Protein–RNA interactions for Protein: Q13286

CLN3, Battenin, humanhuman

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Length 438 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLN3Q13286 AL136139.1-201ENST00000605568 222 ntBASIC7.24□□□□□ -1.25
CLN3Q13286 RPL36A-210ENST00000614077 881 ntTSL 1 (best) BASIC7.24□□□□□ -1.25
CLN3Q13286 MIR6813-201ENST00000621638 56 ntBASIC7.24□□□□□ -1.25
CLN3Q13286 AC026336.5-201ENST00000624455 738 ntBASIC7.24□□□□□ -1.25
CLN3Q13286 AC116563.2-201ENST00000624751 535 ntBASIC7.24□□□□□ -1.25
CLN3Q13286 LINC00466-206ENST00000634576 1279 ntTSL 5 BASIC7.24□□□□□ -1.25
CLN3Q13286 AC006453.3-201ENST00000635891 377 ntBASIC7.24□□□□□ -1.25
CLN3Q13286 BCAS3-234ENST00000639611 108 ntTSL 5 BASIC7.24□□□□□ -1.25
CLN3Q13286 MKKS-204ENST00000639674 192 ntBASIC7.24□□□□□ -1.25
CLN3Q13286 MIR137HG-205ENST00000634594 3586 ntTSL 5 BASIC7.24□□□□□ -1.25
CLN3Q13286 NUDT13-206ENST00000537969 2151 ntTSL 2 BASIC7.24□□□□□ -1.25
CLN3Q13286 DAAM1-201ENST00000360909 4227 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.24□□□□□ -1.25
CLN3Q13286 NUDT13-203ENST00000372997 1919 ntTSL 1 (best) BASIC7.24□□□□□ -1.25
CLN3Q13286 AL365475.1-201ENST00000565135 1949 ntBASIC7.24□□□□□ -1.25
CLN3Q13286 ABCA4-207ENST00000536513 3740 ntTSL 1 (best) BASIC7.24□□□□□ -1.25
CLN3Q13286 KCNJ1-203ENST00000392664 1674 ntTSL 1 (best) BASIC7.24□□□□□ -1.25
CLN3Q13286 LINC01741-201ENST00000427173 1666 ntTSL 1 (best) BASIC7.24□□□□□ -1.25
CLN3Q13286 MDM4-214ENST00000612738 9407 ntTSL 5 BASIC7.24□□□□□ -1.25
CLN3Q13286 MAP3K20-208ENST00000539448 2312 ntTSL 1 (best) BASIC7.24□□□□□ -1.25
CLN3Q13286 AC011592.1-201ENST00000624647 3634 ntBASIC7.24□□□□□ -1.25
CLN3Q13286 KYNUP1-201ENST00000466683 1406 ntBASIC7.24□□□□□ -1.25
CLN3Q13286 NPIPB8-202ENST00000529716 2058 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.24□□□□□ -1.25
CLN3Q13286 FAM122C-211ENST00000623326 2064 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.24□□□□□ -1.25
CLN3Q13286 TNPO1-201ENST00000337273 11183 ntTSL 1 (best) BASIC7.24□□□□□ -1.25
CLN3Q13286 MSN-201ENST00000360270 3944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.24□□□□□ -1.25
CLN3Q13286 GAPVD1-204ENST00000394083 4747 ntTSL 5 BASIC7.24□□□□□ -1.25
CLN3Q13286 CASC23-201ENST00000534076 1563 ntTSL 1 (best) BASIC7.24□□□□□ -1.25
CLN3Q13286 CELF1-215ENST00000532048 3044 ntTSL 1 (best) BASIC7.24□□□□□ -1.25
CLN3Q13286 DIAPH3-201ENST00000267215 3449 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.24□□□□□ -1.25
CLN3Q13286 STN1-202ENST00000369764 1311 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.24□□□□□ -1.25
CLN3Q13286 GPR63-201ENST00000229955 5952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.24□□□□□ -1.25
