Protein–RNA interactions for Protein: Q12805

EFEMP1, EGF-containing fibulin-like extracellular matrix protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 493 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EFEMP1Q12805 RAB9B-201ENST00000243298 3748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.43□□□□□ -1.38
EFEMP1Q12805 RRM1-201ENST00000300738 3076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.43□□□□□ -1.38
EFEMP1Q12805 PTPN3-202ENST00000374541 6703 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.43□□□□□ -1.38
EFEMP1Q12805 DAAM1-202ENST00000395125 5806 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.43□□□□□ -1.38
EFEMP1Q12805 AC024587.1-201ENST00000505925 2157 ntBASIC6.43□□□□□ -1.38
EFEMP1Q12805 RABGAP1L-203ENST00000347255 1744 ntTSL 1 (best) BASIC6.43□□□□□ -1.38
EFEMP1Q12805 AC011416.1-201ENST00000514947 1732 ntBASIC6.43□□□□□ -1.38
EFEMP1Q12805 PRIM2-201ENST00000274891 864 ntTSL 1 (best) BASIC6.43□□□□□ -1.38
EFEMP1Q12805 OR5P2-201ENST00000329434 1069 ntAPPRIS P1 BASIC6.43□□□□□ -1.38
EFEMP1Q12805 OR2M5-201ENST00000366476 939 ntAPPRIS P1 BASIC6.43□□□□□ -1.38
EFEMP1Q12805 PKIB-203ENST00000368446 556 ntTSL 2 BASIC6.43□□□□□ -1.38
EFEMP1Q12805 MIR130B-202ENST00000385018 82 ntBASIC6.43□□□□□ -1.38
EFEMP1Q12805 FAIM-204ENST00000393035 946 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.43□□□□□ -1.38
EFEMP1Q12805 SNX10-203ENST00000409367 746 ntTSL 5 BASIC6.43□□□□□ -1.38
EFEMP1Q12805 RPS7P8-201ENST00000418311 581 ntBASIC6.43□□□□□ -1.38
EFEMP1Q12805 LINC00317-201ENST00000419069 612 ntTSL 1 (best) BASIC6.43□□□□□ -1.38
EFEMP1Q12805 AF064858.3-201ENST00000419664 509 ntTSL 5 BASIC6.43□□□□□ -1.38
EFEMP1Q12805 AJ239322.2-201ENST00000421696 575 ntTSL 5 BASIC6.43□□□□□ -1.38
EFEMP1Q12805 AC007064.3-201ENST00000422608 359 ntBASIC6.43□□□□□ -1.38
EFEMP1Q12805 RPL5P2-201ENST00000429598 854 ntBASIC6.43□□□□□ -1.38
EFEMP1Q12805 AL139327.2-202ENST00000437057 400 ntTSL 3 BASIC6.43□□□□□ -1.38
EFEMP1Q12805 LARS2-AS1-201ENST00000442534 575 ntTSL 4 BASIC6.43□□□□□ -1.38
EFEMP1Q12805 AL355355.1-201ENST00000442900 793 ntBASIC6.43□□□□□ -1.38
EFEMP1Q12805 AC114814.1-201ENST00000444926 691 ntTSL 3 BASIC6.43□□□□□ -1.38
EFEMP1Q12805 AL133217.1-201ENST00000450980 425 ntBASIC6.43□□□□□ -1.38
EFEMP1Q12805 AC073594.1-201ENST00000462065 364 ntBASIC6.43□□□□□ -1.38
EFEMP1Q12805 RPL36A-206ENST00000471855 399 ntTSL 3 BASIC6.43□□□□□ -1.38
EFEMP1Q12805 AC104411.1-201ENST00000480817 320 ntTSL 3 BASIC6.43□□□□□ -1.38
EFEMP1Q12805 AC098869.2-201ENST00000514187 862 ntTSL 3 BASIC6.43□□□□□ -1.38
EFEMP1Q12805 AC097103.2-205ENST00000515247 567 ntTSL 4 BASIC6.43□□□□□ -1.38
EFEMP1Q12805 SNORA19.3-201ENST00000516165 130 ntBASIC6.43□□□□□ -1.38
EFEMP1Q12805 LONRF1-203ENST00000525024 841 ntTSL 1 (best) BASIC6.43□□□□□ -1.38
