Protein–RNA interactions for Protein: Q16787

LAMA3, Laminin subunit alpha-3, humanhuman

Predictions only

Length 3,333 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LAMA3Q16787 C15orf41-205ENST00000563167 772 ntTSL 3 BASIC5.52□□□□□ -1.53
LAMA3Q16787 UBL5-207ENST00000590068 390 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.52□□□□□ -1.53
LAMA3Q16787 AC006115.2-201ENST00000596823 202 ntBASIC5.52□□□□□ -1.53
LAMA3Q16787 AC097495.1-201ENST00000637675 546 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.52□□□□□ -1.53
LAMA3Q16787 DNAH7-202ENST00000409063 1845 ntTSL 1 (best) BASIC5.52□□□□□ -1.53
LAMA3Q16787 AC032011.1-201ENST00000611703 1549 ntBASIC5.52□□□□□ -1.53
LAMA3Q16787 PTPRT-204ENST00000373190 12559 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.52□□□□□ -1.53
LAMA3Q16787 OGT-201ENST00000373701 3310 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC5.52□□□□□ -1.53
LAMA3Q16787 SMARCA2-206ENST00000382185 1584 ntTSL 2 BASIC5.52□□□□□ -1.53
LAMA3Q16787 LRRC37A3-204ENST00000400877 3273 ntTSL 2 BASIC5.52□□□□□ -1.53
LAMA3Q16787 LAMB4-201ENST00000205386 5857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.52□□□□□ -1.53
LAMA3Q16787 DIAPH3-206ENST00000465066 2735 ntTSL 1 (best) BASIC5.52□□□□□ -1.53
LAMA3Q16787 SSMEM1-201ENST00000297819 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.52□□□□□ -1.53
LAMA3Q16787 LINC01317-201ENST00000366209 779 ntTSL 5 BASIC5.52□□□□□ -1.53
LAMA3Q16787 VN1R21P-201ENST00000426703 765 ntBASIC5.52□□□□□ -1.53
LAMA3Q16787 AP000402.1-201ENST00000446404 540 ntTSL 3 BASIC5.52□□□□□ -1.53
LAMA3Q16787 RN7SL542P-201ENST00000467147 294 ntBASIC5.52□□□□□ -1.53
LAMA3Q16787 RN7SL423P-201ENST00000486202 304 ntBASIC5.52□□□□□ -1.53
LAMA3Q16787 AC138360.1-201ENST00000552332 386 ntTSL 3 BASIC5.52□□□□□ -1.53
LAMA3Q16787 AC009237.13-201ENST00000603193 276 ntBASIC5.52□□□□□ -1.53
LAMA3Q16787 AC018816.2-201ENST00000621460 353 ntBASIC5.52□□□□□ -1.53
LAMA3Q16787 PCBP1-AS1-278ENST00000625518 864 ntTSL 5 BASIC5.52□□□□□ -1.53
LAMA3Q16787 SORBS1-202ENST00000306402 5858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.52□□□□□ -1.53
LAMA3Q16787 UTY-203ENST00000362096 4990 ntTSL 1 (best) BASIC5.52□□□□□ -1.53
LAMA3Q16787 LRRC7-203ENST00000370958 2375 ntTSL 1 (best) BASIC5.52□□□□□ -1.53
LAMA3Q16787 CYP2C8-201ENST00000371270 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.52□□□□□ -1.53
LAMA3Q16787 TMOD2-201ENST00000249700 9191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.52□□□□□ -1.53
LAMA3Q16787 ZBTB40-204ENST00000404138 8992 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC5.52□□□□□ -1.53
LAMA3Q16787 AC006600.2-201ENST00000624834 2506 ntBASIC5.51□□□□□ -1.53
LAMA3Q16787 NIFKP7-201ENST00000503365 834 ntBASIC5.51□□□□□ -1.53
LAMA3Q16787 AC114956.1-201ENST00000504277 512 ntTSL 5 BASIC5.51□□□□□ -1.53
LAMA3Q16787 AL133485.1-201ENST00000555966 392 ntTSL 2 BASIC5.51□□□□□ -1.53