CLN3Q13286 AC093297.3-201ENST00000607056 2517 ntBASIC7.24□□□□□ -1.25
CLN3Q13286 GUCY2F-201ENST00000218006 3714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.24□□□□□ -1.25
CLN3Q13286 DUXAP8-204ENST00000447898 4136 ntTSL 1 (best) BASIC7.24□□□□□ -1.25
CLN3Q13286 LINC01360-203ENST00000440762 3871 ntTSL 1 (best) BASIC7.24□□□□□ -1.25
CLN3Q13286 CYFIP2-210ENST00000522463 3477 ntTSL 2 BASIC7.24□□□□□ -1.25
CLN3Q13286 ZNF69-202ENST00000429654 2010 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.23□□□□□ -1.25
CLN3Q13286 AC006213.1-202ENST00000589021 2176 ntTSL 2 BASIC7.23□□□□□ -1.25
CLN3Q13286 CSNK1A1-204ENST00000504676 1772 ntTSL 2 BASIC7.23□□□□□ -1.25
CLN3Q13286 NTRK3-201ENST00000317501 3826 ntTSL 1 (best) BASIC7.23□□□□□ -1.25
CLN3Q13286 ESRP1-202ENST00000423620 3746 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC7.23□□□□□ -1.25
CLN3Q13286 ZKSCAN8-202ENST00000457389 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.23□□□□□ -1.25
CLN3Q13286 ZNF733P-201ENST00000331425 1506 ntTSL 1 (best) BASIC7.23□□□□□ -1.25
CLN3Q13286 SLC7A2-204ENST00000494857 7622 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC7.23□□□□□ -1.25
CLN3Q13286 AC099506.1-201ENST00000567359 4037 ntTSL 1 (best) BASIC7.23□□□□□ -1.25
CLN3Q13286 VMA21-201ENST00000330374 4717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.23□□□□□ -1.25
CLN3Q13286 MYRFL-203ENST00000547771 3465 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.23□□□□□ -1.25
CLN3Q13286 TNPO3-201ENST00000265388 4153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.23□□□□□ -1.25
CLN3Q13286 RSF1-201ENST00000308488 11550 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.23□□□□□ -1.25
CLN3Q13286 OR14J1-203ENST00000641895 6443 ntAPPRIS P1 BASIC7.23□□□□□ -1.25
CLN3Q13286 RIOK2-201ENST00000283109 3922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.23□□□□□ -1.25
CLN3Q13286 PRRC2C-201ENST00000338920 10355 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC7.23□□□□□ -1.25
CLN3Q13286 PDLIM5-219ENST00000514743 3356 ntTSL 2 BASIC7.23□□□□□ -1.25
CLN3Q13286 CACNB2-201ENST00000282343 3524 ntTSL 1 (best) BASIC7.23□□□□□ -1.25
CLN3Q13286 SLC7A2-203ENST00000470360 7638 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC7.23□□□□□ -1.25
CLN3Q13286 GABRG3-201ENST00000333743 1235 ntTSL 5 BASIC7.23□□□□□ -1.25
CLN3Q13286 RNA5SP429-201ENST00000363688 109 ntBASIC7.23□□□□□ -1.25
CLN3Q13286 CBWD5-205ENST00000377395 1143 ntTSL 1 (best) BASIC7.23□□□□□ -1.25
CLN3Q13286 SNORA70G-201ENST00000383923 142 ntBASIC7.23□□□□□ -1.25
CLN3Q13286 FLG-AS1-202ENST00000392688 2995 ntTSL 2 BASIC7.23□□□□□ -1.25
CLN3Q13286 Z97832.1-201ENST00000402490 328 ntBASIC7.23□□□□□ -1.25
CLN3Q13286 RNA5SP118-201ENST00000410385 109 ntBASIC7.23□□□□□ -1.25
