Protein–RNA interactions for Protein: Q13761

RUNX3, Runt-related transcription factor 3, humanhuman

Predictions only

Length 415 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RUNX3Q13761 CALN1-203ENST00000395276 9189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.56□□□□□ -1.52
RUNX3Q13761 MDN1-205ENST00000629399 17400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.56□□□□□ -1.52
RUNX3Q13761 ST8SIA4-201ENST00000231461 6303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.56□□□□□ -1.52
RUNX3Q13761 AQP4-201ENST00000383168 5274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.56□□□□□ -1.52
RUNX3Q13761 CACNA2D3-210ENST00000490478 3557 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.56□□□□□ -1.52
RUNX3Q13761 OGT-201ENST00000373701 3310 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC5.56□□□□□ -1.52
RUNX3Q13761 FLRT3-201ENST00000341420 3971 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.56□□□□□ -1.52
RUNX3Q13761 SEMA6D-210ENST00000558816 4419 ntTSL 5 BASIC5.56□□□□□ -1.52
RUNX3Q13761 CFAP57-204ENST00000528956 3037 ntTSL 2 BASIC5.56□□□□□ -1.52
RUNX3Q13761 ATP5A1P4-201ENST00000556888 1605 ntBASIC5.56□□□□□ -1.52
RUNX3Q13761 MYO5A-209ENST00000553916 5989 ntTSL 5 BASIC5.55□□□□□ -1.52
RUNX3Q13761 ELMO1-203ENST00000396045 2524 ntTSL 1 (best) BASIC5.55□□□□□ -1.52
RUNX3Q13761 ZCCHC6-204ENST00000375957 2262 ntTSL 2 BASIC5.55□□□□□ -1.52
RUNX3Q13761 MUC4-215ENST00000475231 16273 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.55□□□□□ -1.52
RUNX3Q13761 XKRY2-202ENST00000623874 1581 ntBASIC5.55□□□□□ -1.52
RUNX3Q13761 XKRY-202ENST00000624960 1581 ntBASIC5.55□□□□□ -1.52
RUNX3Q13761 GTDC1-204ENST00000392869 10514 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.55□□□□□ -1.52
RUNX3Q13761 SELE-204ENST00000367776 3576 ntTSL 5 BASIC5.55□□□□□ -1.52
RUNX3Q13761 SELE-205ENST00000367777 3576 ntTSL 5 BASIC5.55□□□□□ -1.52
RUNX3Q13761 LINC01981-201ENST00000432163 2833 ntTSL 1 (best) BASIC5.55□□□□□ -1.52
RUNX3Q13761 OFD1P17-201ENST00000437639 3018 ntBASIC5.55□□□□□ -1.52
RUNX3Q13761 ETF1-203ENST00000503014 1736 ntTSL 2 BASIC5.55□□□□□ -1.52
RUNX3Q13761 OR8I2-201ENST00000302124 1010 ntAPPRIS P1 BASIC5.55□□□□□ -1.52
RUNX3Q13761 AC096669.1-202ENST00000413708 616 ntTSL 2 BASIC5.55□□□□□ -1.52
RUNX3Q13761 AL031767.1-201ENST00000426374 386 ntTSL 5 BASIC5.55□□□□□ -1.52
RUNX3Q13761 TXNDC12-AS1-201ENST00000428794 391 ntTSL 3 BASIC5.55□□□□□ -1.52
RUNX3Q13761 AL109807.1-201ENST00000438222 569 ntTSL 3 BASIC5.55□□□□□ -1.52
RUNX3Q13761 AC068491.2-201ENST00000438897 617 ntTSL 2 BASIC5.55□□□□□ -1.52
RUNX3Q13761 GYPB-202ENST00000502664 521 ntTSL 1 (best) BASIC5.55□□□□□ -1.52
RUNX3Q13761 RPS4XP20-201ENST00000505751 772 ntBASIC5.55□□□□□ -1.52
RUNX3Q13761 AC079858.1-201ENST00000507842 448 ntTSL 3 BASIC5.55□□□□□ -1.52