LAMA3Q16787 AC011443.1-201ENST00000599484 365 ntTSL 3 BASIC5.51□□□□□ -1.53
LAMA3Q16787 AL161756.2-201ENST00000604597 246 ntBASIC5.51□□□□□ -1.53
LAMA3Q16787 AC243585.1-201ENST00000617867 607 ntTSL 3 BASIC5.51□□□□□ -1.53
LAMA3Q16787 AC021106.3-201ENST00000623925 531 ntBASIC5.51□□□□□ -1.53
LAMA3Q16787 CENPI-204ENST00000423383 2314 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC5.51□□□□□ -1.53
LAMA3Q16787 AP001267.1-201ENST00000531742 2074 ntTSL 2 BASIC5.51□□□□□ -1.53
LAMA3Q16787 CSMD1-218ENST00000635120 11737 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC5.51□□□□□ -1.53
LAMA3Q16787 DDI2-202ENST00000480945 10625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.51□□□□□ -1.53
LAMA3Q16787 ZNF28-204ENST00000457749 4556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.51□□□□□ -1.53
LAMA3Q16787 BCOR-202ENST00000378444 6358 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.51□□□□□ -1.53
LAMA3Q16787 AP005432.1-201ENST00000580891 3485 ntBASIC5.51□□□□□ -1.53
LAMA3Q16787 LARS-201ENST00000274562 2213 ntTSL 2 BASIC5.51□□□□□ -1.53
LAMA3Q16787 AC099329.2-203ENST00000471537 3605 ntTSL 1 (best) BASIC5.51□□□□□ -1.53
LAMA3Q16787 AC004784.1-201ENST00000635495 1833 ntTSL 5 BASIC5.51□□□□□ -1.53
LAMA3Q16787 ITGA11-202ENST00000423218 10192 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC5.51□□□□□ -1.53
LAMA3Q16787 OR2D2-201ENST00000299459 1110 ntAPPRIS P1 BASIC5.51□□□□□ -1.53
LAMA3Q16787 SAMD13-202ENST00000370669 856 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC5.51□□□□□ -1.53
LAMA3Q16787 AP002530.1-201ENST00000405705 684 ntBASIC5.51□□□□□ -1.53
LAMA3Q16787 CACYBP-203ENST00000406752 243 ntTSL 5 BASIC5.51□□□□□ -1.53
LAMA3Q16787 MAST4-207ENST00000407621 559 ntTSL 2 BASIC5.51□□□□□ -1.53
LAMA3Q16787 CYTOR-204ENST00000409898 560 ntTSL 5 BASIC5.51□□□□□ -1.53
LAMA3Q16787 RPS4XP16-201ENST00000427198 791 ntBASIC5.51□□□□□ -1.53
LAMA3Q16787 OR2B7P-201ENST00000429302 934 ntBASIC5.51□□□□□ -1.53
LAMA3Q16787 AC090617.2-201ENST00000433167 404 ntTSL 3 BASIC5.51□□□□□ -1.53
LAMA3Q16787 RPS29P10-201ENST00000439197 166 ntBASIC5.51□□□□□ -1.53
LAMA3Q16787 MIR4435-2HG-214ENST00000453478 560 ntTSL 4 BASIC5.51□□□□□ -1.53
LAMA3Q16787 snoU13.24-201ENST00000458998 104 ntBASIC5.51□□□□□ -1.53
LAMA3Q16787 AK3P4-201ENST00000504283 583 ntBASIC5.51□□□□□ -1.53
LAMA3Q16787 AC091912.1-201ENST00000511351 248 ntBASIC5.51□□□□□ -1.53
LAMA3Q16787 AP003080.1-202ENST00000526526 915 ntBASIC5.51□□□□□ -1.53
LAMA3Q16787 AC020891.2-201ENST00000559672 776 ntTSL 2 BASIC5.51□□□□□ -1.53
LAMA3Q16787 AC005154.1-213ENST00000578572 445 ntTSL 3 BASIC5.51□□□□□ -1.53
LAMA3Q16787 AC069200.1-201ENST00000609511 323 ntBASIC5.51□□□□□ -1.53
LAMA3Q16787 AP004243.1-201ENST00000529108 1433 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.51□□□□□ -1.53
LAMA3Q16787 EEF1A1-210ENST00000610520 3447 ntTSL 5 BASIC5.51□□□□□ -1.53
LAMA3Q16787 ICA1L-202ENST00000392237 5173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.51□□□□□ -1.53