CLN3Q13286 AL450992.3-201ENST00000413192 568 ntBASIC7.23□□□□□ -1.25
CLN3Q13286 AL590806.1-201ENST00000415818 853 ntBASIC7.23□□□□□ -1.25
CLN3Q13286 AC005062.1-207ENST00000418442 587 ntTSL 3 BASIC7.23□□□□□ -1.25
CLN3Q13286 KLF7-IT1-201ENST00000428777 655 ntTSL 2 BASIC7.23□□□□□ -1.25
CLN3Q13286 AL513175.1-201ENST00000431492 780 ntBASIC7.23□□□□□ -1.25
CLN3Q13286 AL645634.2-201ENST00000431956 411 ntTSL 3 BASIC7.23□□□□□ -1.25
CLN3Q13286 RPL7P29-201ENST00000437151 728 ntBASIC7.23□□□□□ -1.25
CLN3Q13286 AC083864.2-201ENST00000446024 482 ntTSL 3 BASIC7.23□□□□□ -1.25
CLN3Q13286 AL161454.1-201ENST00000446226 569 ntBASIC7.23□□□□□ -1.25
CLN3Q13286 AC079448.1-201ENST00000449377 373 ntBASIC7.23□□□□□ -1.25
CLN3Q13286 TTTY19-201ENST00000453955 269 ntTSL 1 (best) BASIC7.23□□□□□ -1.25
CLN3Q13286 BX248409.1-201ENST00000455497 255 ntBASIC7.23□□□□□ -1.25
CLN3Q13286 AL391863.1-202ENST00000457427 612 ntTSL 5 BASIC7.23□□□□□ -1.25
CLN3Q13286 AC110749.1-201ENST00000462007 357 ntBASIC7.23□□□□□ -1.25
CLN3Q13286 SSBP1-205ENST00000465582 731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.23□□□□□ -1.25
CLN3Q13286 RN7SL456P-201ENST00000469290 295 ntBASIC7.23□□□□□ -1.25
CLN3Q13286 AC079080.1-201ENST00000479841 822 ntBASIC7.23□□□□□ -1.25
CLN3Q13286 AC099521.1-201ENST00000482557 334 ntBASIC7.23□□□□□ -1.25
CLN3Q13286 KCTD9P2-201ENST00000512203 1013 ntBASIC7.23□□□□□ -1.25
CLN3Q13286 RNA5SP216-201ENST00000516111 123 ntBASIC7.23□□□□□ -1.25
CLN3Q13286 CASC21-201ENST00000521586 290 ntTSL 1 (best) BASIC7.23□□□□□ -1.25
CLN3Q13286 IGKV3-34-201ENST00000521692 293 ntBASIC7.23□□□□□ -1.25
CLN3Q13286 AC130366.1-201ENST00000526505 1192 ntBASIC7.23□□□□□ -1.25
CLN3Q13286 AC118942.1-202ENST00000529081 578 ntTSL 5 BASIC7.23□□□□□ -1.25
CLN3Q13286 AC068631.3-201ENST00000538831 225 ntBASIC7.23□□□□□ -1.25
CLN3Q13286 AC243972.3-201ENST00000539655 198 ntBASIC7.23□□□□□ -1.25
CLN3Q13286 AC084200.1-201ENST00000547370 547 ntTSL 4 BASIC7.23□□□□□ -1.25
CLN3Q13286 AC011611.1-201ENST00000552179 197 ntBASIC7.23□□□□□ -1.25
CLN3Q13286 AC068643.2-202ENST00000552759 622 ntTSL 3 BASIC7.23□□□□□ -1.25
CLN3Q13286 COPZ1-218ENST00000553231 551 ntTSL 5 BASIC7.23□□□□□ -1.25
CLN3Q13286 MIR3682-201ENST00000581338 84 ntBASIC7.23□□□□□ -1.25
CLN3Q13286 AC005884.2-201ENST00000593107 247 ntTSL 5 BASIC7.23□□□□□ -1.25
CLN3Q13286 AC112187.2-201ENST00000604345 283 ntBASIC7.23□□□□□ -1.25
CLN3Q13286 AC005070.2-201ENST00000604391 260 ntBASIC7.23□□□□□ -1.25
CLN3Q13286 AC004852.1-201ENST00000605206 154 ntBASIC7.23□□□□□ -1.25
CLN3Q13286 AL161931.1-201ENST00000612768 246 ntBASIC7.23□□□□□ -1.25
CLN3Q13286 MIR8075-201ENST00000614354 80 ntBASIC7.23□□□□□ -1.25
CLN3Q13286 SNAP23-222ENST00000626061 237 ntTSL 5 BASIC7.23□□□□□ -1.25
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