EFEMP1Q12805 AC107882.1-201ENST00000530837 477 ntTSL 3 BASIC6.43□□□□□ -1.38
EFEMP1Q12805 AC002056.2-201ENST00000532913 284 ntTSL 5 BASIC6.43□□□□□ -1.38
EFEMP1Q12805 RPA2P3-201ENST00000533268 770 ntBASIC6.43□□□□□ -1.38
EFEMP1Q12805 OLR1-210ENST00000544577 924 ntTSL 5 BASIC6.43□□□□□ -1.38
EFEMP1Q12805 RPL36A-209ENST00000553110 429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.43□□□□□ -1.38
EFEMP1Q12805 LINC00921-201ENST00000572123 243 ntTSL 5 BASIC6.43□□□□□ -1.38
EFEMP1Q12805 MTCO3P24-201ENST00000572729 782 ntBASIC6.43□□□□□ -1.38
EFEMP1Q12805 MIR3189-201ENST00000578735 73 ntBASIC6.43□□□□□ -1.38
EFEMP1Q12805 AC217774.1-201ENST00000578936 517 ntTSL 4 BASIC6.43□□□□□ -1.38
EFEMP1Q12805 TEX41-218ENST00000596540 882 ntTSL 5 BASIC6.43□□□□□ -1.38
EFEMP1Q12805 AC011497.2-201ENST00000600255 639 ntBASIC6.43□□□□□ -1.38
EFEMP1Q12805 LAMTOR5-207ENST00000602858 553 ntTSL 2 BASIC6.43□□□□□ -1.38
EFEMP1Q12805 AC008555.7-201ENST00000605008 583 ntBASIC6.43□□□□□ -1.38
EFEMP1Q12805 AC107952.2-201ENST00000606048 486 ntBASIC6.43□□□□□ -1.38
EFEMP1Q12805 MALAT1-205ENST00000610851 584 ntTSL 2 BASIC6.43□□□□□ -1.38
EFEMP1Q12805 MIR6778-201ENST00000617912 73 ntBASIC6.43□□□□□ -1.38
EFEMP1Q12805 LINC01206-233ENST00000630063 878 ntTSL 5 BASIC6.43□□□□□ -1.38
EFEMP1Q12805 CCDC195-201ENST00000638102 606 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.43□□□□□ -1.38
EFEMP1Q12805 AC112243.1-201ENST00000623949 3851 ntBASIC6.43□□□□□ -1.38
EFEMP1Q12805 NPIPB8-202ENST00000529716 2058 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.43□□□□□ -1.38
EFEMP1Q12805 UBA2-202ENST00000439527 2802 ntTSL 2 BASIC6.43□□□□□ -1.38
EFEMP1Q12805 AP001636.3-201ENST00000533954 2810 ntTSL 2 BASIC6.43□□□□□ -1.38
EFEMP1Q12805 RAD23B-202ENST00000416373 3835 ntTSL 1 (best) BASIC6.43□□□□□ -1.38
EFEMP1Q12805 RFTN2-201ENST00000295049 5827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.43□□□□□ -1.38
EFEMP1Q12805 CDK1-202ENST00000373809 1613 ntTSL 1 (best) BASIC6.43□□□□□ -1.38
EFEMP1Q12805 BTBD10-210ENST00000530907 1871 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC6.43□□□□□ -1.38
EFEMP1Q12805 SPAG9-209ENST00000510283 4949 ntTSL 2 BASIC6.43□□□□□ -1.38
EFEMP1Q12805 POT1-202ENST00000393329 3950 ntTSL 5 BASIC6.42□□□□□ -1.38
EFEMP1Q12805 NAT1-209ENST00000541942 1948 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC6.42□□□□□ -1.38
EFEMP1Q12805 NFIA-201ENST00000357977 3200 ntTSL 2 BASIC6.42□□□□□ -1.38
EFEMP1Q12805 CHD2-215ENST00000628375 3202 ntTSL 5 BASIC6.42□□□□□ -1.38
EFEMP1Q12805 SBNO1-201ENST00000267176 11121 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC6.42□□□□□ -1.38
EFEMP1Q12805 ADAM20P1-202ENST00000556964 3034 ntTSL 1 (best) BASIC6.42□□□□□ -1.38
EFEMP1Q12805 HACD3-211ENST00000569894 1471 ntTSL 5 BASIC6.42□□□□□ -1.38
