5.77□□□□□ -1.49
ZNF548Q8NEK5 AC099521.1-201ENST00000482557 334 ntBASIC5.77□□□□□ -1.49
ZNF548Q8NEK5 RPL23AP40-201ENST00000487630 390 ntBASIC5.77□□□□□ -1.49
ZNF548Q8NEK5 RN7SL629P-201ENST00000489622 285 ntBASIC5.77□□□□□ -1.49
ZNF548Q8NEK5 RN7SL466P-201ENST00000497546 295 ntBASIC5.77□□□□□ -1.49
ZNF548Q8NEK5 CCDC11P1-201ENST00000503137 1162 ntBASIC5.77□□□□□ -1.49
ZNF548Q8NEK5 ST13P12-201ENST00000508958 1094 ntBASIC5.77□□□□□ -1.49
ZNF548Q8NEK5 AC126768.1-201ENST00000511698 490 ntTSL 3 BASIC5.77□□□□□ -1.49
ZNF548Q8NEK5 AC104997.1-201ENST00000519761 717 ntBASIC5.77□□□□□ -1.49
ZNF548Q8NEK5 AC079209.1-202ENST00000521953 522 ntTSL 3 BASIC5.77□□□□□ -1.49
ZNF548Q8NEK5 CD44-AS1-201ENST00000528869 587 ntTSL 4 BASIC5.77□□□□□ -1.49
ZNF548Q8NEK5 AC108471.2-203ENST00000532680 517 ntTSL 5 BASIC5.77□□□□□ -1.49
ZNF548Q8NEK5 TEX49-202ENST00000548380 573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.77□□□□□ -1.49
ZNF548Q8NEK5 AC092078.2-201ENST00000560900 581 ntTSL 4 BASIC5.77□□□□□ -1.49
ZNF548Q8NEK5 MIR4489-201ENST00000578869 62 ntBASIC5.77□□□□□ -1.49
ZNF548Q8NEK5 NPM1P45-201ENST00000583151 559 ntBASIC5.77□□□□□ -1.49
ZNF548Q8NEK5 BNIP3P38-201ENST00000601117 544 ntBASIC5.77□□□□□ -1.49
ZNF548Q8NEK5 AC133794.1-201ENST00000602731 914 ntBASIC5.77□□□□□ -1.49
ZNF548Q8NEK5 AL360012.1-201ENST00000602813 131 ntBASIC5.77□□□□□ -1.49
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ZNF548Q8NEK5 ABI1P1-201ENST00000603375 1120 ntBASIC5.77□□□□□ -1.49
ZNF548Q8NEK5 AL589674.2-201ENST00000604304 337 ntBASIC5.77□□□□□ -1.49
ZNF548Q8NEK5 LINC01050-201ENST00000604485 760 ntTSL 3 BASIC5.77□□□□□ -1.49
ZNF548Q8NEK5 AC013244.3-201ENST00000605614 388 ntBASIC5.77□□□□□ -1.49
ZNF548Q8NEK5 AL356608.1-201ENST00000610034 820 ntBASIC5.77□□□□□ -1.49
ZNF548Q8NEK5 CR589904.2-201ENST00000612533 440 ntBASIC5.77□□□□□ -1.49
ZNF548Q8NEK5 AP000484.1-201ENST00000620067 1252 ntBASIC5.77□□□□□ -1.49
ZNF548Q8NEK5 AL138955.1-201ENST00000622881 1040 ntBASIC5.77□□□□□ -1.49
ZNF548Q8NEK5 ADAMTS9-AS1-210ENST00000625328 699 ntTSL 5 BASIC5.77□□□□□ -1.49
ZNF548Q8NEK5 AP001043.1-201ENST00000626259 773 ntTSL 5 BASIC5.77□□□□□ -1.49
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ZNF548Q8NEK5 HIF1AN-201ENST00000299163 13011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.77□□□□□ -1.49
ZNF548Q8NEK5 TTI1-203ENST00000449821 3791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.77□□□□□ -1.49
ZNF548Q8NEK5 MYBPC1-214ENST00000549145 4031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.77□□□□□ -1.49
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ZNF548Q8NEK5 TTF2-201ENST00000369466 9462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.77□□□□□ -1.49
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ZNF548Q8NEK5 AL049634.1-201ENST00000453770 1720 ntBASIC5.77□□□□□ -1.49
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ZNF548Q8NEK5 MOSPD2-201ENST00000380492 4163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.76□□□□□ -1.49
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ZNF548Q8NEK5 AL050305.1-201ENST00000399993 1230 ntBASIC5.76□□□□□ -1.49
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ZNF548Q8NEK5 MTND4LP7-201ENST00000431728 294 ntBASIC5.76□□□□□ -1.49
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ZNF548Q8NEK5 AC092106.1-201ENST00000444291 373 ntBASIC5.76□□□□□ -1.49
ZNF548Q8NEK5 AL353804.1-201ENST00000444482 451 ntTSL 5 BASIC5.76□□□□□ -1.49
ZNF548Q8NEK5 CYP3A43-210ENST00000444905 733 ntTSL 5 BASIC5.76□□□□□ -1.49
ZNF548Q8NEK5 AC073909.1-201ENST00000447112 999 ntBASIC5.76□□□□□ -1.49
ZNF548Q8NEK5 OSTCP1-201ENST00000455507 450 ntBASIC5.76□□□□□ -1.49
ZNF548Q8NEK5 AL356270.1-201ENST00000456587 522 ntTSL 3 BASIC5.76□□□□□ -1.49
ZNF548Q8NEK5 MTND2P30-201ENST00000456663 382 ntBASIC5.76□□□□□ -1.49
ZNF548Q8NEK5 AC108751.3-201ENST00000461814 1020 ntBASIC5.76□□□□□ -1.49
ZNF548Q8NEK5 RPS23P6-201ENST00000466136 431 ntBASIC5.76□□□□□ -1.49
ZNF548Q8NEK5 AC112184.1-201ENST00000505179 312 ntBASIC5.76□□□□□ -1.49
ZNF548Q8NEK5 AC138866.2-201ENST00000508650 584 ntBASIC5.76□□□□□ -1.49
ZNF548Q8NEK5 AC104350.1-201ENST00000518750 877 ntTSL 3 BASIC5.76□□□□□ -1.49
ZNF548Q8NEK5 IGLV3-30-201ENST00000524362 298 ntBASIC5.76□□□□□ -1.49
ZNF548Q8NEK5 BMPR1APS2-201ENST00000527904 1012 ntBASIC5.76□□□□□ -1.49
ZNF548Q8NEK5 OR4A42P-201ENST00000531397 938 ntBASIC5.76□□□□□ -1.49
ZNF548Q8NEK5 GPRC5D-AS1-208ENST00000545914 566 ntTSL 3 BASIC5.76□□□□□ -1.49
ZNF548Q8NEK5 MGAT4C-206ENST00000552435 550 ntTSL 4 BASIC5.76□□□□□ -1.49
ZNF548Q8NEK5 AC105339.2-201ENST00000558342 1091 ntTSL 3 BASIC5.76□□□□□ -1.49
ZNF548Q8NEK5 PWRN3-201ENST00000566797 849 ntTSL 5 BASIC5.76□□□□□ -1.49
ZNF548Q8NEK5 GARSP1-201ENST00000570895 719 ntBASIC5.76□□□□□ -1.49
ZNF548Q8NEK5 U95743.1-201ENST00000573369 1001 ntTSL 5 BASIC5.76□□□□□ -1.49
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