Protein–RNA interactions for Protein: Q01094

E2F1, Transcription factor E2F1, humanhuman

Predictions only

Length 437 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
E2F1Q01094 AL445465.1-206ENST00000609544 528 ntTSL 5 BASIC5.89□□□□□ -1.47
E2F1Q01094 AL161457.2-201ENST00000629181 630 ntTSL 5 BASIC5.89□□□□□ -1.47
E2F1Q01094 IGLV10-54-202ENST00000640991 351 ntTSL 5 BASIC5.89□□□□□ -1.47
E2F1Q01094 AC116667.2-201ENST00000641075 823 ntBASIC5.89□□□□□ -1.47
E2F1Q01094 SEPT7-203ENST00000399035 4066 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC5.89□□□□□ -1.47
E2F1Q01094 CHD6-202ENST00000373222 2477 ntTSL 1 (best) BASIC5.89□□□□□ -1.47
E2F1Q01094 PPP1R2P3-201ENST00000522232 1991 ntAPPRIS P1 BASIC5.89□□□□□ -1.47
E2F1Q01094 PLEKHA1-201ENST00000368988 3872 ntTSL 5 BASIC5.89□□□□□ -1.47
E2F1Q01094 RFX3-212ENST00000617270 9253 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.89□□□□□ -1.47
E2F1Q01094 AC012254.3-201ENST00000591183 2117 ntBASIC5.89□□□□□ -1.47
E2F1Q01094 GABRA2-206ENST00000507460 5812 ntTSL 1 (best) BASIC5.89□□□□□ -1.47
E2F1Q01094 RIC3-202ENST00000335425 5223 ntTSL 1 (best) BASIC5.89□□□□□ -1.47
E2F1Q01094 MTOR-202ENST00000376838 4017 ntTSL 2 BASIC5.89□□□□□ -1.47
E2F1Q01094 PAPD4-203ENST00000428308 2204 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC5.89□□□□□ -1.47
E2F1Q01094 DGKB-201ENST00000399322 6684 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC5.88□□□□□ -1.47
E2F1Q01094 PDE4B-203ENST00000371045 3982 ntTSL 1 (best) BASIC5.88□□□□□ -1.47
E2F1Q01094 CDK14-206ENST00000436577 4787 ntTSL 2 BASIC5.88□□□□□ -1.47
E2F1Q01094 CARD6-201ENST00000254691 4221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.88□□□□□ -1.47
E2F1Q01094 AC137056.2-201ENST00000624055 1958 ntBASIC5.88□□□□□ -1.47
E2F1Q01094 FSCB-201ENST00000340446 2938 ntAPPRIS P1 BASIC5.88□□□□□ -1.47
E2F1Q01094 OR11H1-201ENST00000252835 982 ntAPPRIS P1 BASIC5.88□□□□□ -1.47
E2F1Q01094 OR11H13P-201ENST00000359695 979 ntBASIC5.88□□□□□ -1.47
E2F1Q01094 OR3A2-201ENST00000408891 1076 ntBASIC5.88□□□□□ -1.47
E2F1Q01094 AL096829.1-201ENST00000413677 457 ntBASIC5.88□□□□□ -1.47
E2F1Q01094 FO393401.1-203ENST00000416260 486 ntTSL 5 BASIC5.88□□□□□ -1.47
E2F1Q01094 AC007568.1-201ENST00000422912 471 ntBASIC5.88□□□□□ -1.47
E2F1Q01094 AL450384.1-201ENST00000433526 413 ntTSL 2 BASIC5.88□□□□□ -1.47
E2F1Q01094 LARGE-IT1-201ENST00000445391 558 ntTSL 4 BASIC5.88□□□□□ -1.47
E2F1Q01094 ZNF619P1-201ENST00000446539 752 ntBASIC5.88□□□□□ -1.47
E2F1Q01094 RAB28P3-201ENST00000448325 597 ntBASIC5.88□□□□□ -1.47
E2F1Q01094 AL731661.2-201ENST00000448824 806 ntTSL 1 (best) BASIC5.88□□□□□ -1.47
E2F1Q01094 TMEM247-203ENST00000449601 741 ntTSL 1 (best) BASIC5.88□□□□□ -1.47
