Protein–RNA interactions for Protein: Q8N9B8

RASGEF1A, Ras-GEF domain-containing family member 1A, humanhuman

Predictions only

Length 481 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RASGEF1AQ8N9B8 CDC27P2-201ENST00000425026 1922 ntBASIC5.56□□□□□ -1.52
RASGEF1AQ8N9B8 PATL1-201ENST00000300146 4072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.56□□□□□ -1.52
RASGEF1AQ8N9B8 MEIOB-201ENST00000325962 1694 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.56□□□□□ -1.52
RASGEF1AQ8N9B8 AC138409.2-201ENST00000514048 5001 ntTSL 5 BASIC5.56□□□□□ -1.52
RASGEF1AQ8N9B8 AC087667.1-201ENST00000500180 1422 ntTSL 1 (best) BASIC5.56□□□□□ -1.52
RASGEF1AQ8N9B8 KCNJ16-202ENST00000392670 4009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.56□□□□□ -1.52
RASGEF1AQ8N9B8 DCN-202ENST00000393155 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.56□□□□□ -1.52
RASGEF1AQ8N9B8 IFIT2-203ENST00000638108 3703 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC5.56□□□□□ -1.52
RASGEF1AQ8N9B8 GPX8-201ENST00000296734 3245 ntTSL 1 (best) BASIC5.55□□□□□ -1.52
RASGEF1AQ8N9B8 ZNF780A-205ENST00000594395 2044 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC5.55□□□□□ -1.52
RASGEF1AQ8N9B8 TCF4-268ENST00000629387 3789 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC5.55□□□□□ -1.52
RASGEF1AQ8N9B8 GTPBP10-201ENST00000222511 7531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.55□□□□□ -1.52
RASGEF1AQ8N9B8 BMPR2-204ENST00000638587 3443 ntTSL 5 BASIC5.55□□□□□ -1.52
RASGEF1AQ8N9B8 RPL39P5-201ENST00000273411 449 ntTSL 1 (best) BASIC5.55□□□□□ -1.52
RASGEF1AQ8N9B8 HBG1-201ENST00000330597 808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.55□□□□□ -1.52
RASGEF1AQ8N9B8 GABRG3-201ENST00000333743 1235 ntTSL 5 BASIC5.55□□□□□ -1.52
RASGEF1AQ8N9B8 U3.10-201ENST00000364459 214 ntBASIC5.55□□□□□ -1.52
RASGEF1AQ8N9B8 RN7SKP81-201ENST00000365603 331 ntBASIC5.55□□□□□ -1.52
RASGEF1AQ8N9B8 AC005042.1-201ENST00000393397 800 ntBASIC5.55□□□□□ -1.52
RASGEF1AQ8N9B8 AC096644.3-201ENST00000416788 338 ntBASIC5.55□□□□□ -1.52
RASGEF1AQ8N9B8 AL450996.1-201ENST00000445574 1202 ntBASIC5.55□□□□□ -1.52
RASGEF1AQ8N9B8 SRGAP3-AS4-201ENST00000449023 377 ntTSL 2 BASIC5.55□□□□□ -1.52
RASGEF1AQ8N9B8 AC073130.1-202ENST00000454897 587 ntTSL 2 BASIC5.55□□□□□ -1.52
RASGEF1AQ8N9B8 AC091544.1-201ENST00000484702 348 ntBASIC5.55□□□□□ -1.52
RASGEF1AQ8N9B8 AC012123.2-201ENST00000485809 248 ntBASIC5.55□□□□□ -1.52
RASGEF1AQ8N9B8 AC093001.1-201ENST00000489011 551 ntTSL 4 BASIC5.55□□□□□ -1.52
RASGEF1AQ8N9B8 TIFA-202ENST00000500655 769 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC5.55□□□□□ -1.52
RASGEF1AQ8N9B8 PMP2-202ENST00000519260 1264 ntTSL 1 (best) BASIC5.55□□□□□ -1.52
RASGEF1AQ8N9B8 AC113208.4-201ENST00000563568 206 ntTSL 3 BASIC5.55□□□□□ -1.52
RASGEF1AQ8N9B8 TTN-AS1-219ENST00000586707 834 ntTSL 5 BASIC5.55□□□□□ -1.52
RASGEF1AQ8N9B8 ZNF667-AS1-207ENST00000592146 668 ntTSL 5 BASIC5.55□□□□□ -1.52
RASGEF1AQ8N9B8 AC010894.2-203ENST00000606406 499 ntTSL 3 BASIC5.55□□□□□ -1.52