RUNX3Q13761 OR51A1P-201ENST00000511110 946 ntBASIC5.55□□□□□ -1.52
RUNX3Q13761 LNX1-AS1-204ENST00000514364 495 ntTSL 3 BASIC5.55□□□□□ -1.52
RUNX3Q13761 E2F5-204ENST00000517476 1094 ntTSL 2 BASIC5.55□□□□□ -1.52
RUNX3Q13761 MAL2-208ENST00000523307 556 ntTSL 4 BASIC5.55□□□□□ -1.52
RUNX3Q13761 AP004607.2-201ENST00000533949 322 ntBASIC5.55□□□□□ -1.52
RUNX3Q13761 NMNAT1P5-201ENST00000559657 841 ntBASIC5.55□□□□□ -1.52
RUNX3Q13761 AC018558.5-201ENST00000565840 952 ntBASIC5.55□□□□□ -1.52
RUNX3Q13761 OR1F2P-201ENST00000570470 933 ntBASIC5.55□□□□□ -1.52
RUNX3Q13761 MIR4436B2-201ENST00000581415 91 ntBASIC5.55□□□□□ -1.52
RUNX3Q13761 MIR4436B1-201ENST00000583272 91 ntBASIC5.55□□□□□ -1.52
RUNX3Q13761 AC015726.1-202ENST00000602532 475 ntTSL 5 BASIC5.55□□□□□ -1.52
RUNX3Q13761 IGLCOR22-2-201ENST00000605398 313 ntBASIC5.55□□□□□ -1.52
RUNX3Q13761 MIR6798-201ENST00000612887 67 ntBASIC5.55□□□□□ -1.52
RUNX3Q13761 AC005899.7-201ENST00000618199 588 ntBASIC5.55□□□□□ -1.52
RUNX3Q13761 LINC01630-202ENST00000578152 3188 ntTSL 2 BASIC5.55□□□□□ -1.52
RUNX3Q13761 OAZ3-204ENST00000479764 3789 ntTSL 5 BASIC5.55□□□□□ -1.52
RUNX3Q13761 TSPAN6-204ENST00000612152 3796 ntTSL 5 BASIC5.55□□□□□ -1.52
RUNX3Q13761 HSPD1P7-201ENST00000447985 1686 ntBASIC5.55□□□□□ -1.52
RUNX3Q13761 ZNF107-205ENST00000613690 5589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.55□□□□□ -1.52
RUNX3Q13761 PPP1R1C-201ENST00000280295 1636 ntTSL 1 (best) BASIC5.55□□□□□ -1.52
RUNX3Q13761 CAPRIN2-202ENST00000395805 4156 ntTSL 1 (best) BASIC5.55□□□□□ -1.52
RUNX3Q13761 PAK3-201ENST00000262836 2178 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC5.55□□□□□ -1.52
RUNX3Q13761 PAK3-205ENST00000417227 2196 ntTSL 1 (best) BASIC5.55□□□□□ -1.52
RUNX3Q13761 AC123912.3-201ENST00000600907 1367 ntBASIC5.55□□□□□ -1.52
RUNX3Q13761 EXD1-201ENST00000314992 2942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.54□□□□□ -1.52
RUNX3Q13761 GART-205ENST00000381839 3469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.54□□□□□ -1.52
RUNX3Q13761 NRDC-213ENST00000539524 3417 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.54□□□□□ -1.52
RUNX3Q13761 AL138820.1-201ENST00000617901 5305 ntBASIC5.54□□□□□ -1.52
RUNX3Q13761 CSNK1A1-205ENST00000515435 1856 ntTSL 5 BASIC5.54□□□□□ -1.52
RUNX3Q13761 TPK1-207ENST00000538212 2243 ntTSL 2 BASIC5.54□□□□□ -1.52
RUNX3Q13761 MAP9-208ENST00000515654 2044 ntTSL 5 BASIC5.54□□□□□ -1.52
RUNX3Q13761 PFKFB2-201ENST00000367079 3494 ntTSL 1 (best) BASIC5.54□□□□□ -1.52
RUNX3Q13761 C1orf162-201ENST00000343534 1107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.54□□□□□ -1.52
RUNX3Q13761 AL121977.1-201ENST00000401636 979 ntBASIC5.54□□□□□ -1.52
RUNX3Q13761 AL109941.1-201ENST00000401925 229 ntBASIC5.54□□□□□ -1.52
RUNX3Q13761 DNAJA1P4-201ENST00000406473 1166 ntBASIC5.54□□□□□ -1.52