E2F1Q01094 GEMIN2P1-201ENST00000454246 752 ntBASIC5.88□□□□□ -1.47
E2F1Q01094 PEX5L-AS2-201ENST00000462801 630 ntTSL 2 BASIC5.88□□□□□ -1.47
E2F1Q01094 AC114728.1-201ENST00000488289 483 ntBASIC5.88□□□□□ -1.47
E2F1Q01094 AC083795.1-201ENST00000491760 320 ntBASIC5.88□□□□□ -1.47
E2F1Q01094 SPTSSB-202ENST00000497137 880 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC5.88□□□□□ -1.47
E2F1Q01094 AC093534.1-201ENST00000504977 132 ntBASIC5.88□□□□□ -1.47
E2F1Q01094 AF250324.1-203ENST00000508156 517 ntTSL 3 BASIC5.88□□□□□ -1.47
E2F1Q01094 AC093248.1-201ENST00000513197 417 ntTSL 2 BASIC5.88□□□□□ -1.47
E2F1Q01094 AC067904.2-201ENST00000517322 1283 ntBASIC5.88□□□□□ -1.47
E2F1Q01094 AC091979.1-201ENST00000517595 706 ntTSL 2 BASIC5.88□□□□□ -1.47
E2F1Q01094 AC034205.1-201ENST00000520621 638 ntBASIC5.88□□□□□ -1.47
E2F1Q01094 IGLV2-28-201ENST00000520681 304 ntBASIC5.88□□□□□ -1.47
E2F1Q01094 LINC01033-204ENST00000523194 715 ntTSL 2 BASIC5.88□□□□□ -1.47
E2F1Q01094 OR5D2P-201ENST00000524390 911 ntBASIC5.88□□□□□ -1.47
E2F1Q01094 AP003066.2-201ENST00000529375 555 ntBASIC5.88□□□□□ -1.47
E2F1Q01094 MYL6-213ENST00000549017 502 ntTSL 3 BASIC5.88□□□□□ -1.47
E2F1Q01094 NOP56P3-201ENST00000549457 385 ntBASIC5.88□□□□□ -1.47
E2F1Q01094 LINC02258-201ENST00000551280 777 ntTSL 2 BASIC5.88□□□□□ -1.47
E2F1Q01094 OR11H2-201ENST00000556246 948 ntAPPRIS P1 BASIC5.88□□□□□ -1.47
E2F1Q01094 DPPA3P2-202ENST00000557188 1219 ntBASIC5.88□□□□□ -1.47
E2F1Q01094 THSD4-AS1-201ENST00000561571 554 ntTSL 5 BASIC5.88□□□□□ -1.47
E2F1Q01094 AC010547.6-201ENST00000571789 193 ntBASIC5.88□□□□□ -1.47
E2F1Q01094 AC009121.2-202ENST00000572706 505 ntTSL 3 BASIC5.88□□□□□ -1.47
E2F1Q01094 AC099850.2-201ENST00000577660 557 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC5.88□□□□□ -1.47
E2F1Q01094 CCL4-202ENST00000615863 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.88□□□□□ -1.47
E2F1Q01094 AC096861.1-201ENST00000616652 240 ntBASIC5.88□□□□□ -1.47
E2F1Q01094 AC084824.4-201ENST00000620106 731 ntBASIC5.88□□□□□ -1.47
E2F1Q01094 LINC02033-201ENST00000623207 971 ntTSL 2 BASIC5.88□□□□□ -1.47
E2F1Q01094 AL691477.1-201ENST00000624398 162 ntBASIC5.88□□□□□ -1.47
E2F1Q01094 OR8G5-202ENST00000641707 1156 ntAPPRIS P1 BASIC5.88□□□□□ -1.47
E2F1Q01094 SEPT7P7-201ENST00000420492 1301 ntBASIC5.88□□□□□ -1.47
E2F1Q01094 ZNF521-201ENST00000361524 4871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.88□□□□□ -1.47
E2F1Q01094 OR2H1-201ENST00000377132 2253 ntAPPRIS P1 BASIC5.88□□□□□ -1.47
E2F1Q01094 MOSPD2-201ENST00000380492 4163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.88□□□□□ -1.47
E2F1Q01094 ZNF624-201ENST00000311331 4241 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.88□□□□□ -1.47
