Protein–RNA interactions for Protein: Q12772

SREBF2, Sterol regulatory element-binding protein 2, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SREBF2Q12772 MPDZ-219ENST00000546205 6342 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.41□□□□□ -1.38
SREBF2Q12772 ABCA10-201ENST00000269081 6362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.41□□□□□ -1.38
SREBF2Q12772 DCN-202ENST00000393155 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.41□□□□□ -1.38
SREBF2Q12772 FAM26D-201ENST00000368596 1353 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.41□□□□□ -1.38
SREBF2Q12772 SMCO1-201ENST00000397537 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.41□□□□□ -1.38
SREBF2Q12772 MDN1-205ENST00000629399 17400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.41□□□□□ -1.38
SREBF2Q12772 CPS1-204ENST00000451903 4770 ntTSL 1 (best) BASIC6.41□□□□□ -1.38
SREBF2Q12772 LGALS8-220ENST00000526634 1852 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.41□□□□□ -1.38
SREBF2Q12772 AC005821.1-203ENST00000577270 3145 ntTSL 1 (best) BASIC6.41□□□□□ -1.38
SREBF2Q12772 IQCM-206ENST00000636793 1900 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC6.4□□□□□ -1.38
SREBF2Q12772 APOL6-201ENST00000409652 10121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.4□□□□□ -1.38
SREBF2Q12772 MAPK10-365ENST00000641902 3825 ntBASIC6.4□□□□□ -1.38
SREBF2Q12772 ESRRG-206ENST00000366938 5274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.4□□□□□ -1.38
SREBF2Q12772 INTS6P1-201ENST00000504674 2530 ntBASIC6.4□□□□□ -1.38
SREBF2Q12772 CFAP57-204ENST00000528956 3037 ntTSL 2 BASIC6.4□□□□□ -1.38
SREBF2Q12772 OR55B1P-203ENST00000641518 2602 ntBASIC6.4□□□□□ -1.38
SREBF2Q12772 CPED1-203ENST00000423795 2189 ntTSL 1 (best) BASIC6.4□□□□□ -1.38
SREBF2Q12772 PYROXD1-205ENST00000538582 3639 ntTSL 2 BASIC6.4□□□□□ -1.38
SREBF2Q12772 KIAA0391-209ENST00000604948 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC6.4□□□□□ -1.38
SREBF2Q12772 PTER-202ENST00000378000 3777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.4□□□□□ -1.38
SREBF2Q12772 RN7SKP104-201ENST00000362605 328 ntBASIC6.4□□□□□ -1.38
SREBF2Q12772 SNORD8-201ENST00000363915 110 ntBASIC6.4□□□□□ -1.38
SREBF2Q12772 METTL5-205ENST00000409837 936 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC6.4□□□□□ -1.38
SREBF2Q12772 C14orf105-202ENST00000422976 1153 ntTSL 1 (best) BASIC6.4□□□□□ -1.38
SREBF2Q12772 AL391097.2-201ENST00000435057 485 ntTSL 3 BASIC6.4□□□□□ -1.38
SREBF2Q12772 RPS3AP38-201ENST00000435889 763 ntBASIC6.4□□□□□ -1.38
SREBF2Q12772 ARPP21-218ENST00000438071 1103 ntTSL 3 BASIC6.4□□□□□ -1.38
SREBF2Q12772 AP001604.1-201ENST00000447384 954 ntTSL 1 (best) BASIC6.4□□□□□ -1.38
SREBF2Q12772 AC009963.2-201ENST00000453431 138 ntBASIC6.4□□□□□ -1.38
SREBF2Q12772 MEMO1P4-201ENST00000453590 386 ntBASIC6.4□□□□□ -1.38