EFEMP1Q12805 GOLGA6L22-204ENST00000622895 4178 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC6.42□□□□□ -1.38
EFEMP1Q12805 PDE1A-204ENST00000410103 2000 ntTSL 1 (best) BASIC6.42□□□□□ -1.38
EFEMP1Q12805 ESRRG-212ENST00000463665 3359 ntTSL 2 BASIC6.42□□□□□ -1.38
EFEMP1Q12805 NDST4-204ENST00000613194 3439 ntTSL 5 BASIC6.42□□□□□ -1.38
EFEMP1Q12805 CLASP2-205ENST00000461133 4814 ntTSL 5 BASIC6.42□□□□□ -1.38
EFEMP1Q12805 ERICH3-202ENST00000420661 2068 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.42□□□□□ -1.38
EFEMP1Q12805 NPL-212ENST00000614468 2376 ntTSL 5 BASIC6.42□□□□□ -1.38
EFEMP1Q12805 TSPAN8-201ENST00000247829 1227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.42□□□□□ -1.38
EFEMP1Q12805 CLEC7A-202ENST00000304084 1130 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC6.42□□□□□ -1.38
EFEMP1Q12805 TMEM202-201ENST00000341689 1012 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC6.42□□□□□ -1.38
EFEMP1Q12805 AL590867.1-201ENST00000392385 1212 ntTSL 2 BASIC6.42□□□□□ -1.38
EFEMP1Q12805 AC004386.1-201ENST00000393214 761 ntBASIC6.42□□□□□ -1.38
EFEMP1Q12805 RPA3-204ENST00000406109 434 ntTSL 3 BASIC6.42□□□□□ -1.38
EFEMP1Q12805 CEBPZOS-205ENST00000406711 687 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.42□□□□□ -1.38
EFEMP1Q12805 ELOCP17-201ENST00000414751 326 ntBASIC6.42□□□□□ -1.38
EFEMP1Q12805 HYALP1-201ENST00000417674 1279 ntBASIC6.42□□□□□ -1.38
EFEMP1Q12805 LINC00310-202ENST00000419881 910 ntTSL 5 BASIC6.42□□□□□ -1.38
EFEMP1Q12805 AC244033.1-201ENST00000426826 870 ntBASIC6.42□□□□□ -1.38
EFEMP1Q12805 AC006369.2-201ENST00000431712 384 ntTSL 3 BASIC6.42□□□□□ -1.38
EFEMP1Q12805 AC092447.2-201ENST00000435487 669 ntBASIC6.42□□□□□ -1.38
EFEMP1Q12805 AC098614.3-201ENST00000438957 440 ntBASIC6.42□□□□□ -1.38
EFEMP1Q12805 AC069542.1-201ENST00000445235 557 ntTSL 3 BASIC6.42□□□□□ -1.38
EFEMP1Q12805 TMEM246-AS1-204ENST00000450109 538 ntTSL 3 BASIC6.42□□□□□ -1.38
EFEMP1Q12805 LRRC37A14P-201ENST00000452297 462 ntBASIC6.42□□□□□ -1.38
EFEMP1Q12805 AC092155.2-201ENST00000454675 477 ntBASIC6.42□□□□□ -1.38
EFEMP1Q12805 GRM7-AS3-209ENST00000458713 454 ntTSL 3 BASIC6.42□□□□□ -1.38
EFEMP1Q12805 AC010468.3-201ENST00000508225 458 ntBASIC6.42□□□□□ -1.38
EFEMP1Q12805 AC096759.1-201ENST00000510744 473 ntTSL 3 BASIC6.42□□□□□ -1.38
EFEMP1Q12805 MTND3P5-201ENST00000512798 333 ntBASIC6.42□□□□□ -1.38
EFEMP1Q12805 HAND2-AS1-233ENST00000515345 797 ntTSL 3 BASIC6.42□□□□□ -1.38
EFEMP1Q12805 RN7SKP238-201ENST00000516483 249 ntBASIC6.42□□□□□ -1.38
EFEMP1Q12805 AC108515.1-201ENST00000517407 525 ntTSL 3 BASIC6.42□□□□□ -1.38
EFEMP1Q12805 AP003461.1-201ENST00000528866 78 ntBASIC6.42□□□□□ -1.38
EFEMP1Q12805 RRAS2-205ENST00000529237 1278 ntTSL 2 BASIC6.42□□□□□ -1.38
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 106.5 ms