E2F1Q01094 AMN1-208ENST00000537562 1538 ntTSL 5 BASIC5.88□□□□□ -1.47
E2F1Q01094 OR52N5-202ENST00000641181 2778 ntAPPRIS P1 BASIC5.88□□□□□ -1.47
E2F1Q01094 PUM2-202ENST00000338086 6112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.88□□□□□ -1.47
E2F1Q01094 CLASP2-205ENST00000461133 4814 ntTSL 5 BASIC5.87□□□□□ -1.47
E2F1Q01094 RAP1GDS1-202ENST00000339360 2092 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC5.87□□□□□ -1.47
E2F1Q01094 LINC02086-202ENST00000492522 2091 ntTSL 5 BASIC5.87□□□□□ -1.47
E2F1Q01094 HELZ-207ENST00000580168 6279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.87□□□□□ -1.47
E2F1Q01094 CAPRIN2-203ENST00000417045 3535 ntTSL 1 (best) BASIC5.87□□□□□ -1.47
E2F1Q01094 TOP2B-201ENST00000264331 5358 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.87□□□□□ -1.47
E2F1Q01094 LARP4-203ENST00000398473 6427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.87□□□□□ -1.47
E2F1Q01094 BANK1-206ENST00000504592 3544 ntTSL 2 BASIC5.87□□□□□ -1.47
E2F1Q01094 OR6C74-201ENST00000343870 1105 ntAPPRIS P1 BASIC5.87□□□□□ -1.47
E2F1Q01094 SNORA43.1-201ENST00000364863 140 ntBASIC5.87□□□□□ -1.47
E2F1Q01094 CFHR2-201ENST00000367415 1059 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.87□□□□□ -1.47
E2F1Q01094 FAM66C-201ENST00000372173 678 ntTSL 5 BASIC5.87□□□□□ -1.47
E2F1Q01094 AF228730.1-201ENST00000397972 663 ntBASIC5.87□□□□□ -1.47
E2F1Q01094 AL445238.1-204ENST00000400311 463 ntBASIC5.87□□□□□ -1.47
E2F1Q01094 AL096711.1-201ENST00000404780 554 ntBASIC5.87□□□□□ -1.47
E2F1Q01094 AL391361.1-201ENST00000405580 489 ntBASIC5.87□□□□□ -1.47
E2F1Q01094 RNU4-27P-201ENST00000410889 139 ntBASIC5.87□□□□□ -1.47
E2F1Q01094 AC073257.2-201ENST00000413991 528 ntTSL 3 BASIC5.87□□□□□ -1.47
E2F1Q01094 CYP3A43-205ENST00000415413 990 ntTSL 5 BASIC5.87□□□□□ -1.47
E2F1Q01094 NIFKP3-201ENST00000417799 865 ntBASIC5.87□□□□□ -1.47
E2F1Q01094 Z98742.1-201ENST00000419801 632 ntTSL 3 BASIC5.87□□□□□ -1.47
E2F1Q01094 AC034195.1-201ENST00000420000 559 ntTSL 4 BASIC5.87□□□□□ -1.47
E2F1Q01094 BX510359.3-201ENST00000422168 306 ntBASIC5.87□□□□□ -1.47
E2F1Q01094 AC245517.2-201ENST00000442890 346 ntBASIC5.87□□□□□ -1.47
E2F1Q01094 RNFT1P2-201ENST00000443064 757 ntBASIC5.87□□□□□ -1.47
E2F1Q01094 AL442224.1-201ENST00000443771 391 ntTSL 2 BASIC5.87□□□□□ -1.47
E2F1Q01094 AL163193.1-201ENST00000444895 788 ntBASIC5.87□□□□□ -1.47
E2F1Q01094 AC010976.1-211ENST00000454503 644 ntTSL 2 BASIC5.87□□□□□ -1.47
E2F1Q01094 OARD1-207ENST00000468811 819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.87□□□□□ -1.47
E2F1Q01094 RPS3AP15-201ENST00000483874 781 ntBASIC5.87□□□□□ -1.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 158.2 ms