SREBF2Q12772 AC105021.1-201ENST00000455347 590 ntTSL 3 BASIC6.4□□□□□ -1.38
SREBF2Q12772 NDUFA5P9-201ENST00000472609 340 ntBASIC6.4□□□□□ -1.38
SREBF2Q12772 MSMO1-203ENST00000504317 1026 ntTSL 1 (best) BASIC6.4□□□□□ -1.38
SREBF2Q12772 AC004980.4-201ENST00000513375 203 ntBASIC6.4□□□□□ -1.38
SREBF2Q12772 MTND2P7-201ENST00000521337 640 ntBASIC6.4□□□□□ -1.38
SREBF2Q12772 AC079089.1-202ENST00000528800 1256 ntTSL 1 (best) BASIC6.4□□□□□ -1.38
SREBF2Q12772 SRD5A3-AS1-204ENST00000592823 542 ntTSL 5 BASIC6.4□□□□□ -1.38
SREBF2Q12772 AC234771.5-201ENST00000600161 514 ntBASIC6.4□□□□□ -1.38
SREBF2Q12772 AC091193.1-201ENST00000604640 448 ntBASIC6.4□□□□□ -1.38
SREBF2Q12772 AC105265.3-202ENST00000610188 459 ntTSL 5 BASIC6.4□□□□□ -1.38
SREBF2Q12772 PCA3_2.1-201ENST00000612507 409 ntBASIC6.4□□□□□ -1.38
SREBF2Q12772 EIF3FP1-201ENST00000613970 806 ntBASIC6.4□□□□□ -1.38
SREBF2Q12772 DARS-AS1-227ENST00000627442 633 ntTSL 5 BASIC6.4□□□□□ -1.38
SREBF2Q12772 RFC1-217ENST00000639695 867 ntTSL 5 BASIC6.4□□□□□ -1.38
SREBF2Q12772 ZNF521-201ENST00000361524 4871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.4□□□□□ -1.38
SREBF2Q12772 RNF145-201ENST00000274542 3364 ntTSL 2 BASIC6.4□□□□□ -1.38
SREBF2Q12772 CCDC186-203ENST00000369287 7245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.4□□□□□ -1.39
SREBF2Q12772 ZNF227-201ENST00000313040 3043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.4□□□□□ -1.39
SREBF2Q12772 LNPK-212ENST00000544803 7647 ntTSL 1 (best) BASIC6.4□□□□□ -1.39
SREBF2Q12772 BTN3A2-203ENST00000396934 3672 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC6.4□□□□□ -1.39
SREBF2Q12772 NOVA1-206ENST00000539517 3912 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC6.4□□□□□ -1.39
SREBF2Q12772 RAPGEF4-215ENST00000540783 3974 ntTSL 2 BASIC6.4□□□□□ -1.39
SREBF2Q12772 ZNF484-202ENST00000375495 2867 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.39□□□□□ -1.39
SREBF2Q12772 UPRT-207ENST00000530743 1636 ntTSL 2 BASIC6.39□□□□□ -1.39
SREBF2Q12772 LARP1B-201ENST00000326639 4891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.39□□□□□ -1.39
SREBF2Q12772 ERI2-206ENST00000563117 2903 ntTSL 2 BASIC6.39□□□□□ -1.39
SREBF2Q12772 CPS1-IT1-201ENST00000628368 2306 ntBASIC6.39□□□□□ -1.39
SREBF2Q12772 ETF1-203ENST00000503014 1736 ntTSL 2 BASIC6.39□□□□□ -1.39
SREBF2Q12772 CLEC7A-205ENST00000353231 2446 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.39□□□□□ -1.39
SREBF2Q12772 CLCA1-202ENST00000394711 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.39□□□□□ -1.39
SREBF2Q12772 TEK-204ENST00000519097 3836 ntTSL 2 BASIC6.39□□□□□ -1.39
SREBF2Q12772 FANCD2-205ENST00000431693 2450 ntTSL 1 (best) BASIC6.39□□□□□ -1.39
SREBF2Q12772 NLRP3P1-201ENST00000622303 1785 ntBASIC6.39□□□□□ -1.39
SREBF2Q12772 OR7C1-203ENST00000641666 11711 ntAPPRIS P1 BASIC6.39□□□□□ -1.39
SREBF2Q12772 AP2B1-215ENST00000616681 3267 ntTSL 2 BASIC6.39□□□□□ -1.39