RUNX3Q13761 RPL37P18-201ENST00000411602 243 ntBASIC5.54□□□□□ -1.52
RUNX3Q13761 AL139128.1-201ENST00000413921 941 ntBASIC5.54□□□□□ -1.52
RUNX3Q13761 LINC01593-201ENST00000424355 388 ntTSL 5 BASIC5.54□□□□□ -1.52
RUNX3Q13761 RIMKLBP2-201ENST00000424737 654 ntBASIC5.54□□□□□ -1.52
RUNX3Q13761 AL121578.1-201ENST00000428051 892 ntBASIC5.54□□□□□ -1.52
RUNX3Q13761 AL021408.1-201ENST00000430428 552 ntTSL 4 BASIC5.54□□□□□ -1.52
RUNX3Q13761 LINC01359-203ENST00000444349 381 ntTSL 5 BASIC5.54□□□□□ -1.52
RUNX3Q13761 AC093581.1-201ENST00000446411 461 ntTSL 2 BASIC5.54□□□□□ -1.52
RUNX3Q13761 AL512328.1-202ENST00000452640 850 ntTSL 3 BASIC5.54□□□□□ -1.52
RUNX3Q13761 AC109464.1-201ENST00000511091 819 ntBASIC5.54□□□□□ -1.52
RUNX3Q13761 AC122688.1-201ENST00000541494 223 ntBASIC5.54□□□□□ -1.52
RUNX3Q13761 AC144548.2-201ENST00000550231 946 ntTSL 3 BASIC5.54□□□□□ -1.52
RUNX3Q13761 ETFRF1-202ENST00000553788 708 ntTSL 3 BASIC5.54□□□□□ -1.52
RUNX3Q13761 BLOC1S6-209ENST00000565409 616 ntTSL 4 BASIC5.54□□□□□ -1.52
RUNX3Q13761 UBA3-213ENST00000631029 123 ntTSL 5 BASIC5.54□□□□□ -1.52
RUNX3Q13761 DAZ2-204ENST00000382431 3637 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.54□□□□□ -1.52
RUNX3Q13761 ARIH1-201ENST00000379887 21681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.54□□□□□ -1.52
RUNX3Q13761 USP15-201ENST00000280377 4748 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC5.54□□□□□ -1.52
RUNX3Q13761 IFIT2-201ENST00000371826 3489 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.54□□□□□ -1.52
RUNX3Q13761 OR2T7-201ENST00000641057 3463 ntAPPRIS P1 BASIC5.54□□□□□ -1.52
RUNX3Q13761 ZNF782-208ENST00000535338 3296 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC5.54□□□□□ -1.52
RUNX3Q13761 BRD7P6-201ENST00000431406 1860 ntBASIC5.54□□□□□ -1.52
RUNX3Q13761 DOCK10-202ENST00000409592 7288 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.53□□□□□ -1.52
RUNX3Q13761 ELOVL6-202ENST00000394607 6454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.53□□□□□ -1.52
RUNX3Q13761 CEP128-202ENST00000281129 4461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.53□□□□□ -1.52
RUNX3Q13761 ZRANB3-211ENST00000619650 2494 ntTSL 5 BASIC5.53□□□□□ -1.52
RUNX3Q13761 TTC6-202ENST00000382320 1972 ntTSL 2 BASIC5.53□□□□□ -1.52
RUNX3Q13761 BANK1-203ENST00000444316 3141 ntTSL 2 BASIC5.53□□□□□ -1.52
RUNX3Q13761 GCSAML-210ENST00000536561 4063 ntAPPRIS P3 TSL 4 BASIC5.53□□□□□ -1.52
RUNX3Q13761 UPRT-207ENST00000530743 1636 ntTSL 2 BASIC5.53□□□□□ -1.52
RUNX3Q13761 LIN7C-201ENST00000278193 4688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.53□□□□□ -1.52
RUNX3Q13761 RGS10-201ENST00000369101 738 ntTSL 1 (best) BASIC5.53□□□□□ -1.52
RUNX3Q13761 RNU6ATAC7P-201ENST00000408111 127 ntBASIC5.53□□□□□ -1.52
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