RASGEF1AQ8N9B8 OR7M1P-201ENST00000608946 533 ntBASIC5.55□□□□□ -1.52
RASGEF1AQ8N9B8 SNHG5-214ENST00000623001 598 ntTSL 2 BASIC5.55□□□□□ -1.52
RASGEF1AQ8N9B8 AC008691.1-209ENST00000642094 814 ntBASIC5.55□□□□□ -1.52
RASGEF1AQ8N9B8 ADAM29-202ENST00000404450 3171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.55□□□□□ -1.52
RASGEF1AQ8N9B8 LINC01091-203ENST00000514823 5262 ntTSL 1 (best) BASIC5.55□□□□□ -1.52
RASGEF1AQ8N9B8 SIAH1-202ENST00000380006 3352 ntAPPRIS P3 BASIC5.55□□□□□ -1.52
RASGEF1AQ8N9B8 IPCEF1-202ENST00000367220 1658 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC5.55□□□□□ -1.52
RASGEF1AQ8N9B8 UGT2A2-202ENST00000604629 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.55□□□□□ -1.52
RASGEF1AQ8N9B8 ZNF347-202ENST00000452676 4553 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC5.55□□□□□ -1.52
RASGEF1AQ8N9B8 ESRRG-224ENST00000616180 5194 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.55□□□□□ -1.52
RASGEF1AQ8N9B8 PPP1R9A-206ENST00000433360 5369 ntTSL 1 (best) BASIC5.55□□□□□ -1.52
RASGEF1AQ8N9B8 WDR17-201ENST00000280190 4705 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.55□□□□□ -1.52
RASGEF1AQ8N9B8 USP15-201ENST00000280377 4748 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC5.55□□□□□ -1.52
RASGEF1AQ8N9B8 TRPM3-209ENST00000377110 12258 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC5.55□□□□□ -1.52
RASGEF1AQ8N9B8 NBPF19-201ENST00000369227 3670 ntTSL 5 BASIC5.55□□□□□ -1.52
RASGEF1AQ8N9B8 NBPF20-203ENST00000594479 3670 ntTSL 5 BASIC5.55□□□□□ -1.52
RASGEF1AQ8N9B8 NBPF14-210ENST00000621066 3670 ntTSL 5 BASIC5.55□□□□□ -1.52
RASGEF1AQ8N9B8 ADH4-207ENST00000505590 1400 ntTSL 5 BASIC5.55□□□□□ -1.52
RASGEF1AQ8N9B8 DYNAP-201ENST00000321600 2027 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC5.55□□□□□ -1.52
RASGEF1AQ8N9B8 UGP2-203ENST00000445915 1955 ntTSL 2 BASIC5.55□□□□□ -1.52
RASGEF1AQ8N9B8 FAM19A2-215ENST00000551619 2718 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.54□□□□□ -1.52
RASGEF1AQ8N9B8 LINC01630-202ENST00000578152 3188 ntTSL 2 BASIC5.54□□□□□ -1.52
RASGEF1AQ8N9B8 ZNF420-202ENST00000337995 3535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.54□□□□□ -1.52
RASGEF1AQ8N9B8 WDR64-201ENST00000366552 4371 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.54□□□□□ -1.52
RASGEF1AQ8N9B8 DYDC1-202ENST00000372204 750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.54□□□□□ -1.52
RASGEF1AQ8N9B8 SSX3-202ENST00000376893 800 ntTSL 2 BASIC5.54□□□□□ -1.52
RASGEF1AQ8N9B8 DHFRP5-201ENST00000406944 564 ntBASIC5.54□□□□□ -1.52
RASGEF1AQ8N9B8 RNU2-22P-201ENST00000411266 212 ntBASIC5.54□□□□□ -1.52
RASGEF1AQ8N9B8 AL390243.1-201ENST00000422038 708 ntTSL 2 BASIC5.54□□□□□ -1.52
RASGEF1AQ8N9B8 AL133173.1-201ENST00000423458 397 ntBASIC5.54□□□□□ -1.52
RASGEF1AQ8N9B8 MRPS21P2-201ENST00000424704 264 ntBASIC5.54□□□□□ -1.52
RASGEF1AQ8N9B8 AC015923.1-201ENST00000435892 305 ntTSL 2 BASIC5.54□□□□□ -1.52
RASGEF1AQ8N9B8 LINC02094-201ENST00000437646 520 ntTSL 2 BASIC5.54□□□□□ -1.52
RASGEF1AQ8N9B8 AL391987.1-201ENST00000441025 200 ntBASIC5.54□□□□□ -1.52