LAMA3Q16787 SNCA-213ENST00000618500 3022 ntTSL 1 (best) BASIC5.51□□□□□ -1.53
LAMA3Q16787 ZNF217-201ENST00000302342 5633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.51□□□□□ -1.53
LAMA3Q16787 ATP2B2-201ENST00000352432 8593 ntTSL 1 (best) BASIC5.51□□□□□ -1.53
LAMA3Q16787 IL1RAPL1-202ENST00000378993 3667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.51□□□□□ -1.53
LAMA3Q16787 REL-201ENST00000295025 11255 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.51□□□□□ -1.53
LAMA3Q16787 NAPEPLD-203ENST00000417955 4988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.51□□□□□ -1.53
LAMA3Q16787 F5-202ENST00000367797 7024 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.51□□□□□ -1.53
LAMA3Q16787 EPHA3-201ENST00000336596 5809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.51□□□□□ -1.53
LAMA3Q16787 OR14C36-201ENST00000317861 939 ntAPPRIS P1 BASIC5.51□□□□□ -1.53
LAMA3Q16787 AL583835.2-201ENST00000435483 500 ntTSL 2 BASIC5.51□□□□□ -1.53
LAMA3Q16787 RPS29P9-201ENST00000440360 171 ntBASIC5.51□□□□□ -1.53
LAMA3Q16787 AC010326.1-201ENST00000462726 602 ntBASIC5.51□□□□□ -1.53
LAMA3Q16787 AC097467.3-212ENST00000512269 568 ntTSL 3 BASIC5.51□□□□□ -1.53
LAMA3Q16787 AC012339.2-201ENST00000523996 453 ntBASIC5.51□□□□□ -1.53
LAMA3Q16787 MIR132-201ENST00000591554 101 ntBASIC5.51□□□□□ -1.53
LAMA3Q16787 AC097467.3-209ENST00000595760 615 ntTSL 5 BASIC5.51□□□□□ -1.53
LAMA3Q16787 AC073869.8-201ENST00000641806 335 ntBASIC5.51□□□□□ -1.53
LAMA3Q16787 AL031320.2-201ENST00000591892 2079 ntTSL 5 BASIC5.51□□□□□ -1.53
LAMA3Q16787 RBM33-207ENST00000401878 10149 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC5.51□□□□□ -1.53
LAMA3Q16787 LMO3-225ENST00000541295 3498 ntTSL 2 BASIC5.51□□□□□ -1.53
LAMA3Q16787 FBXL20-201ENST00000264658 10388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.51□□□□□ -1.53
LAMA3Q16787 NEK11-201ENST00000356918 1874 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.5□□□□□ -1.53
LAMA3Q16787 SYNE3-205ENST00000557275 13488 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC5.5□□□□□ -1.53
LAMA3Q16787 CDKAL1-202ENST00000378610 3115 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.5□□□□□ -1.53
LAMA3Q16787 TBCK-205ENST00000432496 3362 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.5□□□□□ -1.53
LAMA3Q16787 IBTK-210ENST00000610980 5195 ntTSL 5 BASIC5.5□□□□□ -1.53
LAMA3Q16787 IFT74-204ENST00000443698 2163 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.5□□□□□ -1.53
LAMA3Q16787 SESN1-201ENST00000302071 2718 ntTSL 1 (best) BASIC5.5□□□□□ -1.53
LAMA3Q16787 S100A9-201ENST00000368738 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.5□□□□□ -1.53
LAMA3Q16787 SNORA70C-201ENST00000384538 135 ntBASIC5.5□□□□□ -1.53
LAMA3Q16787 MIR105-1-201ENST00000385222 81 ntBASIC5.5□□□□□ -1.53
LAMA3Q16787 NANOGP9-201ENST00000439890 892 ntBASIC5.5□□□□□ -1.53
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