SREBF2Q12772 FAM13C-219ENST00000621119 3400 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.39□□□□□ -1.39
SREBF2Q12772 GCNT2-201ENST00000265012 4214 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.39□□□□□ -1.39
SREBF2Q12772 SCAPER-207ENST00000563290 5028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.39□□□□□ -1.39
SREBF2Q12772 BDNF-211ENST00000439476 4532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.39□□□□□ -1.39
SREBF2Q12772 OR10AG1-201ENST00000312345 1016 ntAPPRIS P1 BASIC6.39□□□□□ -1.39
SREBF2Q12772 RNA5SP123-201ENST00000363244 119 ntBASIC6.39□□□□□ -1.39
SREBF2Q12772 IGLV7-43-201ENST00000390298 385 ntAPPRIS P1 BASIC6.39□□□□□ -1.39
SREBF2Q12772 EFCAB9-201ENST00000398186 702 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC6.39□□□□□ -1.39
SREBF2Q12772 COX6CP17-201ENST00000421389 185 ntBASIC6.39□□□□□ -1.39
SREBF2Q12772 RC3H1-IT1-201ENST00000421851 448 ntTSL 5 BASIC6.39□□□□□ -1.39
SREBF2Q12772 AC016027.5-201ENST00000427227 210 ntBASIC6.39□□□□□ -1.39
SREBF2Q12772 AL138878.2-201ENST00000440581 1241 ntBASIC6.39□□□□□ -1.39
SREBF2Q12772 PCBP1-AS1-232ENST00000442040 1111 ntTSL 3 BASIC6.39□□□□□ -1.39
SREBF2Q12772 AL353152.1-201ENST00000455973 470 ntTSL 5 BASIC6.39□□□□□ -1.39
SREBF2Q12772 OR7L1P-201ENST00000456181 380 ntBASIC6.39□□□□□ -1.39
SREBF2Q12772 LINC00601-201ENST00000456514 1168 ntTSL 3 BASIC6.39□□□□□ -1.39
SREBF2Q12772 ATP5J-207ENST00000457143 589 ntTSL 2 BASIC6.39□□□□□ -1.39
SREBF2Q12772 AC073218.1-201ENST00000458413 171 ntTSL 5 BASIC6.39□□□□□ -1.39
SREBF2Q12772 PDCL3P4-201ENST00000489621 720 ntBASIC6.39□□□□□ -1.39
SREBF2Q12772 AC117386.2-203ENST00000489690 557 ntTSL 3 BASIC6.39□□□□□ -1.39
SREBF2Q12772 HMGB1P44-201ENST00000508597 572 ntBASIC6.39□□□□□ -1.39
SREBF2Q12772 LINC00992-202ENST00000514186 564 ntTSL 5 BASIC6.39□□□□□ -1.39
SREBF2Q12772 RNU6-551P-201ENST00000516661 103 ntBASIC6.39□□□□□ -1.39
SREBF2Q12772 IGLV3-24-201ENST00000517477 197 ntBASIC6.39□□□□□ -1.39
SREBF2Q12772 AC090424.1-201ENST00000535243 736 ntBASIC6.39□□□□□ -1.39
SREBF2Q12772 AC024940.3-201ENST00000538551 316 ntBASIC6.39□□□□□ -1.39
SREBF2Q12772 AL121594.2-201ENST00000541658 472 ntBASIC6.39□□□□□ -1.39
SREBF2Q12772 AC010615.3-201ENST00000597319 394 ntBASIC6.39□□□□□ -1.39
SREBF2Q12772 DTNA-232ENST00000599844 853 ntTSL 1 (best) BASIC6.39□□□□□ -1.39
SREBF2Q12772 AC024563.1-201ENST00000601860 618 ntTSL 2 BASIC6.39□□□□□ -1.39
SREBF2Q12772 PXT1-202ENST00000619547 619 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.39□□□□□ -1.39
SREBF2Q12772 AC244517.5-203ENST00000624778 517 ntTSL 2 BASIC6.39□□□□□ -1.39
SREBF2Q12772 DNM1P47-203ENST00000571780 12667 ntBASIC6.39□□□□□ -1.39
SREBF2Q12772 ITCH-201ENST00000262650 3089 ntTSL 1 (best) BASIC6.39□□□□□ -1.39
SREBF2Q12772 CDON-206ENST00000531738 5803 ntTSL 1 (best) BASIC6.39□□□□□ -1.39
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