RASGEF1AQ8N9B8 AC073909.1-201ENST00000447112 999 ntBASIC5.54□□□□□ -1.52
RASGEF1AQ8N9B8 AL450023.1-201ENST00000450868 751 ntBASIC5.54□□□□□ -1.52
RASGEF1AQ8N9B8 AC023141.9-201ENST00000458734 412 ntBASIC5.54□□□□□ -1.52
RASGEF1AQ8N9B8 THOC7-AS1-201ENST00000468961 673 ntTSL 2 BASIC5.54□□□□□ -1.52
RASGEF1AQ8N9B8 LINC02271-202ENST00000506379 596 ntTSL 4 BASIC5.54□□□□□ -1.52
RASGEF1AQ8N9B8 AC106732.1-201ENST00000512458 550 ntTSL 4 BASIC5.54□□□□□ -1.52
RASGEF1AQ8N9B8 AC026616.1-201ENST00000523157 525 ntBASIC5.54□□□□□ -1.52
RASGEF1AQ8N9B8 AP003086.3-201ENST00000527030 365 ntTSL 3 BASIC5.54□□□□□ -1.52
RASGEF1AQ8N9B8 SLC48A1-205ENST00000547002 751 ntTSL 3 BASIC5.54□□□□□ -1.52
RASGEF1AQ8N9B8 AC022404.1-201ENST00000555320 273 ntBASIC5.54□□□□□ -1.52
RASGEF1AQ8N9B8 AC026992.1-201ENST00000558269 571 ntTSL 2 BASIC5.54□□□□□ -1.52
RASGEF1AQ8N9B8 AP000897.2-201ENST00000579509 1057 ntTSL 3 BASIC5.54□□□□□ -1.52
RASGEF1AQ8N9B8 SNORD95-201ENST00000579879 68 ntBASIC5.54□□□□□ -1.52
RASGEF1AQ8N9B8 PIK3C3-207ENST00000587402 452 ntTSL 3 BASIC5.54□□□□□ -1.52
RASGEF1AQ8N9B8 FO393422.1-201ENST00000603908 708 ntBASIC5.54□□□□□ -1.52
RASGEF1AQ8N9B8 FAM49B-230ENST00000639004 837 ntTSL 5 BASIC5.54□□□□□ -1.52
RASGEF1AQ8N9B8 LYVE1-201ENST00000256178 3273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.54□□□□□ -1.52
RASGEF1AQ8N9B8 ZNF440-201ENST00000304060 4189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.54□□□□□ -1.52
RASGEF1AQ8N9B8 LINC02401-201ENST00000550185 3059 ntTSL 1 (best) BASIC5.54□□□□□ -1.52
RASGEF1AQ8N9B8 MYBPC1-216ENST00000550270 3426 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.54□□□□□ -1.52
RASGEF1AQ8N9B8 FRAS1-207ENST00000512123 15624 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.54□□□□□ -1.52
RASGEF1AQ8N9B8 ADAMDEC1-201ENST00000256412 2348 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.54□□□□□ -1.52
RASGEF1AQ8N9B8 FAM72B-201ENST00000355228 1773 ntTSL 1 (best) BASIC5.54□□□□□ -1.52
RASGEF1AQ8N9B8 ZNF615-213ENST00000602063 4094 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC5.54□□□□□ -1.52
RASGEF1AQ8N9B8 AC068870.1-201ENST00000563737 2455 ntBASIC5.54□□□□□ -1.52
RASGEF1AQ8N9B8 CSMD1-215ENST00000537824 13512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.54□□□□□ -1.52
RASGEF1AQ8N9B8 AC011604.2-201ENST00000381541 2268 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC5.54□□□□□ -1.52
RASGEF1AQ8N9B8 ZNF343-207ENST00000612935 3675 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.54□□□□□ -1.52
RASGEF1AQ8N9B8 KMO-202ENST00000366557 4888 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.54□□□□□ -1.52
RASGEF1AQ8N9B8 OPRM1-219ENST00000522555 2440 ntTSL 1 (best) BASIC5.54□□□□□ -1.52
RASGEF1AQ8N9B8 SLC10A7-202ENST00000394059 1730 ntTSL 1 (best) BASIC5.54□□□□□ -1.52
RASGEF1AQ8N9B8 AC093671.1-201ENST00000624981 2929 ntBASIC5.54□□□□□ -1.52
RASGEF1AQ8N9B8 EEF1A1P33-201ENST00000554413 1362 ntBASIC5.54□□□□□ -1.52
RASGEF1AQ8N9B8 AC005261.6-201ENST00000623072 1387 ntBASIC5.54□□□□□ -1.52
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 89.9 ms